RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000612229.4

PTPRT-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type T, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRT, Length 11,285 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRT-209ENST00000612229 G3V2L1 256 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRT-209ENST00000612229 PHOX2AO14813 284 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRT-209ENST00000612229 B4GALT2O60909 372 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRT-209ENST00000612229 ZNF728P0DKX0 622 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRT-209ENST00000612229 ACP2P11117 423 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRT-209ENST00000612229 CPN1P15169 458 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRT-209ENST00000612229 SOX18P35713 384 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRT-209ENST00000612229 NDUFA6P56556 154 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRT-209ENST00000612229 WDR5P61964 334 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
PTPRT-209ENST00000612229 RPS27LQ71UM5 84 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
PTPRT-209ENST00000612229 CLDN22Q8N7P3 220 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRT-209ENST00000612229 TMEM175Q9BSA9 504 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRT-209ENST00000612229 WASH4PA8MWX3 477 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRT-209ENST00000612229 BAXQ07812 192 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRT-209ENST00000612229 C3orf38Q5JPI3 329 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRT-209ENST00000612229 ADGRG5Q8IZF4 528 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRT-209ENST00000612229 KCNJ15Q99712 375 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRT-209ENST00000612229 H0Y8G0 127 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRT-209ENST00000612229 AGPAT2O15120 278 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRT-209ENST00000612229 S1PR4O95977 384 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRT-209ENST00000612229 CTRB1P17538 263 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRT-209ENST00000612229 GGT5P36269 586 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRT-209ENST00000612229 RFX2P48378 723 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRT-209ENST00000612229 MEOX1P50221 254 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRT-209ENST00000612229 SEC13P55735 322 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRT-209ENST00000612229 DHODHQ02127 395 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRT-209ENST00000612229 SGCAQ16586 387 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRT-209ENST00000612229 CTRB2Q6GPI1 263 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRT-209ENST00000612229 RGMBQ6NW40 437 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRT-209ENST00000612229 SDSLQ96GA7 329 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRT-209ENST00000612229 DHRS4Q9BTZ2 278 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRT-209ENST00000612229 V9GY05 133 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRT-209ENST00000612229 AADACP22760 399 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRT-209ENST00000612229 ACVRL1P37023 503 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRT-209ENST00000612229 NKPD1Q17RQ9 610 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRT-209ENST00000612229 CLEC12BQ2HXU8 276 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRT-209ENST00000612229 PLCXD3Q63HM9 321 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRT-209ENST00000612229 OR4C11Q6IEV9 310 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRT-209ENST00000612229 IL20RBQ6UXL0 311 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRT-209ENST00000612229 LRRC56Q8IYG6 542 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
PTPRT-209ENST00000612229 OR10K1Q8NGX5 313 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRT-209ENST00000612229 TMIGD2Q96BF3 282 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRT-209ENST00000612229 BORCS6Q96GS4 357 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRT-209ENST00000612229 FBRSL1Q9HCM7 1045 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
PTPRT-209ENST00000612229 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRT-209ENST00000612229 TRBV23OR9-2A0A075B6M9 112 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRT-209ENST00000612229 SLC9B1P1A6NJY1 282 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRT-209ENST00000612229 YIF1AO95070 293 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRT-209ENST00000612229 LALBAP00709 142 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRT-209ENST00000612229 C8orf89P0DMQ9 161 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRT-209ENST00000612229 SELEP16581 610 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRT-209ENST00000612229 INHBCP55103 352 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRT-209ENST00000612229 HIST1H3AP68431 136 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRT-209ENST00000612229 ZNF805Q5CZA5 627 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRT-209ENST00000612229 DTX3Q8N9I9 347 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRT-209ENST00000612229 NETO1Q8TDF5 533 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRT-209ENST00000612229 NMNAT1Q9HAN9 279 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
PTPRT-209ENST00000612229 HRASLSQ9HDD0 168 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRT-209ENST00000612229 DCAF16Q9NXF7 216 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRT-209ENST00000612229 ZNF281Q9Y2X9 895 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRT-209ENST00000612229 A3GALT2U3KPV4 340 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRT-209ENST00000612229 HSFX4A0A1B0GTS1 333 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
PTPRT-209ENST00000612229 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
PTPRT-209ENST00000612229 CTXN2P0C2S0 81 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRT-209ENST00000612229 MAT2AP31153 395 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
PTPRT-209ENST00000612229 TMEM115Q12893 351 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
PTPRT-209ENST00000612229 VAMP3Q15836 100 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRT-209ENST00000612229 CRTC1Q6UUV9 634 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRT-209ENST00000612229 OR4K5Q8NGD3 323 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRT-209ENST00000612229 OR5M3Q8NGP4 307 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRT-209ENST00000612229 RAB3CQ96E17 227 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRT-209ENST00000612229 SLC6A18Q96N87 628 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRT-209ENST00000612229 JAM3Q9BX67 310 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRT-209ENST00000612229 METTL17Q9H7H0 456 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
PTPRT-209ENST00000612229 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
PTPRT-209ENST00000612229 SLC11A1P49279 550 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRT-209ENST00000612229 OR4D1Q15615 310 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRT-209ENST00000612229 SCLYQ96I15 445 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRT-209ENST00000612229 CIB3Q96Q77 187 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
PTPRT-209ENST00000612229 PRTFDC1Q9NRG1 225 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRT-209ENST00000612229 DNAJC15Q9Y5T4 150 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRT-209ENST00000612229 CACNG3O60359 315 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRT-209ENST00000612229 OR10J4P0C629 311 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRT-209ENST00000612229 TMEM225BP0DP42 221 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRT-209ENST00000612229 TNFSF8P32971 234 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRT-209ENST00000612229 RING1Q06587 406 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRT-209ENST00000612229 DGAT2L6Q6ZPD8 337 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRT-209ENST00000612229 CLDN19Q8N6F1 224 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRT-209ENST00000612229 OR13D1Q8NGV5 346 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRT-209ENST00000612229 SLC41A2Q96JW4 573 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRT-209ENST00000612229 LMF1Q96S06 567 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRT-209ENST00000612229 XYLT2Q9H1B5 865 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRT-209ENST00000612229 NECAP2Q9NVZ3 263 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRT-209ENST00000612229 MRPS16Q9Y3D3 137 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
PTPRT-209ENST00000612229 ZNF337Q9Y3M9 751 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRT-209ENST00000612229 STYXL1Q9Y6J8 313 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRT-209ENST00000612229 ARAP2Q8WZ64 1704 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRT-209ENST00000612229 SPINT2O43291 252 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRT-209ENST00000612229 NDUFB2O95178 105 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRT-209ENST00000612229 DDOSTP39656 456 aa6.53□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.8 ms