RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000260356.5

THBS1-201, Transcript of thrombospondin 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene THBS1, Length 7,775 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THBS1-201ENST00000260356 IDUAP35475 653 aa10.66□□□□□ -0.7
THBS1-201ENST00000260356 FLI1Q01543 452 aaPredicted RBP10.66□□□□□ -0.7
THBS1-201ENST00000260356 SNTB1Q13884 538 aaKnown RBP10.66□□□□□ -0.7
THBS1-201ENST00000260356 FAM58AQ8N1B3 248 aa10.66□□□□□ -0.7
THBS1-201ENST00000260356 OR8J2Q8NGG1 315 aa10.66□□□□□ -0.7
THBS1-201ENST00000260356 SECTM1Q8WVN6 248 aa10.66□□□□□ -0.7
THBS1-201ENST00000260356 PURGQ9UJV8 347 aaKnown RBP10.66□□□□□ -0.7
THBS1-201ENST00000260356 EXO1Q9UQ84 846 aaKnown RBP10.66□□□□□ -0.7
THBS1-201ENST00000260356 ETV7Q9Y603 341 aa10.66□□□□□ -0.7
THBS1-201ENST00000260356 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP10.66□□□□□ -0.7
THBS1-201ENST00000260356 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP10.66□□□□□ -0.7
THBS1-201ENST00000260356 HSPB6O14558 160 aa10.66□□□□□ -0.7
THBS1-201ENST00000260356 CNR1P21554 472 aa10.66□□□□□ -0.7
THBS1-201ENST00000260356 GABRB3P28472 473 aa10.66□□□□□ -0.7
THBS1-201ENST00000260356 TAGLN2P37802 199 aaKnown RBP10.66□□□□□ -0.7
THBS1-201ENST00000260356 OPRD1P41143 372 aa10.66□□□□□ -0.7
THBS1-201ENST00000260356 VASPP50552 380 aaPredicted RBP10.66□□□□□ -0.7
THBS1-201ENST00000260356 LILRB4Q8NHJ6 448 aa10.66□□□□□ -0.7
THBS1-201ENST00000260356 ISG20Q96AZ6 181 aaKnown RBP10.66□□□□□ -0.7
THBS1-201ENST00000260356 INTS12Q96CB8 462 aaKnown RBP10.66□□□□□ -0.7
THBS1-201ENST00000260356 TCTN2Q96GX1 697 aa10.66□□□□□ -0.7
THBS1-201ENST00000260356 SGPP1Q9BX95 441 aa10.66□□□□□ -0.7
THBS1-201ENST00000260356 ACPTQ9BZG2 426 aa10.66□□□□□ -0.7
THBS1-201ENST00000260356 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP10.66□□□□□ -0.7
THBS1-201ENST00000260356 ZNF355PQ9NSJ1 428 aa10.66□□□□□ -0.7
THBS1-201ENST00000260356 GNG12Q9UBI6 72 aa10.66□□□□□ -0.7
THBS1-201ENST00000260356 A6NL46 340 aa10.65□□□□□ -0.7
THBS1-201ENST00000260356 GALR3O60755 368 aaPredicted RBP10.65□□□□□ -0.7
THBS1-201ENST00000260356 FOLR1P15328 257 aa10.65□□□□□ -0.7
THBS1-201ENST00000260356 EBPQ15125 230 aaKnown RBP10.65□□□□□ -0.7
THBS1-201ENST00000260356 CDONQ4KMG0 1287 aa10.65□□□□□ -0.7
THBS1-201ENST00000260356 FRMPD2BQ6IN97 320 aa10.65□□□□□ -0.7
THBS1-201ENST00000260356 LYPD4Q6UWN0 246 aa10.65□□□□□ -0.7
THBS1-201ENST00000260356 FAM57BQ71RH2 274 aa10.65□□□□□ -0.7
THBS1-201ENST00000260356 ADGRG5Q8IZF4 528 aa10.65□□□□□ -0.7
THBS1-201ENST00000260356 ZNF454Q8N9F8 522 aa10.65□□□□□ -0.7
THBS1-201ENST00000260356 OR52R1Q8NGF1 315 aa10.65□□□□□ -0.7
THBS1-201ENST00000260356 TMIGD2Q96BF3 282 aa10.65□□□□□ -0.7
THBS1-201ENST00000260356 MED17Q9NVC6 651 aa10.65□□□□□ -0.7
THBS1-201ENST00000260356 TIMM8AO60220 97 aaPredicted RBP10.65□□□□□ -0.7
THBS1-201ENST00000260356 ADAM23O75077 832 aa10.65□□□□□ -0.7
THBS1-201ENST00000260356 SDC1P18827 310 aa10.65□□□□□ -0.7
THBS1-201ENST00000260356 HTR5AP47898 357 aa10.65□□□□□ -0.7
THBS1-201ENST00000260356 C18orf21Q32NC0 220 aaPredicted RBP10.65□□□□□ -0.7
THBS1-201ENST00000260356 CBARPQ8N350 705 aaPredicted RBP10.65□□□□□ -0.7
THBS1-201ENST00000260356 WDTC1Q8N5D0 677 aa10.65□□□□□ -0.7
THBS1-201ENST00000260356 OR10K1Q8NGX5 313 aa10.65□□□□□ -0.7
THBS1-201ENST00000260356 OR7D2Q96RA2 312 aa10.65□□□□□ -0.7
THBS1-201ENST00000260356 C1GALT1Q9NS00 363 aa10.65□□□□□ -0.7
THBS1-201ENST00000260356 CAMK2AQ9UQM7 478 aa10.65□□□□□ -0.7
THBS1-201ENST00000260356 NSG1A0A0A6YYJ2 146 aa10.65□□□□□ -0.7
THBS1-201ENST00000260356 TRBV11-1A0A0K0K1C0 115 aa10.65□□□□□ -0.7
THBS1-201ENST00000260356 GABRR3A8MPY1 467 aa10.65□□□□□ -0.7
THBS1-201ENST00000260356 CD46P15529 392 aa10.65□□□□□ -0.7
THBS1-201ENST00000260356 GPLD1P80108 840 aa10.65□□□□□ -0.7
THBS1-201ENST00000260356 SORDQ00796 357 aa10.65□□□□□ -0.7
THBS1-201ENST00000260356 RANBP10Q6VN20 620 aa10.65□□□□□ -0.7
THBS1-201ENST00000260356 MCATQ8IVS2 390 aaKnown RBP10.65□□□□□ -0.7
THBS1-201ENST00000260356 CNTN4Q8IWV2 1026 aa10.65□□□□□ -0.7
THBS1-201ENST00000260356 ENTHD1Q8IYW4 607 aa10.65□□□□□ -0.7
THBS1-201ENST00000260356 PXT1Q8NFP0 134 aa10.65□□□□□ -0.7
THBS1-201ENST00000260356 TPPP3Q9BW30 176 aa10.65□□□□□ -0.7
THBS1-201ENST00000260356 A0A0B4J2A0 478 aa10.65□□□□□ -0.7
THBS1-201ENST00000260356 CLDN24A6NM45 220 aa10.65□□□□□ -0.7
THBS1-201ENST00000260356 FRS3O43559 492 aa10.65□□□□□ -0.7
THBS1-201ENST00000260356 MRPL33O75394 65 aaKnown RBP10.65□□□□□ -0.7
THBS1-201ENST00000260356 MT-ND4LP03901 98 aa10.65□□□□□ -0.7
THBS1-201ENST00000260356 IQCF3P0C7M6 154 aa10.65□□□□□ -0.7
THBS1-201ENST00000260356 GDF1P27539 372 aa10.65□□□□□ -0.7
THBS1-201ENST00000260356 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP10.65□□□□□ -0.7
THBS1-201ENST00000260356 OR7E24Q6IFN5 339 aa10.65□□□□□ -0.7
THBS1-201ENST00000260356 PIWIL3Q7Z3Z3 882 aaKnown RBP10.65□□□□□ -0.7
THBS1-201ENST00000260356 FAM122AQ96E09 287 aa10.65□□□□□ -0.7
THBS1-201ENST00000260356 BORCS6Q96GS4 357 aa10.65□□□□□ -0.7
THBS1-201ENST00000260356 SHPKQ9UHJ6 478 aa10.65□□□□□ -0.7
THBS1-201ENST00000260356 OR5K3A6NET4 321 aa10.65□□□□□ -0.7
THBS1-201ENST00000260356 DVL1O14640 695 aa10.65□□□□□ -0.7
THBS1-201ENST00000260356 C1orf105O95561 183 aa10.65□□□□□ -0.7
THBS1-201ENST00000260356 GPX3P22352 226 aa10.65□□□□□ -0.7
THBS1-201ENST00000260356 GABRA4P48169 554 aa10.65□□□□□ -0.7
THBS1-201ENST00000260356 DVL1P1P54792 670 aaPredicted RBP10.65□□□□□ -0.7
THBS1-201ENST00000260356 KCNJ8Q15842 424 aa10.65□□□□□ -0.7
THBS1-201ENST00000260356 ALKAL2Q6UX46 152 aa10.65□□□□□ -0.7
THBS1-201ENST00000260356 LMO3Q8TAP4 145 aa10.65□□□□□ -0.7
THBS1-201ENST00000260356 SLC30A3Q99726 388 aa10.65□□□□□ -0.7
THBS1-201ENST00000260356 OSGIN1Q9UJX0 560 aa10.65□□□□□ -0.7
THBS1-201ENST00000260356 CBLCQ9ULV8 474 aa10.65□□□□□ -0.7
THBS1-201ENST00000260356 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa10.65□□□□□ -0.7
THBS1-201ENST00000260356 MROH6A6NGR9 719 aa10.65□□□□□ -0.71
THBS1-201ENST00000260356 IKZF1Q13422 519 aa10.65□□□□□ -0.71
THBS1-201ENST00000260356 BCL7AQ4VC05 210 aa10.65□□□□□ -0.71
THBS1-201ENST00000260356 AVPI1Q5T686 147 aa10.65□□□□□ -0.71
THBS1-201ENST00000260356 IL34Q6ZMJ4 242 aa10.65□□□□□ -0.71
THBS1-201ENST00000260356 DBX2Q6ZNG2 339 aa10.65□□□□□ -0.71
THBS1-201ENST00000260356 SLC16A14Q7RTX9 510 aa10.65□□□□□ -0.71
THBS1-201ENST00000260356 SSUH2Q9Y2M2 353 aa10.65□□□□□ -0.71
THBS1-201ENST00000260356 GPR45Q9Y5Y3 372 aa10.65□□□□□ -0.71
THBS1-201ENST00000260356 PSMB1P20618 241 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
THBS1-201ENST00000260356 IL3RAP26951 378 aa10.64□□□□□ -0.71
THBS1-201ENST00000260356 C21orf33P30042 268 aaPredicted RBP10.64□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.6 ms