RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000155840.9

KCNQ1-201, Transcript of potassium voltage-gated channel subfamily Q member 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene KCNQ1, Length 3,245 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ1-201ENST00000155840 LRIT1Q9P2V4 623 aa15.93■□□□□ 0.14
KCNQ1-201ENST00000155840 ST6GALNAC2Q9UJ37 374 aa15.93■□□□□ 0.14
KCNQ1-201ENST00000155840 ZNF223Q9UK11 482 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
KCNQ1-201ENST00000155840 OR10H1Q9Y4A9 318 aa15.93■□□□□ 0.14
KCNQ1-201ENST00000155840 TRANK1O15050 2925 aa15.93■□□□□ 0.14
KCNQ1-201ENST00000155840 MEIKINA0A087WXM9 373 aa15.93■□□□□ 0.14
KCNQ1-201ENST00000155840 DEFA5Q01523 94 aa15.93■□□□□ 0.14
KCNQ1-201ENST00000155840 CDK5R1Q15078 307 aa15.93■□□□□ 0.14
KCNQ1-201ENST00000155840 PCGF3Q3KNV8 242 aa15.93■□□□□ 0.14
KCNQ1-201ENST00000155840 DMKNQ6E0U4 476 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
KCNQ1-201ENST00000155840 ETFBKMTQ8IXQ9 262 aa15.93■□□□□ 0.14
KCNQ1-201ENST00000155840 PRR22Q8IZ63 422 aa15.93■□□□□ 0.14
KCNQ1-201ENST00000155840 SFXN5Q8TD22 340 aa15.93■□□□□ 0.14
KCNQ1-201ENST00000155840 STK35Q8TDR2 534 aa15.93■□□□□ 0.14
KCNQ1-201ENST00000155840 GFI1Q99684 422 aa15.93■□□□□ 0.14
KCNQ1-201ENST00000155840 NCDNQ9UBB6 729 aa15.93■□□□□ 0.14
KCNQ1-201ENST00000155840 CDC14CA4D256 554 aa15.92■□□□□ 0.14
KCNQ1-201ENST00000155840 FAM25EA8MYX2 175 aa15.92■□□□□ 0.14
KCNQ1-201ENST00000155840 KHNYNO15037 678 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
KCNQ1-201ENST00000155840 LPLP06858 475 aa15.92■□□□□ 0.14
KCNQ1-201ENST00000155840 ERGP11308 486 aa15.92■□□□□ 0.14
KCNQ1-201ENST00000155840 NID1P14543 1247 aa15.92■□□□□ 0.14
KCNQ1-201ENST00000155840 MAOBP27338 520 aa15.92■□□□□ 0.14
KCNQ1-201ENST00000155840 KLF9Q13886 244 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
KCNQ1-201ENST00000155840 MLC1Q15049 377 aa15.92■□□□□ 0.14
KCNQ1-201ENST00000155840 C4orf46Q504U0 113 aa15.92■□□□□ 0.14
KCNQ1-201ENST00000155840 DCAF12L2Q5VW00 463 aa15.92■□□□□ 0.14
KCNQ1-201ENST00000155840 ELP2Q6IA86 826 aa15.92■□□□□ 0.14
KCNQ1-201ENST00000155840 ADAMTSL4Q6UY14 1074 aa15.92■□□□□ 0.14
KCNQ1-201ENST00000155840 IDO2Q6ZQW0 420 aa15.92■□□□□ 0.14
KCNQ1-201ENST00000155840 GLB1L2Q8IW92 636 aa15.92■□□□□ 0.14
KCNQ1-201ENST00000155840 AHCYL2Q96HN2 611 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
KCNQ1-201ENST00000155840 ADAD1Q96M93 576 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
KCNQ1-201ENST00000155840 DMRTA2Q96SC8 542 aa15.92■□□□□ 0.14
KCNQ1-201ENST00000155840 CNN2Q99439 309 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
KCNQ1-201ENST00000155840 SLC17A9Q9BYT1 436 aa15.92■□□□□ 0.14
KCNQ1-201ENST00000155840 TCF7L1Q9HCS4 588 aa15.92■□□□□ 0.14
KCNQ1-201ENST00000155840 SDHAF2Q9NX18 166 aa15.92■□□□□ 0.14
KCNQ1-201ENST00000155840 SCP2D1Q9UJQ7 156 aa15.92■□□□□ 0.14
KCNQ1-201ENST00000155840 SULT1A3P0DMM9 295 aa15.92■□□□□ 0.14
KCNQ1-201ENST00000155840 SULT1A4P0DMN0 295 aa15.92■□□□□ 0.14
KCNQ1-201ENST00000155840 IGFALSP35858 605 aa15.92■□□□□ 0.14
KCNQ1-201ENST00000155840 EFNB2P52799 333 aa15.92■□□□□ 0.14
KCNQ1-201ENST00000155840 TNFRSF17Q02223 184 aa15.92■□□□□ 0.14
KCNQ1-201ENST00000155840 OR10K2Q6IF99 312 aa15.92■□□□□ 0.14
KCNQ1-201ENST00000155840 TTLQ8NG68 377 aa15.92■□□□□ 0.14
KCNQ1-201ENST00000155840 OR51D1Q8NGF3 324 aa15.92■□□□□ 0.14
KCNQ1-201ENST00000155840 FCAMRQ8WWV6 532 aa15.92■□□□□ 0.14
KCNQ1-201ENST00000155840 ATOH1Q92858 354 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
KCNQ1-201ENST00000155840 PTDSS2Q9BVG9 487 aa15.92■□□□□ 0.14
KCNQ1-201ENST00000155840 RSPH9Q9H1X1 276 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
KCNQ1-201ENST00000155840 MOKQ9UQ07 419 aa15.92■□□□□ 0.14
KCNQ1-201ENST00000155840 FARSAQ9Y285 508 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
KCNQ1-201ENST00000155840 KLHDC2Q9Y2U9 406 aa15.92■□□□□ 0.14
KCNQ1-201ENST00000155840 G3V3Q6 166 aa15.92■□□□□ 0.14
KCNQ1-201ENST00000155840 CCSO14618 274 aa15.92■□□□□ 0.14
KCNQ1-201ENST00000155840 TBX19O60806 448 aa15.92■□□□□ 0.14
KCNQ1-201ENST00000155840 KRT33AO76009 404 aa15.92■□□□□ 0.14
KCNQ1-201ENST00000155840 CFL1P23528 166 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
KCNQ1-201ENST00000155840 GJA4P35212 333 aa15.92■□□□□ 0.14
KCNQ1-201ENST00000155840 TMEM52BQ4KMG9 183 aa15.92■□□□□ 0.14
KCNQ1-201ENST00000155840 GPALPP1Q8IXQ4 340 aa15.92■□□□□ 0.14
KCNQ1-201ENST00000155840 GJD3Q8N144 294 aa15.92■□□□□ 0.14
KCNQ1-201ENST00000155840 LSMEM1Q8N8F7 131 aa15.92■□□□□ 0.14
KCNQ1-201ENST00000155840 OR6M1Q8NGM8 313 aa15.92■□□□□ 0.14
KCNQ1-201ENST00000155840 SPPL3Q8TCT6 385 aa15.92■□□□□ 0.14
KCNQ1-201ENST00000155840 OR1E3Q8WZA6 343 aa15.92■□□□□ 0.14
KCNQ1-201ENST00000155840 FAM3CQ92520 227 aa15.92■□□□□ 0.14
KCNQ1-201ENST00000155840 SLC25A38Q96DW6 304 aa15.92■□□□□ 0.14
KCNQ1-201ENST00000155840 SEC22AQ96IW7 307 aa15.92■□□□□ 0.14
KCNQ1-201ENST00000155840 CCDC3Q9BQI4 270 aa15.92■□□□□ 0.14
KCNQ1-201ENST00000155840 DAPP1Q9UN19 280 aa15.92■□□□□ 0.14
KCNQ1-201ENST00000155840 H0YGG7 62 aa15.91■□□□□ 0.14
KCNQ1-201ENST00000155840 DCTN6O00399 190 aa15.91■□□□□ 0.14
KCNQ1-201ENST00000155840 NFATC1O95644 943 aa15.91■□□□□ 0.14
KCNQ1-201ENST00000155840 ATP1B1P05026 303 aa15.91■□□□□ 0.14
KCNQ1-201ENST00000155840 ARF3P61204 181 aaPredicted RBP15.91■□□□□ 0.14
KCNQ1-201ENST00000155840 GAS6Q14393 721 aa15.91■□□□□ 0.14
KCNQ1-201ENST00000155840 SLC6A19Q695T7 634 aa15.91■□□□□ 0.14
KCNQ1-201ENST00000155840 TMEM81Q6P7N7 255 aa15.91■□□□□ 0.14
KCNQ1-201ENST00000155840 LSM14AQ8ND56 463 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
KCNQ1-201ENST00000155840 OR6N2Q8NGY6 317 aa15.91■□□□□ 0.14
KCNQ1-201ENST00000155840 OR4C3Q8NH37 302 aa15.91■□□□□ 0.14
KCNQ1-201ENST00000155840 BRIX1Q8TDN6 353 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
KCNQ1-201ENST00000155840 LMAN2LQ9H0V9 348 aa15.91■□□□□ 0.14
KCNQ1-201ENST00000155840 ZNF230Q9UIE0 474 aaPredicted RBP15.91■□□□□ 0.14
KCNQ1-201ENST00000155840 FRYLO94915 3013 aa15.91■□□□□ 0.14
KCNQ1-201ENST00000155840 ANXA2P2A6NMY6 339 aa15.91■□□□□ 0.14
KCNQ1-201ENST00000155840 IGKV1D-16P01601 117 aa15.91■□□□□ 0.14
KCNQ1-201ENST00000155840 IFNA16P05015 189 aa15.91■□□□□ 0.14
KCNQ1-201ENST00000155840 HSD17B2P37059 387 aa15.91■□□□□ 0.14
KCNQ1-201ENST00000155840 RPS11P62280 158 aaKnown RBP eCLIP15.91■□□□□ 0.142e-8■■■■■ 63.3
KCNQ1-201ENST00000155840 PITPNAQ00169 270 aa15.91■□□□□ 0.14
KCNQ1-201ENST00000155840 SORDQ00796 357 aa15.91■□□□□ 0.14
KCNQ1-201ENST00000155840 COL28A1Q2UY09 1125 aa15.91■□□□□ 0.14
KCNQ1-201ENST00000155840 ARHGAP11BQ3KRB8 267 aa15.91■□□□□ 0.14
KCNQ1-201ENST00000155840 ATRAIDQ6UW56 229 aa15.91■□□□□ 0.14
KCNQ1-201ENST00000155840 ATXN7L1Q9ULK2 861 aaPredicted RBP15.91■□□□□ 0.14
KCNQ1-201ENST00000155840 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP15.9■□□□□ 0.14
KCNQ1-201ENST00000155840 RNGTTO60942 597 aaKnown RBP15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.6 ms