RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495084.1

COBLL1-223, Transcript of cordon-bleu WH2 repeat protein like 1, human

TSL 3

Gene COBLL1, Length 472 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
COBLL1-223	ENST00000495084	SCN10A	Q9Y5Y9	1956 aa		4.87	□□□□□ -1.63
COBLL1-223	ENST00000495084	ARPC4-TTLL3	A0A0A6YYG9	625 aa		4.87	□□□□□ -1.63
COBLL1-223	ENST00000495084		A0A1B0GW55	424 aa		4.87	□□□□□ -1.63
COBLL1-223	ENST00000495084	TRDV1	A0A1B0GX56	115 aa		4.87	□□□□□ -1.63
COBLL1-223	ENST00000495084	TRBC2	A0A5B9	178 aa		4.87	□□□□□ -1.63
COBLL1-223	ENST00000495084	LINC01553	A4QN01	128 aa		4.87	□□□□□ -1.63
COBLL1-223	ENST00000495084	KRT87P	A6NCN2	255 aa		4.87	□□□□□ -1.63
COBLL1-223	ENST00000495084	TUBAL3	A6NHL2	446 aa		4.87	□□□□□ -1.63
COBLL1-223	ENST00000495084	LIPT2	A6NK58	231 aa		4.87	□□□□□ -1.63
COBLL1-223	ENST00000495084		H3BN98	237 aa		4.87	□□□□□ -1.63
COBLL1-223	ENST00000495084	CASC3	O15234	703 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
COBLL1-223	ENST00000495084	OR10H3	O60404	316 aa		4.87	□□□□□ -1.63
COBLL1-223	ENST00000495084	LRAT	O95237	230 aa		4.87	□□□□□ -1.63
COBLL1-223	ENST00000495084	HLA-DQB1	P01920	261 aa		4.87	□□□□□ -1.63
COBLL1-223	ENST00000495084	C1QB	P02746	253 aa		4.87	□□□□□ -1.63
COBLL1-223	ENST00000495084	HMGN1	P05114	100 aa		4.87	□□□□□ -1.63
COBLL1-223	ENST00000495084	DUX4L2	P0CJ85	424 aa		4.87	□□□□□ -1.63
COBLL1-223	ENST00000495084	DUX4L3	P0CJ86	424 aa		4.87	□□□□□ -1.63
COBLL1-223	ENST00000495084	DUX4L4	P0CJ87	422 aa		4.87	□□□□□ -1.63
COBLL1-223	ENST00000495084	DUX4L5	P0CJ88	424 aa		4.87	□□□□□ -1.63
COBLL1-223	ENST00000495084	DUX4L6	P0CJ89	424 aa		4.87	□□□□□ -1.63
COBLL1-223	ENST00000495084	DUX4L7	P0CJ90	424 aa		4.87	□□□□□ -1.63
COBLL1-223	ENST00000495084	PRSS56	P0CW18	603 aa		4.87	□□□□□ -1.63
COBLL1-223	ENST00000495084	C1GALT1C1L	P0DN25	315 aa		4.87	□□□□□ -1.63
COBLL1-223	ENST00000495084	SLC2A2	P11168	524 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
COBLL1-223	ENST00000495084	ITGB6	P18564	788 aa		4.87	□□□□□ -1.63
COBLL1-223	ENST00000495084	ATF6	P18850	670 aa		4.87	□□□□□ -1.63
COBLL1-223	ENST00000495084	MAOA	P21397	527 aa		4.87	□□□□□ -1.63
COBLL1-223	ENST00000495084	CBL	P22681	906 aa		4.87	□□□□□ -1.63
COBLL1-223	ENST00000495084	F8A1	P23610	371 aa		4.87	□□□□□ -1.63
COBLL1-223	ENST00000495084	GTF2E2	P29084	291 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
COBLL1-223	ENST00000495084	ALDH4A1	P30038	563 aa		4.87	□□□□□ -1.63
COBLL1-223	ENST00000495084	GABRA5	P31644	462 aa		4.87	□□□□□ -1.63
COBLL1-223	ENST00000495084	CCR7	P32248	378 aa		4.87	□□□□□ -1.63
COBLL1-223	ENST00000495084	EIF2S3	P41091	472 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
COBLL1-223	ENST00000495084	CDKN2C	P42773	168 aa		4.87	□□□□□ -1.63
COBLL1-223	ENST00000495084	SPINT3	P49223	89 aa		4.87	□□□□□ -1.63
COBLL1-223	ENST00000495084	ATP12A	P54707	1039 aa		4.87	□□□□□ -1.63
COBLL1-223	ENST00000495084	RAG2	P55895	527 aa		4.87	□□□□□ -1.63
COBLL1-223	ENST00000495084	TAS2R43	P59537	309 aa		4.87	□□□□□ -1.63
COBLL1-223	ENST00000495084	NANOS2	P60321	138 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
COBLL1-223	ENST00000495084	PFN3	P60673	137 aa		4.87	□□□□□ -1.63
COBLL1-223	ENST00000495084	RAB14	P61106	215 aa		4.87	□□□□□ -1.63
COBLL1-223	ENST00000495084	ARF3	P61204	181 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
COBLL1-223	ENST00000495084	ARF1	P84077	181 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
COBLL1-223	ENST00000495084	LTB	Q06643	244 aa		4.87	□□□□□ -1.63
COBLL1-223	ENST00000495084	C2orf80	Q0P641	193 aa		4.87	□□□□□ -1.63
COBLL1-223	ENST00000495084	TNK1	Q13470	666 aa		4.87	□□□□□ -1.63
COBLL1-223	ENST00000495084	TPBG	Q13641	420 aa		4.87	□□□□□ -1.63
COBLL1-223	ENST00000495084	PDE7A	Q13946	482 aa		4.87	□□□□□ -1.63
COBLL1-223	ENST00000495084	DOC2A	Q14183	400 aa		4.87	□□□□□ -1.63
COBLL1-223	ENST00000495084	ARHGAP19	Q14CB8	494 aa		4.87	□□□□□ -1.63
COBLL1-223	ENST00000495084	SF3B4	Q15427	424 aa	Known RBP eCLIP	4.87	□□□□□ -1.63
COBLL1-223	ENST00000495084	CDKN3	Q16667	212 aa		4.87	□□□□□ -1.63
COBLL1-223	ENST00000495084	EXOC3L2	Q2M3D2	409 aa		4.87	□□□□□ -1.63
COBLL1-223	ENST00000495084	GTDC1	Q4AE62	458 aa		4.87	□□□□□ -1.63
COBLL1-223	ENST00000495084	ATAD3C	Q5T2N8	411 aa		4.87	□□□□□ -1.63
COBLL1-223	ENST00000495084	C12orf73	Q69YU5	71 aa		4.87	□□□□□ -1.63
COBLL1-223	ENST00000495084	RPL13AP3	Q6NVV1	102 aa		4.87	□□□□□ -1.63
COBLL1-223	ENST00000495084	SLC36A4	Q6YBV0	504 aa		4.87	□□□□□ -1.63
COBLL1-223	ENST00000495084	MOB2	Q70IA6	237 aa		4.87	□□□□□ -1.63
COBLL1-223	ENST00000495084	VTCN1	Q7Z7D3	282 aa		4.87	□□□□□ -1.63
COBLL1-223	ENST00000495084	TPRA1	Q86W33	373 aa		4.87	□□□□□ -1.63
COBLL1-223	ENST00000495084	NAGS	Q8N159	534 aa		4.87	□□□□□ -1.63
COBLL1-223	ENST00000495084	CLDN19	Q8N6F1	224 aa		4.87	□□□□□ -1.63
COBLL1-223	ENST00000495084	LRRC17	Q8N6Y2	441 aa		4.87	□□□□□ -1.63
COBLL1-223	ENST00000495084	AQP11	Q8NBQ7	271 aa		4.87	□□□□□ -1.63
COBLL1-223	ENST00000495084	KLHDC9	Q8NEP7	349 aa		4.87	□□□□□ -1.63
COBLL1-223	ENST00000495084	OR7G3	Q8NG95	312 aa		4.87	□□□□□ -1.63
COBLL1-223	ENST00000495084	CLHC1	Q8NHS4	586 aa		4.87	□□□□□ -1.63
COBLL1-223	ENST00000495084	BBS10	Q8TAM1	723 aa		4.87	□□□□□ -1.63
COBLL1-223	ENST00000495084	SUN5	Q8TC36	379 aa		4.87	□□□□□ -1.63
COBLL1-223	ENST00000495084	ZFAND1	Q8TCF1	268 aa		4.87	□□□□□ -1.63
COBLL1-223	ENST00000495084	GPR151	Q8TDV0	419 aa		4.87	□□□□□ -1.63
COBLL1-223	ENST00000495084	CREB3L4	Q8TEY5	395 aa		4.87	□□□□□ -1.63
COBLL1-223	ENST00000495084	DEDD2	Q8WXF8	326 aa		4.87	□□□□□ -1.63
COBLL1-223	ENST00000495084	SLC7A6	Q92536	515 aa		4.87	□□□□□ -1.63
COBLL1-223	ENST00000495084	OSTF1	Q92882	214 aa		4.87	□□□□□ -1.63
COBLL1-223	ENST00000495084	NEUROG1	Q92886	237 aa		4.87	□□□□□ -1.63
COBLL1-223	ENST00000495084	ECHDC3	Q96DC8	303 aa		4.87	□□□□□ -1.63
COBLL1-223	ENST00000495084	ZNF354B	Q96LW1	612 aa		4.87	□□□□□ -1.63
COBLL1-223	ENST00000495084	HARBI1	Q96MB7	349 aa		4.87	□□□□□ -1.63
COBLL1-223	ENST00000495084	CMTM3	Q96MX0	182 aa		4.87	□□□□□ -1.63
COBLL1-223	ENST00000495084	OR2A14	Q96R47	310 aa		4.87	□□□□□ -1.63
COBLL1-223	ENST00000495084	FAIM2	Q9BWQ8	316 aa		4.87	□□□□□ -1.63
COBLL1-223	ENST00000495084	OR51E2	Q9H255	320 aa		4.87	□□□□□ -1.63
COBLL1-223	ENST00000495084	FGF20	Q9NP95	211 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
COBLL1-223	ENST00000495084	ACSS1	Q9NUB1	689 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
COBLL1-223	ENST00000495084	ACER3	Q9NUN7	267 aa		4.87	□□□□□ -1.63
COBLL1-223	ENST00000495084	RBFOX1	Q9NWB1	397 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
COBLL1-223	ENST00000495084	HCFC1R1	Q9NWW0	138 aa		4.87	□□□□□ -1.63
COBLL1-223	ENST00000495084	KLHL28	Q9NXS3	571 aa		4.87	□□□□□ -1.63
COBLL1-223	ENST00000495084	VNN3	Q9NY84	501 aa		4.87	□□□□□ -1.63
COBLL1-223	ENST00000495084	B3GNT2	Q9NY97	397 aa		4.87	□□□□□ -1.63
COBLL1-223	ENST00000495084	GPR83	Q9NYM4	423 aa		4.87	□□□□□ -1.63
COBLL1-223	ENST00000495084	ZNF226	Q9NYT6	803 aa		4.87	□□□□□ -1.63
COBLL1-223	ENST00000495084	DUX4	Q9UBX2	424 aa		4.87	□□□□□ -1.63
COBLL1-223	ENST00000495084	HS3ST2	Q9Y278	367 aa		4.87	□□□□□ -1.63
COBLL1-223	ENST00000495084	PRG3	Q9Y2Y8	225 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
COBLL1-223	ENST00000495084	OR51B4	Q9Y5P0	310 aa		4.87	□□□□□ -1.63

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