RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000539589.5

PACSIN3-211, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene PACSIN3, Length 2,009 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-211ENST00000539589 IL12BP29460 328 aa18.47■□□□□ 0.55
PACSIN3-211ENST00000539589 RPL4P36578 427 aaKnown RBP18.47■□□□□ 0.55
PACSIN3-211ENST00000539589 HNRNPA0Q13151 305 aaKnown RBP18.47■□□□□ 0.55
PACSIN3-211ENST00000539589 CDCP2Q5VXM1 449 aa18.47■□□□□ 0.55
PACSIN3-211ENST00000539589 APOOLQ6UXV4 268 aa18.47■□□□□ 0.55
PACSIN3-211ENST00000539589 SLC22A16Q86VW1 577 aa18.47■□□□□ 0.55
PACSIN3-211ENST00000539589 ARIH2OSQ8N7S6 290 aa18.47■□□□□ 0.55
PACSIN3-211ENST00000539589 CMKLR1Q99788 373 aa18.47■□□□□ 0.55
PACSIN3-211ENST00000539589 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP18.47■□□□□ 0.55
PACSIN3-211ENST00000539589 NRSN2Q9GZP1 204 aa18.47■□□□□ 0.55
PACSIN3-211ENST00000539589 IER3IP1Q9Y5U9 82 aa18.47■□□□□ 0.55
PACSIN3-211ENST00000539589 B3GALT1Q9Y5Z6 326 aa18.47■□□□□ 0.55
PACSIN3-211ENST00000539589 OIP5O43482 229 aa18.47■□□□□ 0.55
PACSIN3-211ENST00000539589 HNRNPCP07910 306 aaKnown RBP eCLIP18.47■□□□□ 0.55
PACSIN3-211ENST00000539589 GAAP10253 952 aa18.47■□□□□ 0.55
PACSIN3-211ENST00000539589 CLUP10909 449 aa18.47■□□□□ 0.55
PACSIN3-211ENST00000539589 RANBP1P43487 201 aa18.47■□□□□ 0.55
PACSIN3-211ENST00000539589 EMP2P54851 167 aa18.47■□□□□ 0.55
PACSIN3-211ENST00000539589 STEAP3Q658P3 488 aa18.47■□□□□ 0.55
PACSIN3-211ENST00000539589 CBLN3Q6UW01 205 aa18.47■□□□□ 0.55
PACSIN3-211ENST00000539589 SLC29A4Q7RTT9 530 aa18.47■□□□□ 0.55
PACSIN3-211ENST00000539589 ATG4DQ86TL0 474 aaPredicted RBP18.47■□□□□ 0.55
PACSIN3-211ENST00000539589 PRR22Q8IZ63 422 aa18.47■□□□□ 0.55
PACSIN3-211ENST00000539589 NFAM1Q8NET5 270 aaPredicted RBP18.47■□□□□ 0.55
PACSIN3-211ENST00000539589 OR4K13Q8NH42 304 aa18.47■□□□□ 0.55
PACSIN3-211ENST00000539589 WDR77Q9BQA1 342 aaPredicted RBP18.47■□□□□ 0.55
PACSIN3-211ENST00000539589 TMEM43Q9BTV4 400 aa18.47■□□□□ 0.55
PACSIN3-211ENST00000539589 ADGRL4Q9HBW9 690 aa18.47■□□□□ 0.55
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PACSIN3-211ENST00000539589 FAM86C1Q9NVL1 165 aa18.47■□□□□ 0.55
PACSIN3-211ENST00000539589 LOXL2Q9Y4K0 774 aa18.47■□□□□ 0.55
PACSIN3-211ENST00000539589 IGKV1D-42A0A075B6H8 117 aa18.46■□□□□ 0.55
PACSIN3-211ENST00000539589 MCIDASD6RGH6 385 aa18.46■□□□□ 0.55
PACSIN3-211ENST00000539589 LRRN3E7EW58 273 aa18.46■□□□□ 0.55
PACSIN3-211ENST00000539589 TO15178 435 aa18.46■□□□□ 0.55
PACSIN3-211ENST00000539589 ICOSLGO75144 302 aa18.46■□□□□ 0.55
PACSIN3-211ENST00000539589 MT-ND5P03915 603 aa18.46■□□□□ 0.55
PACSIN3-211ENST00000539589 MRPL3P09001 348 aaKnown RBP18.46■□□□□ 0.55
PACSIN3-211ENST00000539589 CLEC2LP0C7M8 214 aa18.46■□□□□ 0.55
PACSIN3-211ENST00000539589 HIST1H1CP16403 213 aaKnown RBP18.46■□□□□ 0.55
PACSIN3-211ENST00000539589 GALP22466 123 aa18.46■□□□□ 0.55
PACSIN3-211ENST00000539589 PRPS1P60891 318 aa18.46■□□□□ 0.55
PACSIN3-211ENST00000539589 ACTC1P68032 377 aa18.46■□□□□ 0.55
PACSIN3-211ENST00000539589 ACTA1P68133 377 aa18.46■□□□□ 0.55
PACSIN3-211ENST00000539589 ISXQ2M1V0 245 aa18.46■□□□□ 0.55
PACSIN3-211ENST00000539589 WDFY2Q96P53 400 aa18.46■□□□□ 0.55
PACSIN3-211ENST00000539589 CCDC32Q9BV29 185 aa18.46■□□□□ 0.55
PACSIN3-211ENST00000539589 KATNB1Q9BVA0 655 aa18.46■□□□□ 0.55
PACSIN3-211ENST00000539589 HDHD5Q9BXW7 423 aa18.46■□□□□ 0.55
PACSIN3-211ENST00000539589 ULBP3Q9BZM4 244 aa18.46■□□□□ 0.55
PACSIN3-211ENST00000539589 WWTR1Q9GZV5 400 aa18.46■□□□□ 0.55
PACSIN3-211ENST00000539589 LAT2Q9GZY6 243 aa18.46■□□□□ 0.55
PACSIN3-211ENST00000539589 FBXL4Q9UKA2 621 aa18.46■□□□□ 0.55
PACSIN3-211ENST00000539589 CMAHPQ9Y471 501 aa18.46■□□□□ 0.55
PACSIN3-211ENST00000539589 A0A1W2PNU3 283 aaPredicted RBP18.45■□□□□ 0.54
PACSIN3-211ENST00000539589 OR6C76A6NM76 312 aa18.45■□□□□ 0.54
PACSIN3-211ENST00000539589 GTF2E2P29084 291 aaKnown RBP18.45■□□□□ 0.54
PACSIN3-211ENST00000539589 SLC6A8P48029 635 aa18.45■□□□□ 0.54
PACSIN3-211ENST00000539589 TGM4P49221 684 aa18.45■□□□□ 0.54
PACSIN3-211ENST00000539589 NR0B1P51843 470 aaKnown RBP18.45■□□□□ 0.54
PACSIN3-211ENST00000539589 PSPHP78330 225 aa18.45■□□□□ 0.54
PACSIN3-211ENST00000539589 FAM198BQ6UWH4 519 aa18.45■□□□□ 0.54
PACSIN3-211ENST00000539589 ZNF517Q6ZMY9 492 aaPredicted RBP18.45■□□□□ 0.54
PACSIN3-211ENST00000539589 GPALPP1Q8IXQ4 340 aa18.45■□□□□ 0.54
PACSIN3-211ENST00000539589 GALNT6Q8NCL4 622 aa18.45■□□□□ 0.54
PACSIN3-211ENST00000539589 FAM83FQ8NEG4 500 aaPredicted RBP18.45■□□□□ 0.54
PACSIN3-211ENST00000539589 SMPDL3BQ92485 455 aa18.45■□□□□ 0.54
PACSIN3-211ENST00000539589 AP3S1Q92572 193 aa18.45■□□□□ 0.54
PACSIN3-211ENST00000539589 TIMP4Q99727 224 aa18.45■□□□□ 0.54
PACSIN3-211ENST00000539589 LRFN3Q9BTN0 628 aa18.45■□□□□ 0.54
PACSIN3-211ENST00000539589 SP140LQ9H930 580 aa18.45■□□□□ 0.54
PACSIN3-211ENST00000539589 POLE4Q9NR33 117 aa18.45■□□□□ 0.54
PACSIN3-211ENST00000539589 PLEKHB1Q9UF11 243 aaPredicted RBP18.45■□□□□ 0.54
PACSIN3-211ENST00000539589 MUC6Q6W4X9 2439 aa18.45■□□□□ 0.54
PACSIN3-211ENST00000539589 CDC14CA4D256 554 aa18.45■□□□□ 0.54
PACSIN3-211ENST00000539589 SLC35F4A4IF30 521 aa18.45■□□□□ 0.54
PACSIN3-211ENST00000539589 GABRPO00591 440 aa18.45■□□□□ 0.54
PACSIN3-211ENST00000539589 GYPBP06028 91 aa18.45■□□□□ 0.54
PACSIN3-211ENST00000539589 RPS4XP62701 263 aaKnown RBP18.45■□□□□ 0.54
PACSIN3-211ENST00000539589 E2F1Q01094 437 aa18.45■□□□□ 0.54
PACSIN3-211ENST00000539589 DBPQ10586 325 aaPredicted RBP18.45■□□□□ 0.54
PACSIN3-211ENST00000539589 DESI1Q6ICB0 168 aa18.45■□□□□ 0.54
PACSIN3-211ENST00000539589 SYT14Q8NB59 555 aa18.45■□□□□ 0.54
PACSIN3-211ENST00000539589 SDR9C7Q8NEX9 313 aa18.45■□□□□ 0.54
PACSIN3-211ENST00000539589 ZNF563Q8TA94 476 aa18.45■□□□□ 0.54
PACSIN3-211ENST00000539589 MR1Q95460 341 aa18.45■□□□□ 0.54
PACSIN3-211ENST00000539589 CDC6Q99741 560 aa18.45■□□□□ 0.54
PACSIN3-211ENST00000539589 CRB3Q9BUF7 120 aa18.45■□□□□ 0.54
PACSIN3-211ENST00000539589 POLHQ9Y253 713 aa18.45■□□□□ 0.54
PACSIN3-211ENST00000539589 CASKO14936 926 aa18.44■□□□□ 0.54
PACSIN3-211ENST00000539589 ARPC3O15145 178 aa18.44■□□□□ 0.54
PACSIN3-211ENST00000539589 RNF13O43567 381 aa18.44■□□□□ 0.54
PACSIN3-211ENST00000539589 IDH3BO43837 385 aa18.44■□□□□ 0.54
PACSIN3-211ENST00000539589 CAPZA2P47755 286 aa18.44■□□□□ 0.54
PACSIN3-211ENST00000539589 LGALS3BPQ08380 585 aa18.44■□□□□ 0.54
PACSIN3-211ENST00000539589 PLCXD2Q0VAA5 305 aa18.44■□□□□ 0.54
PACSIN3-211ENST00000539589 VASNQ6EMK4 673 aa18.44■□□□□ 0.54
PACSIN3-211ENST00000539589 TMEM205Q6UW68 189 aa18.44■□□□□ 0.54
PACSIN3-211ENST00000539589 RAB11FIP2Q7L804 512 aa18.44■□□□□ 0.54
PACSIN3-211ENST00000539589 MARCH9Q86YJ5 346 aa18.44■□□□□ 0.54
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