RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000623650.3

SNHG5-217, Transcript of small nucleolar RNA host gene 5, human

TSL 5

Gene SNHG5, Length 886 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNHG5-217	ENST00000623650	DUSP7	Q16829	419 aa		7.38	□□□□□ -1.23
SNHG5-217	ENST00000623650	ENTPD8	Q5MY95	495 aa		7.38	□□□□□ -1.23
SNHG5-217	ENST00000623650	DCST1	Q5T197	706 aa		7.38	□□□□□ -1.23
SNHG5-217	ENST00000623650	TIGD3	Q6B0B8	471 aa		7.38	□□□□□ -1.23
SNHG5-217	ENST00000623650	SPINK14	Q6IE38	97 aa		7.38	□□□□□ -1.23
SNHG5-217	ENST00000623650	OR5M10	Q6IEU7	315 aa		7.38	□□□□□ -1.23
SNHG5-217	ENST00000623650	C3orf33	Q6P1S2	294 aa		7.38	□□□□□ -1.23
SNHG5-217	ENST00000623650	HIST3H2A	Q7L7L0	130 aa		7.38	□□□□□ -1.23
SNHG5-217	ENST00000623650	GRINA	Q7Z429	371 aa		7.38	□□□□□ -1.23
SNHG5-217	ENST00000623650	GALNTL5	Q7Z4T8	443 aa		7.38	□□□□□ -1.23
SNHG5-217	ENST00000623650	MDGA2	Q7Z553	956 aa		7.38	□□□□□ -1.23
SNHG5-217	ENST00000623650	OFCC1	Q8IZS5	231 aa		7.38	□□□□□ -1.23
SNHG5-217	ENST00000623650	ATG16L2	Q8NAA4	619 aa		7.38	□□□□□ -1.23
SNHG5-217	ENST00000623650	OR2M7	Q8NG81	312 aa		7.38	□□□□□ -1.23
SNHG5-217	ENST00000623650	OR10Q1	Q8NGQ4	319 aa		7.38	□□□□□ -1.23
SNHG5-217	ENST00000623650	PIGX	Q8TBF5	258 aa		7.38	□□□□□ -1.23
SNHG5-217	ENST00000623650	SLC25A43	Q8WUT9	341 aa	Predicted RBP	7.38	□□□□□ -1.23
SNHG5-217	ENST00000623650	PSMF1	Q92530	271 aa		7.38	□□□□□ -1.23
SNHG5-217	ENST00000623650	CNOT9	Q92600	299 aa	Known RBP	7.38	□□□□□ -1.23
SNHG5-217	ENST00000623650	HIST1H2AC	Q93077	130 aa		7.38	□□□□□ -1.23
SNHG5-217	ENST00000623650	C1GALT1C1	Q96EU7	318 aa		7.38	□□□□□ -1.23
SNHG5-217	ENST00000623650	SLC41A3	Q96GZ6	507 aa		7.38	□□□□□ -1.23
SNHG5-217	ENST00000623650	CENPN	Q96H22	339 aa	Predicted RBP	7.38	□□□□□ -1.23
SNHG5-217	ENST00000623650	MRGPRX4	Q96LA9	322 aa		7.38	□□□□□ -1.23
SNHG5-217	ENST00000623650	SFXN2	Q96NB2	322 aa		7.38	□□□□□ -1.23
SNHG5-217	ENST00000623650	ZNF300	Q96RE9	604 aa	Predicted RBP	7.38	□□□□□ -1.23
SNHG5-217	ENST00000623650	C9orf16	Q9BUW7	83 aa		7.38	□□□□□ -1.23
SNHG5-217	ENST00000623650	TAPBPL	Q9BX59	468 aa		7.38	□□□□□ -1.23
SNHG5-217	ENST00000623650	TIGAR	Q9NQ88	270 aa		7.38	□□□□□ -1.23
SNHG5-217	ENST00000623650	AGPAT4	Q9NRZ5	378 aa		7.38	□□□□□ -1.23
SNHG5-217	ENST00000623650	RLIM	Q9NVW2	624 aa		7.38	□□□□□ -1.23
SNHG5-217	ENST00000623650	MED11	Q9P086	117 aa		7.38	□□□□□ -1.23
SNHG5-217	ENST00000623650	CDC42EP3	Q9UKI2	254 aa		7.38	□□□□□ -1.23
SNHG5-217	ENST00000623650	CNOT11	Q9UKZ1	510 aa	Known RBP	7.38	□□□□□ -1.23
SNHG5-217	ENST00000623650	VDAC3	Q9Y277	283 aa		7.38	□□□□□ -1.23
SNHG5-217	ENST00000623650	B3GNT3	Q9Y2A9	372 aa		7.38	□□□□□ -1.23
SNHG5-217	ENST00000623650	C15orf41	Q9Y2V0	281 aa		7.38	□□□□□ -1.23
SNHG5-217	ENST00000623650	MED31	Q9Y3C7	131 aa		7.38	□□□□□ -1.23
SNHG5-217	ENST00000623650	HTR3E	A5X5Y0	456 aa		7.37	□□□□□ -1.23
SNHG5-217	ENST00000623650	EIF4E1B	A6NMX2	242 aa	Known RBP	7.37	□□□□□ -1.23
SNHG5-217	ENST00000623650	FAM166B	A8MTA8	275 aa		7.37	□□□□□ -1.23
SNHG5-217	ENST00000623650	FAAH	O00519	579 aa		7.37	□□□□□ -1.23
SNHG5-217	ENST00000623650	FRS3	O43559	492 aa		7.37	□□□□□ -1.23
SNHG5-217	ENST00000623650	CHP2	O43745	196 aa		7.37	□□□□□ -1.23
SNHG5-217	ENST00000623650	OR10H3	O60404	316 aa		7.37	□□□□□ -1.23
SNHG5-217	ENST00000623650	MT-ND1	P03886	318 aa		7.37	□□□□□ -1.23
SNHG5-217	ENST00000623650	PLA2G1B	P04054	148 aa	Known RBP	7.37	□□□□□ -1.23
SNHG5-217	ENST00000623650	ZNF17	P17021	662 aa		7.37	□□□□□ -1.23
SNHG5-217	ENST00000623650	TNFRSF1B	P20333	461 aa		7.37	□□□□□ -1.23
SNHG5-217	ENST00000623650	FPR1	P21462	350 aa		7.37	□□□□□ -1.23
SNHG5-217	ENST00000623650	TCEA1	P23193	301 aa	Known RBP	7.37	□□□□□ -1.23
SNHG5-217	ENST00000623650	ELK4	P28324	431 aa		7.37	□□□□□ -1.23
SNHG5-217	ENST00000623650	SRD5A2	P31213	254 aa		7.37	□□□□□ -1.23
SNHG5-217	ENST00000623650	APOBEC1	P41238	236 aa	Known RBP	7.37	□□□□□ -1.23
SNHG5-217	ENST00000623650	RBM34	P42696	430 aa	Known RBP	7.37	□□□□□ -1.23
SNHG5-217	ENST00000623650	YAP1	P46937	504 aa	Known RBP	7.37	□□□□□ -1.23
SNHG5-217	ENST00000623650	TPD52	P55327	224 aa	Predicted RBP	7.37	□□□□□ -1.23
SNHG5-217	ENST00000623650	RPS3A	P61247	264 aa	Known RBP	7.37	□□□□□ -1.23
SNHG5-217	ENST00000623650	RBPJ	Q06330	500 aa		7.37	□□□□□ -1.23
SNHG5-217	ENST00000623650	CD69	Q07108	199 aa		7.37	□□□□□ -1.23
SNHG5-217	ENST00000623650	SELENBP1	Q13228	472 aa		7.37	□□□□□ -1.23
SNHG5-217	ENST00000623650	SF3B4	Q15427	424 aa	Known RBP eCLIP	7.37	□□□□□ -1.23
SNHG5-217	ENST00000623650	CD226	Q15762	336 aa		7.37	□□□□□ -1.23
SNHG5-217	ENST00000623650	ATP6AP1	Q15904	470 aa		7.37	□□□□□ -1.23
SNHG5-217	ENST00000623650	ST3GAL2	Q16842	350 aa		7.37	□□□□□ -1.23
SNHG5-217	ENST00000623650	PRR31	Q5SQ13	230 aa		7.37	□□□□□ -1.23
SNHG5-217	ENST00000623650	PIWIL3	Q7Z3Z3	882 aa	Known RBP	7.37	□□□□□ -1.23
SNHG5-217	ENST00000623650	PQLC1	Q8N2U9	271 aa		7.37	□□□□□ -1.23
SNHG5-217	ENST00000623650	CLIP4	Q8N3C7	705 aa		7.37	□□□□□ -1.23
SNHG5-217	ENST00000623650	FAM109A	Q8N4B1	249 aa		7.37	□□□□□ -1.23
SNHG5-217	ENST00000623650	OR6T1	Q8NGN1	323 aa		7.37	□□□□□ -1.23
SNHG5-217	ENST00000623650	ADAMTS16	Q8TE57	1224 aa		7.37	□□□□□ -1.23
SNHG5-217	ENST00000623650	DNAJC9	Q8WXX5	260 aa		7.37	□□□□□ -1.23
SNHG5-217	ENST00000623650	ARSG	Q96EG1	525 aa		7.37	□□□□□ -1.23
SNHG5-217	ENST00000623650	OSBPL10	Q9BXB5	764 aa		7.37	□□□□□ -1.23
SNHG5-217	ENST00000623650	PRRG3	Q9BZD7	231 aa		7.37	□□□□□ -1.23
SNHG5-217	ENST00000623650	RNPEPL1	Q9HAU8	725 aa		7.37	□□□□□ -1.23
SNHG5-217	ENST00000623650	C12orf10	Q9HB07	376 aa		7.37	□□□□□ -1.23
SNHG5-217	ENST00000623650	CTPS2	Q9NRF8	586 aa		7.37	□□□□□ -1.23
SNHG5-217	ENST00000623650	MED17	Q9NVC6	651 aa		7.37	□□□□□ -1.23
SNHG5-217	ENST00000623650	QPCTL	Q9NXS2	382 aa		7.37	□□□□□ -1.23
SNHG5-217	ENST00000623650	FLRT3	Q9NZU0	649 aa		7.37	□□□□□ -1.23
SNHG5-217	ENST00000623650	RIMS3	Q9UJD0	308 aa		7.37	□□□□□ -1.23
SNHG5-217	ENST00000623650	SLC7A7	Q9UM01	511 aa		7.37	□□□□□ -1.23
SNHG5-217	ENST00000623650	CHD6	Q8TD26	2715 aa		7.36	□□□□□ -1.23
SNHG5-217	ENST00000623650	IGLV3-32	A0A0A0MS00	114 aa		7.36	□□□□□ -1.23
SNHG5-217	ENST00000623650		A0A1B0GWA3	101 aa		7.36	□□□□□ -1.23
SNHG5-217	ENST00000623650	CLDN24	A6NM45	220 aa		7.36	□□□□□ -1.23
SNHG5-217	ENST00000623650		G3V2T6	193 aa		7.36	□□□□□ -1.23
SNHG5-217	ENST00000623650	TPST2	O60704	377 aa		7.36	□□□□□ -1.23
SNHG5-217	ENST00000623650	NEURL1	O76050	574 aa		7.36	□□□□□ -1.23
SNHG5-217	ENST00000623650	OR6A2	O95222	327 aa		7.36	□□□□□ -1.23
SNHG5-217	ENST00000623650	LY86	O95711	162 aa		7.36	□□□□□ -1.23
SNHG5-217	ENST00000623650	SAG	P10523	405 aa	Predicted RBP	7.36	□□□□□ -1.23
SNHG5-217	ENST00000623650	ANPEP	P15144	967 aa		7.36	□□□□□ -1.23
SNHG5-217	ENST00000623650	CCNA2	P20248	432 aa		7.36	□□□□□ -1.23
SNHG5-217	ENST00000623650	GSTM3	P21266	225 aa		7.36	□□□□□ -1.23
SNHG5-217	ENST00000623650	RAD23A	P54725	363 aa		7.36	□□□□□ -1.23
SNHG5-217	ENST00000623650	CASP6	P55212	293 aa		7.36	□□□□□ -1.23
SNHG5-217	ENST00000623650	VLDLR	P98155	873 aa		7.36	□□□□□ -1.23

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.5 ms