RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590874.5

CAPNS1-211, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 926 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-211ENST00000590874 GPAT4Q86UL3 456 aa22.32■■□□□ 1.16
CAPNS1-211ENST00000590874 NUDCD3Q8IVD9 361 aa22.32■■□□□ 1.16
CAPNS1-211ENST00000590874 OR1K1Q8NGR3 316 aa22.32■■□□□ 1.16
CAPNS1-211ENST00000590874 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP22.32■■□□□ 1.16
CAPNS1-211ENST00000590874 CCDC115Q96NT0 180 aa22.32■■□□□ 1.16
CAPNS1-211ENST00000590874 KATNB1Q9BVA0 655 aa22.32■■□□□ 1.16
CAPNS1-211ENST00000590874 BPESC1Q9GZL8 116 aa22.32■■□□□ 1.16
CAPNS1-211ENST00000590874 C20orf27Q9GZN8 174 aa22.32■■□□□ 1.16
CAPNS1-211ENST00000590874 OBP2BQ9NPH6 170 aa22.32■■□□□ 1.16
CAPNS1-211ENST00000590874 WDR91A4D1P6 747 aa22.31■■□□□ 1.16
CAPNS1-211ENST00000590874 E9PBE3 544 aa22.31■■□□□ 1.16
CAPNS1-211ENST00000590874 IQCCQ4KMZ1 466 aa22.31■■□□□ 1.16
CAPNS1-211ENST00000590874 LRRC74BQ6ZQY2 392 aa22.31■■□□□ 1.16
CAPNS1-211ENST00000590874 TEX37Q96LM6 180 aa22.31■■□□□ 1.16
CAPNS1-211ENST00000590874 ALKBH3Q96Q83 286 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
CAPNS1-211ENST00000590874 MYOZ1Q9NP98 299 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
CAPNS1-211ENST00000590874 RLIMQ9NVW2 624 aa22.31■■□□□ 1.16
CAPNS1-211ENST00000590874 TMEM45AQ9NWC5 275 aa22.31■■□□□ 1.16
CAPNS1-211ENST00000590874 BTNL2Q9UIR0 455 aa22.31■■□□□ 1.16
CAPNS1-211ENST00000590874 MALRD1Q5VYJ5 2156 aa22.31■■□□□ 1.16
CAPNS1-211ENST00000590874 KRT33AO76009 404 aa22.3■■□□□ 1.16
CAPNS1-211ENST00000590874 TGFAP01135 160 aa22.3■■□□□ 1.16
CAPNS1-211ENST00000590874 IL7RP16871 459 aa22.3■■□□□ 1.16
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF23P17027 643 aa22.3■■□□□ 1.16
CAPNS1-211ENST00000590874 HNF1AP20823 631 aa22.3■■□□□ 1.16
CAPNS1-211ENST00000590874 S100A3P33764 101 aa22.3■■□□□ 1.16
CAPNS1-211ENST00000590874 CDKN2CP42773 168 aa22.3■■□□□ 1.16
CAPNS1-211ENST00000590874 SELENOPP49908 381 aa22.3■■□□□ 1.16
CAPNS1-211ENST00000590874 P2RY4P51582 365 aa22.3■■□□□ 1.16
CAPNS1-211ENST00000590874 CLNS1AP54105 237 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
CAPNS1-211ENST00000590874 ABCE1P61221 599 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
CAPNS1-211ENST00000590874 TUBA1BP68363 451 aa22.3■■□□□ 1.16
CAPNS1-211ENST00000590874 TUBA4AP68366 448 aa22.3■■□□□ 1.16
CAPNS1-211ENST00000590874 IFFO1Q0D2I5 559 aa22.3■■□□□ 1.16
CAPNS1-211ENST00000590874 CHI3L2Q15782 390 aa22.3■■□□□ 1.16
CAPNS1-211ENST00000590874 DPY19L1Q2PZI1 675 aa22.3■■□□□ 1.16
CAPNS1-211ENST00000590874 VHLLQ6RSH7 139 aa22.3■■□□□ 1.16
CAPNS1-211ENST00000590874 TUBA1AQ71U36 451 aa22.3■■□□□ 1.16
CAPNS1-211ENST00000590874 LINGO2Q7L985 606 aa22.3■■□□□ 1.16
CAPNS1-211ENST00000590874 ABHD12BQ7Z5M8 362 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
CAPNS1-211ENST00000590874 KCNS3Q9BQ31 491 aa22.3■■□□□ 1.16
CAPNS1-211ENST00000590874 SEC61A2Q9H9S3 476 aa22.3■■□□□ 1.16
CAPNS1-211ENST00000590874 ARFGEF3Q5TH69 2177 aa22.3■■□□□ 1.16
CAPNS1-211ENST00000590874 CCDC154A6NI56 674 aa22.29■■□□□ 1.16
CAPNS1-211ENST00000590874 B9A039 149 aa22.29■■□□□ 1.16
CAPNS1-211ENST00000590874 NR5A2O00482 541 aa22.29■■□□□ 1.16
CAPNS1-211ENST00000590874 CRYAAP02489 173 aa22.29■■□□□ 1.16
CAPNS1-211ENST00000590874 SERPINE1P05121 402 aa22.29■■□□□ 1.16
CAPNS1-211ENST00000590874 OR4A8P0C604 315 aa22.29■■□□□ 1.16
CAPNS1-211ENST00000590874 MYZAPP0CAP1 466 aa22.29■■□□□ 1.16
CAPNS1-211ENST00000590874 GKN3PP0CG01 181 aa22.29■■□□□ 1.16
CAPNS1-211ENST00000590874 UQCRBP14927 111 aa22.29■■□□□ 1.16
CAPNS1-211ENST00000590874 NME5P56597 212 aa22.29■■□□□ 1.16
CAPNS1-211ENST00000590874 NAAAQ02083 359 aa22.29■■□□□ 1.16
CAPNS1-211ENST00000590874 BNIP2Q12982 314 aa22.29■■□□□ 1.16
CAPNS1-211ENST00000590874 GNA13Q14344 377 aa22.29■■□□□ 1.16
CAPNS1-211ENST00000590874 EFNB3Q15768 340 aa22.29■■□□□ 1.16
CAPNS1-211ENST00000590874 COX20Q5RI15 118 aa22.29■■□□□ 1.16
CAPNS1-211ENST00000590874 PNPT1Q8TCS8 783 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
CAPNS1-211ENST00000590874 PLK3Q9H4B4 646 aa22.29■■□□□ 1.16
CAPNS1-211ENST00000590874 PIF1Q9H611 641 aa22.29■■□□□ 1.16
CAPNS1-211ENST00000590874 MTHFD2LQ9H903 347 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
CAPNS1-211ENST00000590874 ADPRHL2Q9NX46 363 aa22.29■■□□□ 1.16
CAPNS1-211ENST00000590874 RAP2CQ9Y3L5 183 aa22.29■■□□□ 1.16
CAPNS1-211ENST00000590874 NBEAL1Q6ZS30 2694 aa22.29■■□□□ 1.16
CAPNS1-211ENST00000590874 LRP5LA4QPB2 252 aa22.28■■□□□ 1.16
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF587BE7ETH6 402 aa22.28■■□□□ 1.16
CAPNS1-211ENST00000590874 PDE5AO76074 875 aa22.28■■□□□ 1.16
CAPNS1-211ENST00000590874 DBIP07108 87 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
CAPNS1-211ENST00000590874 CECR9P0C854 216 aa22.28■■□□□ 1.16
CAPNS1-211ENST00000590874 CXCR1P25024 350 aa22.28■■□□□ 1.16
CAPNS1-211ENST00000590874 CALCRP30988 508 aa22.28■■□□□ 1.16
CAPNS1-211ENST00000590874 UBE2NP61088 152 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
CAPNS1-211ENST00000590874 MAPK11Q15759 364 aa22.28■■□□□ 1.16
CAPNS1-211ENST00000590874 GSTA3Q16772 222 aa22.28■■□□□ 1.16
CAPNS1-211ENST00000590874 CR1LQ2VPA4 569 aa22.28■■□□□ 1.16
CAPNS1-211ENST00000590874 TMEM225Q6GV28 225 aa22.28■■□□□ 1.16
CAPNS1-211ENST00000590874 CREB3L2Q70SY1 520 aa22.28■■□□□ 1.16
CAPNS1-211ENST00000590874 BCL2L2Q92843 193 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
CAPNS1-211ENST00000590874 PANX1Q96RD7 426 aa22.28■■□□□ 1.16
CAPNS1-211ENST00000590874 SORT1Q99523 831 aa22.28■■□□□ 1.16
CAPNS1-211ENST00000590874 NUF2Q9BZD4 464 aa22.28■■□□□ 1.16
CAPNS1-211ENST00000590874 ROPN1BQ9BZX4 212 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
CAPNS1-211ENST00000590874 NELFAQ9H3P2 528 aa22.28■■□□□ 1.16
CAPNS1-211ENST00000590874 ROPN1Q9HAT0 212 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
CAPNS1-211ENST00000590874 CRNNQ9UBG3 495 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
CAPNS1-211ENST00000590874 A0A096LPE4 126 aa22.27■■□□□ 1.16
CAPNS1-211ENST00000590874 ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 625 aa22.27■■□□□ 1.16
CAPNS1-211ENST00000590874 A0A1W2PPZ6 126 aa22.27■■□□□ 1.16
CAPNS1-211ENST00000590874 FRS3O43559 492 aa22.27■■□□□ 1.16
CAPNS1-211ENST00000590874 UPK3AO75631 287 aa22.27■■□□□ 1.16
CAPNS1-211ENST00000590874 GSNP06396 782 aa22.27■■□□□ 1.16
CAPNS1-211ENST00000590874 NR2F1P10589 423 aa22.27■■□□□ 1.16
CAPNS1-211ENST00000590874 LBPP18428 481 aa22.27■■□□□ 1.16
CAPNS1-211ENST00000590874 PPOXP50336 477 aa22.27■■□□□ 1.16
CAPNS1-211ENST00000590874 UFM1P61960 85 aa22.27■■□□□ 1.16
CAPNS1-211ENST00000590874 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP22.27■■□□□ 1.161e-6■■■□□ 15.5
CAPNS1-211ENST00000590874 ANKRD16Q6P6B7 361 aa22.27■■□□□ 1.16
CAPNS1-211ENST00000590874 VRK2Q86Y07 508 aa22.27■■□□□ 1.16
CAPNS1-211ENST00000590874 CADM2Q8N3J6 435 aa22.27■■□□□ 1.16
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