RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530579.6

NEDD8-MDP1-201, Transcript of NEDD8-MDP1 readthrough, humanhuman

TSL 2

Gene NEDD8-MDP1, Length 471 nt, Biotype nonsense mediated decay.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 DLGAP1O14490 977 aa7.65□□□□□ -1.18
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TNFSF11O14788 317 aa7.65□□□□□ -1.18
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PTP4A3O75365 173 aa7.65□□□□□ -1.18
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 RPL4P36578 427 aaKnown RBP7.65□□□□□ -1.18
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 AQP2P41181 271 aa7.65□□□□□ -1.18
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 DIO1P49895 249 aa7.65□□□□□ -1.18
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TPD52P55327 224 aaPredicted RBP7.65□□□□□ -1.18
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ESRRGP62508 458 aa7.65□□□□□ -1.18
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CSNK2A1P68400 391 aaPredicted RBP7.65□□□□□ -1.18
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 GINS1Q14691 196 aa7.65□□□□□ -1.18
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 INAQ16352 499 aa7.65□□□□□ -1.18
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SGCBQ16585 318 aa7.65□□□□□ -1.18
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 GXYLT1Q4G148 440 aa7.65□□□□□ -1.18
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 NHSL2Q5HYW2 709 aa7.65□□□□□ -1.18
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CLEC12AQ5QGZ9 265 aa7.65□□□□□ -1.18
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TMEM236Q5W0B7 351 aa7.65□□□□□ -1.18
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TTC23Q5W5X9 447 aa7.65□□□□□ -1.18
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 HBMQ6B0K9 141 aa7.65□□□□□ -1.18
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SMARCD3Q6STE5 483 aa7.65□□□□□ -1.18
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 FAM180AQ6UWF9 173 aa7.65□□□□□ -1.18
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 Q6ZPB1 254 aaPredicted RBP7.65□□□□□ -1.18
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TRILQ7L0X0 811 aa7.65□□□□□ -1.18
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CHMP1BQ7LBR1 199 aa7.65□□□□□ -1.18
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 NANOGNBQ7Z5D8 188 aa7.65□□□□□ -1.18
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 KIF18BQ86Y91 864 aa7.65□□□□□ -1.18
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PARP8Q8N3A8 854 aa7.65□□□□□ -1.18
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CISD2Q8N5K1 135 aaKnown RBP7.65□□□□□ -1.18
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 OR52L1Q8NGH7 329 aa7.65□□□□□ -1.18
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 OR5J2Q8NH18 312 aa7.65□□□□□ -1.18
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 OR6S1Q8NH40 331 aa7.65□□□□□ -1.18
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 MOSPD2Q8NHP6 518 aa7.65□□□□□ -1.18
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 NEIL3Q8TAT5 605 aa7.65□□□□□ -1.18
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 FANK1Q8TC84 345 aa7.65□□□□□ -1.18
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ZHX1-C8orf76Q96EF9 292 aa7.65□□□□□ -1.18
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CNTNAP3BQ96NU0 1288 aa7.65□□□□□ -1.18
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 NAA11Q9BSU3 229 aaPredicted RBP7.65□□□□□ -1.18
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ADI1Q9BV57 179 aa7.65□□□□□ -1.18
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 IFT27Q9BW83 186 aa7.65□□□□□ -1.18
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TSSK6Q9BXA6 273 aa7.65□□□□□ -1.18
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TEX12Q9BXU0 123 aa7.65□□□□□ -1.18
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CNTNAP3Q9BZ76 1288 aa7.65□□□□□ -1.18
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 NDEL1Q9GZM8 345 aa7.65□□□□□ -1.18
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SLC25A18Q9H1K4 315 aa7.65□□□□□ -1.18
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 Q9H521 79 aa7.65□□□□□ -1.18
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TIGARQ9NQ88 270 aa7.65□□□□□ -1.18
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TBC1D23Q9NUY8 699 aa7.65□□□□□ -1.18
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 IL20RAQ9UHF4 553 aa7.65□□□□□ -1.18
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CAMK2AQ9UQM7 478 aa7.65□□□□□ -1.18
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TRAPPC4Q9Y296 219 aa7.65□□□□□ -1.18
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 GMPPBQ9Y5P6 360 aa7.65□□□□□ -1.18
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CORINQ9Y5Q5 1042 aa7.65□□□□□ -1.18
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CDH10Q9Y6N8 788 aa7.65□□□□□ -1.18
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SPTBN2O15020 2390 aa7.64□□□□□ -1.19
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 FTCDNL1E5RQL4 147 aa7.64□□□□□ -1.19
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 C11orf98E9PRG8 122 aa7.64□□□□□ -1.19
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 H0YAE9 185 aa7.64□□□□□ -1.19
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 H0YC42 278 aa7.64□□□□□ -1.19
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 M0R082 166 aa7.64□□□□□ -1.19
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PLPP3O14495 311 aa7.64□□□□□ -1.19
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 BCKDKO14874 412 aa7.64□□□□□ -1.19
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 RNF13O43567 381 aa7.64□□□□□ -1.19
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CXCL13O43927 109 aa7.64□□□□□ -1.19
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SERPINI2O75830 405 aa7.64□□□□□ -1.19
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 AKR7A3O95154 331 aa7.64□□□□□ -1.19
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 NDUFB2O95178 105 aa7.64□□□□□ -1.19
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PMS2P2O95744 297 aa7.64□□□□□ -1.19
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 IGHG3P01860 377 aa7.64□□□□□ -1.19
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TP53P04637 393 aaPredicted RBP7.64□□□□□ -1.19
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ASAH2BP0C7U1 165 aa7.64□□□□□ -1.19
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ADORA3P0DMS8 318 aa7.64□□□□□ -1.19
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 AHCYP23526 432 aa7.64□□□□□ -1.19
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SLC6A6P31641 620 aa7.64□□□□□ -1.19
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CAPGP40121 348 aa7.64□□□□□ -1.19
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 EIF1AXP47813 144 aaKnown RBP7.64□□□□□ -1.19
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 GIPRP48546 466 aa7.64□□□□□ -1.19
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 LHX2P50458 406 aa7.64□□□□□ -1.19
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SUCLG1P53597 346 aaKnown RBP7.64□□□□□ -1.19
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CLDN15P56746 228 aa7.64□□□□□ -1.19
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PRPS1P60891 318 aa7.64□□□□□ -1.19
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 RPS3AP61247 264 aaKnown RBP7.64□□□□□ -1.19
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ADARB1P78563 741 aaKnown RBP7.64□□□□□ -1.19
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 C19orf57Q0VDD7 668 aa7.64□□□□□ -1.19
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 KLRB1Q12918 225 aa7.64□□□□□ -1.19
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PTGES3Q15185 160 aaKnown RBP7.64□□□□□ -1.19
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 BCL2A1Q16548 175 aa7.64□□□□□ -1.19
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ST3GAL2Q16842 350 aa7.64□□□□□ -1.19
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ANKDD1AQ495B1 522 aa7.64□□□□□ -1.19
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ALG10Q5BKT4 473 aa7.64□□□□□ -1.19
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 VASNQ6EMK4 673 aa7.64□□□□□ -1.19
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TMEM225Q6GV28 225 aa7.64□□□□□ -1.19
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 RPL13AP3Q6NVV1 102 aa7.64□□□□□ -1.19
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ZNF620Q6ZNG0 422 aa7.64□□□□□ -1.19
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ESPNLQ6ZVH7 1005 aa7.64□□□□□ -1.19
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 H1FNTQ75WM6 255 aaPredicted RBP7.64□□□□□ -1.19
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 GGNQ86UU5 652 aa7.64□□□□□ -1.19
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 IGFN1Q86VF2 1251 aa7.64□□□□□ -1.19
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SIAH3Q8IW03 269 aa7.64□□□□□ -1.19
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 IQCF1Q8N6M8 205 aa7.64□□□□□ -1.19
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CLDN22Q8N7P3 220 aa7.64□□□□□ -1.19
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TMEM99Q8N816 258 aa7.64□□□□□ -1.19
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.1 ms