RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613995.4

PDE4DIP-240, Transcript of phosphodiesterase 4D interacting protein, human

TSL 5

Gene PDE4DIP, Length 569 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PDE4DIP-240	ENST00000613995	SP5	Q6BEB4	398 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
PDE4DIP-240	ENST00000613995	DLEU7	Q6UYE1	221 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PDE4DIP-240	ENST00000613995	ZNF836	Q6ZNA1	936 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PDE4DIP-240	ENST00000613995	SPATA21	Q7Z572	469 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PDE4DIP-240	ENST00000613995	CPLX4	Q7Z7G2	160 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PDE4DIP-240	ENST00000613995	GGN	Q86UU5	652 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PDE4DIP-240	ENST00000613995	VRK2	Q86Y07	508 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PDE4DIP-240	ENST00000613995	LIX1L	Q8IVB5	337 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PDE4DIP-240	ENST00000613995	GCNT2	Q8N0V5	402 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PDE4DIP-240	ENST00000613995	C10orf111	Q8N326	155 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PDE4DIP-240	ENST00000613995	DPP10	Q8N608	796 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PDE4DIP-240	ENST00000613995	CNEP1R1	Q8N9A8	125 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PDE4DIP-240	ENST00000613995	C9orf106	Q8NAJ2	232 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PDE4DIP-240	ENST00000613995	NAXE	Q8NCW5	288 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PDE4DIP-240	ENST00000613995	OR8H1	Q8NGG4	311 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PDE4DIP-240	ENST00000613995	OR52P1P	Q8NH57	321 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PDE4DIP-240	ENST00000613995	OR5W2	Q8NH69	310 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PDE4DIP-240	ENST00000613995	LILRB4	Q8NHJ6	448 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PDE4DIP-240	ENST00000613995	ZNF563	Q8TA94	476 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PDE4DIP-240	ENST00000613995	GPR119	Q8TDV5	335 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PDE4DIP-240	ENST00000613995	C10orf82	Q8WW14	230 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PDE4DIP-240	ENST00000613995	ZNF524	Q96C55	264 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PDE4DIP-240	ENST00000613995	INTS12	Q96CB8	462 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
PDE4DIP-240	ENST00000613995	DNAJA3	Q96EY1	480 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PDE4DIP-240	ENST00000613995	TMEM19	Q96HH6	336 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PDE4DIP-240	ENST00000613995	ZNF845	Q96IR2	970 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
PDE4DIP-240	ENST00000613995	MOGAT1	Q96PD6	335 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PDE4DIP-240	ENST00000613995	CPPED1	Q9BRF8	314 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
PDE4DIP-240	ENST00000613995	SLC39A3	Q9BRY0	314 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PDE4DIP-240	ENST00000613995	JAM3	Q9BX67	310 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PDE4DIP-240	ENST00000613995	PINK1	Q9BXM7	581 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PDE4DIP-240	ENST00000613995	PRRG4	Q9BZD6	226 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PDE4DIP-240	ENST00000613995	NSRP1	Q9H0G5	558 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
PDE4DIP-240	ENST00000613995	CALHM2	Q9HA72	323 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PDE4DIP-240	ENST00000613995	A4GALT	Q9NPC4	353 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PDE4DIP-240	ENST00000613995	RASSF1	Q9NS23	344 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PDE4DIP-240	ENST00000613995	ACER3	Q9NUN7	267 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PDE4DIP-240	ENST00000613995	RLIM	Q9NVW2	624 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PDE4DIP-240	ENST00000613995	THUMPD1	Q9NXG2	353 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
PDE4DIP-240	ENST00000613995	CLCF1	Q9UBD9	225 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PDE4DIP-240	ENST00000613995	CORO2B	Q9UQ03	480 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PDE4DIP-240	ENST00000613995	ZNF443	Q9Y2A4	671 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
PDE4DIP-240	ENST00000613995	SLC35A3	Q9Y2D2	325 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PDE4DIP-240	ENST00000613995	AP4B1	Q9Y6B7	739 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PDE4DIP-240	ENST00000613995	FBN2	P35556	2912 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PDE4DIP-240	ENST00000613995	FLNA	P21333	2647 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
PDE4DIP-240	ENST00000613995	PDZD2	O15018	2839 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PDE4DIP-240	ENST00000613995	DSCAM	O60469	2012 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PDE4DIP-240	ENST00000613995	TNFSF12-TNFSF13	A0A0A6YY99	330 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PDE4DIP-240	ENST00000613995		A0A0G2JPF8	293 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PDE4DIP-240	ENST00000613995		A0A0J9YW62	118 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PDE4DIP-240	ENST00000613995	TCRBV5S2	A0A599	114 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PDE4DIP-240	ENST00000613995	CDHR4	A6H8M9	788 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PDE4DIP-240	ENST00000613995	GMNC	A6NCL1	334 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PDE4DIP-240	ENST00000613995	MBD3L4	A6NDZ8	208 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
PDE4DIP-240	ENST00000613995	MBD3L3	A6NE82	208 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
PDE4DIP-240	ENST00000613995	CFAP73	A6NFT4	308 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PDE4DIP-240	ENST00000613995	MBD3L5	A6NJ08	208 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
PDE4DIP-240	ENST00000613995	HNRNPCL2	B2RXH8	293 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PDE4DIP-240	ENST00000613995	HNRNPCL3	B7ZW38	293 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PDE4DIP-240	ENST00000613995	EEF1E1-BLOC1S5	C9J1V9	151 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PDE4DIP-240	ENST00000613995	MRAS	O14807	208 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PDE4DIP-240	ENST00000613995	EEF1E1	O43324	174 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
PDE4DIP-240	ENST00000613995	FRS3	O43559	492 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PDE4DIP-240	ENST00000613995	EFNA2	O43921	213 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PDE4DIP-240	ENST00000613995	CXCL13	O43927	109 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PDE4DIP-240	ENST00000613995	HNRNPCL1	O60812	293 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
PDE4DIP-240	ENST00000613995	PGM3	O95394	542 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PDE4DIP-240	ENST00000613995	SYNGR4	O95473	234 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PDE4DIP-240	ENST00000613995	C8B	P07358	591 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PDE4DIP-240	ENST00000613995	HNRNPCL4	P0DMR1	293 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PDE4DIP-240	ENST00000613995	TFPI	P10646	304 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PDE4DIP-240	ENST00000613995	COX6B1	P14854	86 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PDE4DIP-240	ENST00000613995	DRD4	P21917	467 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PDE4DIP-240	ENST00000613995	RPS4Y1	P22090	263 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
PDE4DIP-240	ENST00000613995	SLC6A2	P23975	617 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PDE4DIP-240	ENST00000613995	CTSS	P25774	331 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PDE4DIP-240	ENST00000613995	SLC7A1	P30825	629 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PDE4DIP-240	ENST00000613995	UQCRC1	P31930	480 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PDE4DIP-240	ENST00000613995	CEACAM8	P31997	349 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
PDE4DIP-240	ENST00000613995	TIMP3	P35625	211 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PDE4DIP-240	ENST00000613995	SLC6A8	P48029	635 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PDE4DIP-240	ENST00000613995	CARD18	P57730	90 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PDE4DIP-240	ENST00000613995	SIRPA	P78324	504 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PDE4DIP-240	ENST00000613995	CDK6	Q00534	326 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PDE4DIP-240	ENST00000613995	CYLC2	Q14093	348 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
PDE4DIP-240	ENST00000613995	SCARB2	Q14108	478 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PDE4DIP-240	ENST00000613995	PON3	Q15166	354 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PDE4DIP-240	ENST00000613995	MAPRE2	Q15555	327 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PDE4DIP-240	ENST00000613995	TRMT5	Q32P41	509 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
PDE4DIP-240	ENST00000613995	SLC25A35	Q3KQZ1	300 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PDE4DIP-240	ENST00000613995	TMEM176B	Q3YBM2	270 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
PDE4DIP-240	ENST00000613995	LIN52	Q52LA3	116 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PDE4DIP-240	ENST00000613995	FBLN7	Q53RD9	439 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PDE4DIP-240	ENST00000613995	RUNDC3A	Q59EK9	446 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PDE4DIP-240	ENST00000613995	ZNF311	Q5JNZ3	666 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PDE4DIP-240	ENST00000613995	PDSS1	Q5T2R2	415 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PDE4DIP-240	ENST00000613995	REP15	Q6BDI9	236 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PDE4DIP-240	ENST00000613995	REEP3	Q6NUK4	255 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PDE4DIP-240	ENST00000613995	MEX3B	Q6ZN04	569 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67

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