RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284617.6

CCSAP-201, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,121 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-201ENST00000284617 P2RY12Q9H244 342 aa19.62■□□□□ 0.73
CCSAP-201ENST00000284617 WDR76Q9H967 626 aa19.62■□□□□ 0.73
CCSAP-201ENST00000284617 PIGAP37287 484 aa19.62■□□□□ 0.73
CCSAP-201ENST00000284617 ERV3-1Q14264 604 aa19.62■□□□□ 0.73
CCSAP-201ENST00000284617 DPY19L2P2Q6ZN68 376 aa19.62■□□□□ 0.73
CCSAP-201ENST00000284617 CMSS1Q9BQ75 279 aaKnown RBP19.62■□□□□ 0.73
CCSAP-201ENST00000284617 AMBRA1Q9C0C7 1298 aa19.62■□□□□ 0.73
CCSAP-201ENST00000284617 CXCL16Q9H2A7 254 aa19.62■□□□□ 0.73
CCSAP-201ENST00000284617 DNAJB11Q9UBS4 358 aa19.62■□□□□ 0.73
CCSAP-201ENST00000284617 ACAD8Q9UKU7 415 aa19.62■□□□□ 0.73
CCSAP-201ENST00000284617 A0A1B0GWA3 101 aa19.62■□□□□ 0.73
CCSAP-201ENST00000284617 SURF4O15260 269 aa19.62■□□□□ 0.73
CCSAP-201ENST00000284617 NPPBP16860 134 aa19.62■□□□□ 0.73
CCSAP-201ENST00000284617 ETV5P41161 510 aa19.62■□□□□ 0.73
CCSAP-201ENST00000284617 IDO2Q6ZQW0 420 aa19.62■□□□□ 0.73
CCSAP-201ENST00000284617 SVBPQ8N300 66 aa19.62■□□□□ 0.73
CCSAP-201ENST00000284617 SUSD5O60279 629 aa19.61■□□□□ 0.73
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF44P15621 663 aa19.61■□□□□ 0.73
CCSAP-201ENST00000284617 C18orf63Q68DL7 685 aa19.61■□□□□ 0.73
CCSAP-201ENST00000284617 FRMD1Q8N878 549 aa19.61■□□□□ 0.73
CCSAP-201ENST00000284617 MARCH5Q9NX47 278 aa19.61■□□□□ 0.73
CCSAP-201ENST00000284617 ETV7Q9Y603 341 aa19.61■□□□□ 0.73
CCSAP-201ENST00000284617 TRIM64BA6NI03 449 aa19.61■□□□□ 0.73
CCSAP-201ENST00000284617 HIDE1A8MVS5 230 aa19.61■□□□□ 0.73
CCSAP-201ENST00000284617 MTHFD2P13995 350 aa19.61■□□□□ 0.73
CCSAP-201ENST00000284617 RAB6AP20340 208 aa19.61■□□□□ 0.73
CCSAP-201ENST00000284617 ARNTP27540 789 aa19.61■□□□□ 0.73
CCSAP-201ENST00000284617 DLEU7Q6UYE1 221 aa19.61■□□□□ 0.73
CCSAP-201ENST00000284617 GAREM2Q75VX8 874 aa19.61■□□□□ 0.73
CCSAP-201ENST00000284617 OR6T1Q8NGN1 323 aa19.61■□□□□ 0.73
CCSAP-201ENST00000284617 SLC22A12Q96S37 553 aa19.61■□□□□ 0.73
CCSAP-201ENST00000284617 WDR83Q9BRX9 315 aaKnown RBP19.61■□□□□ 0.73
CCSAP-201ENST00000284617 NIPAL2Q9H841 368 aa19.61■□□□□ 0.73
CCSAP-201ENST00000284617 C4BP0C0L5 1744 aa19.61■□□□□ 0.73
CCSAP-201ENST00000284617 PRKACBP22694 351 aa19.61■□□□□ 0.73
CCSAP-201ENST00000284617 GDF1P27539 372 aa19.61■□□□□ 0.73
CCSAP-201ENST00000284617 GAB1Q13480 694 aa19.61■□□□□ 0.73
CCSAP-201ENST00000284617 TMEM207Q6UWW9 146 aa19.61■□□□□ 0.73
CCSAP-201ENST00000284617 TEX37Q96LM6 180 aa19.61■□□□□ 0.73
CCSAP-201ENST00000284617 C19orf12Q9NSK7 152 aa19.61■□□□□ 0.73
CCSAP-201ENST00000284617 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP19.61■□□□□ 0.73
CCSAP-201ENST00000284617 TRAPPC2LH3BP13 241 aa19.61■□□□□ 0.73
CCSAP-201ENST00000284617 TMX2-CTNND1H3BSU7 103 aa19.61■□□□□ 0.73
CCSAP-201ENST00000284617 TGM6O95932 706 aa19.61■□□□□ 0.73
CCSAP-201ENST00000284617 OR1D4P47884 311 aa19.61■□□□□ 0.73
CCSAP-201ENST00000284617 VEGFBP49765 207 aa19.61■□□□□ 0.73
CCSAP-201ENST00000284617 ZP2Q05996 745 aa19.61■□□□□ 0.73
CCSAP-201ENST00000284617 OPCMLQ14982 345 aa19.61■□□□□ 0.73
CCSAP-201ENST00000284617 ABHD17CQ6PCB6 329 aa19.61■□□□□ 0.73
CCSAP-201ENST00000284617 GDF7Q7Z4P5 450 aa19.61■□□□□ 0.73
CCSAP-201ENST00000284617 SMIM3Q9BZL3 60 aa19.61■□□□□ 0.73
CCSAP-201ENST00000284617 NMNAT2Q9BZQ4 307 aa19.61■□□□□ 0.73
CCSAP-201ENST00000284617 TRAV36DV7A0A075B6V5 113 aa19.6■□□□□ 0.73
CCSAP-201ENST00000284617 ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 625 aa19.6■□□□□ 0.73
CCSAP-201ENST00000284617 GFRA2O00451 464 aa19.6■□□□□ 0.73
CCSAP-201ENST00000284617 SLC35E2P0CK97 266 aa19.6■□□□□ 0.73
CCSAP-201ENST00000284617 LIPAP38571 399 aa19.6■□□□□ 0.73
CCSAP-201ENST00000284617 LYSMD4Q5XG99 296 aa19.6■□□□□ 0.73
CCSAP-201ENST00000284617 OR5M10Q6IEU7 315 aa19.6■□□□□ 0.73
CCSAP-201ENST00000284617 FAM57BQ71RH2 274 aa19.6■□□□□ 0.73
CCSAP-201ENST00000284617 TMEM59Q9BXS4 323 aa19.6■□□□□ 0.73
CCSAP-201ENST00000284617 ACVR1Q04771 509 aa19.6■□□□□ 0.73
CCSAP-201ENST00000284617 KCNG3Q8TAE7 436 aa19.6■□□□□ 0.73
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF566Q969W8 418 aa19.6■□□□□ 0.73
CCSAP-201ENST00000284617 MICU1Q9BPX6 476 aa19.6■□□□□ 0.73
CCSAP-201ENST00000284617 SLCO5A1Q9H2Y9 848 aa19.6■□□□□ 0.73
CCSAP-201ENST00000284617 PTBP1P26599 531 aaKnown RBP eCLIP19.6■□□□□ 0.731e-10■■■□□ 14.9
CCSAP-201ENST00000284617 EPHA4P54764 986 aa19.6■□□□□ 0.73
CCSAP-201ENST00000284617 HYAL4Q2M3T9 481 aa19.6■□□□□ 0.73
CCSAP-201ENST00000284617 ADPRMQ3LIE5 342 aa19.6■□□□□ 0.73
CCSAP-201ENST00000284617 YIF1BQ5BJH7 314 aa19.6■□□□□ 0.73
CCSAP-201ENST00000284617 B3GLCTQ6Y288 498 aa19.6■□□□□ 0.73
CCSAP-201ENST00000284617 NME7Q9Y5B8 376 aa19.6■□□□□ 0.73
CCSAP-201ENST00000284617 NSG1A0A0A6YYJ2 146 aa19.6■□□□□ 0.73
CCSAP-201ENST00000284617 CXCL12P48061 93 aa19.6■□□□□ 0.73
CCSAP-201ENST00000284617 AFF3P51826 1226 aaKnown RBP19.6■□□□□ 0.73
CCSAP-201ENST00000284617 TMEM52BQ4KMG9 183 aa19.6■□□□□ 0.73
CCSAP-201ENST00000284617 CMIPQ8IY22 773 aa19.6■□□□□ 0.73
CCSAP-201ENST00000284617 NMNAT3Q96T66 252 aa19.6■□□□□ 0.73
CCSAP-201ENST00000284617 TCEAL7Q9BRU2 100 aa19.6■□□□□ 0.73
CCSAP-201ENST00000284617 CORINQ9Y5Q5 1042 aa19.6■□□□□ 0.73
CCSAP-201ENST00000284617 NPFFR2Q9Y5X5 522 aa19.6■□□□□ 0.73
CCSAP-201ENST00000284617 TCRBP04435 133 aa19.59■□□□□ 0.73
CCSAP-201ENST00000284617 MAKP20794 623 aa19.59■□□□□ 0.73
CCSAP-201ENST00000284617 CD79BP40259 229 aa19.59■□□□□ 0.73
CCSAP-201ENST00000284617 CSNK1G2P78368 415 aa19.59■□□□□ 0.73
CCSAP-201ENST00000284617 MFSD12Q6NUT3 480 aa19.59■□□□□ 0.73
CCSAP-201ENST00000284617 MOB3CQ70IA8 216 aa19.59■□□□□ 0.73
CCSAP-201ENST00000284617 DPY19L4Q7Z388 723 aa19.59■□□□□ 0.73
CCSAP-201ENST00000284617 GPR155Q7Z3F1 870 aa19.59■□□□□ 0.73
CCSAP-201ENST00000284617 KLHDC8BQ8IXV7 354 aa19.59■□□□□ 0.73
CCSAP-201ENST00000284617 OR13C9Q8NGT0 318 aa19.59■□□□□ 0.73
CCSAP-201ENST00000284617 ARL5BQ96KC2 179 aa19.59■□□□□ 0.73
CCSAP-201ENST00000284617 MYO9BQ13459 2157 aa19.59■□□□□ 0.73
CCSAP-201ENST00000284617 WDPCPO95876 746 aa19.59■□□□□ 0.73
CCSAP-201ENST00000284617 CLDN12P56749 244 aa19.59■□□□□ 0.73
CCSAP-201ENST00000284617 MSMO1Q15800 293 aa19.59■□□□□ 0.73
CCSAP-201ENST00000284617 SLC22A25Q6T423 547 aa19.59■□□□□ 0.73
CCSAP-201ENST00000284617 KRBOX1C9JBD0 128 aa19.59■□□□□ 0.73
CCSAP-201ENST00000284617 HCRTR1O43613 425 aa19.59■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.4 ms