RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497230.2

PRRX1-207, Transcript of paired related homeobox 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PRRX1, Length 3,501 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRX1-207ENST00000497230 OR56A3Q8NH54 315 aa11.05□□□□□ -0.64
PRRX1-207ENST00000497230 TMEM239Q8WW34 195 aa11.05□□□□□ -0.64
PRRX1-207ENST00000497230 TGIF2Q9GZN2 237 aa11.05□□□□□ -0.64
PRRX1-207ENST00000497230 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP11.05□□□□□ -0.64
PRRX1-207ENST00000497230 TM7SF3Q9NS93 570 aa11.05□□□□□ -0.64
PRRX1-207ENST00000497230 DSPPQ9NZW4 1301 aa11.05□□□□□ -0.64
PRRX1-207ENST00000497230 DCDC2BA2VCK2 349 aa11.05□□□□□ -0.64
PRRX1-207ENST00000497230 PRAMEF27A3QJZ7 478 aa11.05□□□□□ -0.64
PRRX1-207ENST00000497230 DNASE2O00115 360 aaPredicted RBP11.05□□□□□ -0.64
PRRX1-207ENST00000497230 OIP5O43482 229 aa11.05□□□□□ -0.64
PRRX1-207ENST00000497230 SELENOFO60613 162 aa11.05□□□□□ -0.64
PRRX1-207ENST00000497230 HLA-AP01891 365 aaKnown RBP11.05□□□□□ -0.64
PRRX1-207ENST00000497230 CD3DP04234 171 aa11.05□□□□□ -0.64
PRRX1-207ENST00000497230 BDKRB2P30411 391 aa11.05□□□□□ -0.64
PRRX1-207ENST00000497230 CDNFQ49AH0 187 aa11.05□□□□□ -0.64
PRRX1-207ENST00000497230 ARHGAP40Q5TG30 622 aa11.05□□□□□ -0.64
PRRX1-207ENST00000497230 ZNF660Q6AZW8 331 aaPredicted RBP11.05□□□□□ -0.64
PRRX1-207ENST00000497230 NIPAL3Q6P499 406 aa11.05□□□□□ -0.64
PRRX1-207ENST00000497230 OR1S1Q8NH92 325 aa11.05□□□□□ -0.64
PRRX1-207ENST00000497230 SFT2D1Q8WV19 159 aa11.05□□□□□ -0.64
PRRX1-207ENST00000497230 DCUN1D4Q92564 292 aa11.05□□□□□ -0.64
PRRX1-207ENST00000497230 PEX11GQ96HA9 241 aa11.05□□□□□ -0.64
PRRX1-207ENST00000497230 AMDHD1Q96NU7 426 aa11.05□□□□□ -0.64
PRRX1-207ENST00000497230 TSSK2Q96PF2 358 aa11.05□□□□□ -0.64
PRRX1-207ENST00000497230 C1QTNF2Q9BXJ5 285 aa11.05□□□□□ -0.64
PRRX1-207ENST00000497230 ZNF334Q9HCZ1 680 aaPredicted RBP11.05□□□□□ -0.64
PRRX1-207ENST00000497230 MAN2C1Q9NTJ4 1040 aa11.05□□□□□ -0.64
PRRX1-207ENST00000497230 ADAM18Q9Y3Q7 739 aa11.05□□□□□ -0.64
PRRX1-207ENST00000497230 ATG4BQ9Y4P1 393 aa11.05□□□□□ -0.64
PRRX1-207ENST00000497230 A0A1B0GUH1 482 aa11.05□□□□□ -0.64
PRRX1-207ENST00000497230 GRM6O15303 877 aa11.05□□□□□ -0.64
PRRX1-207ENST00000497230 OR6A2O95222 327 aa11.05□□□□□ -0.64
PRRX1-207ENST00000497230 UBBP0CG47 229 aa11.05□□□□□ -0.64
PRRX1-207ENST00000497230 UBCP0CG48 685 aaKnown RBP11.05□□□□□ -0.64
PRRX1-207ENST00000497230 BAMBIQ13145 260 aa11.05□□□□□ -0.64
PRRX1-207ENST00000497230 MAPK14Q16539 360 aa11.05□□□□□ -0.64
PRRX1-207ENST00000497230 THSD4Q6ZMP0 1018 aa11.05□□□□□ -0.64
PRRX1-207ENST00000497230 TTLL10Q6ZVT0 673 aa11.05□□□□□ -0.64
PRRX1-207ENST00000497230 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP11.05□□□□□ -0.64
PRRX1-207ENST00000497230 AMZ2Q86W34 360 aa11.05□□□□□ -0.64
PRRX1-207ENST00000497230 OR4C16Q8NGL9 310 aa11.05□□□□□ -0.64
PRRX1-207ENST00000497230 OR5M9Q8NGP3 310 aa11.05□□□□□ -0.64
PRRX1-207ENST00000497230 OR6N2Q8NGY6 317 aa11.05□□□□□ -0.64
PRRX1-207ENST00000497230 JAM3Q9BX67 310 aa11.05□□□□□ -0.64
PRRX1-207ENST00000497230 SMIM3Q9BZL3 60 aa11.05□□□□□ -0.64
PRRX1-207ENST00000497230 MIOXQ9UGB7 285 aa11.05□□□□□ -0.64
PRRX1-207ENST00000497230 TSC2P49815 1807 aa11.04□□□□□ -0.64
PRRX1-207ENST00000497230 PLSCR5A0PG75 271 aa11.04□□□□□ -0.64
PRRX1-207ENST00000497230 H7C1C5 153 aa11.04□□□□□ -0.64
PRRX1-207ENST00000497230 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP11.04□□□□□ -0.64
PRRX1-207ENST00000497230 ZNF254O75437 659 aa11.04□□□□□ -0.64
PRRX1-207ENST00000497230 TXNDC12O95881 172 aa11.04□□□□□ -0.64
PRRX1-207ENST00000497230 NQO2P16083 231 aa11.04□□□□□ -0.64
PRRX1-207ENST00000497230 VASPP50552 380 aaPredicted RBP11.04□□□□□ -0.64
PRRX1-207ENST00000497230 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP11.04□□□□□ -0.64
PRRX1-207ENST00000497230 NRG3P56975 720 aa11.04□□□□□ -0.64
PRRX1-207ENST00000497230 H2BFSP57053 126 aa11.04□□□□□ -0.64
PRRX1-207ENST00000497230 LCN6P62502 163 aa11.04□□□□□ -0.64
PRRX1-207ENST00000497230 LTBQ06643 244 aa11.04□□□□□ -0.64
PRRX1-207ENST00000497230 HFEQ30201 348 aa11.04□□□□□ -0.64
PRRX1-207ENST00000497230 UBE2NLQ5JXB2 153 aa11.04□□□□□ -0.64
PRRX1-207ENST00000497230 C9orf131Q5VYM1 1079 aa11.04□□□□□ -0.64
PRRX1-207ENST00000497230 TFAP2EQ6VUC0 442 aa11.04□□□□□ -0.64
PRRX1-207ENST00000497230 FAM83HQ6ZRV2 1179 aaPredicted RBP11.04□□□□□ -0.64
PRRX1-207ENST00000497230 MORN4Q8NDC4 146 aa11.04□□□□□ -0.64
PRRX1-207ENST00000497230 OR1M1Q8NGA1 313 aa11.04□□□□□ -0.64
PRRX1-207ENST00000497230 CCDC107Q8WV48 283 aa11.04□□□□□ -0.64
PRRX1-207ENST00000497230 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP11.04□□□□□ -0.64
PRRX1-207ENST00000497230 NMNAT3Q96T66 252 aa11.04□□□□□ -0.64
PRRX1-207ENST00000497230 SPSB2Q99619 263 aa11.04□□□□□ -0.64
PRRX1-207ENST00000497230 CMKLR1Q99788 373 aa11.04□□□□□ -0.64
PRRX1-207ENST00000497230 CALML5Q9NZT1 146 aa11.04□□□□□ -0.64
PRRX1-207ENST00000497230 ASH2LQ9UBL3 628 aa11.04□□□□□ -0.64
PRRX1-207ENST00000497230 ZNF629Q9UEG4 869 aaPredicted RBP11.04□□□□□ -0.64
PRRX1-207ENST00000497230 SLC27A6Q9Y2P4 619 aa11.04□□□□□ -0.64
PRRX1-207ENST00000497230 KDM4EB2RXH2 506 aaPredicted RBP11.04□□□□□ -0.64
PRRX1-207ENST00000497230 NDUFS6O75380 124 aaKnown RBP11.04□□□□□ -0.64
PRRX1-207ENST00000497230 TGM6O95932 706 aa11.04□□□□□ -0.64
PRRX1-207ENST00000497230 GALTP07902 379 aa11.04□□□□□ -0.64
PRRX1-207ENST00000497230 DAOP14920 347 aa11.04□□□□□ -0.64
PRRX1-207ENST00000497230 CCKBRP32239 447 aa11.04□□□□□ -0.64
PRRX1-207ENST00000497230 PRSS3P35030 304 aa11.04□□□□□ -0.64
PRRX1-207ENST00000497230 RORAP35398 523 aa11.04□□□□□ -0.64
PRRX1-207ENST00000497230 PBX2P40425 430 aa11.04□□□□□ -0.64
PRRX1-207ENST00000497230 P2RX1P51575 399 aa11.04□□□□□ -0.64
PRRX1-207ENST00000497230 DEFB115Q30KQ5 88 aa11.04□□□□□ -0.64
PRRX1-207ENST00000497230 AMZ1Q400G9 498 aa11.04□□□□□ -0.64
PRRX1-207ENST00000497230 OR4C11Q6IEV9 310 aa11.04□□□□□ -0.64
PRRX1-207ENST00000497230 OR2W3Q7Z3T1 314 aa11.04□□□□□ -0.64
PRRX1-207ENST00000497230 COMMD2Q86X83 199 aa11.04□□□□□ -0.64
PRRX1-207ENST00000497230 GLB1L2Q8IW92 636 aa11.04□□□□□ -0.64
PRRX1-207ENST00000497230 KLHDC8AQ8IYD2 350 aa11.04□□□□□ -0.64
PRRX1-207ENST00000497230 GJD3Q8N144 294 aa11.04□□□□□ -0.64
PRRX1-207ENST00000497230 OR10G6Q8NH81 332 aa11.04□□□□□ -0.64
PRRX1-207ENST00000497230 NUBPLQ8TB37 319 aa11.04□□□□□ -0.64
PRRX1-207ENST00000497230 FAM46BQ96A09 425 aa11.04□□□□□ -0.64
PRRX1-207ENST00000497230 ISOC2Q96AB3 205 aa11.04□□□□□ -0.64
PRRX1-207ENST00000497230 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP11.04□□□□□ -0.64
PRRX1-207ENST00000497230 POFUT1Q9H488 388 aa11.04□□□□□ -0.64
PRRX1-207ENST00000497230 TAS2R5Q9NYW4 299 aa11.04□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.5 ms