RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000600393.1

FCHO1-233, Transcript of FCH domain only 1, human

TSL 4

Gene FCHO1, Length 597 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FCHO1-233	ENST00000600393	FAAH	O00519	579 aa		11.28	□□□□□ -0.6
FCHO1-233	ENST00000600393	CD5L	O43866	347 aa		11.28	□□□□□ -0.6
FCHO1-233	ENST00000600393	EIF1B	O60739	113 aa	Known RBP	11.28	□□□□□ -0.6
FCHO1-233	ENST00000600393	KRT75	O95678	551 aa		11.28	□□□□□ -0.6
FCHO1-233	ENST00000600393	CXCR1	P25024	350 aa		11.28	□□□□□ -0.6
FCHO1-233	ENST00000600393	ANXA11	P50995	505 aa	Known RBP	11.28	□□□□□ -0.6
FCHO1-233	ENST00000600393	P2RY4	P51582	365 aa		11.28	□□□□□ -0.6
FCHO1-233	ENST00000600393	DSTN	P60981	165 aa		11.28	□□□□□ -0.6
FCHO1-233	ENST00000600393	TUBA1B	P68363	451 aa		11.28	□□□□□ -0.6
FCHO1-233	ENST00000600393	TUBA4A	P68366	448 aa		11.28	□□□□□ -0.6
FCHO1-233	ENST00000600393	GNA13	Q14344	377 aa		11.28	□□□□□ -0.6
FCHO1-233	ENST00000600393	LIN52	Q52LA3	116 aa		11.28	□□□□□ -0.6
FCHO1-233	ENST00000600393	PDCD4	Q53EL6	469 aa	Known RBP	11.28	□□□□□ -0.6
FCHO1-233	ENST00000600393	C6orf10	Q5SRN2	563 aa		11.28	□□□□□ -0.6
FCHO1-233	ENST00000600393	TUBA1A	Q71U36	451 aa		11.28	□□□□□ -0.6
FCHO1-233	ENST00000600393	LINGO2	Q7L985	606 aa		11.28	□□□□□ -0.6
FCHO1-233	ENST00000600393	AAED1	Q7RTV5	226 aa		11.28	□□□□□ -0.6
FCHO1-233	ENST00000600393	CROCCP2	Q86T23	111 aa		11.28	□□□□□ -0.6
FCHO1-233	ENST00000600393	COMTD1	Q86VU5	262 aa		11.28	□□□□□ -0.6
FCHO1-233	ENST00000600393	KIRREL3	Q8IZU9	778 aa		11.28	□□□□□ -0.6
FCHO1-233	ENST00000600393	FBXL14	Q8N1E6	418 aa		11.28	□□□□□ -0.6
FCHO1-233	ENST00000600393	MAL2	Q969L2	176 aa		11.28	□□□□□ -0.6
FCHO1-233	ENST00000600393	TMEM19	Q96HH6	336 aa		11.28	□□□□□ -0.6
FCHO1-233	ENST00000600393	RADIL	Q96JH8	1075 aa		11.28	□□□□□ -0.6
FCHO1-233	ENST00000600393	NAA11	Q9BSU3	229 aa	Predicted RBP	11.28	□□□□□ -0.6
FCHO1-233	ENST00000600393	RSPO3	Q9BXY4	272 aa	Predicted RBP	11.28	□□□□□ -0.6
FCHO1-233	ENST00000600393	MANSC1	Q9H8J5	431 aa		11.28	□□□□□ -0.6
FCHO1-233	ENST00000600393	TPT1P8	Q9HAU6	139 aa		11.28	□□□□□ -0.6
FCHO1-233	ENST00000600393	BARX1	Q9HBU1	254 aa	Predicted RBP	11.28	□□□□□ -0.6
FCHO1-233	ENST00000600393	SEC14L4	Q9UDX3	406 aa		11.28	□□□□□ -0.6
FCHO1-233	ENST00000600393	DCTN4	Q9UJW0	460 aa		11.28	□□□□□ -0.6
FCHO1-233	ENST00000600393	MOK	Q9UQ07	419 aa		11.28	□□□□□ -0.6
FCHO1-233	ENST00000600393	MGAT4B	Q9UQ53	548 aa		11.28	□□□□□ -0.6
FCHO1-233	ENST00000600393	YLPM1	P49750	1951 aa	Known RBP	11.28	□□□□□ -0.6
FCHO1-233	ENST00000600393	MALRD1	Q5VYJ5	2156 aa		11.27	□□□□□ -0.6
FCHO1-233	ENST00000600393	SLC22A3	O75751	556 aa		11.27	□□□□□ -0.61
FCHO1-233	ENST00000600393	ANP32D	O95626	131 aa		11.27	□□□□□ -0.61
FCHO1-233	ENST00000600393	LGI1	O95970	557 aa		11.27	□□□□□ -0.61
FCHO1-233	ENST00000600393	GPI	P06744	558 aa		11.27	□□□□□ -0.61
FCHO1-233	ENST00000600393	IDO1	P14902	403 aa		11.27	□□□□□ -0.61
FCHO1-233	ENST00000600393	MPG	P29372	298 aa		11.27	□□□□□ -0.61
FCHO1-233	ENST00000600393	SELENOP	P49908	381 aa		11.27	□□□□□ -0.61
FCHO1-233	ENST00000600393	MAGOH	P61326	146 aa	Known RBP	11.27	□□□□□ -0.61
FCHO1-233	ENST00000600393	ATG16L1	Q676U5	607 aa		11.27	□□□□□ -0.61
FCHO1-233	ENST00000600393	OR7E24	Q6IFN5	339 aa		11.27	□□□□□ -0.61
FCHO1-233	ENST00000600393	SLC2A7	Q6PXP3	512 aa		11.27	□□□□□ -0.61
FCHO1-233	ENST00000600393	GLB1L3	Q8NCI6	653 aa	Predicted RBP	11.27	□□□□□ -0.61
FCHO1-233	ENST00000600393	PMM1	Q92871	262 aa		11.27	□□□□□ -0.61
FCHO1-233	ENST00000600393	TMEM45B	Q96B21	275 aa		11.27	□□□□□ -0.61
FCHO1-233	ENST00000600393	C3orf49	Q96BT1	292 aa		11.27	□□□□□ -0.61
FCHO1-233	ENST00000600393	MAEL	Q96JY0	434 aa	Known RBP	11.27	□□□□□ -0.61
FCHO1-233	ENST00000600393	ADAD1	Q96M93	576 aa	Known RBP	11.27	□□□□□ -0.61
FCHO1-233	ENST00000600393	GRIP2	Q9C0E4	1043 aa		11.27	□□□□□ -0.61
FCHO1-233	ENST00000600393	VIPAS39	Q9H9C1	493 aa		11.27	□□□□□ -0.61
FCHO1-233	ENST00000600393	SEC61A2	Q9H9S3	476 aa		11.27	□□□□□ -0.61
FCHO1-233	ENST00000600393	RNF212B	A8MTL3	300 aa		11.26	□□□□□ -0.61
FCHO1-233	ENST00000600393	TMEM229A	B2RXF0	380 aa		11.26	□□□□□ -0.61
FCHO1-233	ENST00000600393	NR5A2	O00482	541 aa		11.26	□□□□□ -0.61
FCHO1-233	ENST00000600393	TLX2	O43763	284 aa	Predicted RBP	11.26	□□□□□ -0.61
FCHO1-233	ENST00000600393	IFNA2	P01563	188 aa		11.26	□□□□□ -0.61
FCHO1-233	ENST00000600393	IL6	P05231	212 aa		11.26	□□□□□ -0.61
FCHO1-233	ENST00000600393	TFPT	P0C1Z6	253 aa		11.26	□□□□□ -0.61
FCHO1-233	ENST00000600393	UQCRB	P14927	111 aa		11.26	□□□□□ -0.61
FCHO1-233	ENST00000600393	NCF2	P19878	526 aa	Predicted RBP	11.26	□□□□□ -0.61
FCHO1-233	ENST00000600393	FKBP2	P26885	142 aa	Known RBP	11.26	□□□□□ -0.61
FCHO1-233	ENST00000600393	POLR2J	P52435	117 aa	Known RBP	11.26	□□□□□ -0.61
FCHO1-233	ENST00000600393	CRISP3	P54108	245 aa		11.26	□□□□□ -0.61
FCHO1-233	ENST00000600393	TXNL4A	P83876	142 aa	Known RBP	11.26	□□□□□ -0.61
FCHO1-233	ENST00000600393	NRF1	Q16656	503 aa		11.26	□□□□□ -0.61
FCHO1-233	ENST00000600393	RNF220	Q5VTB9	566 aa		11.26	□□□□□ -0.61
FCHO1-233	ENST00000600393	C1orf140	Q5VVS0	124 aa		11.26	□□□□□ -0.61
FCHO1-233	ENST00000600393	PRAMEF8	Q5VWM4	474 aa		11.26	□□□□□ -0.61
FCHO1-233	ENST00000600393	PRAMEF7	Q5VXH5	474 aa		11.26	□□□□□ -0.61
FCHO1-233	ENST00000600393	WBP2NL	Q6ICG8	309 aa		11.26	□□□□□ -0.61
FCHO1-233	ENST00000600393	CLEC2A	Q6UVW9	174 aa		11.26	□□□□□ -0.61
FCHO1-233	ENST00000600393	ZNF440	Q8IYI8	595 aa		11.26	□□□□□ -0.61
FCHO1-233	ENST00000600393	C10orf111	Q8N326	155 aa		11.26	□□□□□ -0.61
FCHO1-233	ENST00000600393	KDM8	Q8N371	416 aa		11.26	□□□□□ -0.61
FCHO1-233	ENST00000600393	OR10H5	Q8NGA6	315 aa		11.26	□□□□□ -0.61
FCHO1-233	ENST00000600393	FBXO17	Q96EF6	278 aa		11.26	□□□□□ -0.61
FCHO1-233	ENST00000600393	ITCH	Q96J02	903 aa		11.26	□□□□□ -0.61
FCHO1-233	ENST00000600393	RHNO1	Q9BSD3	238 aa		11.26	□□□□□ -0.61
FCHO1-233	ENST00000600393	PAIP1	Q9H074	479 aa	Known RBP	11.26	□□□□□ -0.61
FCHO1-233	ENST00000600393	SDR39U1	Q9NRG7	319 aa	Predicted RBP	11.26	□□□□□ -0.61
FCHO1-233	ENST00000600393	PARPBP	Q9NWS1	579 aa		11.26	□□□□□ -0.61
FCHO1-233	ENST00000600393	ZIM2	Q9NZV7	527 aa		11.26	□□□□□ -0.61
FCHO1-233	ENST00000600393	AMDHD2	Q9Y303	409 aa		11.26	□□□□□ -0.61
FCHO1-233	ENST00000600393		A0A096LPE4	126 aa		11.25	□□□□□ -0.61
FCHO1-233	ENST00000600393	IGHV1-18	A0A0C4DH31	117 aa		11.25	□□□□□ -0.61
FCHO1-233	ENST00000600393		A0A1W2PPZ6	126 aa		11.25	□□□□□ -0.61
FCHO1-233	ENST00000600393	UBD	O15205	165 aa		11.25	□□□□□ -0.61
FCHO1-233	ENST00000600393	NPIPB7	O75200	414 aa		11.25	□□□□□ -0.61
FCHO1-233	ENST00000600393	UPK3A	O75631	287 aa		11.25	□□□□□ -0.61
FCHO1-233	ENST00000600393	ZCCHC18	P0CG32	403 aa		11.25	□□□□□ -0.61
FCHO1-233	ENST00000600393	HOXB9	P17482	250 aa	Predicted RBP	11.25	□□□□□ -0.61
FCHO1-233	ENST00000600393	LRRC74A	Q0VAA2	488 aa		11.25	□□□□□ -0.61
FCHO1-233	ENST00000600393	RAB35	Q15286	201 aa		11.25	□□□□□ -0.61
FCHO1-233	ENST00000600393	TMEM249	Q2WGJ8	235 aa		11.25	□□□□□ -0.61
FCHO1-233	ENST00000600393	TBRG1	Q3YBR2	411 aa		11.25	□□□□□ -0.61
FCHO1-233	ENST00000600393	C6orf52	Q5T4I8	152 aa		11.25	□□□□□ -0.61

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