RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000562425.1

PKD1-226, Transcript of polycystin 1, transient receptor potential channel interacting, humanhuman

TSL 3

Gene PKD1, Length 608 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD1-226ENST00000562425 ABCD2Q9UBJ2 740 aa14.6□□□□□ -0.07
PKD1-226ENST00000562425 SH3GLB1Q9Y371 365 aa14.6□□□□□ -0.07
PKD1-226ENST00000562425 ZFHX3Q15911 3703 aa14.59□□□□□ -0.07
PKD1-226ENST00000562425 A0A087WUJ7 227 aa14.59□□□□□ -0.07
PKD1-226ENST00000562425 C16orf97H3BN30 126 aa14.59□□□□□ -0.07
PKD1-226ENST00000562425 CXCR6O00574 342 aa14.59□□□□□ -0.07
PKD1-226ENST00000562425 TPST2O60704 377 aa14.59□□□□□ -0.07
PKD1-226ENST00000562425 GMNNO75496 209 aa14.59□□□□□ -0.07
PKD1-226ENST00000562425 VAMP5O95183 116 aa14.59□□□□□ -0.07
PKD1-226ENST00000562425 CRYBA2P53672 197 aa14.59□□□□□ -0.07
PKD1-226ENST00000562425 SLC16A1P53985 500 aa14.59□□□□□ -0.07
PKD1-226ENST00000562425 SELENOWP63302 87 aa14.59□□□□□ -0.07
PKD1-226ENST00000562425 MXRA7P84157 204 aa14.59□□□□□ -0.07
PKD1-226ENST00000562425 FAM27E3Q08E93 113 aa14.59□□□□□ -0.07
PKD1-226ENST00000562425 KRT72Q14CN4 511 aa14.59□□□□□ -0.07
PKD1-226ENST00000562425 EXOC3L2Q2M3D2 409 aa14.59□□□□□ -0.07
PKD1-226ENST00000562425 ENTPD8Q5MY95 495 aa14.59□□□□□ -0.07
PKD1-226ENST00000562425 OTUD3Q5T2D3 398 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
PKD1-226ENST00000562425 TMEM225Q6GV28 225 aa14.59□□□□□ -0.07
PKD1-226ENST00000562425 NUFIP2Q7Z417 695 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
PKD1-226ENST00000562425 CARM1Q86X55 608 aa14.59□□□□□ -0.07
PKD1-226ENST00000562425 ZNF295-AS1Q8N0V1 137 aa14.59□□□□□ -0.07
PKD1-226ENST00000562425 WFDC6Q9BQY6 131 aa14.59□□□□□ -0.07
PKD1-226ENST00000562425 ARL8BQ9NVJ2 186 aa14.59□□□□□ -0.07
PKD1-226ENST00000562425 ADA2Q9NZK5 511 aa14.59□□□□□ -0.07
PKD1-226ENST00000562425 CRIM1Q9NZV1 1036 aa14.59□□□□□ -0.07
PKD1-226ENST00000562425 TRAV36DV7A0A075B6V5 113 aa14.58□□□□□ -0.08
PKD1-226ENST00000562425 TRAPPC13A5PLN9 417 aa14.58□□□□□ -0.08
PKD1-226ENST00000562425 ZNF716A6NP11 495 aa14.58□□□□□ -0.08
PKD1-226ENST00000562425 CASKO14936 926 aa14.58□□□□□ -0.08
PKD1-226ENST00000562425 CHP2O43745 196 aa14.58□□□□□ -0.08
PKD1-226ENST00000562425 KLK2P20151 261 aa14.58□□□□□ -0.08
PKD1-226ENST00000562425 IFNA8P32881 189 aa14.58□□□□□ -0.08
PKD1-226ENST00000562425 RPS5P46782 204 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
PKD1-226ENST00000562425 CDH12P55289 794 aa14.58□□□□□ -0.08
PKD1-226ENST00000562425 TLE4Q04727 773 aa14.58□□□□□ -0.08
PKD1-226ENST00000562425 SNTB1Q13884 538 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
PKD1-226ENST00000562425 MFSD13AQ14CX5 517 aa14.58□□□□□ -0.08
PKD1-226ENST00000562425 FAM69AQ5T7M9 428 aa14.58□□□□□ -0.08
PKD1-226ENST00000562425 C16orf89Q6UX73 402 aa14.58□□□□□ -0.08
PKD1-226ENST00000562425 CCDC103Q8IW40 242 aa14.58□□□□□ -0.08
PKD1-226ENST00000562425 ZNF100Q8IYN0 542 aa14.58□□□□□ -0.08
PKD1-226ENST00000562425 PGAM4Q8N0Y7 254 aa14.58□□□□□ -0.08
PKD1-226ENST00000562425 OR6S1Q8NH40 331 aa14.58□□□□□ -0.08
PKD1-226ENST00000562425 ADAMTS16Q8TE57 1224 aa14.58□□□□□ -0.08
PKD1-226ENST00000562425 SLC25A36Q96CQ1 311 aa14.58□□□□□ -0.08
PKD1-226ENST00000562425 TPD52L3Q96J77 140 aa14.58□□□□□ -0.08
PKD1-226ENST00000562425 DACH2Q96NX9 599 aa14.58□□□□□ -0.08
PKD1-226ENST00000562425 ZNF300Q96RE9 604 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
PKD1-226ENST00000562425 TMEM43Q9BTV4 400 aa14.58□□□□□ -0.08
PKD1-226ENST00000562425 SF3B5Q9BWJ5 86 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
PKD1-226ENST00000562425 POLR2J2Q9GZM3 115 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
PKD1-226ENST00000562425 PCDHAC1Q9H158 963 aa14.58□□□□□ -0.08
PKD1-226ENST00000562425 POLR2J3Q9H1A7 115 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
PKD1-226ENST00000562425 PARPBPQ9NWS1 579 aa14.58□□□□□ -0.08
PKD1-226ENST00000562425 ING1Q9UK53 422 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
PKD1-226ENST00000562425 NOSIPQ9Y314 301 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
PKD1-226ENST00000562425 ITPR3Q14573 2671 aa14.58□□□□□ -0.08
PKD1-226ENST00000562425 ANKHD1Q8IWZ3 2542 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
PKD1-226ENST00000562425 AQP7P3A6NL99 342 aa14.57□□□□□ -0.08
PKD1-226ENST00000562425 CPSF4LA6NMK7 179 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
PKD1-226ENST00000562425 AKR7A3O95154 331 aa14.57□□□□□ -0.08
PKD1-226ENST00000562425 CNOT4O95628 575 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
PKD1-226ENST00000562425 EPXP11678 715 aa14.57□□□□□ -0.08
PKD1-226ENST00000562425 PPP3CBP16298 524 aa14.57□□□□□ -0.08
PKD1-226ENST00000562425 UGT2B10P36537 528 aa14.57□□□□□ -0.08
PKD1-226ENST00000562425 OR3A2P47893 321 aa14.57□□□□□ -0.08
PKD1-226ENST00000562425 EGR4Q05215 589 aa14.57□□□□□ -0.08
PKD1-226ENST00000562425 NPTX1Q15818 432 aa14.57□□□□□ -0.08
PKD1-226ENST00000562425 TFAP2EQ6VUC0 442 aa14.57□□□□□ -0.08
PKD1-226ENST00000562425 RBM45Q8IUH3 476 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
PKD1-226ENST00000562425 FITM2Q8N6M3 262 aa14.57□□□□□ -0.08
PKD1-226ENST00000562425 TMEM99Q8N816 258 aa14.57□□□□□ -0.08
PKD1-226ENST00000562425 OR4D11Q8NGI4 311 aa14.57□□□□□ -0.08
PKD1-226ENST00000562425 LINC01560Q8TB33 94 aa14.57□□□□□ -0.08
PKD1-226ENST00000562425 FAM162AQ96A26 154 aa14.57□□□□□ -0.08
PKD1-226ENST00000562425 ZNF775Q96BV0 537 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
PKD1-226ENST00000562425 KTI12Q96EK9 354 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
PKD1-226ENST00000562425 NSL1Q96IY1 281 aa14.57□□□□□ -0.08
PKD1-226ENST00000562425 MPP4Q96JB8 637 aa14.57□□□□□ -0.08
PKD1-226ENST00000562425 HDHD5Q9BXW7 423 aa14.57□□□□□ -0.08
PKD1-226ENST00000562425 KLHL4Q9C0H6 718 aa14.57□□□□□ -0.08
PKD1-226ENST00000562425 MCCC2Q9HCC0 563 aa14.57□□□□□ -0.08
PKD1-226ENST00000562425 C6orf203Q9P0P8 240 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
PKD1-226ENST00000562425 RASD1Q9Y272 281 aa14.57□□□□□ -0.08
PKD1-226ENST00000562425 NF1P21359 2839 aa14.57□□□□□ -0.08
PKD1-226ENST00000562425 SH3D21A4FU49 640 aa14.56□□□□□ -0.08
PKD1-226ENST00000562425 ZNF814B7Z6K7 855 aa14.56□□□□□ -0.08
PKD1-226ENST00000562425 FTCDNL1E5RQL4 147 aa14.56□□□□□ -0.08
PKD1-226ENST00000562425 MRPL33O75394 65 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
PKD1-226ENST00000562425 GOSR1O95249 250 aa14.56□□□□□ -0.08
PKD1-226ENST00000562425 SLC17A1Q14916 467 aa14.56□□□□□ -0.08
PKD1-226ENST00000562425 DAZAP2Q15038 168 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
PKD1-226ENST00000562425 P2RY6Q15077 328 aa14.56□□□□□ -0.08
PKD1-226ENST00000562425 SPATS1Q496A3 300 aa14.56□□□□□ -0.08
PKD1-226ENST00000562425 SAMD4BQ5PRF9 694 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
PKD1-226ENST00000562425 TTC33Q6PID6 262 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
PKD1-226ENST00000562425 LINC00114Q6XXX2 140 aa14.56□□□□□ -0.08
PKD1-226ENST00000562425 SPNS3Q6ZMD2 512 aa14.56□□□□□ -0.08
PKD1-226ENST00000562425 DEF8Q6ZN54 512 aa14.56□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.5 ms