RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511747.5

SH3BP2-221, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP2, Length 2,351 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-221ENST00000511747 ZNHIT3Q15649 155 aaPredicted RBP24.82■■□□□ 1.56
SH3BP2-221ENST00000511747 MANEAQ5SRI9 462 aa24.82■■□□□ 1.56
SH3BP2-221ENST00000511747 HES5Q5TA89 166 aa24.82■■□□□ 1.56
SH3BP2-221ENST00000511747 FAM199XQ6PEV8 388 aaPredicted RBP24.82■■□□□ 1.56
SH3BP2-221ENST00000511747 OR6K6Q8NGW6 343 aa24.82■■□□□ 1.56
SH3BP2-221ENST00000511747 GCDHQ92947 438 aaPredicted RBP24.82■■□□□ 1.56
SH3BP2-221ENST00000511747 GFI1Q99684 422 aa24.82■■□□□ 1.56
SH3BP2-221ENST00000511747 MKKSQ9NPJ1 570 aaPredicted RBP24.82■■□□□ 1.56
SH3BP2-221ENST00000511747 CD93Q9NPY3 652 aa24.82■■□□□ 1.56
SH3BP2-221ENST00000511747 OR6C68A6NDL8 312 aa24.82■■□□□ 1.56
SH3BP2-221ENST00000511747 GMDSO60547 372 aa24.82■■□□□ 1.56
SH3BP2-221ENST00000511747 APBB3O95704 486 aa24.82■■□□□ 1.56
SH3BP2-221ENST00000511747 SSTR2P30874 369 aa24.82■■□□□ 1.56
SH3BP2-221ENST00000511747 ZNF527Q8NB42 609 aa24.82■■□□□ 1.56
SH3BP2-221ENST00000511747 HSPA12BQ96MM6 686 aa24.82■■□□□ 1.56
SH3BP2-221ENST00000511747 GABRG3Q99928 467 aa24.82■■□□□ 1.56
SH3BP2-221ENST00000511747 POT1Q9NUX5 634 aa24.82■■□□□ 1.56
SH3BP2-221ENST00000511747 HRASLS2Q9NWW9 162 aa24.82■■□□□ 1.56
SH3BP2-221ENST00000511747 IFITM5A6NNB3 132 aa24.81■■□□□ 1.56
SH3BP2-221ENST00000511747 C2orf74A8MZ97 194 aa24.81■■□□□ 1.56
SH3BP2-221ENST00000511747 IDSB3KWA1 339 aa24.81■■□□□ 1.56
SH3BP2-221ENST00000511747 PEX14O75381 377 aa24.81■■□□□ 1.56
SH3BP2-221ENST00000511747 GXYLT1Q4G148 440 aa24.81■■□□□ 1.56
SH3BP2-221ENST00000511747 DPY19L2P2Q6ZN68 376 aa24.81■■□□□ 1.56
SH3BP2-221ENST00000511747 ZNF550Q7Z398 422 aa24.81■■□□□ 1.56
SH3BP2-221ENST00000511747 OR11G2Q8NGC1 345 aa24.81■■□□□ 1.56
SH3BP2-221ENST00000511747 ZPLD1Q8TCW7 415 aa24.81■■□□□ 1.56
SH3BP2-221ENST00000511747 ASB12Q8WXK4 309 aa24.81■■□□□ 1.56
SH3BP2-221ENST00000511747 LMF2Q9BU23 707 aaKnown RBP24.81■■□□□ 1.56
SH3BP2-221ENST00000511747 SPRTNQ9H040 489 aaPredicted RBP24.81■■□□□ 1.56
SH3BP2-221ENST00000511747 ST6GALNAC1Q9NSC7 600 aaPredicted RBP24.81■■□□□ 1.56
SH3BP2-221ENST00000511747 FLVCR2Q9UPI3 526 aa24.81■■□□□ 1.56
SH3BP2-221ENST00000511747 RCE1Q9Y256 329 aa24.81■■□□□ 1.56
SH3BP2-221ENST00000511747 DOCK8Q8NF50 2099 aa24.81■■□□□ 1.56
SH3BP2-221ENST00000511747 ACOD1A6NK06 481 aa24.81■■□□□ 1.56
SH3BP2-221ENST00000511747 PSMD9O00233 223 aa24.81■■□□□ 1.56
SH3BP2-221ENST00000511747 HCRTR1O43613 425 aa24.81■■□□□ 1.56
SH3BP2-221ENST00000511747 RDH16O75452 317 aa24.81■■□□□ 1.56
SH3BP2-221ENST00000511747 HOXB2P14652 356 aa24.81■■□□□ 1.56
SH3BP2-221ENST00000511747 TYRP1P17643 537 aa24.81■■□□□ 1.56
SH3BP2-221ENST00000511747 SPI1P17947 270 aa24.81■■□□□ 1.56
SH3BP2-221ENST00000511747 MAGEB1P43366 347 aa24.81■■□□□ 1.56
SH3BP2-221ENST00000511747 ZNF81P51508 661 aa24.81■■□□□ 1.56
SH3BP2-221ENST00000511747 ZP1P60852 638 aa24.81■■□□□ 1.56
SH3BP2-221ENST00000511747 HSF2Q03933 536 aa24.81■■□□□ 1.56
SH3BP2-221ENST00000511747 ZNF433Q8N7K0 673 aaPredicted RBP24.81■■□□□ 1.56
SH3BP2-221ENST00000511747 PHYHIPQ92561 330 aa24.81■■□□□ 1.56
SH3BP2-221ENST00000511747 DDOQ99489 341 aa24.81■■□□□ 1.56
SH3BP2-221ENST00000511747 LMAN2LQ9H0V9 348 aa24.81■■□□□ 1.56
SH3BP2-221ENST00000511747 IGFLR1Q9H665 355 aa24.81■■□□□ 1.56
SH3BP2-221ENST00000511747 SCP2D1Q9UJQ7 156 aa24.81■■□□□ 1.56
SH3BP2-221ENST00000511747 ZSCAN5BA6NJL1 495 aa24.8■■□□□ 1.56
SH3BP2-221ENST00000511747 GPRIN2O60269 458 aa24.8■■□□□ 1.56
SH3BP2-221ENST00000511747 CCR9P51686 369 aa24.8■■□□□ 1.56
SH3BP2-221ENST00000511747 RNF44Q7L0R7 432 aa24.8■■□□□ 1.56
SH3BP2-221ENST00000511747 SIPA1Q96FS4 1042 aa24.8■■□□□ 1.56
SH3BP2-221ENST00000511747 DPCDQ9BVM2 203 aaPredicted RBP24.8■■□□□ 1.56
SH3BP2-221ENST00000511747 SLC25A18Q9H1K4 315 aa24.8■■□□□ 1.56
SH3BP2-221ENST00000511747 HRASLSQ9HDD0 168 aa24.8■■□□□ 1.56
SH3BP2-221ENST00000511747 WSB2Q9NYS7 404 aaPredicted RBP24.8■■□□□ 1.56
SH3BP2-221ENST00000511747 AIPO00170 330 aa24.8■■□□□ 1.56
SH3BP2-221ENST00000511747 HRKO00198 91 aa24.8■■□□□ 1.56
SH3BP2-221ENST00000511747 SRSF5Q13243 272 aaKnown RBP24.8■■□□□ 1.56
SH3BP2-221ENST00000511747 IKZF1Q13422 519 aa24.8■■□□□ 1.56
SH3BP2-221ENST00000511747 NDUFAF6Q330K2 333 aa24.8■■□□□ 1.56
SH3BP2-221ENST00000511747 TMEM255AQ5JRV8 349 aa24.8■■□□□ 1.56
SH3BP2-221ENST00000511747 FAM69AQ5T7M9 428 aa24.8■■□□□ 1.56
SH3BP2-221ENST00000511747 SERPINA12Q8IW75 414 aa24.8■■□□□ 1.56
SH3BP2-221ENST00000511747 RBCK1Q9BYM8 510 aa24.8■■□□□ 1.56
SH3BP2-221ENST00000511747 EIF3KQ9UBQ5 218 aaKnown RBP24.8■■□□□ 1.56
SH3BP2-221ENST00000511747 DTX4Q9Y2E6 619 aa24.8■■□□□ 1.56
SH3BP2-221ENST00000511747 ZNF749O43361 778 aa24.79■■□□□ 1.56
SH3BP2-221ENST00000511747 RAB38P57729 211 aa24.79■■□□□ 1.56
SH3BP2-221ENST00000511747 SNTA1Q13424 505 aa24.79■■□□□ 1.56
SH3BP2-221ENST00000511747 FCRLAQ7L513 359 aa24.79■■□□□ 1.56
SH3BP2-221ENST00000511747 SFTPA2Q8IWL1 248 aa24.79■■□□□ 1.56
SH3BP2-221ENST00000511747 RCBTB1Q8NDN9 531 aa24.79■■□□□ 1.56
SH3BP2-221ENST00000511747 OR9A4Q8NGU2 314 aa24.79■■□□□ 1.56
SH3BP2-221ENST00000511747 OR2T35Q8NGX2 323 aa24.79■■□□□ 1.56
SH3BP2-221ENST00000511747 OR52I2Q8NH67 350 aa24.79■■□□□ 1.56
SH3BP2-221ENST00000511747 NXPE2Q96DL1 559 aa24.79■■□□□ 1.56
SH3BP2-221ENST00000511747 ZNF436Q9C0F3 470 aaPredicted RBP24.79■■□□□ 1.56
SH3BP2-221ENST00000511747 A0A087WUJ7 227 aa24.79■■□□□ 1.56
SH3BP2-221ENST00000511747 TOXO94900 526 aa24.79■■□□□ 1.56
SH3BP2-221ENST00000511747 PSMB1P20618 241 aaKnown RBP24.79■■□□□ 1.56
SH3BP2-221ENST00000511747 GPR143P51810 404 aa24.79■■□□□ 1.56
SH3BP2-221ENST00000511747 AP2S1P53680 142 aaPredicted RBP24.79■■□□□ 1.56
SH3BP2-221ENST00000511747 NANOS3P60323 173 aaKnown RBP24.79■■□□□ 1.56
SH3BP2-221ENST00000511747 ALG11Q2TAA5 492 aa24.79■■□□□ 1.56
SH3BP2-221ENST00000511747 TOR2AQ5JU69 321 aa24.79■■□□□ 1.56
SH3BP2-221ENST00000511747 CCDC3Q9BQI4 270 aa24.79■■□□□ 1.56
SH3BP2-221ENST00000511747 GLTPQ9NZD2 209 aa24.79■■□□□ 1.56
SH3BP2-221ENST00000511747 AKAP7Q9P0M2 348 aaPredicted RBP24.79■■□□□ 1.56
SH3BP2-221ENST00000511747 ZNF281Q9Y2X9 895 aa24.79■■□□□ 1.56
SH3BP2-221ENST00000511747 ANKRD61A6NGH8 418 aa24.78■■□□□ 1.56
SH3BP2-221ENST00000511747 KHNYNO15037 678 aaKnown RBP24.78■■□□□ 1.56
SH3BP2-221ENST00000511747 ZFPL1O95159 310 aa24.78■■□□□ 1.56
SH3BP2-221ENST00000511747 DPP4P27487 766 aa24.78■■□□□ 1.56
SH3BP2-221ENST00000511747 SELENOPP49908 381 aa24.78■■□□□ 1.56
SH3BP2-221ENST00000511747 ERVK-25P63136 954 aa24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.5 ms