RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635152.1

BRF1-222, Transcript of BRF1, RNA polymerase III transcription initiation factor subunit, human

TSL 2

Gene BRF1, Length 2,876 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BRF1-222	ENST00000635152	TRAV6	A0A075B6T7	132 aa		11.98	□□□□□ -0.49
BRF1-222	ENST00000635152	TEX13C	A0A0J9YWL9	993 aa		11.98	□□□□□ -0.49
BRF1-222	ENST00000635152	RGS13	O14921	159 aa		11.98	□□□□□ -0.49
BRF1-222	ENST00000635152	ORC5	O43913	435 aa		11.98	□□□□□ -0.49
BRF1-222	ENST00000635152	SOX30	O94993	753 aa		11.98	□□□□□ -0.49
BRF1-222	ENST00000635152	NSA2	O95478	260 aa	Known RBP	11.98	□□□□□ -0.49
BRF1-222	ENST00000635152	YES1	P07947	543 aa		11.98	□□□□□ -0.49
BRF1-222	ENST00000635152	OR2T7	P0C7T2	308 aa		11.98	□□□□□ -0.49
BRF1-222	ENST00000635152	SPI1	P17947	270 aa		11.98	□□□□□ -0.49
BRF1-222	ENST00000635152	NPR2	P20594	1047 aa		11.98	□□□□□ -0.49
BRF1-222	ENST00000635152	OR1D4	P47884	311 aa		11.98	□□□□□ -0.49
BRF1-222	ENST00000635152	CDK5R1	Q15078	307 aa		11.98	□□□□□ -0.49
BRF1-222	ENST00000635152	TRAM1	Q15629	374 aa		11.98	□□□□□ -0.49
BRF1-222	ENST00000635152	DEFB133	Q30KQ1	61 aa		11.98	□□□□□ -0.49
BRF1-222	ENST00000635152	PRAMEF17	Q5VTA0	474 aa		11.98	□□□□□ -0.49
BRF1-222	ENST00000635152	POMZP3	Q6PJE2	187 aa		11.98	□□□□□ -0.49
BRF1-222	ENST00000635152	TPRA1	Q86W33	373 aa		11.98	□□□□□ -0.49
BRF1-222	ENST00000635152	IZUMO1	Q8IYV9	350 aa		11.98	□□□□□ -0.49
BRF1-222	ENST00000635152	OR2T27	Q8NH04	317 aa		11.98	□□□□□ -0.49
BRF1-222	ENST00000635152	SLC2A12	Q8TD20	617 aa		11.98	□□□□□ -0.49
BRF1-222	ENST00000635152	SMIM19	Q96E16	107 aa		11.98	□□□□□ -0.49
BRF1-222	ENST00000635152	RNF170	Q96K19	258 aa		11.98	□□□□□ -0.49
BRF1-222	ENST00000635152		Q96M85	177 aa		11.98	□□□□□ -0.49
BRF1-222	ENST00000635152	UBL7	Q96S82	380 aa	Predicted RBP	11.98	□□□□□ -0.49
BRF1-222	ENST00000635152	KLHDC3	Q9BQ90	382 aa		11.98	□□□□□ -0.49
BRF1-222	ENST00000635152	MARVELD1	Q9BSK0	173 aa		11.98	□□□□□ -0.49
BRF1-222	ENST00000635152	OR8D2	Q9GZM6	311 aa		11.98	□□□□□ -0.49
BRF1-222	ENST00000635152	RPRD1B	Q9NQG5	326 aa	Known RBP	11.98	□□□□□ -0.49
BRF1-222	ENST00000635152		A0A087WV48	116 aa		11.97	□□□□□ -0.49
BRF1-222	ENST00000635152	CDC14C	A4D256	554 aa		11.97	□□□□□ -0.49
BRF1-222	ENST00000635152	ELOA3D	A6NLF2	546 aa	Predicted RBP	11.97	□□□□□ -0.49
BRF1-222	ENST00000635152	EFCAB7	A8K855	629 aa		11.97	□□□□□ -0.49
BRF1-222	ENST00000635152	WNT1	P04628	370 aa		11.97	□□□□□ -0.49
BRF1-222	ENST00000635152	F13B	P05160	661 aa		11.97	□□□□□ -0.49
BRF1-222	ENST00000635152	HLA-DMA	P28067	261 aa		11.97	□□□□□ -0.49
BRF1-222	ENST00000635152	RBMS1	P29558	406 aa	Known RBP	11.97	□□□□□ -0.49
BRF1-222	ENST00000635152	ELOA3B	Q3SY89	546 aa		11.97	□□□□□ -0.49
BRF1-222	ENST00000635152	LEG1	Q6P5S2	330 aa		11.97	□□□□□ -0.49
BRF1-222	ENST00000635152	ZNF615	Q8N8J6	731 aa		11.97	□□□□□ -0.49
BRF1-222	ENST00000635152	ZNF511	Q8NB15	262 aa		11.97	□□□□□ -0.49
BRF1-222	ENST00000635152	ELOA3	Q8NG57	546 aa		11.97	□□□□□ -0.49
BRF1-222	ENST00000635152	KCTD12	Q96CX2	325 aa	Known RBP	11.97	□□□□□ -0.49
BRF1-222	ENST00000635152	MOGAT1	Q96PD6	335 aa		11.97	□□□□□ -0.49
BRF1-222	ENST00000635152	C17orf51	A8MQB3	221 aa		11.97	□□□□□ -0.49
BRF1-222	ENST00000635152	RPP14	O95059	124 aa	Known RBP	11.97	□□□□□ -0.49
BRF1-222	ENST00000635152	CD1C	P29017	333 aa		11.97	□□□□□ -0.49
BRF1-222	ENST00000635152	FUT7	Q11130	342 aa		11.97	□□□□□ -0.49
BRF1-222	ENST00000635152	BCL2L15	Q5TBC7	163 aa		11.97	□□□□□ -0.49
BRF1-222	ENST00000635152	DPY19L2P2	Q6ZN68	376 aa		11.97	□□□□□ -0.49
BRF1-222	ENST00000635152	TTLL10	Q6ZVT0	673 aa		11.97	□□□□□ -0.49
BRF1-222	ENST00000635152	IQCF2	Q8IXL9	164 aa		11.97	□□□□□ -0.49
BRF1-222	ENST00000635152	OR6C4	Q8NGE1	309 aa		11.97	□□□□□ -0.49
BRF1-222	ENST00000635152	ZDHHC19	Q8WVZ1	309 aa	Predicted RBP	11.97	□□□□□ -0.49
BRF1-222	ENST00000635152	TRIM63	Q969Q1	353 aa		11.97	□□□□□ -0.49
BRF1-222	ENST00000635152	ZNF524	Q96C55	264 aa		11.97	□□□□□ -0.49
BRF1-222	ENST00000635152	GAL3ST4	Q96RP7	486 aa		11.97	□□□□□ -0.49
BRF1-222	ENST00000635152	NCDN	Q9UBB6	729 aa		11.97	□□□□□ -0.49
BRF1-222	ENST00000635152	ZNF337	Q9Y3M9	751 aa		11.97	□□□□□ -0.49
BRF1-222	ENST00000635152	IGKV1D-42	A0A075B6H8	117 aa		11.97	□□□□□ -0.49
BRF1-222	ENST00000635152	ACOD1	A6NK06	481 aa		11.97	□□□□□ -0.49
BRF1-222	ENST00000635152	CHURC1-FNTB	B4DL54	471 aa		11.97	□□□□□ -0.49
BRF1-222	ENST00000635152		H3BSH0	61 aa		11.97	□□□□□ -0.49
BRF1-222	ENST00000635152		H7C1C5	153 aa		11.97	□□□□□ -0.49
BRF1-222	ENST00000635152	FLRT2	O43155	660 aa		11.97	□□□□□ -0.49
BRF1-222	ENST00000635152	CD53	P19397	219 aa		11.97	□□□□□ -0.49
BRF1-222	ENST00000635152	EVI2B	P34910	448 aa		11.97	□□□□□ -0.49
BRF1-222	ENST00000635152	FNTB	P49356	437 aa		11.97	□□□□□ -0.49
BRF1-222	ENST00000635152	DIO1	P49895	249 aa		11.97	□□□□□ -0.49
BRF1-222	ENST00000635152	LCN6	P62502	163 aa		11.97	□□□□□ -0.49
BRF1-222	ENST00000635152	ACTA2	P62736	377 aa		11.97	□□□□□ -0.49
BRF1-222	ENST00000635152	ACTG2	P63267	376 aa		11.97	□□□□□ -0.49
BRF1-222	ENST00000635152	LGALS3BP	Q08380	585 aa		11.97	□□□□□ -0.49
BRF1-222	ENST00000635152	APOOL	Q6UXV4	268 aa		11.97	□□□□□ -0.49
BRF1-222	ENST00000635152	PRSS58	Q8IYP2	241 aa		11.97	□□□□□ -0.49
BRF1-222	ENST00000635152	SIX5	Q8N196	739 aa		11.97	□□□□□ -0.49
BRF1-222	ENST00000635152	ZNF671	Q8TAW3	534 aa		11.97	□□□□□ -0.49
BRF1-222	ENST00000635152	NRSN2	Q9GZP1	204 aa		11.97	□□□□□ -0.49
BRF1-222	ENST00000635152	SLC25A18	Q9H1K4	315 aa		11.97	□□□□□ -0.49
BRF1-222	ENST00000635152	NRIP3	Q9NQ35	241 aa		11.97	□□□□□ -0.49
BRF1-222	ENST00000635152	KLHL21	Q9UJP4	597 aa		11.97	□□□□□ -0.49
BRF1-222	ENST00000635152	ARID1B	Q8NFD5	2236 aa	Predicted RBP	11.96	□□□□□ -0.49
BRF1-222	ENST00000635152	CABIN1	Q9Y6J0	2220 aa		11.96	□□□□□ -0.49
BRF1-222	ENST00000635152	PCDH15	Q96QU1	1955 aa		11.96	□□□□□ -0.49
BRF1-222	ENST00000635152	CPNE3	O75131	537 aa	Known RBP	11.96	□□□□□ -0.49
BRF1-222	ENST00000635152	OR7A10	O76100	309 aa		11.96	□□□□□ -0.49
BRF1-222	ENST00000635152	IFI6	P09912	130 aa		11.96	□□□□□ -0.49
BRF1-222	ENST00000635152	EPX	P11678	715 aa		11.96	□□□□□ -0.49
BRF1-222	ENST00000635152	SLC6A1	P30531	599 aa		11.96	□□□□□ -0.49
BRF1-222	ENST00000635152	CDKN2A	P42771	156 aa	Known RBP	11.96	□□□□□ -0.49
BRF1-222	ENST00000635152	GRK6	P43250	576 aa		11.96	□□□□□ -0.49
BRF1-222	ENST00000635152	RPS11	P62280	158 aa	Known RBP eCLIP	11.96	□□□□□ -0.49
BRF1-222	ENST00000635152	IGLV3-21	P80748	117 aa	Predicted RBP	11.96	□□□□□ -0.49
BRF1-222	ENST00000635152	EFR3A	Q14156	821 aa		11.96	□□□□□ -0.49
BRF1-222	ENST00000635152	ELOC	Q15369	112 aa		11.96	□□□□□ -0.49
BRF1-222	ENST00000635152	NTRK2	Q16620	822 aa		11.96	□□□□□ -0.49
BRF1-222	ENST00000635152	SNAP47	Q5SQN1	464 aa		11.96	□□□□□ -0.49
BRF1-222	ENST00000635152	PRSS45	Q7RTY3	260 aa		11.96	□□□□□ -0.49
BRF1-222	ENST00000635152	ZNF433	Q8N7K0	673 aa	Predicted RBP	11.96	□□□□□ -0.49
BRF1-222	ENST00000635152	POMGNT2	Q8NAT1	580 aa		11.96	□□□□□ -0.49
BRF1-222	ENST00000635152	TSTD1	Q8NFU3	115 aa		11.96	□□□□□ -0.49

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