RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556343.1

ACTN1-218, Transcript of actinin alpha 1, humanhuman

TSL 3

Gene ACTN1, Length 274 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN1-218ENST00000556343 IDH3BO43837 385 aa8.3□□□□□ -1.08
ACTN1-218ENST00000556343 EFNA2O43921 213 aa8.3□□□□□ -1.08
ACTN1-218ENST00000556343 MPZL2O60487 215 aa8.3□□□□□ -1.08
ACTN1-218ENST00000556343 MITFO75030 526 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
ACTN1-218ENST00000556343 PTP4A3O75365 173 aa8.3□□□□□ -1.08
ACTN1-218ENST00000556343 SYNGR4O95473 234 aa8.3□□□□□ -1.08
ACTN1-218ENST00000556343 SNAP29O95721 258 aa8.3□□□□□ -1.08
ACTN1-218ENST00000556343 IGHG3P01860 377 aa8.3□□□□□ -1.08
ACTN1-218ENST00000556343 BGLAPP02818 100 aa8.3□□□□□ -1.08
ACTN1-218ENST00000556343 PDGFAP04085 211 aa8.3□□□□□ -1.08
ACTN1-218ENST00000556343 FAM87AP0C7U9 286 aa8.3□□□□□ -1.08
ACTN1-218ENST00000556343 ADORA3P0DMS8 318 aa8.3□□□□□ -1.08
ACTN1-218ENST00000556343 GRPRP30550 384 aa8.3□□□□□ -1.08
ACTN1-218ENST00000556343 CD97P48960 835 aa8.3□□□□□ -1.08
ACTN1-218ENST00000556343 GFRA1P56159 465 aa8.3□□□□□ -1.08
ACTN1-218ENST00000556343 B3GALT5-AS1P59052 145 aa8.3□□□□□ -1.08
ACTN1-218ENST00000556343 RAC3P60763 192 aa8.3□□□□□ -1.08
ACTN1-218ENST00000556343 CDC42P60953 191 aa8.3□□□□□ -1.08
ACTN1-218ENST00000556343 EGR4Q05215 589 aa8.3□□□□□ -1.08
ACTN1-218ENST00000556343 KLRB1Q12918 225 aa8.3□□□□□ -1.08
ACTN1-218ENST00000556343 MYBPHQ13203 477 aa8.3□□□□□ -1.08
ACTN1-218ENST00000556343 MED21Q13503 144 aa8.3□□□□□ -1.08
ACTN1-218ENST00000556343 KEAP1Q14145 624 aa8.3□□□□□ -1.08
ACTN1-218ENST00000556343 GINS1Q14691 196 aa8.3□□□□□ -1.08
ACTN1-218ENST00000556343 SGCBQ16585 318 aa8.3□□□□□ -1.08
ACTN1-218ENST00000556343 SLC36A3Q495N2 470 aa8.3□□□□□ -1.08
ACTN1-218ENST00000556343 NHSL2Q5HYW2 709 aa8.3□□□□□ -1.08
ACTN1-218ENST00000556343 SLC6A19Q695T7 634 aa8.3□□□□□ -1.08
ACTN1-218ENST00000556343 HBMQ6B0K9 141 aa8.3□□□□□ -1.08
ACTN1-218ENST00000556343 GTF2IRD2BQ6EKJ0 949 aa8.3□□□□□ -1.08
ACTN1-218ENST00000556343 TMEM225Q6GV28 225 aa8.3□□□□□ -1.08
ACTN1-218ENST00000556343 KRT80Q6KB66 452 aa8.3□□□□□ -1.08
ACTN1-218ENST00000556343 SLC27A4Q6P1M0 643 aa8.3□□□□□ -1.08
ACTN1-218ENST00000556343 CASP12Q6UXS9 341 aa8.3□□□□□ -1.08
ACTN1-218ENST00000556343 DPY19L2P2Q6ZN68 376 aa8.3□□□□□ -1.08
ACTN1-218ENST00000556343 ZNF620Q6ZNG0 422 aa8.3□□□□□ -1.08
ACTN1-218ENST00000556343 TRILQ7L0X0 811 aa8.3□□□□□ -1.08
ACTN1-218ENST00000556343 SLC46A3Q7Z3Q1 461 aa8.3□□□□□ -1.08
ACTN1-218ENST00000556343 GTF2IRD2Q86UP8 949 aa8.3□□□□□ -1.08
ACTN1-218ENST00000556343 PM20D2Q8IYS1 436 aa8.3□□□□□ -1.08
ACTN1-218ENST00000556343 ADPRHL1Q8NDY3 354 aa8.3□□□□□ -1.08
ACTN1-218ENST00000556343 OR2T33Q8NG76 320 aa8.3□□□□□ -1.08
ACTN1-218ENST00000556343 OR2V1Q8NHB1 315 aa8.3□□□□□ -1.08
ACTN1-218ENST00000556343 NEIL3Q8TAT5 605 aa8.3□□□□□ -1.08
ACTN1-218ENST00000556343 TRUB1Q8WWH5 349 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
ACTN1-218ENST00000556343 CPNE4Q96A23 557 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
ACTN1-218ENST00000556343 MIB2Q96AX9 1013 aa8.3□□□□□ -1.08
ACTN1-218ENST00000556343 ZNF524Q96C55 264 aa8.3□□□□□ -1.08
ACTN1-218ENST00000556343 WBP1Q96G27 269 aa8.3□□□□□ -1.08
ACTN1-218ENST00000556343 PLEKHA8Q96JA3 519 aa8.3□□□□□ -1.08
ACTN1-218ENST00000556343 SLC38A2Q96QD8 506 aa8.3□□□□□ -1.08
ACTN1-218ENST00000556343 TNFRSF13CQ96RJ3 184 aa8.3□□□□□ -1.08
ACTN1-218ENST00000556343 IFT27Q9BW83 186 aa8.3□□□□□ -1.08
ACTN1-218ENST00000556343 TSSK6Q9BXA6 273 aa8.3□□□□□ -1.08
ACTN1-218ENST00000556343 GRIP2Q9C0E4 1043 aa8.3□□□□□ -1.08
ACTN1-218ENST00000556343 OR11A1Q9GZK7 315 aa8.3□□□□□ -1.08
ACTN1-218ENST00000556343 SLC25A18Q9H1K4 315 aa8.3□□□□□ -1.08
ACTN1-218ENST00000556343 OR52D1Q9H346 318 aa8.3□□□□□ -1.08
ACTN1-218ENST00000556343 TMEM185BQ9H7F4 350 aa8.3□□□□□ -1.08
ACTN1-218ENST00000556343 IMPAD1Q9NX62 359 aa8.3□□□□□ -1.08
ACTN1-218ENST00000556343 IL20Q9NYY1 176 aa8.3□□□□□ -1.08
ACTN1-218ENST00000556343 TMEFF2Q9UIK5 374 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
ACTN1-218ENST00000556343 MCTS1Q9ULC4 181 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
ACTN1-218ENST00000556343 NPIPA1Q9UND3 350 aa8.3□□□□□ -1.08
ACTN1-218ENST00000556343 SIGLEC7Q9Y286 467 aa8.3□□□□□ -1.08
ACTN1-218ENST00000556343 HIF3AQ9Y2N7 669 aa8.3□□□□□ -1.08
ACTN1-218ENST00000556343 CSAG2Q9Y5P2 127 aa8.3□□□□□ -1.08
ACTN1-218ENST00000556343 HSPE1-MOB4S4R3N1 261 aa8.3□□□□□ -1.08
ACTN1-218ENST00000556343 ASPMQ8IZT6 3477 aa8.3□□□□□ -1.08
ACTN1-218ENST00000556343 ANKRD11Q6UB99 2663 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
ACTN1-218ENST00000556343 A0A1B0GVC2 190 aa8.29□□□□□ -1.08
ACTN1-218ENST00000556343 A0A1W2PRG6 482 aa8.29□□□□□ -1.08
ACTN1-218ENST00000556343 ZC3H12DA2A288 527 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
ACTN1-218ENST00000556343 OR14I1A6ND48 311 aa8.29□□□□□ -1.08
ACTN1-218ENST00000556343 SNTNA6NMZ2 147 aa8.29□□□□□ -1.08
ACTN1-218ENST00000556343 AQP7O14520 342 aa8.29□□□□□ -1.08
ACTN1-218ENST00000556343 IMPA2O14732 288 aa8.29□□□□□ -1.08
ACTN1-218ENST00000556343 RNF13O43567 381 aa8.29□□□□□ -1.08
ACTN1-218ENST00000556343 DENRO43583 198 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
ACTN1-218ENST00000556343 VAMP5O95183 116 aa8.29□□□□□ -1.08
ACTN1-218ENST00000556343 IFNGP01579 166 aa8.29□□□□□ -1.08
ACTN1-218ENST00000556343 ASAH2BP0C7U1 165 aa8.29□□□□□ -1.08
ACTN1-218ENST00000556343 PTNP21246 168 aa8.29□□□□□ -1.08
ACTN1-218ENST00000556343 FUT4P22083 530 aa8.29□□□□□ -1.08
ACTN1-218ENST00000556343 ENPP1P22413 925 aa8.29□□□□□ -1.08
ACTN1-218ENST00000556343 AHCYP23526 432 aa8.29□□□□□ -1.08
ACTN1-218ENST00000556343 NOS3P29474 1203 aa8.29□□□□□ -1.08
ACTN1-218ENST00000556343 GIPRP48546 466 aa8.29□□□□□ -1.08
ACTN1-218ENST00000556343 DIO1P49895 249 aa8.29□□□□□ -1.08
ACTN1-218ENST00000556343 ZP4Q12836 540 aa8.29□□□□□ -1.08
ACTN1-218ENST00000556343 C1DQ13901 141 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
ACTN1-218ENST00000556343 PTGES3Q15185 160 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
ACTN1-218ENST00000556343 ALG10Q5BKT4 473 aa8.29□□□□□ -1.08
ACTN1-218ENST00000556343 GPR139Q6DWJ6 353 aa8.29□□□□□ -1.08
ACTN1-218ENST00000556343 VASNQ6EMK4 673 aa8.29□□□□□ -1.08
ACTN1-218ENST00000556343 ARHGAP11AQ6P4F7 1023 aa8.29□□□□□ -1.08
ACTN1-218ENST00000556343 HDDC2Q7Z4H3 204 aa8.29□□□□□ -1.08
ACTN1-218ENST00000556343 C8orf59Q8N0T1 100 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
ACTN1-218ENST00000556343 GHDCQ8N2G8 530 aa8.29□□□□□ -1.08
ACTN1-218ENST00000556343 OR13C2Q8NGS9 318 aa8.29□□□□□ -1.08
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