RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000027009.10

Casp12-201, Transcript of Caspase-12, mouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Casp12, Length 2,649 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Golga7	Q91W53	137 aa		3.68	□□□□□ -1.82
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Prpf19	Q99KP6	504 aa	Known RBP	3.68	□□□□□ -1.82
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Rcbtb2	Q99LJ7	551 aa		3.68	□□□□□ -1.82
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Teddm3	Q9CQH1	294 aa		3.68	□□□□□ -1.82
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Prr23a3	Q9CWP9	254 aa		3.68	□□□□□ -1.82
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Ddx28	Q9CWT6	540 aa	Known RBP	3.68	□□□□□ -1.82
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Prorsd1	Q9D820	169 aa		3.68	□□□□□ -1.82
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Tmem89	Q9DA04	169 aa		3.68	□□□□□ -1.82
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Vmn1r29	Q9EQ41	303 aa		3.68	□□□□□ -1.82
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Scamp2	Q9ERN0	329 aa		3.68	□□□□□ -1.82
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Tmem37	Q9JJV3	211 aa		3.68	□□□□□ -1.82
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Usp19	Q3UJD6	1360 aa		3.68	□□□□□ -1.82
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Baz2a	Q91YE5	1889 aa	Known RBP	3.68	□□□□□ -1.82
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Nktr	P30415	1453 aa		3.68	□□□□□ -1.82
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Slc23a4	A0A0J9YUX7	615 aa		3.68	□□□□□ -1.82
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Otud3	B1AZ99	396 aa		3.68	□□□□□ -1.82
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Gprin2	D3Z1D7	455 aa		3.68	□□□□□ -1.82
Casp12-201	ENSMUST00000027009	1700003H04Rik	E9PXM2	192 aa		3.68	□□□□□ -1.82
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Olfr419	E9Q0Y7	313 aa		3.68	□□□□□ -1.82
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Olfr568	E9Q554	313 aa		3.68	□□□□□ -1.82
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Vmn1r7	E9Q8T0	311 aa		3.68	□□□□□ -1.82
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Gm3424	L7N298	263 aa		3.68	□□□□□ -1.82
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Gm8246	M0QWX9	263 aa		3.68	□□□□□ -1.82
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Hoxc6	P10629	235 aa		3.68	□□□□□ -1.82
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Fgf5	P15656	264 aa		3.68	□□□□□ -1.82
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Alox5ap	P30355	161 aa		3.68	□□□□□ -1.82
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Csk	P41241	450 aa		3.68	□□□□□ -1.82
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Dmwd	Q08274	665 aa		3.68	□□□□□ -1.82
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Bpifa6	Q0VGU8	367 aa		3.68	□□□□□ -1.82
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Treml4	Q3LRV9	263 aa		3.68	□□□□□ -1.82
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Faf2	Q3TDN2	445 aa		3.68	□□□□□ -1.82
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Gm10775	Q3V290	127 aa		3.68	□□□□□ -1.82
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Psg27	Q497W2	474 aa		3.68	□□□□□ -1.82
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Nr2c1	Q505F1	590 aa		3.68	□□□□□ -1.82
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Gpsm1	Q6IR34	673 aa		3.68	□□□□□ -1.82
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Srsf1	Q6PDM2	248 aa	Known RBP	3.68	□□□□□ -1.82
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Paqr6	Q6TCG5	343 aa		3.68	□□□□□ -1.82
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Dnph1	Q80VJ3	173 aa		3.68	□□□□□ -1.82
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Rhot1	Q8BG51	631 aa		3.68	□□□□□ -1.82
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Lair1	Q8BG84	263 aa		3.68	□□□□□ -1.82
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Bricd5	Q8BV89	174 aa		3.68	□□□□□ -1.82
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Dus1l	Q8C2P3	475 aa		3.68	□□□□□ -1.82
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Rnf170	Q8CBG9	286 aa		3.68	□□□□□ -1.82
Casp12-201	ENSMUST00000027009	4932414N04Rik	Q8CEQ9	752 aa		3.68	□□□□□ -1.82
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Btd	Q8CIF4	520 aa		3.68	□□□□□ -1.82
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Stau2	Q8CJ67	570 aa	Known RBP	3.68	□□□□□ -1.82
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Ugt3a2	Q8JZZ0	523 aa		3.68	□□□□□ -1.82
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Ints9	Q8K114	658 aa	Known RBP	3.68	□□□□□ -1.82
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Exd2	Q8VEG4	650 aa	Known RBP	3.68	□□□□□ -1.82
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Olfr1241	Q8VF91	314 aa		3.68	□□□□□ -1.82
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Olfr1378	Q8VGH0	315 aa		3.68	□□□□□ -1.82
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Olfr644	Q8VH21	314 aa		3.68	□□□□□ -1.82
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Trub2	Q91WG3	331 aa	Known RBP	3.68	□□□□□ -1.82
Casp12-201	ENSMUST00000027009	D6Wsu163e	Q91YN0	552 aa		3.68	□□□□□ -1.82
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Tmco1	Q921L3	188 aa	Known RBP	3.68	□□□□□ -1.82
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Txndc9	Q9CQ79	226 aa		3.68	□□□□□ -1.82
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Gje1	Q9CX92	205 aa		3.68	□□□□□ -1.82
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Polr3h	Q9D2C6	204 aa	Known RBP	3.68	□□□□□ -1.82
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Etnk1	Q9D4V0	363 aa		3.68	□□□□□ -1.82
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Prl8a1	Q9DAV8	240 aa		3.68	□□□□□ -1.82
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Hcar2	Q9EP66	360 aa		3.68	□□□□□ -1.82
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Pex3	Q9QXY9	372 aa		3.68	□□□□□ -1.82
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Tsc22d3	Q9Z2S7	137 aa		3.68	□□□□□ -1.82
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Tnr	Q8BYI9	1358 aa		3.68	□□□□□ -1.82
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Triobp	Q99KW3	2014 aa		3.67	□□□□□ -1.82
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Ighv1-7	A0A075B5T7	117 aa		3.67	□□□□□ -1.82
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Olfr1124	A2AT86	318 aa		3.67	□□□□□ -1.82
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Cyp2j12	G3UXT0	502 aa		3.67	□□□□□ -1.82
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Vmn2r97	K7N6Z2	861 aa		3.67	□□□□□ -1.82
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Olfr819	K7N727	320 aa		3.67	□□□□□ -1.82
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Mtco2	P00405	227 aa	Known RBP	3.67	□□□□□ -1.82
Casp12-201	ENSMUST00000027009		P10404	641 aa		3.67	□□□□□ -1.82
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Gstm2	P15626	218 aa		3.67	□□□□□ -1.82
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Krt19	P19001	403 aa		3.67	□□□□□ -1.82
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Fcer1a	P20489	250 aa		3.67	□□□□□ -1.82
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Gdf1	P20863	357 aa		3.67	□□□□□ -1.82
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Cd72	P21855	354 aa		3.67	□□□□□ -1.82
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Il2rg	P34902	369 aa		3.67	□□□□□ -1.82
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Ldlr	P35951	862 aa		3.67	□□□□□ -1.82
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Slc1a3	P56564	543 aa		3.67	□□□□□ -1.82
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Btbd3	P58545	530 aa		3.67	□□□□□ -1.82
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Il11ra2	P70225	432 aa		3.67	□□□□□ -1.82
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Rptn	P97347	1118 aa		3.67	□□□□□ -1.82
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Sox8	Q04886	464 aa		3.67	□□□□□ -1.82
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Sct	Q08535	133 aa		3.67	□□□□□ -1.82
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Medag	Q14BA6	303 aa		3.67	□□□□□ -1.82
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Gm1604b	Q3TRG0	118 aa		3.67	□□□□□ -1.82
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Ahrr	Q3U1U7	701 aa		3.67	□□□□□ -1.82
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Ntn5	Q3UQ22	452 aa		3.67	□□□□□ -1.82
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Tmprss13	Q5U405	543 aa		3.67	□□□□□ -1.82
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Olfr11	Q60890	313 aa		3.67	□□□□□ -1.82
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Hp	Q61646	347 aa		3.67	□□□□□ -1.82
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Zfp82	Q6P9Y7	530 aa		3.67	□□□□□ -1.82
Casp12-201	ENSMUST00000027009	St6gal2	Q76K27	524 aa		3.67	□□□□□ -1.82
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Olfr1148	Q7TR35	314 aa		3.67	□□□□□ -1.82
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Rap2a	Q80ZJ1	183 aa		3.67	□□□□□ -1.82
Casp12-201	ENSMUST00000027009	H2-M10.2	Q85ZW9	329 aa		3.67	□□□□□ -1.82
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Pimreg	Q8BFY7	231 aa		3.67	□□□□□ -1.82
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Bpifb2	Q8C1E1	462 aa		3.67	□□□□□ -1.82
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Ftsj1	Q8CBC7	324 aa		3.67	□□□□□ -1.82

Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 44.8 ms