RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531900.1

GPATCH4-216, Transcript of G-patch domain containing 4, humanhuman

TSL 2

Gene GPATCH4, Length 653 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPATCH4-216ENST00000531900 IFNA14P01570 189 aa9.59□□□□□ -0.87
GPATCH4-216ENST00000531900 KLK2P20151 261 aa9.59□□□□□ -0.87
GPATCH4-216ENST00000531900 FPR1P21462 350 aa9.59□□□□□ -0.87
GPATCH4-216ENST00000531900 DNAJA1P31689 397 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
GPATCH4-216ENST00000531900 KDELR2P33947 212 aa9.59□□□□□ -0.87
GPATCH4-216ENST00000531900 ART1P52961 327 aa9.59□□□□□ -0.87
GPATCH4-216ENST00000531900 RIPPLY3P57055 190 aa9.59□□□□□ -0.87
GPATCH4-216ENST00000531900 SNTB1Q13884 538 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
GPATCH4-216ENST00000531900 SLC17A1Q14916 467 aa9.59□□□□□ -0.87
GPATCH4-216ENST00000531900 POU4F3Q15319 338 aa9.59□□□□□ -0.87
GPATCH4-216ENST00000531900 OR1Q1Q15612 314 aa9.59□□□□□ -0.87
GPATCH4-216ENST00000531900 ALG10BQ5I7T1 473 aa9.59□□□□□ -0.87
GPATCH4-216ENST00000531900 FBXW10Q5XX13 1052 aa9.59□□□□□ -0.87
GPATCH4-216ENST00000531900 PPP4R4Q6NUP7 873 aa9.59□□□□□ -0.87
GPATCH4-216ENST00000531900 Q6ZT83 130 aa9.59□□□□□ -0.87
GPATCH4-216ENST00000531900 RANBP3LQ86VV4 465 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
GPATCH4-216ENST00000531900 MICU2Q8IYU8 434 aa9.59□□□□□ -0.87
GPATCH4-216ENST00000531900 SMYD1Q8NB12 490 aa9.59□□□□□ -0.87
GPATCH4-216ENST00000531900 OR2T12Q8NG77 320 aa9.59□□□□□ -0.87
GPATCH4-216ENST00000531900 OR6T1Q8NGN1 323 aa9.59□□□□□ -0.87
GPATCH4-216ENST00000531900 LINC01560Q8TB33 94 aa9.59□□□□□ -0.87
GPATCH4-216ENST00000531900 TMEM45BQ96B21 275 aa9.59□□□□□ -0.87
GPATCH4-216ENST00000531900 TMEM43Q9BTV4 400 aa9.59□□□□□ -0.87
GPATCH4-216ENST00000531900 ZNF426Q9BUY5 554 aa9.59□□□□□ -0.87
GPATCH4-216ENST00000531900 PTDSS2Q9BVG9 487 aa9.59□□□□□ -0.87
GPATCH4-216ENST00000531900 POLR2J2Q9GZM3 115 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
GPATCH4-216ENST00000531900 POLR2J3Q9H1A7 115 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
GPATCH4-216ENST00000531900 CLEC4MQ9H2X3 399 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
GPATCH4-216ENST00000531900 TMEM27Q9HBJ8 222 aa9.59□□□□□ -0.87
GPATCH4-216ENST00000531900 SLC13A4Q9UKG4 626 aa9.59□□□□□ -0.87
GPATCH4-216ENST00000531900 BAG5Q9UL15 447 aa9.59□□□□□ -0.87
GPATCH4-216ENST00000531900 PLCE1Q9P212 2302 aa9.59□□□□□ -0.87
GPATCH4-216ENST00000531900 SH3D21A4FU49 640 aa9.58□□□□□ -0.88
GPATCH4-216ENST00000531900 ELOA3DA6NLF2 546 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
GPATCH4-216ENST00000531900 CCT8L1PA6NM43 557 aa9.58□□□□□ -0.88
GPATCH4-216ENST00000531900 NME4O00746 187 aa9.58□□□□□ -0.88
GPATCH4-216ENST00000531900 RAMP1O60894 148 aa9.58□□□□□ -0.88
GPATCH4-216ENST00000531900 DCTN3O75935 186 aa9.58□□□□□ -0.88
GPATCH4-216ENST00000531900 LYPD3O95274 346 aa9.58□□□□□ -0.88
GPATCH4-216ENST00000531900 CCNA2P20248 432 aa9.58□□□□□ -0.88
GPATCH4-216ENST00000531900 NTF4P34130 210 aa9.58□□□□□ -0.88
GPATCH4-216ENST00000531900 CPOXP36551 454 aa9.58□□□□□ -0.88
GPATCH4-216ENST00000531900 OR2B6P58173 313 aa9.58□□□□□ -0.88
GPATCH4-216ENST00000531900 SELENOWP63302 87 aa9.58□□□□□ -0.88
GPATCH4-216ENST00000531900 BNIP2Q12982 314 aa9.58□□□□□ -0.88
GPATCH4-216ENST00000531900 CEACAM7Q14002 265 aa9.58□□□□□ -0.88
GPATCH4-216ENST00000531900 MFSD13AQ14CX5 517 aa9.58□□□□□ -0.88
GPATCH4-216ENST00000531900 NPTX1Q15818 432 aa9.58□□□□□ -0.88
GPATCH4-216ENST00000531900 FXNQ16595 210 aa9.58□□□□□ -0.88
GPATCH4-216ENST00000531900 ELOA3BQ3SY89 546 aa9.58□□□□□ -0.88
GPATCH4-216ENST00000531900 C1QTNF12Q5T7M4 302 aa9.58□□□□□ -0.88
GPATCH4-216ENST00000531900 FAM69AQ5T7M9 428 aa9.58□□□□□ -0.88
GPATCH4-216ENST00000531900 SSX8Q7RTT4 187 aa9.58□□□□□ -0.88
GPATCH4-216ENST00000531900 CCDC103Q8IW40 242 aa9.58□□□□□ -0.88
GPATCH4-216ENST00000531900 TMEM99Q8N816 258 aa9.58□□□□□ -0.88
GPATCH4-216ENST00000531900 ZIC4Q8N9L1 334 aa9.58□□□□□ -0.88
GPATCH4-216ENST00000531900 ADPRHL1Q8NDY3 354 aa9.58□□□□□ -0.88
GPATCH4-216ENST00000531900 ELOA3Q8NG57 546 aa9.58□□□□□ -0.88
GPATCH4-216ENST00000531900 OR4D11Q8NGI4 311 aa9.58□□□□□ -0.88
GPATCH4-216ENST00000531900 SLC41A3Q96GZ6 507 aa9.58□□□□□ -0.88
GPATCH4-216ENST00000531900 WFIKKN1Q96NZ8 548 aa9.58□□□□□ -0.88
GPATCH4-216ENST00000531900 LRRC37BQ96QE4 947 aa9.58□□□□□ -0.88
GPATCH4-216ENST00000531900 ZNF300Q96RE9 604 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
GPATCH4-216ENST00000531900 CCT8L2Q96SF2 557 aa9.58□□□□□ -0.88
GPATCH4-216ENST00000531900 MCHR1Q99705 422 aa9.58□□□□□ -0.88
GPATCH4-216ENST00000531900 PRR14Q9BWN1 585 aa9.58□□□□□ -0.88
GPATCH4-216ENST00000531900 TAPBPLQ9BX59 468 aa9.58□□□□□ -0.88
GPATCH4-216ENST00000531900 FAM107BQ9H098 131 aa9.58□□□□□ -0.88
GPATCH4-216ENST00000531900 PARPBPQ9NWS1 579 aa9.58□□□□□ -0.88
GPATCH4-216ENST00000531900 RPS6KB2Q9UBS0 482 aa9.58□□□□□ -0.88
GPATCH4-216ENST00000531900 B3GALT5Q9Y2C3 310 aa9.58□□□□□ -0.88
GPATCH4-216ENST00000531900 SLC9A8Q9Y2E8 581 aa9.58□□□□□ -0.88
GPATCH4-216ENST00000531900 FLVCR1Q9Y5Y0 555 aa9.58□□□□□ -0.88
GPATCH4-216ENST00000531900 ITPR3Q14573 2671 aa9.58□□□□□ -0.88
GPATCH4-216ENST00000531900 ZNF469Q96JG9 3925 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
GPATCH4-216ENST00000531900 TRAV36DV7A0A075B6V5 113 aa9.57□□□□□ -0.88
GPATCH4-216ENST00000531900 PDLIM1O00151 329 aa9.57□□□□□ -0.88
GPATCH4-216ENST00000531900 CHP2O43745 196 aa9.57□□□□□ -0.88
GPATCH4-216ENST00000531900 AHSA1O95433 338 aa9.57□□□□□ -0.88
GPATCH4-216ENST00000531900 FAM107AO95990 144 aa9.57□□□□□ -0.88
GPATCH4-216ENST00000531900 IGF2P01344 180 aa9.57□□□□□ -0.88
GPATCH4-216ENST00000531900 OPN1SWP03999 348 aa9.57□□□□□ -0.88
GPATCH4-216ENST00000531900 HRGP04196 525 aa9.57□□□□□ -0.88
GPATCH4-216ENST00000531900 THY1P04216 161 aa9.57□□□□□ -0.88
GPATCH4-216ENST00000531900 THRBP10828 461 aa9.57□□□□□ -0.88
GPATCH4-216ENST00000531900 COX5AP20674 150 aa9.57□□□□□ -0.88
GPATCH4-216ENST00000531900 CRYGSP22914 178 aa9.57□□□□□ -0.88
GPATCH4-216ENST00000531900 DNASE1P24855 282 aa9.57□□□□□ -0.88
GPATCH4-216ENST00000531900 SLC7A2P52569 658 aa9.57□□□□□ -0.88
GPATCH4-216ENST00000531900 IST1P53990 364 aa9.57□□□□□ -0.88
GPATCH4-216ENST00000531900 CDH12P55289 794 aa9.57□□□□□ -0.88
GPATCH4-216ENST00000531900 NCALDP61601 193 aa9.57□□□□□ -0.88
GPATCH4-216ENST00000531900 LIPEQ05469 1076 aa9.57□□□□□ -0.88
GPATCH4-216ENST00000531900 ITGADQ13349 1161 aa9.57□□□□□ -0.88
GPATCH4-216ENST00000531900 OR7A5Q15622 319 aa9.57□□□□□ -0.88
GPATCH4-216ENST00000531900 ENTPD8Q5MY95 495 aa9.57□□□□□ -0.88
GPATCH4-216ENST00000531900 OTUD3Q5T2D3 398 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
GPATCH4-216ENST00000531900 SFRP5Q5T4F7 317 aa9.57□□□□□ -0.88
GPATCH4-216ENST00000531900 FBXW9Q5XUX1 488 aa9.57□□□□□ -0.88
GPATCH4-216ENST00000531900 C22orf34Q6ZV56 151 aa9.57□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.6 ms