RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000601392.5

CELF4-222, Transcript of CUGBP Elav-like family member 4, human

TSL 1 (best)

Gene CELF4, Length 989 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CELF4-222	ENST00000601392	C1orf140	Q5VVS0	124 aa		11.51	□□□□□ -0.57
CELF4-222	ENST00000601392	KRT80	Q6KB66	452 aa		11.51	□□□□□ -0.57
CELF4-222	ENST00000601392	SLC22A16	Q86VW1	577 aa		11.51	□□□□□ -0.57
CELF4-222	ENST00000601392	PFN4	Q8NHR9	129 aa		11.51	□□□□□ -0.57
CELF4-222	ENST00000601392	MFSD8	Q8NHS3	518 aa		11.51	□□□□□ -0.57
CELF4-222	ENST00000601392	OSTF1	Q92882	214 aa		11.51	□□□□□ -0.57
CELF4-222	ENST00000601392	FAM46A	Q96IP4	442 aa	Known RBP	11.51	□□□□□ -0.57
CELF4-222	ENST00000601392	JSRP1	Q96MG2	331 aa	Predicted RBP	11.51	□□□□□ -0.57
CELF4-222	ENST00000601392	MBOAT4	Q96T53	435 aa		11.51	□□□□□ -0.57
CELF4-222	ENST00000601392	PITX2	Q99697	317 aa		11.51	□□□□□ -0.57
CELF4-222	ENST00000601392	TTTY12	Q9BZ98	90 aa		11.51	□□□□□ -0.57
CELF4-222	ENST00000601392	ZNF703	Q9H7S9	590 aa	Predicted RBP	11.51	□□□□□ -0.57
CELF4-222	ENST00000601392	FKRP	Q9H9S5	495 aa		11.51	□□□□□ -0.57
CELF4-222	ENST00000601392	ZNF229	Q9UJW7	825 aa		11.51	□□□□□ -0.57
CELF4-222	ENST00000601392	DKKL1	Q9UK85	242 aa		11.51	□□□□□ -0.57
CELF4-222	ENST00000601392	SIGLEC7	Q9Y286	467 aa		11.51	□□□□□ -0.57
CELF4-222	ENST00000601392	HDGFL3	Q9Y3E1	203 aa		11.51	□□□□□ -0.57
CELF4-222	ENST00000601392	ZNF337	Q9Y3M9	751 aa		11.51	□□□□□ -0.57
CELF4-222	ENST00000601392	SPTBN1	Q01082	2364 aa	Known RBP	11.51	□□□□□ -0.57
CELF4-222	ENST00000601392	SPEN	Q96T58	3664 aa	Known RBP	11.51	□□□□□ -0.57
CELF4-222	ENST00000601392	UTP20	O75691	2785 aa	Known RBP	11.5	□□□□□ -0.57
CELF4-222	ENST00000601392		A0A0G2JMM0	328 aa		11.5	□□□□□ -0.57
CELF4-222	ENST00000601392		A0A1W2PPB8	328 aa		11.5	□□□□□ -0.57
CELF4-222	ENST00000601392		A0A1W2PRS3	328 aa		11.5	□□□□□ -0.57
CELF4-222	ENST00000601392	PINLYP	A6NC86	204 aa		11.5	□□□□□ -0.57
CELF4-222	ENST00000601392	GJE1	A6NN92	205 aa		11.5	□□□□□ -0.57
CELF4-222	ENST00000601392	ENO4	A6NNW6	628 aa		11.5	□□□□□ -0.57
CELF4-222	ENST00000601392	ZAR1L	A6NP61	321 aa		11.5	□□□□□ -0.57
CELF4-222	ENST00000601392	KIR3DP1	A8MWS1	328 aa		11.5	□□□□□ -0.57
CELF4-222	ENST00000601392		G3V3Y1	287 aa		11.5	□□□□□ -0.57
CELF4-222	ENST00000601392	CDC42EP2	O14613	210 aa		11.5	□□□□□ -0.57
CELF4-222	ENST00000601392	GMFG	O60234	142 aa		11.5	□□□□□ -0.57
CELF4-222	ENST00000601392	PIP5K1C	O60331	668 aa		11.5	□□□□□ -0.57
CELF4-222	ENST00000601392	HCN1	O60741	890 aa		11.5	□□□□□ -0.57
CELF4-222	ENST00000601392	TNFAIP8	O95379	198 aa		11.5	□□□□□ -0.57
CELF4-222	ENST00000601392	AHSA1	O95433	338 aa		11.5	□□□□□ -0.57
CELF4-222	ENST00000601392	BGLAP	P02818	100 aa		11.5	□□□□□ -0.57
CELF4-222	ENST00000601392	RFPL3S	P0C7P2	107 aa		11.5	□□□□□ -0.57
CELF4-222	ENST00000601392	ASAH2B	P0C7U1	165 aa		11.5	□□□□□ -0.57
CELF4-222	ENST00000601392	GIPR	P48546	466 aa		11.5	□□□□□ -0.57
CELF4-222	ENST00000601392	MEOX1	P50221	254 aa		11.5	□□□□□ -0.57
CELF4-222	ENST00000601392	B3GALT5-AS1	P59052	145 aa		11.5	□□□□□ -0.57
CELF4-222	ENST00000601392	PRPS1	P60891	318 aa		11.5	□□□□□ -0.57
CELF4-222	ENST00000601392	RPS4X	P62701	263 aa	Known RBP	11.5	□□□□□ -0.57
CELF4-222	ENST00000601392	CDK5	Q00535	292 aa		11.5	□□□□□ -0.57
CELF4-222	ENST00000601392	FOXD4	Q12950	439 aa	Predicted RBP	11.5	□□□□□ -0.57
CELF4-222	ENST00000601392	PTGES3	Q15185	160 aa	Known RBP	11.5	□□□□□ -0.57
CELF4-222	ENST00000601392	INA	Q16352	499 aa		11.5	□□□□□ -0.57
CELF4-222	ENST00000601392	EIF2S3L	Q2VIR3	472 aa	Known RBP	11.5	□□□□□ -0.57
CELF4-222	ENST00000601392	ZIK1	Q3SY52	487 aa	Predicted RBP	11.5	□□□□□ -0.57
CELF4-222	ENST00000601392	ZBED5	Q49AG3	693 aa		11.5	□□□□□ -0.57
CELF4-222	ENST00000601392	SYT14P1	Q58G82	188 aa		11.5	□□□□□ -0.57
CELF4-222	ENST00000601392	TMEM154	Q6P9G4	183 aa		11.5	□□□□□ -0.57
CELF4-222	ENST00000601392	MAMDC2	Q7Z304	686 aa	Predicted RBP	11.5	□□□□□ -0.57
CELF4-222	ENST00000601392	SLC46A3	Q7Z3Q1	461 aa		11.5	□□□□□ -0.57
CELF4-222	ENST00000601392	GALNT5	Q7Z7M9	940 aa		11.5	□□□□□ -0.57
CELF4-222	ENST00000601392	OAF	Q86UD1	273 aa		11.5	□□□□□ -0.57
CELF4-222	ENST00000601392	TRUB1	Q8WWH5	349 aa	Known RBP	11.5	□□□□□ -0.57
CELF4-222	ENST00000601392	PTDSS2	Q9BVG9	487 aa		11.5	□□□□□ -0.57
CELF4-222	ENST00000601392	NANS	Q9NR45	359 aa		11.5	□□□□□ -0.57
CELF4-222	ENST00000601392	KLHL1	Q9NR64	748 aa		11.5	□□□□□ -0.57
CELF4-222	ENST00000601392	CORIN	Q9Y5Q5	1042 aa		11.5	□□□□□ -0.57
CELF4-222	ENST00000601392	CDH10	Q9Y6N8	788 aa		11.5	□□□□□ -0.57
CELF4-222	ENST00000601392	OR2M5	A3KFT3	312 aa		11.49	□□□□□ -0.57
CELF4-222	ENST00000601392	FTCDNL1	E5RQL4	147 aa		11.49	□□□□□ -0.57
CELF4-222	ENST00000601392	ACOT7	O00154	380 aa		11.49	□□□□□ -0.57
CELF4-222	ENST00000601392	DNPH1	O43598	174 aa		11.49	□□□□□ -0.57
CELF4-222	ENST00000601392	CH25H	O95992	272 aa		11.49	□□□□□ -0.57
CELF4-222	ENST00000601392	SAG	P10523	405 aa	Predicted RBP	11.49	□□□□□ -0.57
CELF4-222	ENST00000601392	BMP7	P18075	431 aa		11.49	□□□□□ -0.57
CELF4-222	ENST00000601392	MYF6	P23409	242 aa		11.49	□□□□□ -0.57
CELF4-222	ENST00000601392	GDF1	P27539	372 aa		11.49	□□□□□ -0.57
CELF4-222	ENST00000601392	GGT2	P36268	569 aa		11.49	□□□□□ -0.57
CELF4-222	ENST00000601392	POLR2I	P36954	125 aa	Known RBP	11.49	□□□□□ -0.57
CELF4-222	ENST00000601392	GFRA1	P56159	465 aa		11.49	□□□□□ -0.57
CELF4-222	ENST00000601392	IL1RL1	Q01638	556 aa		11.49	□□□□□ -0.57
CELF4-222	ENST00000601392	LTB	Q06643	244 aa		11.49	□□□□□ -0.57
CELF4-222	ENST00000601392	FHL1	Q13642	323 aa		11.49	□□□□□ -0.57
CELF4-222	ENST00000601392	SLC10A1	Q14973	349 aa		11.49	□□□□□ -0.57
CELF4-222	ENST00000601392	BCL2A1	Q16548	175 aa		11.49	□□□□□ -0.57
CELF4-222	ENST00000601392	ZNF239	Q16600	458 aa	Known RBP	11.49	□□□□□ -0.57
CELF4-222	ENST00000601392	SLX4IP	Q5VYV7	408 aa		11.49	□□□□□ -0.57
CELF4-222	ENST00000601392	SMARCD3	Q6STE5	483 aa		11.49	□□□□□ -0.57
CELF4-222	ENST00000601392	UGT2A3	Q6UWM9	527 aa		11.49	□□□□□ -0.57
CELF4-222	ENST00000601392	ZNF620	Q6ZNG0	422 aa		11.49	□□□□□ -0.57
CELF4-222	ENST00000601392	PNPLA5	Q7Z6Z6	429 aa	Predicted RBP	11.49	□□□□□ -0.57
CELF4-222	ENST00000601392	CHERP	Q8IWX8	916 aa	Known RBP	11.49	□□□□□ -0.57
CELF4-222	ENST00000601392	FAM109A	Q8N4B1	249 aa		11.49	□□□□□ -0.57
CELF4-222	ENST00000601392	TMEM251	Q8N6I4	163 aa		11.49	□□□□□ -0.57
CELF4-222	ENST00000601392	SCAI	Q8N9R8	606 aa		11.49	□□□□□ -0.57
CELF4-222	ENST00000601392	SETD9	Q8NE22	299 aa		11.49	□□□□□ -0.57
CELF4-222	ENST00000601392	FAM83F	Q8NEG4	500 aa	Predicted RBP	11.49	□□□□□ -0.57
CELF4-222	ENST00000601392	CYGB	Q8WWM9	190 aa		11.49	□□□□□ -0.57
CELF4-222	ENST00000601392	TAAR8	Q969N4	342 aa		11.49	□□□□□ -0.57
CELF4-222	ENST00000601392	KTI12	Q96EK9	354 aa	Predicted RBP	11.49	□□□□□ -0.57
CELF4-222	ENST00000601392	NPAS1	Q99742	590 aa		11.49	□□□□□ -0.57
CELF4-222	ENST00000601392	TEX12	Q9BXU0	123 aa		11.49	□□□□□ -0.57
CELF4-222	ENST00000601392	HES7	Q9BYE0	225 aa		11.49	□□□□□ -0.57
CELF4-222	ENST00000601392	NDEL1	Q9GZM8	345 aa		11.49	□□□□□ -0.57
CELF4-222	ENST00000601392	RIBC2	Q9H4K1	309 aa		11.49	□□□□□ -0.57

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.4 ms