RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563951.1

CCDC33-211, Transcript of coiled-coil domain containing 33, humanhuman

TSL 5

Gene CCDC33, Length 308 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC33-211ENST00000563951 PAQR6Q6TCH4 344 aa7.56□□□□□ -1.2
CCDC33-211ENST00000563951 SEZ6L2Q6UXD5 910 aa7.56□□□□□ -1.2
CCDC33-211ENST00000563951 STAC2Q6ZMT1 411 aa7.56□□□□□ -1.2
CCDC33-211ENST00000563951 CPLX4Q7Z7G2 160 aa7.56□□□□□ -1.2
CCDC33-211ENST00000563951 SLC30A8Q8IWU4 369 aa7.56□□□□□ -1.2
CCDC33-211ENST00000563951 MICU2Q8IYU8 434 aa7.56□□□□□ -1.2
CCDC33-211ENST00000563951 SLC43A2Q8N370 569 aa7.56□□□□□ -1.2
CCDC33-211ENST00000563951 TMEM99Q8N816 258 aa7.56□□□□□ -1.2
CCDC33-211ENST00000563951 OR2T12Q8NG77 320 aa7.56□□□□□ -1.2
CCDC33-211ENST00000563951 OR52E4Q8NGH9 312 aa7.56□□□□□ -1.2
CCDC33-211ENST00000563951 VANGL1Q8TAA9 524 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
CCDC33-211ENST00000563951 FAM222BQ8WU58 562 aa7.56□□□□□ -1.2
CCDC33-211ENST00000563951 NRGNQ92686 78 aa7.56□□□□□ -1.2
CCDC33-211ENST00000563951 ZNF775Q96BV0 537 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
CCDC33-211ENST00000563951 DDIT4LQ96D03 193 aa7.56□□□□□ -1.2
CCDC33-211ENST00000563951 KTI12Q96EK9 354 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
CCDC33-211ENST00000563951 ECSITQ9BQ95 431 aa7.56□□□□□ -1.2
CCDC33-211ENST00000563951 ZNF559Q9BR84 538 aa7.56□□□□□ -1.2
CCDC33-211ENST00000563951 PCDHAC1Q9H158 963 aa7.56□□□□□ -1.2
CCDC33-211ENST00000563951 ARMC7Q9H6L4 198 aa7.56□□□□□ -1.2
CCDC33-211ENST00000563951 C12orf10Q9HB07 376 aa7.56□□□□□ -1.2
CCDC33-211ENST00000563951 CACYBPQ9HB71 228 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
CCDC33-211ENST00000563951 MCCC2Q9HCC0 563 aa7.56□□□□□ -1.2
CCDC33-211ENST00000563951 TIGARQ9NQ88 270 aa7.56□□□□□ -1.2
CCDC33-211ENST00000563951 ARL8BQ9NVJ2 186 aa7.56□□□□□ -1.2
CCDC33-211ENST00000563951 GID8Q9NWU2 228 aa7.56□□□□□ -1.2
CCDC33-211ENST00000563951 KLHL9Q9P2J3 617 aa7.56□□□□□ -1.2
CCDC33-211ENST00000563951 B3GAT1Q9P2W7 334 aa7.56□□□□□ -1.2
CCDC33-211ENST00000563951 CADP27708 2225 aa7.56□□□□□ -1.2
CCDC33-211ENST00000563951 CELSR1Q9NYQ6 3014 aa7.55□□□□□ -1.2
CCDC33-211ENST00000563951 A0A087WUJ7 227 aa7.55□□□□□ -1.2
CCDC33-211ENST00000563951 SH3D21A4FU49 640 aa7.55□□□□□ -1.2
CCDC33-211ENST00000563951 AQP7P3A6NL99 342 aa7.55□□□□□ -1.2
CCDC33-211ENST00000563951 A6NNC1 897 aa7.55□□□□□ -1.2
CCDC33-211ENST00000563951 A8MVM7 634 aa7.55□□□□□ -1.2
CCDC33-211ENST00000563951 DEFB108AA8MXU0 73 aa7.55□□□□□ -1.2
CCDC33-211ENST00000563951 LRRN3E7EW58 273 aa7.55□□□□□ -1.2
CCDC33-211ENST00000563951 FMO6PO60774 539 aa7.55□□□□□ -1.2
CCDC33-211ENST00000563951 AKR7A3O95154 331 aa7.55□□□□□ -1.2
CCDC33-211ENST00000563951 HRGP04196 525 aa7.55□□□□□ -1.2
CCDC33-211ENST00000563951 C8BP07358 591 aa7.55□□□□□ -1.2
CCDC33-211ENST00000563951 PNMTP11086 282 aa7.55□□□□□ -1.2
CCDC33-211ENST00000563951 EPXP11678 715 aa7.55□□□□□ -1.2
CCDC33-211ENST00000563951 CXCR1P25024 350 aa7.55□□□□□ -1.2
CCDC33-211ENST00000563951 MAP2K6P52564 334 aa7.55□□□□□ -1.2
CCDC33-211ENST00000563951 CDH12P55289 794 aa7.55□□□□□ -1.2
CCDC33-211ENST00000563951 FOXG1P55316 489 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
CCDC33-211ENST00000563951 PSME3P61289 254 aa7.55□□□□□ -1.2
CCDC33-211ENST00000563951 SLC35A1P78382 337 aa7.55□□□□□ -1.2
CCDC33-211ENST00000563951 SLC17A1Q14916 467 aa7.55□□□□□ -1.2
CCDC33-211ENST00000563951 DAZAP2Q15038 168 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
CCDC33-211ENST00000563951 LRRC23Q53EV4 343 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
CCDC33-211ENST00000563951 CYBRD1Q53TN4 286 aa7.55□□□□□ -1.2
CCDC33-211ENST00000563951 ALG10BQ5I7T1 473 aa7.55□□□□□ -1.2
CCDC33-211ENST00000563951 TMEM201Q5SNT2 666 aa7.55□□□□□ -1.2
CCDC33-211ENST00000563951 INTS11Q5TA45 600 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
CCDC33-211ENST00000563951 LINC00114Q6XXX2 140 aa7.55□□□□□ -1.2
CCDC33-211ENST00000563951 ARPINQ7Z6K5 226 aa7.55□□□□□ -1.2
CCDC33-211ENST00000563951 CARM1Q86X55 608 aa7.55□□□□□ -1.2
CCDC33-211ENST00000563951 KIF18BQ86Y91 864 aa7.55□□□□□ -1.2
CCDC33-211ENST00000563951 WDFY1Q8IWB7 410 aa7.55□□□□□ -1.2
CCDC33-211ENST00000563951 ZIC4Q8N9L1 334 aa7.55□□□□□ -1.2
CCDC33-211ENST00000563951 BHLHE22Q8NFJ8 381 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
CCDC33-211ENST00000563951 PIGXQ8TBF5 258 aa7.55□□□□□ -1.2
CCDC33-211ENST00000563951 STK35Q8TDR2 534 aa7.55□□□□□ -1.2
CCDC33-211ENST00000563951 SLC38A4Q969I6 547 aa7.55□□□□□ -1.2
CCDC33-211ENST00000563951 TAAR8Q969N4 342 aa7.55□□□□□ -1.2
CCDC33-211ENST00000563951 WFIKKN1Q96NZ8 548 aa7.55□□□□□ -1.2
CCDC33-211ENST00000563951 ZNF385AQ96PM9 386 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
CCDC33-211ENST00000563951 CCT8L2Q96SF2 557 aa7.55□□□□□ -1.2
CCDC33-211ENST00000563951 MCHR1Q99705 422 aa7.55□□□□□ -1.2
CCDC33-211ENST00000563951 SH3GL1Q99961 368 aa7.55□□□□□ -1.2
CCDC33-211ENST00000563951 PRSS27Q9BQR3 290 aa7.55□□□□□ -1.2
CCDC33-211ENST00000563951 ZNF426Q9BUY5 554 aa7.55□□□□□ -1.2
CCDC33-211ENST00000563951 TRIM2Q9C040 744 aa7.55□□□□□ -1.2
CCDC33-211ENST00000563951 ADPRHL2Q9NX46 363 aa7.55□□□□□ -1.2
CCDC33-211ENST00000563951 KLHL28Q9NXS3 571 aa7.55□□□□□ -1.2
CCDC33-211ENST00000563951 ELOVL5Q9NYP7 299 aa7.55□□□□□ -1.2
CCDC33-211ENST00000563951 PRDM4Q9UKN5 801 aa7.55□□□□□ -1.2
CCDC33-211ENST00000563951 ARL2BPQ9Y2Y0 163 aa7.55□□□□□ -1.2
CCDC33-211ENST00000563951 FLVCR1Q9Y5Y0 555 aa7.55□□□□□ -1.2
CCDC33-211ENST00000563951 ELOVL7A1L3X0 281 aa7.54□□□□□ -1.2
CCDC33-211ENST00000563951 ELOA3DA6NLF2 546 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
CCDC33-211ENST00000563951 CPSF4LA6NMK7 179 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
CCDC33-211ENST00000563951 PDLIM1O00151 329 aa7.54□□□□□ -1.2
CCDC33-211ENST00000563951 AHSA1O95433 338 aa7.54□□□□□ -1.2
CCDC33-211ENST00000563951 HPRP00739 348 aa7.54□□□□□ -1.2
CCDC33-211ENST00000563951 IGHV3-9P01782 118 aa7.54□□□□□ -1.2
CCDC33-211ENST00000563951 BGLAPP02818 100 aa7.54□□□□□ -1.2
CCDC33-211ENST00000563951 PSMB1P20618 241 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
CCDC33-211ENST00000563951 COX5AP20674 150 aa7.54□□□□□ -1.2
CCDC33-211ENST00000563951 IGHV1-2P23083 117 aa7.54□□□□□ -1.2
CCDC33-211ENST00000563951 FKBP2P26885 142 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
CCDC33-211ENST00000563951 KDELR2P33947 212 aa7.54□□□□□ -1.2
CCDC33-211ENST00000563951 PEX19P40855 299 aa7.54□□□□□ -1.2
CCDC33-211ENST00000563951 RPS5P46782 204 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
CCDC33-211ENST00000563951 NCALDP61601 193 aa7.54□□□□□ -1.2
CCDC33-211ENST00000563951 POU4F3Q15319 338 aa7.54□□□□□ -1.2
CCDC33-211ENST00000563951 FXNQ16595 210 aa7.54□□□□□ -1.2
CCDC33-211ENST00000563951 ELOA3BQ3SY89 546 aa7.54□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.4 ms