RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590422.1

CTIF-208, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 3

Gene CTIF, Length 412 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-208ENST00000590422 C1orf162Q8NEQ5 155 aaPredicted RBP10.59□□□□□ -0.71
CTIF-208ENST00000590422 PNPT1Q8TCS8 783 aaKnown RBP10.59□□□□□ -0.71
CTIF-208ENST00000590422 C10orf105Q8TEF2 133 aa10.59□□□□□ -0.71
CTIF-208ENST00000590422 THOC1Q96FV9 657 aaKnown RBP10.59□□□□□ -0.71
CTIF-208ENST00000590422 ZNF385AQ96PM9 386 aaKnown RBP10.59□□□□□ -0.71
CTIF-208ENST00000590422 TRNT1Q96Q11 434 aaKnown RBP10.59□□□□□ -0.71
CTIF-208ENST00000590422 SIKE1Q9BRV8 207 aa10.59□□□□□ -0.71
CTIF-208ENST00000590422 NPHS2Q9NP85 383 aa10.59□□□□□ -0.71
CTIF-208ENST00000590422 SLC6A13Q9NSD5 602 aa10.59□□□□□ -0.71
CTIF-208ENST00000590422 AIG1Q9NVV5 245 aa10.59□□□□□ -0.71
CTIF-208ENST00000590422 RLIMQ9NVW2 624 aa10.59□□□□□ -0.71
CTIF-208ENST00000590422 BTNL2Q9UIR0 455 aa10.59□□□□□ -0.71
CTIF-208ENST00000590422 DCTN4Q9UJW0 460 aa10.59□□□□□ -0.71
CTIF-208ENST00000590422 TRAPPC4Q9Y296 219 aa10.59□□□□□ -0.71
CTIF-208ENST00000590422 SLC9A8Q9Y2E8 581 aa10.59□□□□□ -0.71
CTIF-208ENST00000590422 ATP23Q9Y6H3 246 aa10.59□□□□□ -0.71
CTIF-208ENST00000590422 CCDC154A6NI56 674 aa10.58□□□□□ -0.72
CTIF-208ENST00000590422 TRPC5OSA6NMA1 111 aa10.58□□□□□ -0.72
CTIF-208ENST00000590422 PHF1O43189 567 aaPredicted RBP10.58□□□□□ -0.72
CTIF-208ENST00000590422 ZNF208O43345 1280 aa10.58□□□□□ -0.72
CTIF-208ENST00000590422 AKR7A3O95154 331 aa10.58□□□□□ -0.72
CTIF-208ENST00000590422 IFNA2P01563 188 aa10.58□□□□□ -0.72
CTIF-208ENST00000590422 GSNP06396 782 aa10.58□□□□□ -0.72
CTIF-208ENST00000590422 FAM157CP0CG43 387 aa10.58□□□□□ -0.72
CTIF-208ENST00000590422 IGHV4-31P0DP07 118 aa10.58□□□□□ -0.72
CTIF-208ENST00000590422 CDH2P19022 906 aaPredicted RBP10.58□□□□□ -0.72
CTIF-208ENST00000590422 S100A3P33764 101 aa10.58□□□□□ -0.72
CTIF-208ENST00000590422 SLC1A3P43003 542 aa10.58□□□□□ -0.72
CTIF-208ENST00000590422 HTR3AP46098 478 aa10.58□□□□□ -0.72
CTIF-208ENST00000590422 IDH3AP50213 366 aa10.58□□□□□ -0.72
CTIF-208ENST00000590422 DSCR9P59020 149 aa10.58□□□□□ -0.72
CTIF-208ENST00000590422 DPY19L1Q2PZI1 675 aa10.58□□□□□ -0.72
CTIF-208ENST00000590422 HIKESHIQ53FT3 197 aa10.58□□□□□ -0.72
CTIF-208ENST00000590422 OTUD3Q5T2D3 398 aaPredicted RBP10.58□□□□□ -0.72
CTIF-208ENST00000590422 PAQR6Q6TCH4 344 aa10.58□□□□□ -0.72
CTIF-208ENST00000590422 CPLX4Q7Z7G2 160 aa10.58□□□□□ -0.72
CTIF-208ENST00000590422 CMIPQ8IY22 773 aa10.58□□□□□ -0.72
CTIF-208ENST00000590422 C17orf78Q8N4C9 275 aa10.58□□□□□ -0.72
CTIF-208ENST00000590422 TMEM99Q8N816 258 aa10.58□□□□□ -0.72
CTIF-208ENST00000590422 VPS37AQ8NEZ2 397 aa10.58□□□□□ -0.72
CTIF-208ENST00000590422 OR9K2Q8NGE7 335 aa10.58□□□□□ -0.72
CTIF-208ENST00000590422 WDR60Q8WVS4 1066 aa10.58□□□□□ -0.72
CTIF-208ENST00000590422 STON2Q8WXE9 905 aa10.58□□□□□ -0.72
CTIF-208ENST00000590422 FAM168AQ92567 244 aa10.58□□□□□ -0.72
CTIF-208ENST00000590422 DDIT4LQ96D03 193 aa10.58□□□□□ -0.72
CTIF-208ENST00000590422 MAELQ96JY0 434 aaKnown RBP10.58□□□□□ -0.72
CTIF-208ENST00000590422 PANX1Q96RD7 426 aa10.58□□□□□ -0.72
CTIF-208ENST00000590422 FAM107BQ9H098 131 aa10.58□□□□□ -0.72
CTIF-208ENST00000590422 NSRP1Q9H0G5 558 aaKnown RBP10.58□□□□□ -0.72
CTIF-208ENST00000590422 UPB1Q9UBR1 384 aa10.58□□□□□ -0.72
CTIF-208ENST00000590422 MOKQ9UQ07 419 aa10.58□□□□□ -0.72
CTIF-208ENST00000590422 AMDHD2Q9Y303 409 aa10.58□□□□□ -0.72
CTIF-208ENST00000590422 GPR45Q9Y5Y3 372 aa10.58□□□□□ -0.72
CTIF-208ENST00000590422 CFAP73A6NFT4 308 aa10.57□□□□□ -0.72
CTIF-208ENST00000590422 LIPT2A6NK58 231 aa10.57□□□□□ -0.72
CTIF-208ENST00000590422 FAAHO00519 579 aa10.57□□□□□ -0.72
CTIF-208ENST00000590422 EIF1BO60739 113 aaKnown RBP10.57□□□□□ -0.72
CTIF-208ENST00000590422 GKN3PP0CG01 181 aa10.57□□□□□ -0.72
CTIF-208ENST00000590422 SLC25A16P16260 332 aa10.57□□□□□ -0.72
CTIF-208ENST00000590422 FKBP2P26885 142 aaKnown RBP10.57□□□□□ -0.72
CTIF-208ENST00000590422 EPHA3P29320 983 aa10.57□□□□□ -0.72
CTIF-208ENST00000590422 MPGP29372 298 aa10.57□□□□□ -0.72
CTIF-208ENST00000590422 P2RY4P51582 365 aa10.57□□□□□ -0.72
CTIF-208ENST00000590422 EFNA4P52798 201 aa10.57□□□□□ -0.72
CTIF-208ENST00000590422 MVDP53602 400 aa10.57□□□□□ -0.72
CTIF-208ENST00000590422 BNIP2Q12982 314 aa10.57□□□□□ -0.72
CTIF-208ENST00000590422 CEACAM7Q14002 265 aa10.57□□□□□ -0.72
CTIF-208ENST00000590422 OR7A5Q15622 319 aa10.57□□□□□ -0.72
CTIF-208ENST00000590422 MST1LQ2TV78 715 aa10.57□□□□□ -0.72
CTIF-208ENST00000590422 SLC9B1Q4ZJI4 515 aa10.57□□□□□ -0.72
CTIF-208ENST00000590422 LRRC74BQ6ZQY2 392 aa10.57□□□□□ -0.72
CTIF-208ENST00000590422 PIGWQ7Z7B1 504 aa10.57□□□□□ -0.72
CTIF-208ENST00000590422 VRK2Q86Y07 508 aa10.57□□□□□ -0.72
CTIF-208ENST00000590422 DEPDC4Q8N2C3 294 aa10.57□□□□□ -0.72
CTIF-208ENST00000590422 ARIH2OSQ8N7S6 290 aa10.57□□□□□ -0.72
CTIF-208ENST00000590422 TMEM45BQ96B21 275 aa10.57□□□□□ -0.72
CTIF-208ENST00000590422 OR52B2Q96RD2 323 aa10.57□□□□□ -0.72
CTIF-208ENST00000590422 CCT8L2Q96SF2 557 aa10.57□□□□□ -0.72
CTIF-208ENST00000590422 ELAC2Q9BQ52 826 aaKnown RBP10.57□□□□□ -0.72
CTIF-208ENST00000590422 NAA11Q9BSU3 229 aaPredicted RBP10.57□□□□□ -0.72
CTIF-208ENST00000590422 ADAM19Q9H013 955 aa10.57□□□□□ -0.72
CTIF-208ENST00000590422 RABEP2Q9H5N1 569 aa10.57□□□□□ -0.72
CTIF-208ENST00000590422 WDR55Q9H6Y2 383 aaPredicted RBP10.57□□□□□ -0.72
CTIF-208ENST00000590422 FKRPQ9H9S5 495 aa10.57□□□□□ -0.72
CTIF-208ENST00000590422 KLHL14Q9P2G3 628 aa10.57□□□□□ -0.72
CTIF-208ENST00000590422 CDC42EP3Q9UKI2 254 aa10.57□□□□□ -0.72
CTIF-208ENST00000590422 DSPPQ9NZW4 1301 aa10.57□□□□□ -0.72
CTIF-208ENST00000590422 IGHV1-18A0A0C4DH31 117 aa10.56□□□□□ -0.72
CTIF-208ENST00000590422 A0A0G2JND7 137 aa10.56□□□□□ -0.72
CTIF-208ENST00000590422 CDHR4A6H8M9 788 aa10.56□□□□□ -0.72
CTIF-208ENST00000590422 AQP7P3A6NL99 342 aa10.56□□□□□ -0.72
CTIF-208ENST00000590422 FRS3O43559 492 aa10.56□□□□□ -0.72
CTIF-208ENST00000590422 SNX3O60493 162 aa10.56□□□□□ -0.72
CTIF-208ENST00000590422 FAM107AO95990 144 aa10.56□□□□□ -0.72
CTIF-208ENST00000590422 PGRP06401 933 aa10.56□□□□□ -0.72
CTIF-208ENST00000590422 NR2F1P10589 423 aa10.56□□□□□ -0.72
CTIF-208ENST00000590422 PRG2P13727 222 aa10.56□□□□□ -0.72
CTIF-208ENST00000590422 IL7RP16871 459 aa10.56□□□□□ -0.72
CTIF-208ENST00000590422 ACAA2P42765 397 aaKnown RBP10.56□□□□□ -0.72
CTIF-208ENST00000590422 SRSF2Q01130 221 aaKnown RBP10.56□□□□□ -0.72
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