RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000623495.1

LETMD1-238, Transcript of LETM1 domain containing 1, human

Gene LETMD1, Length 2,948 nt, Biotype TEC.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LETMD1-238	ENST00000623495	TWIST2	Q8WVJ9	160 aa		6.66	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	MS4A6E	Q96DS6	147 aa		6.66	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	C1QTNF6	Q9BXI9	259 aa		6.66	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	SLC29A3	Q9BZD2	475 aa		6.66	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	GPR61	Q9BZJ8	451 aa		6.66	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	TSPAN10	Q9H1Z9	355 aa	Predicted RBP	6.66	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	MIEF1	Q9NQG6	463 aa		6.66	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	DMRT3	Q9NQL9	472 aa		6.66	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	PPP4R1L	Q9P1A2	415 aa		6.66	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	PLXNB3	Q9ULL4	1909 aa		6.65	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	TEX13C	A0A0J9YWL9	993 aa		6.65	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	CDRT15L2	A8MXV6	281 aa		6.65	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	INMT-MINDY4	F8WBC2	141 aa		6.65	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	MANBA	O00462	879 aa		6.65	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	PGRMC2	O15173	223 aa		6.65	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	TMPRSS11D	O60235	418 aa		6.65	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	CREG1	O75629	220 aa		6.65	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	GADD45G	O95257	159 aa		6.65	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	MLYCD	O95822	493 aa		6.65	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	MT-ND1	P03886	318 aa		6.65	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	NMB	P08949	121 aa		6.65	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	FGF5	P12034	268 aa		6.65	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	STAT5A	P42229	794 aa		6.65	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	RORC	P51449	518 aa		6.65	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	REEP5	Q00765	189 aa		6.65	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	LIPE	Q05469	1076 aa		6.65	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	RUNX2	Q13950	521 aa		6.65	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	ZNF800	Q2TB10	664 aa	Predicted RBP eCLIP	6.65	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	CDNF	Q49AH0	187 aa		6.65	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	KLHL22	Q53GT1	634 aa		6.65	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	KHDRBS2	Q5VWX1	349 aa	Known RBP	6.65	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	CD276	Q5ZPR3	534 aa		6.65	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	PRICKLE2	Q7Z3G6	844 aa		6.65	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	COMMD6	Q7Z4G1	85 aa		6.65	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	ANKRD46	Q86W74	232 aa		6.65	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	KMT5C	Q86Y97	462 aa		6.65	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	SKA3	Q8IX90	412 aa		6.65	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	MFSD9	Q8NBP5	474 aa		6.65	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	UPRT	Q96BW1	309 aa		6.65	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	SFXN2	Q96NB2	322 aa		6.65	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	CHCHD6	Q9BRQ6	235 aa		6.65	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	ACPT	Q9BZG2	426 aa		6.65	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	SEMA4C	Q9C0C4	833 aa		6.65	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	ACTR6	Q9GZN1	396 aa		6.65	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	OR51E2	Q9H255	320 aa		6.65	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	SLAMF7	Q9NQ25	335 aa		6.65	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	P4HTM	Q9NXG6	502 aa		6.65	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	PLA2G3	Q9NZ20	509 aa		6.65	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	VPS29	Q9UBQ0	182 aa		6.65	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	AASS	Q9UDR5	926 aa		6.65	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	KCND3	Q9UK17	655 aa		6.65	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	DNAJC15	Q9Y5T4	150 aa		6.65	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	CLCA3P	Q9Y6N3	262 aa		6.65	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	SPEN	Q96T58	3664 aa	Known RBP	6.65	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	HEATR5B	Q9P2D3	2071 aa		6.65	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	C9orf170	A2RU37	121 aa		6.65	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	FAM234B	A2RU67	622 aa		6.65	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	T	O15178	435 aa		6.65	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	TOX3	O15405	576 aa	Predicted RBP	6.65	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	PCDH7	O60245	1069 aa		6.65	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	ANKRD34C	P0C6C1	535 aa		6.65	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	ERG	P11308	486 aa		6.65	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	CYP4B1	P13584	511 aa		6.65	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	NT5E	P21589	574 aa		6.65	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	GPX3	P22352	226 aa		6.65	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	TACR1	P25103	407 aa		6.65	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	CALCR	P30988	508 aa		6.65	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	RGS6	P49758	472 aa		6.65	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	HSPB3	Q12988	150 aa		6.65	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	RTP5	Q14D33	572 aa		6.65	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	MAD2L1BP	Q15013	274 aa	Predicted RBP	6.65	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	RFTN2	Q52LD8	501 aa	Predicted RBP	6.65	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	TRIQK	Q629K1	86 aa		6.65	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	HAGHL	Q6PII5	290 aa	Predicted RBP	6.65	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	C3P1	Q6ZMU1	363 aa		6.65	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	FUNDC1	Q8IVP5	155 aa		6.65	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	TMEM132C	Q8N3T6	1108 aa		6.65	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	KDF1	Q8NAX2	398 aa	Predicted RBP	6.65	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	ZNF527	Q8NB42	609 aa		6.65	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	CLEC1A	Q8NC01	280 aa		6.65	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	OR11H4	Q8NGC9	324 aa		6.65	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	OR4K1	Q8NGD4	311 aa		6.65	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	POP5	Q969H6	163 aa	Known RBP	6.65	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	C3orf30	Q96M34	536 aa		6.65	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	KCNC2	Q96PR1	638 aa		6.65	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	SERINC2	Q96SA4	455 aa		6.65	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	VRK1	Q99986	396 aa	Predicted RBP	6.65	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	WDR77	Q9BQA1	342 aa	Predicted RBP	6.65	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	NTMT1	Q9BV86	223 aa		6.65	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	VN1R1	Q9GZP7	353 aa		6.65	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	AICDA	Q9GZX7	198 aa		6.65	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	FN3K	Q9H479	309 aa		6.65	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	DLGAP4	Q9Y2H0	992 aa		6.65	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	MAP4K5	Q9Y4K4	846 aa		6.65	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	CFAP46	Q8IYW2	2715 aa		6.65	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	TP53BP1	Q12888	1972 aa	Predicted RBP	6.64	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	MED13	Q9UHV7	2174 aa		6.64	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	FABP12	A6NFH5	140 aa		6.64	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	NR5A2	O00482	541 aa		6.64	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	ZNHIT1	O43257	154 aa		6.64	□□□□□ -1.35

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