RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531995.1

PUF60-218, Transcript of poly(U) binding splicing factor 60, humanhuman

TSL 3

Gene PUF60, Length 631 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUF60-218ENST00000531995 FKBP2P26885 142 aaKnown RBP16.59■□□□□ 0.25
PUF60-218ENST00000531995 OPRM1P35372 400 aa16.59■□□□□ 0.25
PUF60-218ENST00000531995 CLK1P49759 484 aaKnown RBP16.59■□□□□ 0.25
PUF60-218ENST00000531995 MAP2K6P52564 334 aa16.59■□□□□ 0.25
PUF60-218ENST00000531995 RPS3AP61247 264 aaKnown RBP16.59■□□□□ 0.25
PUF60-218ENST00000531995 PON3Q15166 354 aa16.59■□□□□ 0.25
PUF60-218ENST00000531995 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP16.59■□□□□ 0.253e-9■■■■■ 45.6
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PUF60-218ENST00000531995 FNDC9Q8TBE3 224 aa16.59■□□□□ 0.25
PUF60-218ENST00000531995 ADAMTS16Q8TE57 1224 aa16.59■□□□□ 0.25
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PUF60-218ENST00000531995 DNAJC8O75937 253 aaPredicted RBP16.58■□□□□ 0.24
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PUF60-218ENST00000531995 RCBTB2O95199 551 aa16.58■□□□□ 0.24
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PUF60-218ENST00000531995 SORDQ00796 357 aa16.58■□□□□ 0.24
PUF60-218ENST00000531995 PIN1Q13526 163 aaPredicted RBP16.58■□□□□ 0.24
PUF60-218ENST00000531995 KEAP1Q14145 624 aa16.58■□□□□ 0.24
PUF60-218ENST00000531995 IFI44LQ53G44 452 aa16.58■□□□□ 0.24
PUF60-218ENST00000531995 CYP2R1Q6VVX0 501 aa16.58■□□□□ 0.24
PUF60-218ENST00000531995 KIF18BQ86Y91 864 aa16.58■□□□□ 0.24
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PUF60-218ENST00000531995 SLC47A1Q96FL8 570 aa16.58■□□□□ 0.24
PUF60-218ENST00000531995 NSMCE2Q96MF7 247 aa16.58■□□□□ 0.24
PUF60-218ENST00000531995 PTDSS2Q9BVG9 487 aa16.58■□□□□ 0.24
PUF60-218ENST00000531995 RBM24Q9BX46 236 aaKnown RBP16.58■□□□□ 0.24
PUF60-218ENST00000531995 RNF122Q9H9V4 155 aa16.58■□□□□ 0.24
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PUF60-218ENST00000531995 HDGFL3Q9Y3E1 203 aa16.58■□□□□ 0.24
PUF60-218ENST00000531995 ZNF175Q9Y473 711 aa16.58■□□□□ 0.24
PUF60-218ENST00000531995 SPIN1Q9Y657 262 aaPredicted RBP16.58■□□□□ 0.24
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PUF60-218ENST00000531995 SLC7A1P30825 629 aa16.57■□□□□ 0.24
PUF60-218ENST00000531995 DIO1P49895 249 aa16.57■□□□□ 0.24
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PUF60-218ENST00000531995 SGCBQ16585 318 aa16.57■□□□□ 0.24
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PUF60-218ENST00000531995 CHMP1BQ7LBR1 199 aa16.57■□□□□ 0.24
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PUF60-218ENST00000531995 STK35Q8TDR2 534 aa16.57■□□□□ 0.24
PUF60-218ENST00000531995 GEMIN6Q8WXD5 167 aaKnown RBP16.57■□□□□ 0.24
PUF60-218ENST00000531995 INTS12Q96CB8 462 aaKnown RBP16.57■□□□□ 0.24
PUF60-218ENST00000531995 DDIT4LQ96D03 193 aa16.57■□□□□ 0.24
PUF60-218ENST00000531995 KTI12Q96EK9 354 aaPredicted RBP16.57■□□□□ 0.24
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PUF60-218ENST00000531995 ING1Q9UK53 422 aaPredicted RBP16.57■□□□□ 0.24
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PUF60-218ENST00000531995 SAMD4AQ9UPU9 718 aaKnown RBP16.57■□□□□ 0.24
PUF60-218ENST00000531995 TRAPPC4Q9Y296 219 aa16.57■□□□□ 0.24
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PUF60-218ENST00000531995 ELOA3DA6NLF2 546 aaPredicted RBP16.56■□□□□ 0.24
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PUF60-218ENST00000531995 PNMTP11086 282 aa16.56■□□□□ 0.24
PUF60-218ENST00000531995 YAP1P46937 504 aaKnown RBP16.56■□□□□ 0.24
PUF60-218ENST00000531995 H3F3AP84243 136 aa16.56■□□□□ 0.24
PUF60-218ENST00000531995 GUSBP1Q15486 140 aa16.56■□□□□ 0.24
PUF60-218ENST00000531995 DEFB113Q30KQ7 82 aa16.56■□□□□ 0.24
PUF60-218ENST00000531995 ELOA3BQ3SY89 546 aa16.56■□□□□ 0.24
PUF60-218ENST00000531995 PDSS1Q5T2R2 415 aa16.56■□□□□ 0.24
PUF60-218ENST00000531995 SWT1Q5T5J6 900 aaKnown RBP16.56■□□□□ 0.24
PUF60-218ENST00000531995 FKBP9P1Q75LS8 142 aa16.56■□□□□ 0.24
PUF60-218ENST00000531995 ASRGL1Q7L266 308 aa16.56■□□□□ 0.24
PUF60-218ENST00000531995 ELOA3Q8NG57 546 aa16.56■□□□□ 0.24
PUF60-218ENST00000531995 MBD6Q96DN6 1003 aa16.56■□□□□ 0.24
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