RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519076.5

TRPS1-208, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene TRPS1, Length 3,329 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-208ENST00000519076 MUL1Q969V5 352 aa7.26□□□□□ -1.25
TRPS1-208ENST00000519076 PRRC1Q96M27 445 aa7.26□□□□□ -1.25
TRPS1-208ENST00000519076 CCDC32Q9BV29 185 aa7.26□□□□□ -1.25
TRPS1-208ENST00000519076 OR51V1Q9H2C8 321 aa7.26□□□□□ -1.25
TRPS1-208ENST00000519076 CLEC4MQ9H2X3 399 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
TRPS1-208ENST00000519076 DUSP22Q9NRW4 184 aa7.26□□□□□ -1.25
TRPS1-208ENST00000519076 TAS2R16Q9NYV7 291 aa7.26□□□□□ -1.25
TRPS1-208ENST00000519076 PPP4R1LQ9P1A2 415 aa7.26□□□□□ -1.25
TRPS1-208ENST00000519076 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
TRPS1-208ENST00000519076 CACNA1HO95180 2353 aa7.25□□□□□ -1.25
TRPS1-208ENST00000519076 GVINP1Q7Z2Y8 2422 aa7.25□□□□□ -1.25
TRPS1-208ENST00000519076 PLXND1Q9Y4D7 1925 aa7.25□□□□□ -1.25
TRPS1-208ENST00000519076 A8MXE2 369 aa7.25□□□□□ -1.25
TRPS1-208ENST00000519076 LDLRAD4O15165 306 aa7.25□□□□□ -1.25
TRPS1-208ENST00000519076 CASC3O15234 703 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
TRPS1-208ENST00000519076 DUX1O43812 170 aa7.25□□□□□ -1.25
TRPS1-208ENST00000519076 GALR3O60755 368 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
TRPS1-208ENST00000519076 MED6O75586 246 aa7.25□□□□□ -1.25
TRPS1-208ENST00000519076 RAF1P04049 648 aa7.25□□□□□ -1.25
TRPS1-208ENST00000519076 MAOAP21397 527 aa7.25□□□□□ -1.25
TRPS1-208ENST00000519076 OR1D5P58170 312 aa7.25□□□□□ -1.25
TRPS1-208ENST00000519076 MVKQ03426 396 aa7.25□□□□□ -1.25
TRPS1-208ENST00000519076 CSTF1Q05048 431 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
TRPS1-208ENST00000519076 ASAH1Q13510 395 aa7.25□□□□□ -1.25
TRPS1-208ENST00000519076 ENTPD8Q5MY95 495 aa7.25□□□□□ -1.25
TRPS1-208ENST00000519076 MRM1Q6IN84 353 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
TRPS1-208ENST00000519076 FAHD1Q6P587 224 aa7.25□□□□□ -1.25
TRPS1-208ENST00000519076 RASSF6Q6ZTQ3 369 aa7.25□□□□□ -1.25
TRPS1-208ENST00000519076 SLC24A4Q8NFF2 622 aa7.25□□□□□ -1.25
TRPS1-208ENST00000519076 B3GNT7Q8NFL0 401 aa7.25□□□□□ -1.25
TRPS1-208ENST00000519076 OR8J1Q8NGP2 316 aa7.25□□□□□ -1.25
TRPS1-208ENST00000519076 SLC25A36Q96CQ1 311 aa7.25□□□□□ -1.25
TRPS1-208ENST00000519076 ZNF845Q96IR2 970 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
TRPS1-208ENST00000519076 TRNT1Q96Q11 434 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
TRPS1-208ENST00000519076 EDEM2Q9BV94 578 aa7.25□□□□□ -1.25
TRPS1-208ENST00000519076 ITPAQ9BY32 194 aa7.25□□□□□ -1.25
TRPS1-208ENST00000519076 CHST8Q9H2A9 424 aa7.25□□□□□ -1.25
TRPS1-208ENST00000519076 OPA3Q9H6K4 179 aa7.25□□□□□ -1.25
TRPS1-208ENST00000519076 EGLN3Q9H6Z9 239 aa7.25□□□□□ -1.25
TRPS1-208ENST00000519076 SYNPO2LQ9H987 977 aa7.25□□□□□ -1.25
TRPS1-208ENST00000519076 UNKLQ9H9P5 680 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
TRPS1-208ENST00000519076 SDHAF2Q9NX18 166 aa7.25□□□□□ -1.25
TRPS1-208ENST00000519076 SLC7A7Q9UM01 511 aa7.25□□□□□ -1.25
TRPS1-208ENST00000519076 PEX12O00623 359 aa7.25□□□□□ -1.25
TRPS1-208ENST00000519076 SRPX2O60687 465 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
TRPS1-208ENST00000519076 ENTPD6O75354 484 aa7.25□□□□□ -1.25
TRPS1-208ENST00000519076 GPX5O75715 221 aa7.25□□□□□ -1.25
TRPS1-208ENST00000519076 GSTM3P21266 225 aa7.25□□□□□ -1.25
TRPS1-208ENST00000519076 SLC35A2P78381 396 aa7.25□□□□□ -1.25
TRPS1-208ENST00000519076 LPAL2Q16609 132 aa7.25□□□□□ -1.25
TRPS1-208ENST00000519076 ZNF528Q3MIS6 628 aa7.25□□□□□ -1.25
TRPS1-208ENST00000519076 C9orf152Q5JTZ5 239 aa7.25□□□□□ -1.25
TRPS1-208ENST00000519076 MRPL2Q5T653 305 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
TRPS1-208ENST00000519076 ZCCHC12Q6PEW1 402 aa7.25□□□□□ -1.25
TRPS1-208ENST00000519076 DEGS2Q6QHC5 323 aa7.25□□□□□ -1.25
TRPS1-208ENST00000519076 RNF44Q7L0R7 432 aa7.25□□□□□ -1.25
TRPS1-208ENST00000519076 SHFQ7M4L6 423 aa7.25□□□□□ -1.25
TRPS1-208ENST00000519076 AMER2Q8N7J2 671 aa7.25□□□□□ -1.25
TRPS1-208ENST00000519076 ZSCAN1Q8NBB4 408 aa7.25□□□□□ -1.25
TRPS1-208ENST00000519076 SNX33Q8WV41 574 aa7.25□□□□□ -1.25
TRPS1-208ENST00000519076 RFT1Q96AA3 541 aa7.25□□□□□ -1.25
TRPS1-208ENST00000519076 SLC41A3Q96GZ6 507 aa7.25□□□□□ -1.25
TRPS1-208ENST00000519076 LRFN5Q96NI6 719 aa7.25□□□□□ -1.25
TRPS1-208ENST00000519076 TBX5Q99593 518 aa7.25□□□□□ -1.25
TRPS1-208ENST00000519076 SOX7Q9BT81 388 aa7.25□□□□□ -1.25
TRPS1-208ENST00000519076 IFT27Q9BW83 186 aa7.25□□□□□ -1.25
TRPS1-208ENST00000519076 SLC38A1Q9H2H9 487 aa7.25□□□□□ -1.25
TRPS1-208ENST00000519076 PTGFRNQ9P2B2 879 aa7.25□□□□□ -1.25
TRPS1-208ENST00000519076 KIF25Q9UIL4 384 aa7.25□□□□□ -1.25
TRPS1-208ENST00000519076 SERTAD3Q9UJW9 196 aa7.25□□□□□ -1.25
TRPS1-208ENST00000519076 POMT2Q9UKY4 750 aa7.25□□□□□ -1.25
TRPS1-208ENST00000519076 RPL36Q9Y3U8 105 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
TRPS1-208ENST00000519076 TO15178 435 aa7.24□□□□□ -1.25
TRPS1-208ENST00000519076 TOX3O15405 576 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
TRPS1-208ENST00000519076 HCRTR1O43613 425 aa7.24□□□□□ -1.25
TRPS1-208ENST00000519076 TBX19O60806 448 aa7.24□□□□□ -1.25
TRPS1-208ENST00000519076 LY86O95711 162 aa7.24□□□□□ -1.25
TRPS1-208ENST00000519076 LGI1O95970 557 aa7.24□□□□□ -1.25
TRPS1-208ENST00000519076 CSF2P04141 144 aa7.24□□□□□ -1.25
TRPS1-208ENST00000519076 TPOP07202 933 aa7.24□□□□□ -1.25
TRPS1-208ENST00000519076 HCKP08631 526 aa7.24□□□□□ -1.25
TRPS1-208ENST00000519076 MMP11P24347 488 aa7.24□□□□□ -1.25
TRPS1-208ENST00000519076 AFF3P51826 1226 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
TRPS1-208ENST00000519076 CXCR4P61073 352 aa7.24□□□□□ -1.25
TRPS1-208ENST00000519076 BTG2P78543 158 aa7.24□□□□□ -1.25
TRPS1-208ENST00000519076 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP7.24□□□□□ -1.25
TRPS1-208ENST00000519076 MXD1Q05195 221 aa7.24□□□□□ -1.25
TRPS1-208ENST00000519076 TSTQ16762 297 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
TRPS1-208ENST00000519076 TIMM50Q3ZCQ8 353 aa7.24□□□□□ -1.25
TRPS1-208ENST00000519076 PRAMEF17Q5VTA0 474 aa7.24□□□□□ -1.25
TRPS1-208ENST00000519076 NUP54Q7Z3B4 507 aa7.24□□□□□ -1.25
TRPS1-208ENST00000519076 GPR155Q7Z3F1 870 aa7.24□□□□□ -1.25
TRPS1-208ENST00000519076 PLXDC1Q8IUK5 500 aa7.24□□□□□ -1.25
TRPS1-208ENST00000519076 C9orf62Q8N4C0 152 aa7.24□□□□□ -1.25
TRPS1-208ENST00000519076 ZNF563Q8TA94 476 aa7.24□□□□□ -1.25
TRPS1-208ENST00000519076 PHOSPHO1Q8TCT1 267 aa7.24□□□□□ -1.25
TRPS1-208ENST00000519076 C1GALT1C1Q96EU7 318 aa7.24□□□□□ -1.25
TRPS1-208ENST00000519076 SCARF2Q96GP6 870 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
TRPS1-208ENST00000519076 TCTN2Q96GX1 697 aa7.24□□□□□ -1.25
TRPS1-208ENST00000519076 FRMD6Q96NE9 622 aa7.24□□□□□ -1.25
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