RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583289.5

PTPRM-215, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, human

TSL 5

Gene PTPRM, Length 792 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPRM-215	ENST00000583289	TMPRSS11F	Q6ZWK6	438 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	ZNF550	Q7Z398	422 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	IQCH	Q86VS3	1027 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	SLC22A16	Q86VW1	577 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	TPRA1	Q86W33	373 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	GRAMD2A	Q8IUY3	354 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	PHC2	Q8IXK0	858 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	ZNF440	Q8IYI8	595 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	ZNF619	Q8N2I2	560 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	MS4A15	Q8N5U1	240 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	POGLUT1	Q8NBL1	392 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	OR52I1	Q8NGK6	324 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	OR4C6	Q8NH72	309 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	SNRNP27	Q8WVK2	155 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	PHYHIP	Q92561	330 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	ITFG2	Q969R8	447 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	SLC25A46	Q96AG3	418 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	C1GALT1C1	Q96EU7	318 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	MVB12A	Q96EY5	273 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	SLC41A3	Q96GZ6	507 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	RBM18	Q96H35	190 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	TXNDC15	Q96J42	360 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	OPALIN	Q96PE5	141 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	OR2A5	Q96R48	311 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	CD180	Q99467	661 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	MCHR1	Q99705	422 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	CENPO	Q9BU64	300 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	LDHAL6B	Q9BYZ2	381 aa	Predicted RBP	4.16	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	TRIM2	Q9C040	744 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	NDEL1	Q9GZM8	345 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	HOXD1	Q9GZZ0	328 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	SLC22A4	Q9H015	551 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	OR51E2	Q9H255	320 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	SLC38A1	Q9H2H9	487 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	KLHL31	Q9H511	634 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	XKR8	Q9H6D3	395 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	ANKRA2	Q9H9E1	313 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	UCK1	Q9HA47	277 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	ZBTB20	Q9HC78	741 aa	Predicted RBP	4.16	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	EXOSC4	Q9NPD3	245 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	ABCB10	Q9NRK6	738 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	IRAK4	Q9NWZ3	460 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	AASS	Q9UDR5	926 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	TBC1D29	Q9UFV1	150 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	MRTO4	Q9UKD2	239 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	DAPP1	Q9UN19	280 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	EXOG	Q9Y2C4	368 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	LSM2	Q9Y333	95 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	CAB39	Q9Y376	341 aa	Predicted RBP	4.16	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	MED31	Q9Y3C7	131 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	CMAHP	Q9Y471	501 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	CDH10	Q9Y6N8	788 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	MYO7A	Q13402	2215 aa		4.15	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	GOLGA4	Q13439	2230 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	DNAH12	Q6ZR08	3092 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289		A0A0J9YY10	115 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289		A0A1W2PQF6	199 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	FABP12	A6NFH5	140 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	GLOD5	A6NK44	160 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	OR52A4P	A6NMU1	304 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	WASHC1	A8K0Z3	465 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	TMX2-CTNND1	H3BSU7	103 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289		M0R3H8	397 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	DSCR3	O14972	297 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	SURF4	O15260	269 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	MAGEB3	O15480	346 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	RGS5	O15539	181 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	SEC14L5	O43304	696 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	LAT	O43561	262 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	TPST2	O60704	377 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	B4GALT2	O60909	372 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	TRIM3	O75382	744 aa	Predicted RBP	4.15	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	CS	O75390	466 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	GPX5	O75715	221 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	UBXN7	O94888	489 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	KLF8	O95600	359 aa	Predicted RBP	4.15	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	IGF2	P01344	180 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	IGLV3-19	P01714	112 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	MT-ND5	P03915	603 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	PEPD	P12955	493 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	CTSE	P14091	401 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	DRD5	P21918	477 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	PSMB5	P28074	263 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	TNFSF8	P32971	234 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	ACTR1B	P42025	376 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	OMP	P47874	163 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	EIF2B2	P49770	351 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	DGKE	P52429	567 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	MLLT10	P55197	1068 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	CDH11	P55287	796 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	CTBP2	P56545	445 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	RAB25	P57735	213 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	KRTAP10-9	P60411	292 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	ACTR1A	P61163	376 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	MRPL28	Q13084	256 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	SLC13A2	Q13183	592 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	CBX3	Q13185	183 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	SERTAD2	Q14140	314 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	FGL2	Q14314	439 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	SSX1	Q16384	188 aa		4.15	□□□□□ -1.75

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