RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524393.5

RBBP4-215, Transcript of RB binding protein 4, chromatin remodeling factor, human

TSL 3

Gene RBBP4, Length 583 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBBP4-215	ENST00000524393	LAMP3	Q9UQV4	416 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RBBP4-215	ENST00000524393	ANGPT4	Q9Y264	503 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RBBP4-215	ENST00000524393	GMEB1	Q9Y692	573 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RBBP4-215	ENST00000524393	AKAP6	Q13023	2319 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RBBP4-215	ENST00000524393	ABCA4	P78363	2273 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RBBP4-215	ENST00000524393		A0A0G2JND7	137 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RBBP4-215	ENST00000524393	INHBB	P09529	407 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RBBP4-215	ENST00000524393	GPX2	P18283	190 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RBBP4-215	ENST00000524393	CYP51A1	Q16850	503 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RBBP4-215	ENST00000524393	ZNF672	Q499Z4	452 aa	Predicted RBP	11.1	□□□□□ -0.63
RBBP4-215	ENST00000524393	DHRS4L2	Q6PKH6	230 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RBBP4-215	ENST00000524393	C5orf46	Q6UWT4	87 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RBBP4-215	ENST00000524393	DHDDS	Q86SQ9	333 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RBBP4-215	ENST00000524393	ATG4D	Q86TL0	474 aa	Predicted RBP	11.1	□□□□□ -0.63
RBBP4-215	ENST00000524393	KRTAP1-3	Q8IUG1	177 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RBBP4-215	ENST00000524393	DEPDC4	Q8N2C3	294 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RBBP4-215	ENST00000524393	C17orf78	Q8N4C9	275 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RBBP4-215	ENST00000524393	POMGNT2	Q8NAT1	580 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RBBP4-215	ENST00000524393	HIPK4	Q8NE63	616 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RBBP4-215	ENST00000524393	C1orf162	Q8NEQ5	155 aa	Predicted RBP	11.1	□□□□□ -0.63
RBBP4-215	ENST00000524393	OR9K2	Q8NGE7	335 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RBBP4-215	ENST00000524393	OR52E4	Q8NGH9	312 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RBBP4-215	ENST00000524393	OR52N5	Q8NH56	324 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RBBP4-215	ENST00000524393	GTPBP3	Q969Y2	492 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
RBBP4-215	ENST00000524393	TRIM2	Q9C040	744 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RBBP4-215	ENST00000524393	ALG2	Q9H553	416 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RBBP4-215	ENST00000524393	EVA1A	Q9H8M9	152 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RBBP4-215	ENST00000524393	C12orf10	Q9HB07	376 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RBBP4-215	ENST00000524393	SLC52A3	Q9NQ40	469 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RBBP4-215	ENST00000524393	MRGBP	Q9NV56	204 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RBBP4-215	ENST00000524393	TES	Q9UGI8	421 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
RBBP4-215	ENST00000524393	MGAT4B	Q9UQ53	548 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RBBP4-215	ENST00000524393	RASD1	Q9Y272	281 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RBBP4-215	ENST00000524393	CHST2	Q9Y4C5	530 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RBBP4-215	ENST00000524393	MAGED1	Q9Y5V3	778 aa	Predicted RBP	11.1	□□□□□ -0.63
RBBP4-215	ENST00000524393	TEP1	Q99973	2627 aa	Known RBP	11.09	□□□□□ -0.63
RBBP4-215	ENST00000524393	TRBV5-3	A0A0A0MS03	114 aa		11.09	□□□□□ -0.63
RBBP4-215	ENST00000524393	DPRX	A6NFQ7	191 aa		11.09	□□□□□ -0.63
RBBP4-215	ENST00000524393	OR6C65	A6NJZ3	312 aa		11.09	□□□□□ -0.63
RBBP4-215	ENST00000524393	TMEM229A	B2RXF0	380 aa		11.09	□□□□□ -0.63
RBBP4-215	ENST00000524393	ABCD4	O14678	606 aa		11.09	□□□□□ -0.63
RBBP4-215	ENST00000524393	OR2T1	O43869	369 aa		11.09	□□□□□ -0.63
RBBP4-215	ENST00000524393	TROVE2	P10155	538 aa	Known RBP eCLIP	11.09	□□□□□ -0.63
RBBP4-215	ENST00000524393	PNMT	P11086	282 aa		11.09	□□□□□ -0.63
RBBP4-215	ENST00000524393	RPS5	P46782	204 aa	Known RBP	11.09	□□□□□ -0.63
RBBP4-215	ENST00000524393	ATP5J2	P56134	94 aa		11.09	□□□□□ -0.63
RBBP4-215	ENST00000524393	RGS8	P57771	180 aa	Predicted RBP	11.09	□□□□□ -0.63
RBBP4-215	ENST00000524393	HOXC5	Q00444	222 aa		11.09	□□□□□ -0.63
RBBP4-215	ENST00000524393	GABRA6	Q16445	453 aa		11.09	□□□□□ -0.63
RBBP4-215	ENST00000524393	ALG10B	Q5I7T1	473 aa		11.09	□□□□□ -0.63
RBBP4-215	ENST00000524393	C1QTNF12	Q5T7M4	302 aa		11.09	□□□□□ -0.63
RBBP4-215	ENST00000524393	TSPO2	Q5TGU0	170 aa		11.09	□□□□□ -0.63
RBBP4-215	ENST00000524393	METTL21C	Q5VZV1	264 aa		11.09	□□□□□ -0.63
RBBP4-215	ENST00000524393	KLHL24	Q6TFL4	600 aa		11.09	□□□□□ -0.63
RBBP4-215	ENST00000524393	RANBP3L	Q86VV4	465 aa	Predicted RBP	11.09	□□□□□ -0.63
RBBP4-215	ENST00000524393	ARMC8	Q8IUR7	673 aa		11.09	□□□□□ -0.63
RBBP4-215	ENST00000524393	LSMEM1	Q8N8F7	131 aa		11.09	□□□□□ -0.63
RBBP4-215	ENST00000524393	C11orf65	Q8NCR3	313 aa		11.09	□□□□□ -0.63
RBBP4-215	ENST00000524393	KBTBD8	Q8NFY9	601 aa		11.09	□□□□□ -0.63
RBBP4-215	ENST00000524393	MFSD8	Q8NHS3	518 aa		11.09	□□□□□ -0.63
RBBP4-215	ENST00000524393	RNF217	Q8TC41	542 aa		11.09	□□□□□ -0.63
RBBP4-215	ENST00000524393	TSPEAR	Q8WU66	669 aa		11.09	□□□□□ -0.63
RBBP4-215	ENST00000524393	SMAP2	Q8WU79	429 aa	Predicted RBP	11.09	□□□□□ -0.63
RBBP4-215	ENST00000524393	DNAJA4	Q8WW22	397 aa	Predicted RBP	11.09	□□□□□ -0.63
RBBP4-215	ENST00000524393	SLC38A4	Q969I6	547 aa		11.09	□□□□□ -0.63
RBBP4-215	ENST00000524393	SLC25A36	Q96CQ1	311 aa		11.09	□□□□□ -0.63
RBBP4-215	ENST00000524393	SLCO5A1	Q9H2Y9	848 aa		11.09	□□□□□ -0.63
RBBP4-215	ENST00000524393	SLC7A10	Q9NS82	523 aa		11.09	□□□□□ -0.63
RBBP4-215	ENST00000524393	POU2F3	Q9UKI9	436 aa		11.09	□□□□□ -0.63
RBBP4-215	ENST00000524393	AMDHD2	Q9Y303	409 aa		11.09	□□□□□ -0.63
RBBP4-215	ENST00000524393	DSCAM	O60469	2012 aa		11.09	□□□□□ -0.63
RBBP4-215	ENST00000524393	ITPR3	Q14573	2671 aa		11.08	□□□□□ -0.64
RBBP4-215	ENST00000524393	AKAP9	Q99996	3911 aa		11.08	□□□□□ -0.64
RBBP4-215	ENST00000524393	NPIPB7	O75200	414 aa		11.08	□□□□□ -0.64
RBBP4-215	ENST00000524393	WNT11	O96014	354 aa		11.08	□□□□□ -0.64
RBBP4-215	ENST00000524393	ITGA5	P08648	1049 aa		11.08	□□□□□ -0.64
RBBP4-215	ENST00000524393	PAX1	P15863	534 aa		11.08	□□□□□ -0.64
RBBP4-215	ENST00000524393	PTAFR	P25105	342 aa		11.08	□□□□□ -0.64
RBBP4-215	ENST00000524393	MPG	P29372	298 aa		11.08	□□□□□ -0.64
RBBP4-215	ENST00000524393	AQP1	P29972	269 aa		11.08	□□□□□ -0.64
RBBP4-215	ENST00000524393	NTF4	P34130	210 aa		11.08	□□□□□ -0.64
RBBP4-215	ENST00000524393	ZNF83	P51522	516 aa		11.08	□□□□□ -0.64
RBBP4-215	ENST00000524393	CDH11	P55287	796 aa		11.08	□□□□□ -0.64
RBBP4-215	ENST00000524393	RBBP4	Q09028	425 aa		11.08	□□□□□ -0.64
RBBP4-215	ENST00000524393	NFYC	Q13952	458 aa		11.08	□□□□□ -0.64
RBBP4-215	ENST00000524393	RUNDC3A	Q59EK9	446 aa		11.08	□□□□□ -0.64
RBBP4-215	ENST00000524393	C9orf135	Q5VTT2	229 aa		11.08	□□□□□ -0.64
RBBP4-215	ENST00000524393	FAM91A1	Q658Y4	838 aa		11.08	□□□□□ -0.64
RBBP4-215	ENST00000524393	ULK3	Q6PHR2	472 aa		11.08	□□□□□ -0.64
RBBP4-215	ENST00000524393	SLC22A25	Q6T423	547 aa		11.08	□□□□□ -0.64
RBBP4-215	ENST00000524393	C6orf89	Q6UWU4	347 aa		11.08	□□□□□ -0.64
RBBP4-215	ENST00000524393	SEZ6L2	Q6UXD5	910 aa		11.08	□□□□□ -0.64
RBBP4-215	ENST00000524393	SLC30A8	Q8IWU4	369 aa		11.08	□□□□□ -0.64
RBBP4-215	ENST00000524393	DPP10	Q8N608	796 aa		11.08	□□□□□ -0.64
RBBP4-215	ENST00000524393	LILRB1	Q8NHL6	650 aa	Predicted RBP	11.08	□□□□□ -0.64
RBBP4-215	ENST00000524393	IGFBPL1	Q8WX77	278 aa		11.08	□□□□□ -0.64
RBBP4-215	ENST00000524393	SLC47A1	Q96FL8	570 aa		11.08	□□□□□ -0.64
RBBP4-215	ENST00000524393	ANKRD27	Q96NW4	1050 aa		11.08	□□□□□ -0.64
RBBP4-215	ENST00000524393	MUS81	Q96NY9	551 aa		11.08	□□□□□ -0.64
RBBP4-215	ENST00000524393	CGREF1	Q99674	301 aa		11.08	□□□□□ -0.64

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