RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496574.6

PKD1-222, Transcript of polycystin 1, transient receptor potential channel interacting, human

TSL 5

Gene PKD1, Length 4,419 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PKD1-222	ENST00000496574	OR10Z1	Q8NGY1	313 aa		13.14	□□□□□ -0.31
PKD1-222	ENST00000496574	C2CD4C	Q8TF44	421 aa		13.14	□□□□□ -0.31
PKD1-222	ENST00000496574	APH1B	Q8WW43	257 aa		13.14	□□□□□ -0.31
PKD1-222	ENST00000496574	SSX3	Q99909	188 aa		13.14	□□□□□ -0.31
PKD1-222	ENST00000496574	SYT3	Q9BQG1	590 aa		13.14	□□□□□ -0.31
PKD1-222	ENST00000496574	SLC25A32	Q9H2D1	315 aa		13.14	□□□□□ -0.31
PKD1-222	ENST00000496574	ZNF337	Q9Y3M9	751 aa		13.14	□□□□□ -0.31
PKD1-222	ENST00000496574	ATG4B	Q9Y4P1	393 aa		13.14	□□□□□ -0.31
PKD1-222	ENST00000496574	GIMAP1-GIMAP5	A0A087WTJ2	511 aa		13.14	□□□□□ -0.31
PKD1-222	ENST00000496574	OR52A4P	A6NMU1	304 aa		13.14	□□□□□ -0.31
PKD1-222	ENST00000496574	IFNA1	P01562	189 aa		13.14	□□□□□ -0.31
PKD1-222	ENST00000496574	HOXB5	P09067	269 aa		13.14	□□□□□ -0.31
PKD1-222	ENST00000496574	CD53	P19397	219 aa		13.14	□□□□□ -0.31
PKD1-222	ENST00000496574	ZP3	P21754	424 aa		13.14	□□□□□ -0.31
PKD1-222	ENST00000496574	BDH1	Q02338	343 aa		13.14	□□□□□ -0.31
PKD1-222	ENST00000496574	SPOCK1	Q08629	439 aa		13.14	□□□□□ -0.31
PKD1-222	ENST00000496574	OVCH1	Q7RTY7	1134 aa		13.14	□□□□□ -0.31
PKD1-222	ENST00000496574	ZFP82	Q8N141	532 aa		13.14	□□□□□ -0.31
PKD1-222	ENST00000496574	OR51D1	Q8NGF3	324 aa		13.14	□□□□□ -0.31
PKD1-222	ENST00000496574	DVL3	Q92997	716 aa	Predicted RBP	13.14	□□□□□ -0.31
PKD1-222	ENST00000496574	MYADM	Q96S97	322 aa		13.14	□□□□□ -0.31
PKD1-222	ENST00000496574	HRASLS	Q9HDD0	168 aa		13.14	□□□□□ -0.31
PKD1-222	ENST00000496574	ATXN7L1	Q9ULK2	861 aa	Predicted RBP	13.14	□□□□□ -0.31
PKD1-222	ENST00000496574	EVPL	Q92817	2033 aa		13.14	□□□□□ -0.31
PKD1-222	ENST00000496574		A0A1W2PP55	124 aa		13.14	□□□□□ -0.31
PKD1-222	ENST00000496574	PEX11B	O96011	259 aa		13.14	□□□□□ -0.31
PKD1-222	ENST00000496574	RHO	P08100	348 aa		13.14	□□□□□ -0.31
PKD1-222	ENST00000496574	HBQ1	P09105	142 aa		13.14	□□□□□ -0.31
PKD1-222	ENST00000496574	BMPR1A	P36894	532 aa		13.14	□□□□□ -0.31
PKD1-222	ENST00000496574	RPS21	P63220	83 aa	Known RBP	13.14	□□□□□ -0.31
PKD1-222	ENST00000496574	SNTB1	Q13884	538 aa	Known RBP	13.14	□□□□□ -0.31
PKD1-222	ENST00000496574	TOMM40L	Q969M1	308 aa		13.14	□□□□□ -0.31
PKD1-222	ENST00000496574	ALG12	Q9BV10	488 aa		13.14	□□□□□ -0.31
PKD1-222	ENST00000496574	IFT22	Q9H7X7	185 aa		13.14	□□□□□ -0.31
PKD1-222	ENST00000496574	C2orf42	Q9NWW7	574 aa		13.14	□□□□□ -0.31
PKD1-222	ENST00000496574	SHROOM3	Q8TF72	1996 aa		13.13	□□□□□ -0.31
PKD1-222	ENST00000496574	THEGL	P0DJG4	465 aa		13.13	□□□□□ -0.31
PKD1-222	ENST00000496574	HLA-F	P30511	346 aa		13.13	□□□□□ -0.31
PKD1-222	ENST00000496574	CAMK2B	Q13554	666 aa		13.13	□□□□□ -0.31
PKD1-222	ENST00000496574	GPR18	Q14330	331 aa		13.13	□□□□□ -0.31
PKD1-222	ENST00000496574	DHCR24	Q15392	516 aa		13.13	□□□□□ -0.31
PKD1-222	ENST00000496574	OR5M10	Q6IEU7	315 aa		13.13	□□□□□ -0.31
PKD1-222	ENST00000496574	ZNF620	Q6ZNG0	422 aa		13.13	□□□□□ -0.31
PKD1-222	ENST00000496574	PARS2	Q7L3T8	475 aa	Known RBP	13.13	□□□□□ -0.31
PKD1-222	ENST00000496574	SLC38A6	Q8IZM9	456 aa		13.13	□□□□□ -0.31
PKD1-222	ENST00000496574	SLC2A12	Q8TD20	617 aa		13.13	□□□□□ -0.31
PKD1-222	ENST00000496574	UPRT	Q96BW1	309 aa		13.13	□□□□□ -0.31
PKD1-222	ENST00000496574	SLC25A19	Q9HC21	320 aa		13.13	□□□□□ -0.31
PKD1-222	ENST00000496574	FTSJ1	Q9UET6	329 aa		13.13	□□□□□ -0.31
PKD1-222	ENST00000496574		H3BUI4	141 aa		13.13	□□□□□ -0.31
PKD1-222	ENST00000496574	HMGN4	O00479	90 aa		13.13	□□□□□ -0.31
PKD1-222	ENST00000496574	PLPP1	O14494	284 aa		13.13	□□□□□ -0.31
PKD1-222	ENST00000496574	TNF	P01375	233 aa		13.13	□□□□□ -0.31
PKD1-222	ENST00000496574	PRPH2	P23942	346 aa		13.13	□□□□□ -0.31
PKD1-222	ENST00000496574	CHAT	P28329	748 aa		13.13	□□□□□ -0.31
PKD1-222	ENST00000496574	TNK1	Q13470	666 aa		13.13	□□□□□ -0.31
PKD1-222	ENST00000496574	PPA1	Q15181	289 aa		13.13	□□□□□ -0.31
PKD1-222	ENST00000496574	SLC9A3R2	Q15599	337 aa		13.13	□□□□□ -0.31
PKD1-222	ENST00000496574	TMEM244	Q5VVB8	128 aa		13.13	□□□□□ -0.31
PKD1-222	ENST00000496574	C1orf94	Q6P1W5	598 aa		13.13	□□□□□ -0.31
PKD1-222	ENST00000496574	HTR3D	Q70Z44	454 aa		13.13	□□□□□ -0.31
PKD1-222	ENST00000496574	SYT9	Q86SS6	491 aa		13.13	□□□□□ -0.31
PKD1-222	ENST00000496574	TCEAL8	Q8IYN2	117 aa		13.13	□□□□□ -0.31
PKD1-222	ENST00000496574	ZNF578	Q96N58	590 aa	Predicted RBP	13.13	□□□□□ -0.31
PKD1-222	ENST00000496574	ELOVL3	Q9HB03	270 aa		13.13	□□□□□ -0.31
PKD1-222	ENST00000496574	KLRF1	Q9NZS2	232 aa		13.13	□□□□□ -0.31
PKD1-222	ENST00000496574	UBE2J1	Q9Y385	318 aa	Predicted RBP	13.13	□□□□□ -0.31
PKD1-222	ENST00000496574	PRELID3B	Q9Y3B1	194 aa		13.13	□□□□□ -0.31
PKD1-222	ENST00000496574		A0A1W2PS29	197 aa		13.13	□□□□□ -0.31
PKD1-222	ENST00000496574	SPI1	P17947	270 aa		13.13	□□□□□ -0.31
PKD1-222	ENST00000496574	NME2	P22392	152 aa		13.13	□□□□□ -0.31
PKD1-222	ENST00000496574	CLRN1	P58418	232 aa		13.13	□□□□□ -0.31
PKD1-222	ENST00000496574	C19orf57	Q0VDD7	668 aa		13.13	□□□□□ -0.31
PKD1-222	ENST00000496574	HMGN3	Q15651	99 aa		13.13	□□□□□ -0.31
PKD1-222	ENST00000496574	GPR157	Q5UAW9	335 aa		13.13	□□□□□ -0.31
PKD1-222	ENST00000496574	LPCAT3	Q6P1A2	487 aa		13.13	□□□□□ -0.31
PKD1-222	ENST00000496574	CNKSR3	Q6P9H4	555 aa		13.13	□□□□□ -0.31
PKD1-222	ENST00000496574	HOXB13	Q92826	284 aa	Predicted RBP	13.13	□□□□□ -0.31
PKD1-222	ENST00000496574	PGAM5	Q96HS1	289 aa		13.13	□□□□□ -0.31
PKD1-222	ENST00000496574	TCEAL2	Q9H3H9	227 aa	Predicted RBP	13.13	□□□□□ -0.31
PKD1-222	ENST00000496574	MCCC2	Q9HCC0	563 aa		13.13	□□□□□ -0.31
PKD1-222	ENST00000496574	ACKR4	Q9NPB9	350 aa		13.13	□□□□□ -0.31
PKD1-222	ENST00000496574	C17orf113	A0A1B0GUU1	675 aa		13.12	□□□□□ -0.31
PKD1-222	ENST00000496574	TMEM212	A6NML5	194 aa		13.12	□□□□□ -0.31
PKD1-222	ENST00000496574	ZNF593	O00488	134 aa	Predicted RBP	13.12	□□□□□ -0.31
PKD1-222	ENST00000496574	CBR1	P16152	277 aa		13.12	□□□□□ -0.31
PKD1-222	ENST00000496574	CLDN6	P56747	220 aa		13.12	□□□□□ -0.31
PKD1-222	ENST00000496574	TMEM225	Q6GV28	225 aa		13.12	□□□□□ -0.31
PKD1-222	ENST00000496574	METTL27	Q8N6F8	245 aa	Predicted RBP	13.12	□□□□□ -0.31
PKD1-222	ENST00000496574	JSRP1	Q96MG2	331 aa	Predicted RBP	13.12	□□□□□ -0.31
PKD1-222	ENST00000496574	ST6GALNAC5	Q9BVH7	336 aa		13.12	□□□□□ -0.31
PKD1-222	ENST00000496574	CNTNAP3	Q9BZ76	1288 aa		13.12	□□□□□ -0.31
PKD1-222	ENST00000496574	LINC00597	Q9H2U6	94 aa		13.12	□□□□□ -0.31
PKD1-222	ENST00000496574	LRFN1	Q9P244	771 aa		13.12	□□□□□ -0.31
PKD1-222	ENST00000496574	SCML1	Q9UN30	329 aa		13.12	□□□□□ -0.31
PKD1-222	ENST00000496574	HS3ST2	Q9Y278	367 aa		13.12	□□□□□ -0.31
PKD1-222	ENST00000496574		A0A1W2PQU0	124 aa		13.12	□□□□□ -0.31
PKD1-222	ENST00000496574	SNRPGP15	A8MWD9	76 aa		13.12	□□□□□ -0.31
PKD1-222	ENST00000496574		M0QYG6	137 aa		13.12	□□□□□ -0.31
PKD1-222	ENST00000496574	ADAMTS4	O75173	837 aa		13.12	□□□□□ -0.31

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