RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560965.1

CHP1-208, Transcript of calcineurin like EF-hand protein 1, human

TSL 2

Gene CHP1, Length 467 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CHP1-208	ENST00000560965	SH3YL1	Q96HL8	342 aa	Predicted RBP	5.19	□□□□□ -1.58
CHP1-208	ENST00000560965	EAF1	Q96JC9	268 aa	Predicted RBP	5.19	□□□□□ -1.58
CHP1-208	ENST00000560965	RDH12	Q96NR8	316 aa		5.19	□□□□□ -1.58
CHP1-208	ENST00000560965	ALPK1	Q96QP1	1244 aa		5.19	□□□□□ -1.58
CHP1-208	ENST00000560965	C9orf16	Q9BUW7	83 aa		5.19	□□□□□ -1.58
CHP1-208	ENST00000560965	RSPO3	Q9BXY4	272 aa	Predicted RBP	5.19	□□□□□ -1.58
CHP1-208	ENST00000560965	RTN4R	Q9BZR6	473 aa		5.19	□□□□□ -1.58
CHP1-208	ENST00000560965	GABARAPL1	Q9H0R8	117 aa		5.19	□□□□□ -1.58
CHP1-208	ENST00000560965	RNPEPL1	Q9HAU8	725 aa		5.19	□□□□□ -1.58
CHP1-208	ENST00000560965	GP6	Q9HCN6	339 aa		5.19	□□□□□ -1.58
CHP1-208	ENST00000560965	FANCF	Q9NPI8	374 aa		5.19	□□□□□ -1.58
CHP1-208	ENST00000560965	KLHL1	Q9NR64	748 aa		5.19	□□□□□ -1.58
CHP1-208	ENST00000560965	OSGIN1	Q9UJX0	560 aa		5.19	□□□□□ -1.58
CHP1-208	ENST00000560965	FBXL2	Q9UKC9	423 aa		5.19	□□□□□ -1.58
CHP1-208	ENST00000560965	MED31	Q9Y3C7	131 aa		5.19	□□□□□ -1.58
CHP1-208	ENST00000560965	SAMHD1	Q9Y3Z3	626 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
CHP1-208	ENST00000560965	CORIN	Q9Y5Q5	1042 aa		5.19	□□□□□ -1.58
CHP1-208	ENST00000560965	EPG5	Q9HCE0	2579 aa		5.18	□□□□□ -1.58
CHP1-208	ENST00000560965	TRAV36DV7	A0A075B6V5	113 aa		5.18	□□□□□ -1.58
CHP1-208	ENST00000560965	TMED7-TICAM2	A0A0A6YYA0	188 aa		5.18	□□□□□ -1.58
CHP1-208	ENST00000560965	TRGV5	A0A0B4J1U4	118 aa		5.18	□□□□□ -1.58
CHP1-208	ENST00000560965	LOC102725191	A0A1B0GVB3	256 aa		5.18	□□□□□ -1.58
CHP1-208	ENST00000560965	SH3PXD2B	A1X283	911 aa		5.18	□□□□□ -1.58
CHP1-208	ENST00000560965	OR2M5	A3KFT3	312 aa		5.18	□□□□□ -1.58
CHP1-208	ENST00000560965	CPSF4L	A6NMK7	179 aa	Known RBP	5.18	□□□□□ -1.58
CHP1-208	ENST00000560965		G3V2T6	193 aa		5.18	□□□□□ -1.58
CHP1-208	ENST00000560965		H0YJX3	145 aa		5.18	□□□□□ -1.58
CHP1-208	ENST00000560965	hCG_2039718	K7EN88	272 aa		5.18	□□□□□ -1.58
CHP1-208	ENST00000560965	TNFRSF11B	O00300	401 aa		5.18	□□□□□ -1.58
CHP1-208	ENST00000560965	FFAR1	O14842	300 aa		5.18	□□□□□ -1.58
CHP1-208	ENST00000560965	BCKDK	O14874	412 aa		5.18	□□□□□ -1.58
CHP1-208	ENST00000560965	CASQ2	O14958	399 aa	Predicted RBP	5.18	□□□□□ -1.58
CHP1-208	ENST00000560965	FRS3	O43559	492 aa		5.18	□□□□□ -1.58
CHP1-208	ENST00000560965	SEMA7A	O75326	666 aa		5.18	□□□□□ -1.58
CHP1-208	ENST00000560965	TRAPPC6A	O75865	159 aa		5.18	□□□□□ -1.58
CHP1-208	ENST00000560965	CCNB2	O95067	398 aa		5.18	□□□□□ -1.58
CHP1-208	ENST00000560965	FCGR2A	P12318	317 aa		5.18	□□□□□ -1.58
CHP1-208	ENST00000560965	PRG2	P13727	222 aa		5.18	□□□□□ -1.58
CHP1-208	ENST00000560965	GABRA1	P14867	456 aa		5.18	□□□□□ -1.58
CHP1-208	ENST00000560965	CPN1	P15169	458 aa		5.18	□□□□□ -1.58
CHP1-208	ENST00000560965	CDH2	P19022	906 aa	Predicted RBP	5.18	□□□□□ -1.58
CHP1-208	ENST00000560965	FPR3	P25089	353 aa		5.18	□□□□□ -1.58
CHP1-208	ENST00000560965	MST1	P26927	711 aa		5.18	□□□□□ -1.58
CHP1-208	ENST00000560965	MAGEA5	P43359	124 aa		5.18	□□□□□ -1.58
CHP1-208	ENST00000560965	NUP107	P57740	925 aa		5.18	□□□□□ -1.58
CHP1-208	ENST00000560965	PRPS1	P60891	318 aa		5.18	□□□□□ -1.58
CHP1-208	ENST00000560965	GPR85	P60893	370 aa		5.18	□□□□□ -1.58
CHP1-208	ENST00000560965	SLC35A1	P78382	337 aa		5.18	□□□□□ -1.58
CHP1-208	ENST00000560965	PRKCD	Q05655	676 aa		5.18	□□□□□ -1.58
CHP1-208	ENST00000560965	RBPJ	Q06330	500 aa		5.18	□□□□□ -1.58
CHP1-208	ENST00000560965	SLC34A1	Q06495	639 aa		5.18	□□□□□ -1.58
CHP1-208	ENST00000560965	KRTAP1-1	Q07627	177 aa		5.18	□□□□□ -1.58
CHP1-208	ENST00000560965	FOXF1	Q12946	379 aa		5.18	□□□□□ -1.58
CHP1-208	ENST00000560965	TOMM20	Q15388	145 aa		5.18	□□□□□ -1.58
CHP1-208	ENST00000560965	ZNF239	Q16600	458 aa	Known RBP	5.18	□□□□□ -1.58
CHP1-208	ENST00000560965	EIF2S3L	Q2VIR3	472 aa	Known RBP	5.18	□□□□□ -1.58
CHP1-208	ENST00000560965	PLEKHN1	Q494U1	663 aa	Predicted RBP	5.18	□□□□□ -1.58
CHP1-208	ENST00000560965	ZNF324B	Q6AW86	544 aa	Predicted RBP	5.18	□□□□□ -1.58
CHP1-208	ENST00000560965	GTF2IRD2B	Q6EKJ0	949 aa		5.18	□□□□□ -1.58
CHP1-208	ENST00000560965	VASN	Q6EMK4	673 aa		5.18	□□□□□ -1.58
CHP1-208	ENST00000560965	OR5M10	Q6IEU7	315 aa		5.18	□□□□□ -1.58
CHP1-208	ENST00000560965	C1orf94	Q6P1W5	598 aa		5.18	□□□□□ -1.58
CHP1-208	ENST00000560965	ARSK	Q6UWY0	536 aa		5.18	□□□□□ -1.58
CHP1-208	ENST00000560965	CD300LD	Q6UXZ3	194 aa		5.18	□□□□□ -1.58
CHP1-208	ENST00000560965	ZNF730	Q6ZMV8	503 aa		5.18	□□□□□ -1.58
CHP1-208	ENST00000560965	TRIL	Q7L0X0	811 aa		5.18	□□□□□ -1.58
CHP1-208	ENST00000560965	OLIG3	Q7RTU3	272 aa		5.18	□□□□□ -1.58
CHP1-208	ENST00000560965	HDDC2	Q7Z4H3	204 aa		5.18	□□□□□ -1.58
CHP1-208	ENST00000560965	TSEN54	Q7Z6J9	526 aa	Known RBP	5.18	□□□□□ -1.58
CHP1-208	ENST00000560965	GTF2IRD2	Q86UP8	949 aa		5.18	□□□□□ -1.58
CHP1-208	ENST00000560965	ADGRG3	Q86Y34	549 aa		5.18	□□□□□ -1.58
CHP1-208	ENST00000560965	LACC1	Q8IV20	430 aa		5.18	□□□□□ -1.58
CHP1-208	ENST00000560965	SIAH3	Q8IW03	269 aa		5.18	□□□□□ -1.58
CHP1-208	ENST00000560965	PARP8	Q8N3A8	854 aa		5.18	□□□□□ -1.58
CHP1-208	ENST00000560965	CLDN22	Q8N7P3	220 aa		5.18	□□□□□ -1.58
CHP1-208	ENST00000560965	OR4D11	Q8NGI4	311 aa		5.18	□□□□□ -1.58
CHP1-208	ENST00000560965	OR4C15	Q8NGM1	316 aa		5.18	□□□□□ -1.58
CHP1-208	ENST00000560965	PIGX	Q8TBF5	258 aa		5.18	□□□□□ -1.58
CHP1-208	ENST00000560965	SLC7A13	Q8TCU3	470 aa		5.18	□□□□□ -1.58
CHP1-208	ENST00000560965	ZPLD1	Q8TCW7	415 aa		5.18	□□□□□ -1.58
CHP1-208	ENST00000560965	ABTB1	Q969K4	478 aa	Predicted RBP	5.18	□□□□□ -1.58
CHP1-208	ENST00000560965	CPNE4	Q96A23	557 aa	Predicted RBP	5.18	□□□□□ -1.58
CHP1-208	ENST00000560965	MIB2	Q96AX9	1013 aa		5.18	□□□□□ -1.58
CHP1-208	ENST00000560965	ZHX1-C8orf76	Q96EF9	292 aa		5.18	□□□□□ -1.58
CHP1-208	ENST00000560965	GPR137	Q96N19	417 aa		5.18	□□□□□ -1.58
CHP1-208	ENST00000560965	SFXN2	Q96NB2	322 aa		5.18	□□□□□ -1.58
CHP1-208	ENST00000560965	RBM4B	Q9BQ04	359 aa	Known RBP	5.18	□□□□□ -1.58
CHP1-208	ENST00000560965	SLX1A	Q9BQ83	275 aa		5.18	□□□□□ -1.58
CHP1-208	ENST00000560965	PRSS27	Q9BQR3	290 aa		5.18	□□□□□ -1.58
CHP1-208	ENST00000560965	TACO1	Q9BSH4	297 aa	Known RBP	5.18	□□□□□ -1.58
CHP1-208	ENST00000560965	FUZ	Q9BT04	418 aa		5.18	□□□□□ -1.58
CHP1-208	ENST00000560965	RBM4	Q9BWF3	364 aa	Known RBP	5.18	□□□□□ -1.58
CHP1-208	ENST00000560965	TAPBPL	Q9BX59	468 aa		5.18	□□□□□ -1.58
CHP1-208	ENST00000560965	TEX12	Q9BXU0	123 aa		5.18	□□□□□ -1.58
CHP1-208	ENST00000560965	DGCR6L	Q9BY27	220 aa		5.18	□□□□□ -1.58
CHP1-208	ENST00000560965	PRDM14	Q9GZV8	571 aa		5.18	□□□□□ -1.58
CHP1-208	ENST00000560965	LDAH	Q9H6V9	325 aa		5.18	□□□□□ -1.58
CHP1-208	ENST00000560965	FKRP	Q9H9S5	495 aa		5.18	□□□□□ -1.58
CHP1-208	ENST00000560965	ZNF556	Q9HAH1	456 aa		5.18	□□□□□ -1.58
CHP1-208	ENST00000560965	CTPS2	Q9NRF8	586 aa		5.18	□□□□□ -1.58

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