RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000586900.1

PKN1-208, Transcript of protein kinase N1, human

TSL 3

Gene PKN1, Length 550 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PKN1-208	ENST00000586900		Q9UFV3	132 aa		11.02	□□□□□ -0.65
PKN1-208	ENST00000586900	RNF6	Q9Y252	685 aa		11.02	□□□□□ -0.65
PKN1-208	ENST00000586900		V9GYQ6	96 aa		11.02	□□□□□ -0.65
PKN1-208	ENST00000586900	LRRK2	Q5S007	2527 aa		11.01	□□□□□ -0.65
PKN1-208	ENST00000586900	SPTBN1	Q01082	2364 aa	Known RBP	11.01	□□□□□ -0.65
PKN1-208	ENST00000586900	GCN1	Q92616	2671 aa	Known RBP	11.01	□□□□□ -0.65
PKN1-208	ENST00000586900		A0A1W2PRQ8	180 aa		11.01	□□□□□ -0.65
PKN1-208	ENST00000586900	TCRBV3S1	A0A5B6	114 aa		11.01	□□□□□ -0.65
PKN1-208	ENST00000586900	ZG16	O60844	167 aa		11.01	□□□□□ -0.65
PKN1-208	ENST00000586900	VAMP5	O95183	116 aa		11.01	□□□□□ -0.65
PKN1-208	ENST00000586900	MT-ATP6	P00846	226 aa		11.01	□□□□□ -0.65
PKN1-208	ENST00000586900	TMIGD3	P0DMS9	266 aa	Predicted RBP	11.01	□□□□□ -0.65
PKN1-208	ENST00000586900	FPR1	P21462	350 aa		11.01	□□□□□ -0.65
PKN1-208	ENST00000586900	OPRM1	P35372	400 aa		11.01	□□□□□ -0.65
PKN1-208	ENST00000586900	RPS5	P46782	204 aa	Known RBP	11.01	□□□□□ -0.65
PKN1-208	ENST00000586900	YAP1	P46937	504 aa	Known RBP	11.01	□□□□□ -0.65
PKN1-208	ENST00000586900	SMIM11A	P58511	58 aa		11.01	□□□□□ -0.65
PKN1-208	ENST00000586900	CHRNB3	Q05901	458 aa		11.01	□□□□□ -0.65
PKN1-208	ENST00000586900	DGCR6	Q14129	220 aa		11.01	□□□□□ -0.65
PKN1-208	ENST00000586900	GUSBP1	Q15486	140 aa		11.01	□□□□□ -0.65
PKN1-208	ENST00000586900	OR7A5	Q15622	319 aa		11.01	□□□□□ -0.65
PKN1-208	ENST00000586900	FAM98B	Q52LJ0	330 aa	Known RBP	11.01	□□□□□ -0.65
PKN1-208	ENST00000586900	ABLIM2	Q6H8Q1	611 aa		11.01	□□□□□ -0.65
PKN1-208	ENST00000586900	PLXDC2	Q6UX71	529 aa		11.01	□□□□□ -0.65
PKN1-208	ENST00000586900	MRGPRG	Q86SM5	289 aa		11.01	□□□□□ -0.65
PKN1-208	ENST00000586900	ZDHHC21	Q8IVQ6	265 aa		11.01	□□□□□ -0.65
PKN1-208	ENST00000586900	RNF113B	Q8IZP6	322 aa	Known RBP	11.01	□□□□□ -0.65
PKN1-208	ENST00000586900	NAXE	Q8NCW5	288 aa		11.01	□□□□□ -0.65
PKN1-208	ENST00000586900	LILRB4	Q8NHJ6	448 aa		11.01	□□□□□ -0.65
PKN1-208	ENST00000586900	PIGX	Q8TBF5	258 aa		11.01	□□□□□ -0.65
PKN1-208	ENST00000586900	SSC4D	Q8WTU2	575 aa		11.01	□□□□□ -0.65
PKN1-208	ENST00000586900	TMEM239	Q8WW34	195 aa		11.01	□□□□□ -0.65
PKN1-208	ENST00000586900	ITLN2	Q8WWU7	325 aa	Predicted RBP	11.01	□□□□□ -0.65
PKN1-208	ENST00000586900	ROBO4	Q8WZ75	1007 aa		11.01	□□□□□ -0.65
PKN1-208	ENST00000586900	TAAR8	Q969N4	342 aa		11.01	□□□□□ -0.65
PKN1-208	ENST00000586900	INTS12	Q96CB8	462 aa	Known RBP	11.01	□□□□□ -0.65
PKN1-208	ENST00000586900	DHRS1	Q96LJ7	313 aa		11.01	□□□□□ -0.65
PKN1-208	ENST00000586900	SEPHS2	Q99611	448 aa		11.01	□□□□□ -0.65
PKN1-208	ENST00000586900	PIP5K1A	Q99755	562 aa		11.01	□□□□□ -0.65
PKN1-208	ENST00000586900	SFXN3	Q9BWM7	321 aa		11.01	□□□□□ -0.65
PKN1-208	ENST00000586900	MAN2C1	Q9NTJ4	1040 aa		11.01	□□□□□ -0.65
PKN1-208	ENST00000586900	KLHL9	Q9P2J3	617 aa		11.01	□□□□□ -0.65
PKN1-208	ENST00000586900	CORIN	Q9Y5Q5	1042 aa		11.01	□□□□□ -0.65
PKN1-208	ENST00000586900	IGKV3D-15	A0A087WSY6	115 aa		11	□□□□□ -0.65
PKN1-208	ENST00000586900	DHRS12	A0PJE2	317 aa		11	□□□□□ -0.65
PKN1-208	ENST00000586900	AQP7P3	A6NL99	342 aa		11	□□□□□ -0.65
PKN1-208	ENST00000586900	ZNF724	A8MTY0	619 aa		11	□□□□□ -0.65
PKN1-208	ENST00000586900	hCG_2039718	K7EN88	272 aa		11	□□□□□ -0.65
PKN1-208	ENST00000586900	SS18L1	O75177	396 aa	Predicted RBP	11	□□□□□ -0.65
PKN1-208	ENST00000586900	BGLAP	P02818	100 aa		11	□□□□□ -0.65
PKN1-208	ENST00000586900	MT-ND1	P03886	318 aa		11	□□□□□ -0.65
PKN1-208	ENST00000586900	H1F0	P07305	194 aa	Known RBP	11	□□□□□ -0.65
PKN1-208	ENST00000586900	RAP2A	P10114	183 aa		11	□□□□□ -0.65
PKN1-208	ENST00000586900	SLC16A1	P53985	500 aa		11	□□□□□ -0.65
PKN1-208	ENST00000586900	RASGEF1B	Q0VAM2	473 aa		11	□□□□□ -0.65
PKN1-208	ENST00000586900	PPP4R4	Q6NUP7	873 aa		11	□□□□□ -0.65
PKN1-208	ENST00000586900	FAM214B	Q7L5A3	538 aa		11	□□□□□ -0.65
PKN1-208	ENST00000586900	MCEMP1	Q8IX19	187 aa		11	□□□□□ -0.65
PKN1-208	ENST00000586900	ADGRG5	Q8IZF4	528 aa		11	□□□□□ -0.65
PKN1-208	ENST00000586900	SCAI	Q8N9R8	606 aa		11	□□□□□ -0.65
PKN1-208	ENST00000586900	ADPRHL1	Q8NDY3	354 aa		11	□□□□□ -0.65
PKN1-208	ENST00000586900	TMEM255B	Q8WV15	326 aa		11	□□□□□ -0.65
PKN1-208	ENST00000586900	LIPH	Q8WWY8	451 aa		11	□□□□□ -0.65
PKN1-208	ENST00000586900	ACOT11	Q8WXI4	607 aa	Predicted RBP	11	□□□□□ -0.65
PKN1-208	ENST00000586900	UTP4	Q969X6	686 aa	Known RBP	11	□□□□□ -0.65
PKN1-208	ENST00000586900	SDCCAG3	Q96C92	435 aa		11	□□□□□ -0.65
PKN1-208	ENST00000586900	PSD2	Q9BQI7	771 aa		11	□□□□□ -0.65
PKN1-208	ENST00000586900	SF3B5	Q9BWJ5	86 aa	Known RBP	11	□□□□□ -0.65
PKN1-208	ENST00000586900	BCO1	Q9HAY6	547 aa		11	□□□□□ -0.65
PKN1-208	ENST00000586900	MEPE	Q9NQ76	525 aa	Predicted RBP	11	□□□□□ -0.65
PKN1-208	ENST00000586900	B3GALT5	Q9Y2C3	310 aa		11	□□□□□ -0.65
PKN1-208	ENST00000586900	MED31	Q9Y3C7	131 aa		11	□□□□□ -0.65
PKN1-208	ENST00000586900		A0A087WUU8	490 aa		10.99	□□□□□ -0.65
PKN1-208	ENST00000586900	IGHV3-15	A0A0B4J1V0	119 aa		10.99	□□□□□ -0.65
PKN1-208	ENST00000586900		A0A1W2PNV4	684 aa		10.99	□□□□□ -0.65
PKN1-208	ENST00000586900	ZNF716	A6NP11	495 aa		10.99	□□□□□ -0.65
PKN1-208	ENST00000586900	GPR171	O14626	319 aa		10.99	□□□□□ -0.65
PKN1-208	ENST00000586900	DVL2	O14641	736 aa		10.99	□□□□□ -0.65
PKN1-208	ENST00000586900	CIB2	O75838	187 aa		10.99	□□□□□ -0.65
PKN1-208	ENST00000586900	TNFSF13	O75888	250 aa		10.99	□□□□□ -0.65
PKN1-208	ENST00000586900	KRT36	O76013	467 aa		10.99	□□□□□ -0.65
PKN1-208	ENST00000586900	CLDN14	O95500	239 aa		10.99	□□□□□ -0.65
PKN1-208	ENST00000586900	PLG	P00747	810 aa	Predicted RBP	10.99	□□□□□ -0.65
PKN1-208	ENST00000586900	YES1	P07947	543 aa		10.99	□□□□□ -0.65
PKN1-208	ENST00000586900	GTF2E2	P29084	291 aa	Known RBP	10.99	□□□□□ -0.65
PKN1-208	ENST00000586900	GRPR	P30550	384 aa		10.99	□□□□□ -0.65
PKN1-208	ENST00000586900	KIR2DL2	P43627	348 aa	Predicted RBP	10.99	□□□□□ -0.65
PKN1-208	ENST00000586900	P2RY4	P51582	365 aa		10.99	□□□□□ -0.65
PKN1-208	ENST00000586900	HMGA2	P52926	109 aa		10.99	□□□□□ -0.65
PKN1-208	ENST00000586900	UGT2B15	P54855	530 aa		10.99	□□□□□ -0.65
PKN1-208	ENST00000586900	CTBP2	P56545	445 aa		10.99	□□□□□ -0.65
PKN1-208	ENST00000586900	LTB	Q06643	244 aa		10.99	□□□□□ -0.65
PKN1-208	ENST00000586900	FOXF2	Q12947	444 aa		10.99	□□□□□ -0.65
PKN1-208	ENST00000586900	GK3P	Q14409	553 aa		10.99	□□□□□ -0.65
PKN1-208	ENST00000586900	POU4F3	Q15319	338 aa		10.99	□□□□□ -0.65
PKN1-208	ENST00000586900	ZNF74	Q16587	644 aa		10.99	□□□□□ -0.65
PKN1-208	ENST00000586900	SLC25A35	Q3KQZ1	300 aa		10.99	□□□□□ -0.65
PKN1-208	ENST00000586900	OTUD3	Q5T2D3	398 aa	Predicted RBP	10.99	□□□□□ -0.65
PKN1-208	ENST00000586900	C1orf146	Q5VVC0	180 aa		10.99	□□□□□ -0.65
PKN1-208	ENST00000586900	H1FNT	Q75WM6	255 aa	Predicted RBP	10.99	□□□□□ -0.65

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