RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555557.5

SRP54-208, Transcript of signal recognition particle 54, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SRP54, Length 1,949 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRP54-208ENST00000555557 MCCC2Q9HCC0 563 aa9.2□□□□□ -0.94
SRP54-208ENST00000555557 RASSF1Q9NS23 344 aa9.2□□□□□ -0.94
SRP54-208ENST00000555557 TBC1D23Q9NUY8 699 aa9.2□□□□□ -0.94
SRP54-208ENST00000555557 ENOPH1Q9UHY7 261 aa9.2□□□□□ -0.94
SRP54-208ENST00000555557 PCDHGB6Q9Y5F9 930 aa9.2□□□□□ -0.94
SRP54-208ENST00000555557 CDH10Q9Y6N8 788 aa9.2□□□□□ -0.94
SRP54-208ENST00000555557 KMT2BQ9UMN6 2715 aaPredicted RBP9.2□□□□□ -0.94
SRP54-208ENST00000555557 MPDZO75970 2070 aa9.2□□□□□ -0.94
SRP54-208ENST00000555557 TRAV17A0A0B4J275 112 aa9.19□□□□□ -0.94
SRP54-208ENST00000555557 EIF4E1BA6NMX2 242 aaKnown RBP9.19□□□□□ -0.94
SRP54-208ENST00000555557 H0YC42 278 aa9.19□□□□□ -0.94
SRP54-208ENST00000555557 ZNF208O43345 1280 aa9.19□□□□□ -0.94
SRP54-208ENST00000555557 GLSO94925 669 aaPredicted RBP9.19□□□□□ -0.94
SRP54-208ENST00000555557 AHSA1O95433 338 aa9.19□□□□□ -0.94
SRP54-208ENST00000555557 ASAH2BP0C7U1 165 aa9.19□□□□□ -0.94
SRP54-208ENST00000555557 IMPDH2P12268 514 aa9.19□□□□□ -0.94
SRP54-208ENST00000555557 GGT2P36268 569 aa9.19□□□□□ -0.94
SRP54-208ENST00000555557 AQP2P41181 271 aa9.19□□□□□ -0.94
SRP54-208ENST00000555557 STARP49675 285 aa9.19□□□□□ -0.94
SRP54-208ENST00000555557 MLLT10P55197 1068 aa9.19□□□□□ -0.94
SRP54-208ENST00000555557 ISL1P61371 349 aa9.19□□□□□ -0.94
SRP54-208ENST00000555557 PPIAP62937 165 aaKnown RBP9.19□□□□□ -0.94
SRP54-208ENST00000555557 CDK5Q00535 292 aa9.19□□□□□ -0.94
SRP54-208ENST00000555557 IL5RAQ01344 420 aa9.19□□□□□ -0.94
SRP54-208ENST00000555557 SELENBP1Q13228 472 aa9.19□□□□□ -0.94
SRP54-208ENST00000555557 OR7A5Q15622 319 aa9.19□□□□□ -0.94
SRP54-208ENST00000555557 GLYR1Q49A26 553 aaPredicted RBP9.19□□□□□ -0.94
SRP54-208ENST00000555557 FAM69AQ5T7M9 428 aa9.19□□□□□ -0.94
SRP54-208ENST00000555557 KRT80Q6KB66 452 aa9.19□□□□□ -0.94
SRP54-208ENST00000555557 C3orf33Q6P1S2 294 aa9.19□□□□□ -0.94
SRP54-208ENST00000555557 SMARCD3Q6STE5 483 aa9.19□□□□□ -0.94
SRP54-208ENST00000555557 C8orf59Q8N0T1 100 aaPredicted RBP9.19□□□□□ -0.94
SRP54-208ENST00000555557 ZFP62Q8NB50 900 aaPredicted RBP9.19□□□□□ -0.94
SRP54-208ENST00000555557 OR4Q3Q8NH05 313 aa9.19□□□□□ -0.94
SRP54-208ENST00000555557 MOSPD2Q8NHP6 518 aa9.19□□□□□ -0.94
SRP54-208ENST00000555557 ZCCHC14Q8WYQ9 949 aaKnown RBP9.19□□□□□ -0.94
SRP54-208ENST00000555557 CRELD1Q96HD1 420 aa9.19□□□□□ -0.94
SRP54-208ENST00000555557 OR5B2Q96R09 309 aa9.19□□□□□ -0.94
SRP54-208ENST00000555557 PITX2Q99697 317 aa9.19□□□□□ -0.94
SRP54-208ENST00000555557 PIGQQ9BRB3 760 aa9.19□□□□□ -0.94
SRP54-208ENST00000555557 CHCHD3Q9NX63 227 aaKnown RBP9.19□□□□□ -0.94
SRP54-208ENST00000555557 TVP23BQ9NYZ1 205 aa9.19□□□□□ -0.94
SRP54-208ENST00000555557 SLC6A5Q9Y345 797 aa9.19□□□□□ -0.94
SRP54-208ENST00000555557 PCDHGA9Q9Y5G4 932 aaKnown RBP9.19□□□□□ -0.94
SRP54-208ENST00000555557 TNRC6AQ8NDV7 1962 aaKnown RBP9.19□□□□□ -0.94
SRP54-208ENST00000555557 PTPRQQ9UMZ3 2332 aa9.19□□□□□ -0.94
SRP54-208ENST00000555557 NCKAP5O14513 1909 aa9.19□□□□□ -0.94
SRP54-208ENST00000555557 FREM3P0C091 2139 aa9.19□□□□□ -0.94
SRP54-208ENST00000555557 A0A087WV48 116 aa9.19□□□□□ -0.94
SRP54-208ENST00000555557 MKRN2OSH3BPM6 223 aa9.19□□□□□ -0.94
SRP54-208ENST00000555557 HCN1O60741 890 aa9.19□□□□□ -0.94
SRP54-208ENST00000555557 RCBTB2O95199 551 aa9.19□□□□□ -0.94
SRP54-208ENST00000555557 IGF2P01344 180 aa9.19□□□□□ -0.94
SRP54-208ENST00000555557 BMP7P18075 431 aa9.19□□□□□ -0.94
SRP54-208ENST00000555557 ELK4P28324 431 aa9.19□□□□□ -0.94
SRP54-208ENST00000555557 GRPRP30550 384 aa9.19□□□□□ -0.94
SRP54-208ENST00000555557 SLC9A3P48764 834 aa9.19□□□□□ -0.94
SRP54-208ENST00000555557 CD47Q08722 323 aa9.19□□□□□ -0.94
SRP54-208ENST00000555557 MYBPHQ13203 477 aa9.19□□□□□ -0.94
SRP54-208ENST00000555557 ZNF800Q2TB10 664 aaPredicted RBP eCLIP9.19□□□□□ -0.942e-6■■□□□ 13.9
SRP54-208ENST00000555557 CTU2Q2VPK5 515 aaKnown RBP9.19□□□□□ -0.94
SRP54-208ENST00000555557 THAP5Q7Z6K1 395 aa9.19□□□□□ -0.94
SRP54-208ENST00000555557 ENTHD1Q8IYW4 607 aa9.19□□□□□ -0.94
SRP54-208ENST00000555557 CNIH3Q8TBE1 160 aa9.19□□□□□ -0.94
SRP54-208ENST00000555557 OSTF1Q92882 214 aa9.19□□□□□ -0.94
SRP54-208ENST00000555557 SFXN2Q96NB2 322 aa9.19□□□□□ -0.94
SRP54-208ENST00000555557 ADNPQ9H2P0 1102 aa9.19□□□□□ -0.94
SRP54-208ENST00000555557 B4GALT7Q9UBV7 327 aa9.19□□□□□ -0.94
SRP54-208ENST00000555557 RNF6Q9Y252 685 aa9.19□□□□□ -0.94
SRP54-208ENST00000555557 BSNQ9UPA5 3926 aa9.18□□□□□ -0.94
SRP54-208ENST00000555557 CACNA1GO43497 2377 aa9.18□□□□□ -0.94
SRP54-208ENST00000555557 ATMQ13315 3056 aa9.18□□□□□ -0.94
SRP54-208ENST00000555557 ANKRD11Q6UB99 2663 aaPredicted RBP9.18□□□□□ -0.94
SRP54-208ENST00000555557 MCIDASD6RGH6 385 aa9.18□□□□□ -0.94
SRP54-208ENST00000555557 FTCDNL1E5RQL4 147 aa9.18□□□□□ -0.94
SRP54-208ENST00000555557 M0R082 166 aa9.18□□□□□ -0.94
SRP54-208ENST00000555557 WISP2O76076 250 aa9.18□□□□□ -0.94
SRP54-208ENST00000555557 SLC2A10O95528 541 aa9.18□□□□□ -0.94
SRP54-208ENST00000555557 HIST1H2ABP04908 130 aa9.18□□□□□ -0.94
SRP54-208ENST00000555557 ITGB2P05107 769 aa9.18□□□□□ -0.94
SRP54-208ENST00000555557 F13BP05160 661 aa9.18□□□□□ -0.94
SRP54-208ENST00000555557 HPNP05981 417 aa9.18□□□□□ -0.94
SRP54-208ENST00000555557 UCNP55089 124 aa9.18□□□□□ -0.94
SRP54-208ENST00000555557 CLDN20P56880 219 aa9.18□□□□□ -0.94
SRP54-208ENST00000555557 DBPQ10586 325 aaPredicted RBP9.18□□□□□ -0.94
SRP54-208ENST00000555557 ST3GAL2Q16842 350 aa9.18□□□□□ -0.94
SRP54-208ENST00000555557 SLC35F1Q5T1Q4 408 aa9.18□□□□□ -0.94
SRP54-208ENST00000555557 SLX4IPQ5VYV7 408 aa9.18□□□□□ -0.94
SRP54-208ENST00000555557 LAIR2Q6ISS4 152 aa9.18□□□□□ -0.94
SRP54-208ENST00000555557 SLC27A4Q6P1M0 643 aa9.18□□□□□ -0.94
SRP54-208ENST00000555557 UGT2A3Q6UWM9 527 aa9.18□□□□□ -0.94
SRP54-208ENST00000555557 IGFL3Q6UXB1 125 aa9.18□□□□□ -0.94
SRP54-208ENST00000555557 HIST3H2AQ7L7L0 130 aa9.18□□□□□ -0.94
SRP54-208ENST00000555557 UBQLNLQ8IYU4 475 aa9.18□□□□□ -0.94
SRP54-208ENST00000555557 KDM8Q8N371 416 aa9.18□□□□□ -0.94
SRP54-208ENST00000555557 CLDN22Q8N7P3 220 aa9.18□□□□□ -0.94
SRP54-208ENST00000555557 RBMXL3Q8N7X1 1067 aaKnown RBP9.18□□□□□ -0.94
SRP54-208ENST00000555557 ZNF417Q8TAU3 575 aa9.18□□□□□ -0.94
SRP54-208ENST00000555557 LIPHQ8WWY8 451 aa9.18□□□□□ -0.94
SRP54-208ENST00000555557 TM9SF4Q92544 642 aa9.18□□□□□ -0.94
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.2 ms