RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000540184.5

TULP3-205, Transcript of tubby like protein 3, human

TSL 5

Gene TULP3, Length 978 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TULP3-205	ENST00000540184		A6NNC1	897 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TULP3-205	ENST00000540184	TMEM229A	B2RXF0	380 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TULP3-205	ENST00000540184	VAMP5	O95183	116 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TULP3-205	ENST00000540184	ZNF682	O95780	498 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TULP3-205	ENST00000540184	FAM107A	O95990	144 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TULP3-205	ENST00000540184	ADA	P00813	363 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TULP3-205	ENST00000540184	OR3A2	P47893	321 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TULP3-205	ENST00000540184	MNAT1	P51948	309 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TULP3-205	ENST00000540184	CDH12	P55289	794 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TULP3-205	ENST00000540184	TAS2R41	P59536	307 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TULP3-205	ENST00000540184	DAZAP2	Q15038	168 aa	Predicted RBP	12.84	□□□□□ -0.35
TULP3-205	ENST00000540184	ENTPD8	Q5MY95	495 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TULP3-205	ENST00000540184	C6orf89	Q6UWU4	347 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TULP3-205	ENST00000540184	CASP12	Q6UXS9	341 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TULP3-205	ENST00000540184	DEF8	Q6ZN54	512 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TULP3-205	ENST00000540184	ZC3HAV1	Q7Z2W4	902 aa	Known RBP	12.84	□□□□□ -0.35
TULP3-205	ENST00000540184	CXorf67	Q86X51	503 aa	Predicted RBP	12.84	□□□□□ -0.35
TULP3-205	ENST00000540184	CARM1	Q86X55	608 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TULP3-205	ENST00000540184	TMEM99	Q8N816	258 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TULP3-205	ENST00000540184	FAM162A	Q96A26	154 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TULP3-205	ENST00000540184	KTI12	Q96EK9	354 aa	Predicted RBP	12.84	□□□□□ -0.35
TULP3-205	ENST00000540184	LURAP1	Q96LR2	239 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TULP3-205	ENST00000540184	DOCK7	Q96N67	2140 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TULP3-205	ENST00000540184	WFIKKN1	Q96NZ8	548 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TULP3-205	ENST00000540184	SF3B5	Q9BWJ5	86 aa	Known RBP	12.84	□□□□□ -0.35
TULP3-205	ENST00000540184	ASPN	Q9BXN1	380 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TULP3-205	ENST00000540184	RSPO3	Q9BXY4	272 aa	Predicted RBP	12.84	□□□□□ -0.35
TULP3-205	ENST00000540184	CLEC4M	Q9H2X3	399 aa	Predicted RBP	12.84	□□□□□ -0.35
TULP3-205	ENST00000540184	UPB1	Q9UBR1	384 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TULP3-205	ENST00000540184	TAGLN3	Q9UI15	199 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TULP3-205	ENST00000540184	EDAR	Q9UNE0	448 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TULP3-205	ENST00000540184	RASD1	Q9Y272	281 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TULP3-205	ENST00000540184	GPR52	Q9Y2T5	361 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TULP3-205	ENST00000540184	ADGRG4	Q8IZF6	3080 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TULP3-205	ENST00000540184	INTS1	Q8N201	2190 aa	Known RBP	12.83	□□□□□ -0.36
TULP3-205	ENST00000540184		A0A087WUJ7	227 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TULP3-205	ENST00000540184	TRAPPC13	A5PLN9	417 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TULP3-205	ENST00000540184	AQP7P3	A6NL99	342 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TULP3-205	ENST00000540184	ZNF716	A6NP11	495 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TULP3-205	ENST00000540184	CXCR6	O00574	342 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TULP3-205	ENST00000540184	NME4	O00746	187 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TULP3-205	ENST00000540184	KRT33A	O76009	404 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TULP3-205	ENST00000540184	NQO1	P15559	274 aa	Known RBP	12.83	□□□□□ -0.36
TULP3-205	ENST00000540184	CBL	P22681	906 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TULP3-205	ENST00000540184	GSK3B	P49841	420 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TULP3-205	ENST00000540184	SLC16A1	P53985	500 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TULP3-205	ENST00000540184	H3F3A	P84243	136 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TULP3-205	ENST00000540184	C1D	Q13901	141 aa	Known RBP	12.83	□□□□□ -0.36
TULP3-205	ENST00000540184	MFSD13A	Q14CX5	517 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TULP3-205	ENST00000540184	P2RY6	Q15077	328 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TULP3-205	ENST00000540184	FAM69A	Q5T7M9	428 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TULP3-205	ENST00000540184	TTC33	Q6PID6	262 aa	Predicted RBP	12.83	□□□□□ -0.36
TULP3-205	ENST00000540184	STAC2	Q6ZMT1	411 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TULP3-205	ENST00000540184	FKBP9P1	Q75LS8	142 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TULP3-205	ENST00000540184	RBM45	Q8IUH3	476 aa	Known RBP	12.83	□□□□□ -0.36
TULP3-205	ENST00000540184	P3H2	Q8IVL5	708 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TULP3-205	ENST00000540184	KISS1R	Q969F8	398 aa	Predicted RBP	12.83	□□□□□ -0.36
TULP3-205	ENST00000540184	ACTR6	Q9GZN1	396 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TULP3-205	ENST00000540184	NDE1	Q9NXR1	346 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TULP3-205	ENST00000540184	ING1	Q9UK53	422 aa	Predicted RBP	12.83	□□□□□ -0.36
TULP3-205	ENST00000540184	TESMIN	Q9Y4I5	508 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TULP3-205	ENST00000540184	PKDREJ	Q9NTG1	2253 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TULP3-205	ENST00000540184	HEATR5A	Q86XA9	2040 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TULP3-205	ENST00000540184	CIB4	A0PJX0	185 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TULP3-205	ENST00000540184	ZNF814	B7Z6K7	855 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TULP3-205	ENST00000540184	CHP2	O43745	196 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TULP3-205	ENST00000540184	RAMP1	O60894	148 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TULP3-205	ENST00000540184	NPIPB7	O75200	414 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TULP3-205	ENST00000540184	CTAG2	O75638	210 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TULP3-205	ENST00000540184	GOSR1	O95249	250 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TULP3-205	ENST00000540184	IGHV3-9	P01782	118 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TULP3-205	ENST00000540184	PSMB1	P20618	241 aa	Known RBP	12.82	□□□□□ -0.36
TULP3-205	ENST00000540184	SELENOW	P63302	87 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TULP3-205	ENST00000540184	FOXD4	Q12950	439 aa	Predicted RBP	12.82	□□□□□ -0.36
TULP3-205	ENST00000540184	ITGAD	Q13349	1161 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TULP3-205	ENST00000540184	SLC17A1	Q14916	467 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TULP3-205	ENST00000540184	POU4F3	Q15319	338 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TULP3-205	ENST00000540184	C16orf89	Q6UX73	402 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TULP3-205	ENST00000540184		Q6ZT83	130 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TULP3-205	ENST00000540184	AAED1	Q7RTV5	226 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TULP3-205	ENST00000540184	OR9K2	Q8NGE7	335 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TULP3-205	ENST00000540184	ADAMTS16	Q8TE57	1224 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TULP3-205	ENST00000540184	TAAR8	Q969N4	342 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TULP3-205	ENST00000540184	USB1	Q9BQ65	265 aa	Known RBP	12.82	□□□□□ -0.36
TULP3-205	ENST00000540184	WFDC6	Q9BQY6	131 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TULP3-205	ENST00000540184	RASSF1	Q9NS23	344 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TULP3-205	ENST00000540184	PRSS50	Q9UI38	385 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TULP3-205	ENST00000540184	ADAM21	Q9UKJ8	722 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TULP3-205	ENST00000540184	SLC7A7	Q9UM01	511 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TULP3-205	ENST00000540184	TPST2	O60704	377 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TULP3-205	ENST00000540184	OR6A2	O95222	327 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TULP3-205	ENST00000540184	CNOT4	O95628	575 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
TULP3-205	ENST00000540184	HIST1H2AB	P04908	130 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TULP3-205	ENST00000540184	ZNF43	P17038	809 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TULP3-205	ENST00000540184	TNFRSF1B	P20333	461 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TULP3-205	ENST00000540184	PTN	P21246	168 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TULP3-205	ENST00000540184	GRPR	P30550	384 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TULP3-205	ENST00000540184	OR1E2	P47887	323 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TULP3-205	ENST00000540184	EGR4	Q05215	589 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TULP3-205	ENST00000540184	PMS2P3	Q13401	168 aa		12.81	□□□□□ -0.36

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