RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497327.1

GGPS1-208, Transcript of geranylgeranyl diphosphate synthase 1, human

TSL 3

Gene GGPS1, Length 868 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GGPS1-208	ENST00000497327	FAHD1	Q6P587	224 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GGPS1-208	ENST00000497327	ZNF836	Q6ZNA1	936 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GGPS1-208	ENST00000497327	ASCL5	Q7RTU5	278 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GGPS1-208	ENST00000497327	CPEB2	Q7Z5Q1	589 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
GGPS1-208	ENST00000497327	HMGN2P46	Q86SG4	172 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GGPS1-208	ENST00000497327	CYP4Z1	Q86W10	505 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GGPS1-208	ENST00000497327	CARM1	Q86X55	608 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GGPS1-208	ENST00000497327	HIPK1	Q86Z02	1210 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GGPS1-208	ENST00000497327	GRAMD2A	Q8IUY3	354 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GGPS1-208	ENST00000497327	BCORP1	Q8N888	145 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GGPS1-208	ENST00000497327	COX18	Q8N8Q8	333 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GGPS1-208	ENST00000497327	C17orf47	Q8NEP4	570 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GGPS1-208	ENST00000497327	DEFB124	Q8NES8	71 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GGPS1-208	ENST00000497327	OR6T1	Q8NGN1	323 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GGPS1-208	ENST00000497327	OR2Y1	Q8NGV0	311 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GGPS1-208	ENST00000497327	WDR36	Q8NI36	951 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
GGPS1-208	ENST00000497327	SPPL2A	Q8TCT8	520 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GGPS1-208	ENST00000497327	OIT3	Q8WWZ8	545 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GGPS1-208	ENST00000497327	PROX1	Q92786	737 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GGPS1-208	ENST00000497327	MR1	Q95460	341 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GGPS1-208	ENST00000497327	RMND5B	Q96G75	393 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
GGPS1-208	ENST00000497327	VPS50	Q96JG6	964 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GGPS1-208	ENST00000497327	ART5	Q96L15	291 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GGPS1-208	ENST00000497327	FYTTD1	Q96QD9	318 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
GGPS1-208	ENST00000497327	EPYC	Q99645	322 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GGPS1-208	ENST00000497327	OR8D2	Q9GZM6	311 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GGPS1-208	ENST00000497327	NXF5	Q9H1B4	397 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
GGPS1-208	ENST00000497327		Q9N2J8	555 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GGPS1-208	ENST00000497327	MAN2C1	Q9NTJ4	1040 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GGPS1-208	ENST00000497327	SEC14L3	Q9UDX4	400 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GGPS1-208	ENST00000497327	PISD	Q9UG56	409 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GGPS1-208	ENST00000497327	RAB26	Q9ULW5	256 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GGPS1-208	ENST00000497327	A4GNT	Q9UNA3	340 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GGPS1-208	ENST00000497327	ZNF443	Q9Y2A4	671 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
GGPS1-208	ENST00000497327	IFT52	Q9Y366	437 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GGPS1-208	ENST00000497327	LRP12	Q9Y561	859 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GGPS1-208	ENST00000497327	LYVE1	Q9Y5Y7	322 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GGPS1-208	ENST00000497327	CLCA3P	Q9Y6N3	262 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GGPS1-208	ENST00000497327	ZFHX2	Q9C0A1	2572 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
GGPS1-208	ENST00000497327	VPS13A	Q96RL7	3174 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GGPS1-208	ENST00000497327	NPIPA5	A0A0B4J1W7	369 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GGPS1-208	ENST00000497327	LOC105378220	A0A1B0GUY1	285 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
GGPS1-208	ENST00000497327	C2orf92	A0A1B0GVN3	265 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GGPS1-208	ENST00000497327	SPAAR	A0A1B0GVQ0	90 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GGPS1-208	ENST00000497327		A0A1W2PPL8	197 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GGPS1-208	ENST00000497327		A0A1W2PRQ8	180 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GGPS1-208	ENST00000497327	ARRDC5	A6NEK1	342 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GGPS1-208	ENST00000497327	CLDN24	A6NM45	220 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GGPS1-208	ENST00000497327	NPIPA7	E9PJI5	369 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GGPS1-208	ENST00000497327		M0R3H8	397 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GGPS1-208	ENST00000497327	TNFRSF11B	O00300	401 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GGPS1-208	ENST00000497327	SOCS6	O14544	535 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GGPS1-208	ENST00000497327	PCDH17	O14917	1159 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GGPS1-208	ENST00000497327	ADAMDEC1	O15204	470 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GGPS1-208	ENST00000497327	TSPAN2	O60636	221 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GGPS1-208	ENST00000497327	ZNF354A	O60765	605 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
GGPS1-208	ENST00000497327	NADK	O95544	446 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
GGPS1-208	ENST00000497327	THY1	P04216	161 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GGPS1-208	ENST00000497327	NGFR	P08138	427 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GGPS1-208	ENST00000497327	CD63	P08962	238 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GGPS1-208	ENST00000497327	NPIPA8	P0DM63	369 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GGPS1-208	ENST00000497327	PRG2	P13727	222 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GGPS1-208	ENST00000497327	APEH	P13798	732 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
GGPS1-208	ENST00000497327	ZNF23	P17027	643 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GGPS1-208	ENST00000497327	LCN1	P31025	176 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GGPS1-208	ENST00000497327	RRM2	P31350	389 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GGPS1-208	ENST00000497327	YAP1	P46937	504 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
GGPS1-208	ENST00000497327	HSPA13	P48723	471 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GGPS1-208	ENST00000497327	DAP	P51397	102 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GGPS1-208	ENST00000497327	ATP12A	P54707	1039 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GGPS1-208	ENST00000497327	SLC26A5	P58743	744 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GGPS1-208	ENST00000497327	PSPH	P78330	225 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GGPS1-208	ENST00000497327	ADARB1	P78563	741 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
GGPS1-208	ENST00000497327	HPCA	P84074	193 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GGPS1-208	ENST00000497327	SRSF1	Q07955	248 aa	Known RBP eCLIP	4.86	□□□□□ -1.63
GGPS1-208	ENST00000497327	DGCR6	Q14129	220 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GGPS1-208	ENST00000497327	GALE	Q14376	348 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GGPS1-208	ENST00000497327	CNN3	Q15417	329 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
GGPS1-208	ENST00000497327	SEC23B	Q15437	767 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GGPS1-208	ENST00000497327	TAF11	Q15544	211 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GGPS1-208	ENST00000497327	ZNHIT3	Q15649	155 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
GGPS1-208	ENST00000497327	GPR68	Q15743	365 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GGPS1-208	ENST00000497327	SLC36A3	Q495N2	470 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GGPS1-208	ENST00000497327	LIN52	Q52LA3	116 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GGPS1-208	ENST00000497327	PLA1A	Q53H76	456 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GGPS1-208	ENST00000497327	KLHL26	Q53HC5	615 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GGPS1-208	ENST00000497327	AWAT1	Q58HT5	328 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GGPS1-208	ENST00000497327	C6orf52	Q5T4I8	152 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GGPS1-208	ENST00000497327	RNF220	Q5VTB9	566 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GGPS1-208	ENST00000497327	FAM69B	Q5VUD6	431 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GGPS1-208	ENST00000497327	KDM4D	Q6B0I6	523 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GGPS1-208	ENST00000497327	FAAH2	Q6GMR7	532 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GGPS1-208	ENST00000497327	ZNF770	Q6IQ21	691 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
GGPS1-208	ENST00000497327	PAPD4	Q6PIY7	484 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
GGPS1-208	ENST00000497327	TMPRSS12	Q86WS5	348 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GGPS1-208	ENST00000497327	CHERP	Q8IWX8	916 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
GGPS1-208	ENST00000497327	PEX5L	Q8IYB4	626 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GGPS1-208	ENST00000497327	OFCC1	Q8IZS5	231 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GGPS1-208	ENST00000497327	MARVELD2	Q8N4S9	558 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GGPS1-208	ENST00000497327	SIRT6	Q8N6T7	355 aa		4.86	□□□□□ -1.63

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