RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496332.5

THBS3-208, Transcript of thrombospondin 3, human

TSL 3

Gene THBS3, Length 839 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
THBS3-208	ENST00000496332	DPP10	Q8N608	796 aa		10.43	□□□□□ -0.74
THBS3-208	ENST00000496332	ZIC4	Q8N9L1	334 aa		10.43	□□□□□ -0.74
THBS3-208	ENST00000496332	OR9K2	Q8NGE7	335 aa		10.43	□□□□□ -0.74
THBS3-208	ENST00000496332	STK35	Q8TDR2	534 aa		10.43	□□□□□ -0.74
THBS3-208	ENST00000496332	TMEM171	Q8WVE6	324 aa		10.43	□□□□□ -0.74
THBS3-208	ENST00000496332	IGFBPL1	Q8WX77	278 aa		10.43	□□□□□ -0.74
THBS3-208	ENST00000496332	ANKRD27	Q96NW4	1050 aa		10.43	□□□□□ -0.74
THBS3-208	ENST00000496332	ZNF607	Q96SK3	696 aa		10.43	□□□□□ -0.74
THBS3-208	ENST00000496332	SF3B5	Q9BWJ5	86 aa	Known RBP	10.43	□□□□□ -0.74
THBS3-208	ENST00000496332	PRR14	Q9BWN1	585 aa		10.43	□□□□□ -0.74
THBS3-208	ENST00000496332	TAS2R16	Q9NYV7	291 aa		10.43	□□□□□ -0.74
THBS3-208	ENST00000496332	UPB1	Q9UBR1	384 aa		10.43	□□□□□ -0.74
THBS3-208	ENST00000496332	MALT1	Q9UDY8	824 aa		10.43	□□□□□ -0.74
THBS3-208	ENST00000496332	FREM1	Q5H8C1	2179 aa		10.43	□□□□□ -0.74
THBS3-208	ENST00000496332		A0A1B0GWA3	101 aa		10.42	□□□□□ -0.74
THBS3-208	ENST00000496332	PRORSD1P	A6NEY8	169 aa		10.42	□□□□□ -0.74
THBS3-208	ENST00000496332	ELOA3D	A6NLF2	546 aa	Predicted RBP	10.42	□□□□□ -0.74
THBS3-208	ENST00000496332	SERPINB7	O75635	380 aa		10.42	□□□□□ -0.74
THBS3-208	ENST00000496332	AHSA1	O95433	338 aa		10.42	□□□□□ -0.74
THBS3-208	ENST00000496332	ITGA5	P08648	1049 aa		10.42	□□□□□ -0.74
THBS3-208	ENST00000496332	HTR2A	P28223	471 aa		10.42	□□□□□ -0.74
THBS3-208	ENST00000496332	PTH2R	P49190	550 aa		10.42	□□□□□ -0.74
THBS3-208	ENST00000496332	P2RY4	P51582	365 aa		10.42	□□□□□ -0.74
THBS3-208	ENST00000496332	MTPN	P58546	118 aa		10.42	□□□□□ -0.74
THBS3-208	ENST00000496332	EGR4	Q05215	589 aa		10.42	□□□□□ -0.74
THBS3-208	ENST00000496332	NFYC	Q13952	458 aa		10.42	□□□□□ -0.74
THBS3-208	ENST00000496332	SELPLG	Q14242	412 aa		10.42	□□□□□ -0.74
THBS3-208	ENST00000496332	GABRA6	Q16445	453 aa		10.42	□□□□□ -0.74
THBS3-208	ENST00000496332	ELOA3B	Q3SY89	546 aa		10.42	□□□□□ -0.74
THBS3-208	ENST00000496332	TSPO2	Q5TGU0	170 aa		10.42	□□□□□ -0.74
THBS3-208	ENST00000496332	C9orf135	Q5VTT2	229 aa		10.42	□□□□□ -0.74
THBS3-208	ENST00000496332	SSX8	Q7RTT4	187 aa		10.42	□□□□□ -0.74
THBS3-208	ENST00000496332	AAED1	Q7RTV5	226 aa		10.42	□□□□□ -0.74
THBS3-208	ENST00000496332	YTHDF3	Q7Z739	585 aa	Known RBP	10.42	□□□□□ -0.74
THBS3-208	ENST00000496332	PTOV1	Q86YD1	416 aa		10.42	□□□□□ -0.74
THBS3-208	ENST00000496332	ARMC8	Q8IUR7	673 aa		10.42	□□□□□ -0.74
THBS3-208	ENST00000496332	LSMEM1	Q8N8F7	131 aa		10.42	□□□□□ -0.74
THBS3-208	ENST00000496332	HIPK4	Q8NE63	616 aa		10.42	□□□□□ -0.74
THBS3-208	ENST00000496332	ELOA3	Q8NG57	546 aa		10.42	□□□□□ -0.74
THBS3-208	ENST00000496332	OR52N5	Q8NH56	324 aa		10.42	□□□□□ -0.74
THBS3-208	ENST00000496332	MFSD8	Q8NHS3	518 aa		10.42	□□□□□ -0.74
THBS3-208	ENST00000496332	TSPEAR	Q8WU66	669 aa		10.42	□□□□□ -0.74
THBS3-208	ENST00000496332	NEUROG1	Q92886	237 aa		10.42	□□□□□ -0.74
THBS3-208	ENST00000496332	TMEM45B	Q96B21	275 aa		10.42	□□□□□ -0.74
THBS3-208	ENST00000496332	SLC25A36	Q96CQ1	311 aa		10.42	□□□□□ -0.74
THBS3-208	ENST00000496332	KTI12	Q96EK9	354 aa	Predicted RBP	10.42	□□□□□ -0.74
THBS3-208	ENST00000496332	MUS81	Q96NY9	551 aa		10.42	□□□□□ -0.74
THBS3-208	ENST00000496332	ZNF385A	Q96PM9	386 aa	Known RBP	10.42	□□□□□ -0.74
THBS3-208	ENST00000496332	CGREF1	Q99674	301 aa		10.42	□□□□□ -0.74
THBS3-208	ENST00000496332	TMEM120A	Q9BXJ8	343 aa		10.42	□□□□□ -0.74
THBS3-208	ENST00000496332	TRIM2	Q9C040	744 aa		10.42	□□□□□ -0.74
THBS3-208	ENST00000496332	GSX1	Q9H4S2	264 aa	Predicted RBP	10.42	□□□□□ -0.74
THBS3-208	ENST00000496332	SLC7A10	Q9NS82	523 aa		10.42	□□□□□ -0.74
THBS3-208	ENST00000496332	ZNF446	Q9NWS9	450 aa		10.42	□□□□□ -0.74
THBS3-208	ENST00000496332	NPAP1	Q9NZP6	1156 aa		10.42	□□□□□ -0.74
THBS3-208	ENST00000496332	LAMP3	Q9UQV4	416 aa		10.42	□□□□□ -0.74
THBS3-208	ENST00000496332	FLNA	P21333	2647 aa	Known RBP	10.42	□□□□□ -0.74
THBS3-208	ENST00000496332	ACAN	P16112	2415 aa		10.41	□□□□□ -0.74
THBS3-208	ENST00000496332		A0A1W2PR80	420 aa		10.41	□□□□□ -0.74
THBS3-208	ENST00000496332	FTCDNL1	E5RQL4	147 aa		10.41	□□□□□ -0.74
THBS3-208	ENST00000496332	PDLIM1	O00151	329 aa		10.41	□□□□□ -0.74
THBS3-208	ENST00000496332	MFN2	O95140	757 aa		10.41	□□□□□ -0.74
THBS3-208	ENST00000496332	VAMP5	O95183	116 aa		10.41	□□□□□ -0.74
THBS3-208	ENST00000496332	RPS5	P46782	204 aa	Known RBP	10.41	□□□□□ -0.74
THBS3-208	ENST00000496332	CYP51A1	Q16850	503 aa		10.41	□□□□□ -0.74
THBS3-208	ENST00000496332	ZNF672	Q499Z4	452 aa	Predicted RBP	10.41	□□□□□ -0.74
THBS3-208	ENST00000496332	OR7E24	Q6IFN5	339 aa		10.41	□□□□□ -0.74
THBS3-208	ENST00000496332	C6orf89	Q6UWU4	347 aa		10.41	□□□□□ -0.74
THBS3-208	ENST00000496332	PRSS57	Q6UWY2	283 aa		10.41	□□□□□ -0.74
THBS3-208	ENST00000496332	CREB3L2	Q70SY1	520 aa		10.41	□□□□□ -0.74
THBS3-208	ENST00000496332	C11orf65	Q8NCR3	313 aa		10.41	□□□□□ -0.74
THBS3-208	ENST00000496332	KBTBD8	Q8NFY9	601 aa		10.41	□□□□□ -0.74
THBS3-208	ENST00000496332	DNAJA4	Q8WW22	397 aa	Predicted RBP	10.41	□□□□□ -0.74
THBS3-208	ENST00000496332	FBXW5	Q969U6	566 aa		10.41	□□□□□ -0.74
THBS3-208	ENST00000496332	C18orf12	Q96KH6	178 aa		10.41	□□□□□ -0.74
THBS3-208	ENST00000496332		Q96MF0	132 aa		10.41	□□□□□ -0.74
THBS3-208	ENST00000496332	PTDSS2	Q9BVG9	487 aa		10.41	□□□□□ -0.74
THBS3-208	ENST00000496332	GSX2	Q9BZM3	304 aa		10.41	□□□□□ -0.74
THBS3-208	ENST00000496332	CXorf56	Q9H5V9	222 aa		10.41	□□□□□ -0.74
THBS3-208	ENST00000496332	PIF1	Q9H611	641 aa		10.41	□□□□□ -0.74
THBS3-208	ENST00000496332	C12orf10	Q9HB07	376 aa		10.41	□□□□□ -0.74
THBS3-208	ENST00000496332	SLC13A4	Q9UKG4	626 aa		10.41	□□□□□ -0.74
THBS3-208	ENST00000496332	ANGPT4	Q9Y264	503 aa		10.41	□□□□□ -0.74
THBS3-208	ENST00000496332	RASD1	Q9Y272	281 aa		10.41	□□□□□ -0.74
THBS3-208	ENST00000496332	SLC25A15	Q9Y619	301 aa		10.41	□□□□□ -0.74
THBS3-208	ENST00000496332	RAI1	Q7Z5J4	1906 aa	Predicted RBP	10.41	□□□□□ -0.74
THBS3-208	ENST00000496332	IGKV1D-42	A0A075B6H8	117 aa		10.4	□□□□□ -0.74
THBS3-208	ENST00000496332	ABCD4	O14678	606 aa		10.4	□□□□□ -0.74
THBS3-208	ENST00000496332	TMCC2	O75069	709 aa		10.4	□□□□□ -0.74
THBS3-208	ENST00000496332	SOD3	P08294	240 aa		10.4	□□□□□ -0.74
THBS3-208	ENST00000496332	TROVE2	P10155	538 aa	Known RBP eCLIP	10.4	□□□□□ -0.74
THBS3-208	ENST00000496332	PNMT	P11086	282 aa		10.4	□□□□□ -0.74
THBS3-208	ENST00000496332	PAX1	P15863	534 aa		10.4	□□□□□ -0.74
THBS3-208	ENST00000496332	GTF2E2	P29084	291 aa	Known RBP	10.4	□□□□□ -0.74
THBS3-208	ENST00000496332	ZNF83	P51522	516 aa		10.4	□□□□□ -0.74
THBS3-208	ENST00000496332	ARFIP2	P53365	341 aa		10.4	□□□□□ -0.74
THBS3-208	ENST00000496332	PCBP3	P57721	371 aa	Known RBP	10.4	□□□□□ -0.74
THBS3-208	ENST00000496332	RGS8	P57771	180 aa	Predicted RBP	10.4	□□□□□ -0.74
THBS3-208	ENST00000496332	NCALD	P61601	193 aa		10.4	□□□□□ -0.74
THBS3-208	ENST00000496332	RPS4X	P62701	263 aa	Known RBP	10.4	□□□□□ -0.74

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