RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000627074.2

PCBP1-AS1-308, PCBP1 antisense RNA 1, human

TSL 5

Gene PCBP1-AS1, Length 871 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	SLC25A43	Q8WUT9	341 aa	Predicted RBP	6.75	□□□□□ -1.33
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	PMM1	Q92871	262 aa		6.75	□□□□□ -1.33
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	UTP4	Q969X6	686 aa	Known RBP	6.75	□□□□□ -1.33
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	WFDC6	Q9BQY6	131 aa		6.75	□□□□□ -1.33
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	CPPED1	Q9BRF8	314 aa	Predicted RBP	6.75	□□□□□ -1.33
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	SLC39A3	Q9BRY0	314 aa		6.75	□□□□□ -1.33
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	MED18	Q9BUE0	208 aa		6.75	□□□□□ -1.33
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	TIGAR	Q9NQ88	270 aa		6.75	□□□□□ -1.33
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	SERINC1	Q9NRX5	453 aa		6.75	□□□□□ -1.33
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	TMEM45A	Q9NWC5	275 aa		6.75	□□□□□ -1.33
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	NDRG3	Q9UGV2	375 aa		6.75	□□□□□ -1.33
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	TMED7	Q9Y3B3	224 aa		6.75	□□□□□ -1.33
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	AKAP6	Q13023	2319 aa		6.75	□□□□□ -1.33
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	ABCA4	P78363	2273 aa		6.74	□□□□□ -1.33
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	IGKV3D-15	A0A087WSY6	115 aa		6.74	□□□□□ -1.33
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074		A0A0G2JND7	137 aa		6.74	□□□□□ -1.33
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	CFAP73	A6NFT4	308 aa		6.74	□□□□□ -1.33
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	ZNF724	A8MTY0	619 aa		6.74	□□□□□ -1.33
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	SULT2B1	O00204	365 aa		6.74	□□□□□ -1.33
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	FBP2	O00757	339 aa		6.74	□□□□□ -1.33
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	ZNF208	O43345	1280 aa		6.74	□□□□□ -1.33
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	TPST1	O60507	370 aa		6.74	□□□□□ -1.33
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	GOSR1	O95249	250 aa		6.74	□□□□□ -1.33
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	PLAU	P00749	431 aa		6.74	□□□□□ -1.33
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	ADA	P00813	363 aa		6.74	□□□□□ -1.33
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	PABPC4L	P0CB38	370 aa	Known RBP	6.74	□□□□□ -1.33
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	TFPI	P10646	304 aa		6.74	□□□□□ -1.33
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	GPX2	P18283	190 aa		6.74	□□□□□ -1.33
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	CD53	P19397	219 aa		6.74	□□□□□ -1.33
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	NCF2	P19878	526 aa	Predicted RBP	6.74	□□□□□ -1.33
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	PSMB1	P20618	241 aa	Known RBP	6.74	□□□□□ -1.33
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	SLC1A3	P43003	542 aa		6.74	□□□□□ -1.33
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	OR3A2	P47893	321 aa		6.74	□□□□□ -1.33
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	POLR2H	P52434	150 aa	Known RBP	6.74	□□□□□ -1.33
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	FOXG1	P55316	489 aa	Predicted RBP	6.74	□□□□□ -1.33
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	HOXC5	Q00444	222 aa		6.74	□□□□□ -1.33
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	GUCY1A3	Q02108	690 aa		6.74	□□□□□ -1.33
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	SF3A3	Q12874	501 aa	Known RBP eCLIP	6.74	□□□□□ -1.33	9e-12	■■□□□ 12.7
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	BNIP2	Q12982	314 aa		6.74	□□□□□ -1.33
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	LIN52	Q52LA3	116 aa		6.74	□□□□□ -1.33
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	RUNDC3A	Q59EK9	446 aa		6.74	□□□□□ -1.33
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	BEND4	Q6ZU67	534 aa		6.74	□□□□□ -1.33
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	ATG4D	Q86TL0	474 aa	Predicted RBP	6.74	□□□□□ -1.33
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	MTDH	Q86UE4	582 aa	Known RBP	6.74	□□□□□ -1.33
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	PTOV1	Q86YD1	416 aa		6.74	□□□□□ -1.33
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	KRTAP1-3	Q8IUG1	177 aa		6.74	□□□□□ -1.33
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	SLC43A2	Q8N370	569 aa		6.74	□□□□□ -1.33
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	NFKBID	Q8NI38	313 aa		6.74	□□□□□ -1.33
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	S100PBP	Q96BU1	408 aa		6.74	□□□□□ -1.33
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	PIK3IP1	Q96FE7	263 aa		6.74	□□□□□ -1.33
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	REXO5	Q96IC2	774 aa	Known RBP	6.74	□□□□□ -1.33
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	FOXC2	Q99958	501 aa		6.74	□□□□□ -1.33
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	TMEM120A	Q9BXJ8	343 aa		6.74	□□□□□ -1.33
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	ACTR6	Q9GZN1	396 aa		6.74	□□□□□ -1.33
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	CALML5	Q9NZT1	146 aa		6.74	□□□□□ -1.33
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	KLHL9	Q9P2J3	617 aa		6.74	□□□□□ -1.33
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	HDGFL3	Q9Y3E1	203 aa		6.74	□□□□□ -1.33
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	MBD3L2B	A0A1B0GVZ6	204 aa	Predicted RBP	6.73	□□□□□ -1.33
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	SHISA3	A0PJX4	238 aa		6.73	□□□□□ -1.33
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	CASK	O14936	926 aa		6.73	□□□□□ -1.33
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	TPST2	O60704	377 aa		6.73	□□□□□ -1.33
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	NPIPB7	O75200	414 aa		6.73	□□□□□ -1.33
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	RAF1	P04049	648 aa		6.73	□□□□□ -1.33
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	CD3E	P07766	207 aa		6.73	□□□□□ -1.33
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	ETS2	P15036	469 aa		6.73	□□□□□ -1.33
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	NAT1	P18440	290 aa		6.73	□□□□□ -1.33
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	FPR1	P21462	350 aa		6.73	□□□□□ -1.33
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	IGHV1-2	P23083	117 aa		6.73	□□□□□ -1.33
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	HTR2A	P28223	471 aa		6.73	□□□□□ -1.33
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	HTR3A	P46098	478 aa		6.73	□□□□□ -1.33
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	CLK1	P49759	484 aa	Known RBP	6.73	□□□□□ -1.33
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	GZMM	P51124	257 aa		6.73	□□□□□ -1.33
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	P2RY4	P51582	365 aa		6.73	□□□□□ -1.33
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	SLC16A1	P53985	500 aa		6.73	□□□□□ -1.33
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	OR2B6	P58173	313 aa		6.73	□□□□□ -1.33
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	MTPN	P58546	118 aa		6.73	□□□□□ -1.33
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	CSNK2A1	P68400	391 aa	Predicted RBP	6.73	□□□□□ -1.33
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	IRX1	P78414	480 aa	Predicted RBP	6.73	□□□□□ -1.33
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	CDK6	Q00534	326 aa		6.73	□□□□□ -1.33
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	EGR4	Q05215	589 aa		6.73	□□□□□ -1.33
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	GNA13	Q14344	377 aa		6.73	□□□□□ -1.33
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	PDK3	Q15120	406 aa		6.73	□□□□□ -1.33
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	TAB1	Q15750	504 aa		6.73	□□□□□ -1.33
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	ZNF311	Q5JNZ3	666 aa		6.73	□□□□□ -1.33
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	GCNT6	Q5T4J0	391 aa		6.73	□□□□□ -1.33
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	PRAMEF8	Q5VWM4	474 aa		6.73	□□□□□ -1.33
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	PRAMEF7	Q5VXH5	474 aa		6.73	□□□□□ -1.33
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	ZNF440	Q8IYI8	595 aa		6.73	□□□□□ -1.33
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	CADM2	Q8N3J6	435 aa		6.73	□□□□□ -1.33
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	DPP10	Q8N608	796 aa		6.73	□□□□□ -1.33
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	BBS10	Q8TAM1	723 aa		6.73	□□□□□ -1.33
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	IGFBPL1	Q8WX77	278 aa		6.73	□□□□□ -1.33
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	C3orf49	Q96BT1	292 aa		6.73	□□□□□ -1.33
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	MBD6	Q96DN6	1003 aa		6.73	□□□□□ -1.33
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	MEGF10	Q96KG7	1140 aa		6.73	□□□□□ -1.33
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	ANKRD27	Q96NW4	1050 aa		6.73	□□□□□ -1.33
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	OR10A4	Q9H209	315 aa		6.73	□□□□□ -1.33
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	RAD21L1	Q9H4I0	556 aa		6.73	□□□□□ -1.33
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	TMEM38A	Q9H6F2	299 aa		6.73	□□□□□ -1.33
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	IFT22	Q9H7X7	185 aa		6.73	□□□□□ -1.33

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