RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515749.1

SEC31A-241, Transcript of SEC31 homolog A, COPII coat complex component, humanhuman

TSL 2

Gene SEC31A, Length 829 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC31A-241ENST00000515749 BRD7Q9NPI1 651 aa6.83□□□□□ -1.32
SEC31A-241ENST00000515749 CHCHD3Q9NX63 227 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
SEC31A-241ENST00000515749 GPR83Q9NYM4 423 aa6.83□□□□□ -1.32
SEC31A-241ENST00000515749 PTTG2Q9NZH5 202 aa6.83□□□□□ -1.32
SEC31A-241ENST00000515749 KLRF1Q9NZS2 232 aa6.83□□□□□ -1.32
SEC31A-241ENST00000515749 PPP4R1LQ9P1A2 415 aa6.83□□□□□ -1.32
SEC31A-241ENST00000515749 AASSQ9UDR5 926 aa6.83□□□□□ -1.32
SEC31A-241ENST00000515749 WARS2Q9UGM6 360 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
SEC31A-241ENST00000515749 OSGIN1Q9UJX0 560 aa6.83□□□□□ -1.32
SEC31A-241ENST00000515749 DIMT1Q9UNQ2 313 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
SEC31A-241ENST00000515749 ERGIC3Q9Y282 383 aa6.83□□□□□ -1.32
SEC31A-241ENST00000515749 HIF3AQ9Y2N7 669 aa6.83□□□□□ -1.32
SEC31A-241ENST00000515749 EXOSC1Q9Y3B2 195 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
SEC31A-241ENST00000515749 WIF1Q9Y5W5 379 aa6.83□□□□□ -1.32
SEC31A-241ENST00000515749 WDFY4Q6ZS81 3184 aa6.83□□□□□ -1.32
SEC31A-241ENST00000515749 DOCK10Q96BY6 2186 aa6.82□□□□□ -1.32
SEC31A-241ENST00000515749 IGKV1D-42A0A075B6H8 117 aa6.82□□□□□ -1.32
SEC31A-241ENST00000515749 TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 188 aa6.82□□□□□ -1.32
SEC31A-241ENST00000515749 TEX51A0A1B0GUA7 166 aa6.82□□□□□ -1.32
SEC31A-241ENST00000515749 TRIM64BA6NI03 449 aa6.82□□□□□ -1.32
SEC31A-241ENST00000515749 SLC22A31A6NKX4 558 aa6.82□□□□□ -1.32
SEC31A-241ENST00000515749 PROB1E7EW31 1015 aa6.82□□□□□ -1.32
SEC31A-241ENST00000515749 PRR23D1E9PI22 279 aaPredicted RBP6.82□□□□□ -1.32
SEC31A-241ENST00000515749 ADAM10O14672 748 aa6.82□□□□□ -1.32
SEC31A-241ENST00000515749 SCO2O43819 266 aa6.82□□□□□ -1.32
SEC31A-241ENST00000515749 RAD1O60671 282 aa6.82□□□□□ -1.32
SEC31A-241ENST00000515749 TNFSF15O95150 251 aa6.82□□□□□ -1.32
SEC31A-241ENST00000515749 SNX4O95219 450 aa6.82□□□□□ -1.32
SEC31A-241ENST00000515749 RAB36O95755 333 aa6.82□□□□□ -1.32
SEC31A-241ENST00000515749 CH25HO95992 272 aa6.82□□□□□ -1.32
SEC31A-241ENST00000515749 STSP08842 583 aa6.82□□□□□ -1.32
SEC31A-241ENST00000515749 ASAH2BP0C7U1 165 aa6.82□□□□□ -1.32
SEC31A-241ENST00000515749 FTH1P19P0C7X4 201 aa6.82□□□□□ -1.32
SEC31A-241ENST00000515749 PRR23D2P0DMB1 279 aaPredicted RBP6.82□□□□□ -1.32
SEC31A-241ENST00000515749 CEACAM1P13688 526 aa6.82□□□□□ -1.32
SEC31A-241ENST00000515749 MYL12AP19105 171 aa6.82□□□□□ -1.32
SEC31A-241ENST00000515749 MST1P26927 711 aa6.82□□□□□ -1.32
SEC31A-241ENST00000515749 NOS3P29474 1203 aa6.82□□□□□ -1.32
SEC31A-241ENST00000515749 RBMS1P29558 406 aaKnown RBP6.82□□□□□ -1.32
SEC31A-241ENST00000515749 C21orf33P30042 268 aaPredicted RBP6.82□□□□□ -1.32
SEC31A-241ENST00000515749 GSTT1P30711 240 aa6.82□□□□□ -1.32
SEC31A-241ENST00000515749 HTR1FP30939 366 aa6.82□□□□□ -1.32
SEC31A-241ENST00000515749 DLSTP36957 453 aa6.82□□□□□ -1.32
SEC31A-241ENST00000515749 CASP3P42574 277 aa6.82□□□□□ -1.32
SEC31A-241ENST00000515749 GATA4P43694 442 aa6.82□□□□□ -1.32
SEC31A-241ENST00000515749 CLK1P49759 484 aaKnown RBP6.82□□□□□ -1.32
SEC31A-241ENST00000515749 ZNF41P51814 821 aaPredicted RBP6.82□□□□□ -1.32
SEC31A-241ENST00000515749 NUDT6P53370 316 aa6.82□□□□□ -1.32
SEC31A-241ENST00000515749 CDH11P55287 796 aa6.82□□□□□ -1.32
SEC31A-241ENST00000515749 FOXL2P58012 376 aa6.82□□□□□ -1.32
SEC31A-241ENST00000515749 FXYD6P3P58550 94 aa6.82□□□□□ -1.32
SEC31A-241ENST00000515749 EGR4Q05215 589 aa6.82□□□□□ -1.32
SEC31A-241ENST00000515749 ZNF91Q05481 1191 aa6.82□□□□□ -1.32
SEC31A-241ENST00000515749 PIGFQ07326 219 aa6.82□□□□□ -1.32
SEC31A-241ENST00000515749 LGALS3BPQ08380 585 aa6.82□□□□□ -1.32
SEC31A-241ENST00000515749 FHL1Q13642 323 aa6.82□□□□□ -1.32
SEC31A-241ENST00000515749 C1DQ13901 141 aaKnown RBP6.82□□□□□ -1.32
SEC31A-241ENST00000515749 SLC22A10Q63ZE4 541 aa6.82□□□□□ -1.32
SEC31A-241ENST00000515749 GPR139Q6DWJ6 353 aa6.82□□□□□ -1.32
SEC31A-241ENST00000515749 CCDC81Q6ZN84 652 aa6.82□□□□□ -1.32
SEC31A-241ENST00000515749 C8orf86Q6ZUL3 223 aa6.82□□□□□ -1.32
SEC31A-241ENST00000515749 MEPCEQ7L2J0 689 aaKnown RBP6.82□□□□□ -1.32
SEC31A-241ENST00000515749 CXXC5Q7LFL8 322 aaKnown RBP6.82□□□□□ -1.32
SEC31A-241ENST00000515749 ZNF367Q7RTV3 350 aa6.82□□□□□ -1.32
SEC31A-241ENST00000515749 MAMDC2Q7Z304 686 aaPredicted RBP6.82□□□□□ -1.32
SEC31A-241ENST00000515749 SLC46A3Q7Z3Q1 461 aa6.82□□□□□ -1.32
SEC31A-241ENST00000515749 EGFL6Q8IUX8 553 aa6.82□□□□□ -1.32
SEC31A-241ENST00000515749 TMEM156Q8N614 296 aa6.82□□□□□ -1.32
SEC31A-241ENST00000515749 PSD4Q8NDX1 1056 aa6.82□□□□□ -1.32
SEC31A-241ENST00000515749 OR13C2Q8NGS9 318 aa6.82□□□□□ -1.32
SEC31A-241ENST00000515749 OR51A7Q8NH64 312 aa6.82□□□□□ -1.32
SEC31A-241ENST00000515749 SGCDQ92629 289 aa6.82□□□□□ -1.32
SEC31A-241ENST00000515749 ISOC1Q96CN7 298 aa6.82□□□□□ -1.32
SEC31A-241ENST00000515749 NTNG2Q96CW9 530 aa6.82□□□□□ -1.32
SEC31A-241ENST00000515749 COG8Q96MW5 612 aa6.82□□□□□ -1.32
SEC31A-241ENST00000515749 UCN2Q96RP3 112 aa6.82□□□□□ -1.32
SEC31A-241ENST00000515749 MND1Q9BWT6 205 aa6.82□□□□□ -1.32
SEC31A-241ENST00000515749 JAM3Q9BX67 310 aa6.82□□□□□ -1.32
SEC31A-241ENST00000515749 ANGPTL4Q9BY76 406 aa6.82□□□□□ -1.32
SEC31A-241ENST00000515749 POTEKPQ9BYX7 375 aa6.82□□□□□ -1.32
SEC31A-241ENST00000515749 RTN4RQ9BZR6 473 aa6.82□□□□□ -1.32
SEC31A-241ENST00000515749 CXorf56Q9H5V9 222 aa6.82□□□□□ -1.32
SEC31A-241ENST00000515749 MCCC2Q9HCC0 563 aa6.82□□□□□ -1.32
SEC31A-241ENST00000515749 AMBNQ9NP70 447 aa6.82□□□□□ -1.32
SEC31A-241ENST00000515749 ISYNA1Q9NPH2 558 aa6.82□□□□□ -1.32
SEC31A-241ENST00000515749 NRIP3Q9NQ35 241 aa6.82□□□□□ -1.32
SEC31A-241ENST00000515749 INPP5EQ9NRR6 644 aa6.82□□□□□ -1.32
SEC31A-241ENST00000515749 SERINC1Q9NRX5 453 aa6.82□□□□□ -1.32
SEC31A-241ENST00000515749 HAO2Q9NYQ3 351 aa6.82□□□□□ -1.32
SEC31A-241ENST00000515749 DNAJC27Q9NZQ0 273 aa6.82□□□□□ -1.32
SEC31A-241ENST00000515749 TEKT2Q9UIF3 430 aa6.82□□□□□ -1.32
SEC31A-241ENST00000515749 EXOGQ9Y2C4 368 aaKnown RBP6.82□□□□□ -1.32
SEC31A-241ENST00000515749 TMED7Q9Y3B3 224 aa6.82□□□□□ -1.32
SEC31A-241ENST00000515749 CORINQ9Y5Q5 1042 aa6.82□□□□□ -1.32
SEC31A-241ENST00000515749 SPIN1Q9Y657 262 aaPredicted RBP6.82□□□□□ -1.32
SEC31A-241ENST00000515749 USP34Q70CQ2 3546 aa6.82□□□□□ -1.32
SEC31A-241ENST00000515749 PTPRBP23467 1997 aa6.82□□□□□ -1.32
SEC31A-241ENST00000515749 EP300Q09472 2414 aaPredicted RBP6.81□□□□□ -1.32
SEC31A-241ENST00000515749 TRAV27A0A087WT01 109 aa6.81□□□□□ -1.32
SEC31A-241ENST00000515749 A0A1W2PNU3 283 aaPredicted RBP6.81□□□□□ -1.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.2 ms