RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284957.9

RABGEF1-201, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RABGEF1, Length 3,733 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-201ENST00000284957 DIMT1Q9UNQ2 313 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
RABGEF1-201ENST00000284957 LSM2Q9Y333 95 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
RABGEF1-201ENST00000284957 IMPA2O14732 288 aa8.45□□□□□ -1.06
RABGEF1-201ENST00000284957 SLC2A5P22732 501 aa8.45□□□□□ -1.06
RABGEF1-201ENST00000284957 HTR1FP30939 366 aa8.45□□□□□ -1.06
RABGEF1-201ENST00000284957 TGFBR2P37173 567 aa8.45□□□□□ -1.06
RABGEF1-201ENST00000284957 LIPAP38571 399 aa8.45□□□□□ -1.06
RABGEF1-201ENST00000284957 RPL18Q07020 188 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
RABGEF1-201ENST00000284957 RAB40BQ12829 278 aa8.45□□□□□ -1.06
RABGEF1-201ENST00000284957 C1orf140Q5VVS0 124 aa8.45□□□□□ -1.06
RABGEF1-201ENST00000284957 B3GNT6Q6ZMB0 384 aa8.45□□□□□ -1.06
RABGEF1-201ENST00000284957 IL22RA1Q8N6P7 574 aa8.45□□□□□ -1.06
RABGEF1-201ENST00000284957 ARL5BQ96KC2 179 aa8.45□□□□□ -1.06
RABGEF1-201ENST00000284957 KLHL1Q9NR64 748 aa8.45□□□□□ -1.06
RABGEF1-201ENST00000284957 TAS2R5Q9NYW4 299 aa8.45□□□□□ -1.06
RABGEF1-201ENST00000284957 PCDHGB6Q9Y5F9 930 aa8.45□□□□□ -1.06
RABGEF1-201ENST00000284957 TRIM64BA6NI03 449 aa8.44□□□□□ -1.06
RABGEF1-201ENST00000284957 FTCDNL1E5RQL4 147 aa8.44□□□□□ -1.06
RABGEF1-201ENST00000284957 ARPC3O15145 178 aa8.44□□□□□ -1.06
RABGEF1-201ENST00000284957 SLC25A12O75746 678 aa8.44□□□□□ -1.06
RABGEF1-201ENST00000284957 ATE1O95260 518 aa8.44□□□□□ -1.06
RABGEF1-201ENST00000284957 RPL4P36578 427 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
RABGEF1-201ENST00000284957 ETV1P50549 477 aa8.44□□□□□ -1.06
RABGEF1-201ENST00000284957 ERVK-25P63136 954 aa8.44□□□□□ -1.06
RABGEF1-201ENST00000284957 DCAF10Q5QP82 559 aa8.44□□□□□ -1.06
RABGEF1-201ENST00000284957 FAM69AQ5T7M9 428 aa8.44□□□□□ -1.06
RABGEF1-201ENST00000284957 RNLSQ5VYX0 342 aa8.44□□□□□ -1.06
RABGEF1-201ENST00000284957 ARHGAP11AQ6P4F7 1023 aa8.44□□□□□ -1.06
RABGEF1-201ENST00000284957 DND1Q8IYX4 353 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
RABGEF1-201ENST00000284957 OR4F15Q8NGB8 312 aa8.44□□□□□ -1.06
RABGEF1-201ENST00000284957 OR52E2Q8NGJ4 325 aa8.44□□□□□ -1.06
RABGEF1-201ENST00000284957 OR4K13Q8NH42 304 aa8.44□□□□□ -1.06
RABGEF1-201ENST00000284957 ADAMTS14Q8WXS8 1223 aa8.44□□□□□ -1.06
RABGEF1-201ENST00000284957 FCGR1BQ92637 280 aa8.44□□□□□ -1.06
RABGEF1-201ENST00000284957 RFKQ969G6 155 aa8.44□□□□□ -1.06
RABGEF1-201ENST00000284957 OTULINQ96BN8 352 aa8.44□□□□□ -1.06
RABGEF1-201ENST00000284957 C1GALT1C1Q96EU7 318 aa8.44□□□□□ -1.06
RABGEF1-201ENST00000284957 FGF20Q9NP95 211 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
RABGEF1-201ENST00000284957 HPF1Q9NWY4 346 aa8.44□□□□□ -1.06
RABGEF1-201ENST00000284957 WARS2Q9UGM6 360 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
RABGEF1-201ENST00000284957 FREM3P0C091 2139 aa8.44□□□□□ -1.06
RABGEF1-201ENST00000284957 CCDC182A6NF36 153 aa8.44□□□□□ -1.06
RABGEF1-201ENST00000284957 G3V3Y1 287 aa8.44□□□□□ -1.06
RABGEF1-201ENST00000284957 J3QRE1 110 aa8.44□□□□□ -1.06
RABGEF1-201ENST00000284957 TRMUO75648 421 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
RABGEF1-201ENST00000284957 F13BP05160 661 aa8.44□□□□□ -1.06
RABGEF1-201ENST00000284957 HK1P19367 917 aa8.44□□□□□ -1.06
RABGEF1-201ENST00000284957 NR4A1P22736 598 aa8.44□□□□□ -1.06
RABGEF1-201ENST00000284957 APOBEC1P41238 236 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
RABGEF1-201ENST00000284957 NOVA1P51513 510 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
RABGEF1-201ENST00000284957 TMBIM6P55061 237 aa8.44□□□□□ -1.06
RABGEF1-201ENST00000284957 SLC22A10Q63ZE4 541 aa8.44□□□□□ -1.06
RABGEF1-201ENST00000284957 SLC7A5P1Q8MH63 180 aa8.44□□□□□ -1.06
RABGEF1-201ENST00000284957 SDR9C7Q8NEX9 313 aa8.44□□□□□ -1.06
RABGEF1-201ENST00000284957 ZPLD1Q8TCW7 415 aa8.44□□□□□ -1.06
RABGEF1-201ENST00000284957 STK35Q8TDR2 534 aa8.44□□□□□ -1.06
RABGEF1-201ENST00000284957 RASD2Q96D21 266 aa8.44□□□□□ -1.06
RABGEF1-201ENST00000284957 THOC3Q96J01 351 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
RABGEF1-201ENST00000284957 ZNF649Q9BS31 505 aa8.44□□□□□ -1.06
RABGEF1-201ENST00000284957 DLL3Q9NYJ7 618 aa8.44□□□□□ -1.06
RABGEF1-201ENST00000284957 SNTNA6NMZ2 147 aa8.44□□□□□ -1.06
RABGEF1-201ENST00000284957 RIIAD1A6NNX1 92 aa8.44□□□□□ -1.06
RABGEF1-201ENST00000284957 PRR23D1E9PI22 279 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
RABGEF1-201ENST00000284957 PRR23D2P0DMB1 279 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
RABGEF1-201ENST00000284957 DCTN2Q13561 401 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
RABGEF1-201ENST00000284957 CTF1Q16619 201 aa8.44□□□□□ -1.06
RABGEF1-201ENST00000284957 TIGD6Q17RP2 521 aa8.44□□□□□ -1.06
RABGEF1-201ENST00000284957 ANKDD1AQ495B1 522 aa8.44□□□□□ -1.06
RABGEF1-201ENST00000284957 KLHL22Q53GT1 634 aa8.44□□□□□ -1.06
RABGEF1-201ENST00000284957 ALG10Q5BKT4 473 aa8.44□□□□□ -1.06
RABGEF1-201ENST00000284957 MEPCEQ7L2J0 689 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
RABGEF1-201ENST00000284957 ANKRD13BQ86YJ7 626 aa8.44□□□□□ -1.06
RABGEF1-201ENST00000284957 RAB43Q86YS6 212 aa8.44□□□□□ -1.06
RABGEF1-201ENST00000284957 BEST3Q8N1M1 668 aa8.44□□□□□ -1.06
RABGEF1-201ENST00000284957 NANOGP1Q8N7R0 232 aa8.44□□□□□ -1.06
RABGEF1-201ENST00000284957 NPEPL1Q8NDH3 523 aa8.44□□□□□ -1.06
RABGEF1-201ENST00000284957 OR5M1Q8NGP8 315 aa8.44□□□□□ -1.06
RABGEF1-201ENST00000284957 C9orf43Q8TAL5 461 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
RABGEF1-201ENST00000284957 SLC25A36Q96CQ1 311 aa8.44□□□□□ -1.06
RABGEF1-201ENST00000284957 MRGPRX4Q96LA9 322 aa8.44□□□□□ -1.06
RABGEF1-201ENST00000284957 Q96M85 177 aa8.44□□□□□ -1.06
RABGEF1-201ENST00000284957 GNRHR2Q96P88 292 aa8.44□□□□□ -1.06
RABGEF1-201ENST00000284957 EXOGQ9Y2C4 368 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
RABGEF1-201ENST00000284957 NCKAP5O14513 1909 aa8.44□□□□□ -1.06
RABGEF1-201ENST00000284957 AKAP13Q12802 2813 aa8.43□□□□□ -1.06
RABGEF1-201ENST00000284957 A0A0G2JMM0 328 aa8.43□□□□□ -1.06
RABGEF1-201ENST00000284957 A0A1W2PPB8 328 aa8.43□□□□□ -1.06
RABGEF1-201ENST00000284957 A0A1W2PRS3 328 aa8.43□□□□□ -1.06
RABGEF1-201ENST00000284957 KIR3DP1A8MWS1 328 aa8.43□□□□□ -1.06
RABGEF1-201ENST00000284957 RAB36O95755 333 aa8.43□□□□□ -1.06
RABGEF1-201ENST00000284957 MT-ATP6P00846 226 aa8.43□□□□□ -1.06
RABGEF1-201ENST00000284957 GYPBP06028 91 aa8.43□□□□□ -1.06
RABGEF1-201ENST00000284957 CD14P08571 375 aa8.43□□□□□ -1.06
RABGEF1-201ENST00000284957 ZNF3P17036 446 aa8.43□□□□□ -1.06
RABGEF1-201ENST00000284957 TCEA1P23193 301 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
RABGEF1-201ENST00000284957 RBMS1P29558 406 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
RABGEF1-201ENST00000284957 ZNF41P51814 821 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
RABGEF1-201ENST00000284957 TMEM44Q2T9K0 475 aa8.43□□□□□ -1.06
RABGEF1-201ENST00000284957 ATP1A1-AS1Q5TC04 95 aa8.43□□□□□ -1.06
RABGEF1-201ENST00000284957 TMPRSS7Q7RTY8 843 aa8.43□□□□□ -1.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 73.9 ms