RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000494037.1

TSPAN7-208, Transcript of tetraspanin 7, humanhuman

TSL 4

Gene TSPAN7, Length 575 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN7-208ENST00000494037 MRPL33O75394 65 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
TSPAN7-208ENST00000494037 CD3EP07766 207 aa7.29□□□□□ -1.24
TSPAN7-208ENST00000494037 ETS2P15036 469 aa7.29□□□□□ -1.24
TSPAN7-208ENST00000494037 GPX2P18283 190 aa7.29□□□□□ -1.24
TSPAN7-208ENST00000494037 PPIBP23284 216 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
TSPAN7-208ENST00000494037 AQP1P29972 269 aa7.29□□□□□ -1.24
TSPAN7-208ENST00000494037 MTPNP58546 118 aa7.29□□□□□ -1.24
TSPAN7-208ENST00000494037 IRX1P78414 480 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
TSPAN7-208ENST00000494037 SLC25A3Q00325 362 aa7.29□□□□□ -1.24
TSPAN7-208ENST00000494037 EGR4Q05215 589 aa7.29□□□□□ -1.24
TSPAN7-208ENST00000494037 SPOCK1Q08629 439 aa7.29□□□□□ -1.24
TSPAN7-208ENST00000494037 FAPQ12884 760 aa7.29□□□□□ -1.24
TSPAN7-208ENST00000494037 SCARB2Q14108 478 aa7.29□□□□□ -1.24
TSPAN7-208ENST00000494037 ZNF672Q499Z4 452 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
TSPAN7-208ENST00000494037 RUNDC3AQ59EK9 446 aa7.29□□□□□ -1.24
TSPAN7-208ENST00000494037 TIMM23BQ5SRD1 257 aa7.29□□□□□ -1.24
TSPAN7-208ENST00000494037 TSPO2Q5TGU0 170 aa7.29□□□□□ -1.24
TSPAN7-208ENST00000494037 C9orf135Q5VTT2 229 aa7.29□□□□□ -1.24
TSPAN7-208ENST00000494037 C1orf140Q5VVS0 124 aa7.29□□□□□ -1.24
TSPAN7-208ENST00000494037 REEP3Q6NUK4 255 aa7.29□□□□□ -1.24
TSPAN7-208ENST00000494037 DHRS4L2Q6PKH6 230 aa7.29□□□□□ -1.24
TSPAN7-208ENST00000494037 C6orf89Q6UWU4 347 aa7.29□□□□□ -1.24
TSPAN7-208ENST00000494037 YTHDF3Q7Z739 585 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
TSPAN7-208ENST00000494037 GPAT4Q86UL3 456 aa7.29□□□□□ -1.24
TSPAN7-208ENST00000494037 PTOV1Q86YD1 416 aa7.29□□□□□ -1.24
TSPAN7-208ENST00000494037 ZNF611Q8N823 705 aa7.29□□□□□ -1.24
TSPAN7-208ENST00000494037 ZIC4Q8N9L1 334 aa7.29□□□□□ -1.24
TSPAN7-208ENST00000494037 OR52N5Q8NH56 324 aa7.29□□□□□ -1.24
TSPAN7-208ENST00000494037 TMEM171Q8WVE6 324 aa7.29□□□□□ -1.24
TSPAN7-208ENST00000494037 SLC35B4Q969S0 331 aa7.29□□□□□ -1.24
TSPAN7-208ENST00000494037 TMEM45BQ96B21 275 aa7.29□□□□□ -1.24
TSPAN7-208ENST00000494037 KTI12Q96EK9 354 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
TSPAN7-208ENST00000494037 Q96MF0 132 aa7.29□□□□□ -1.24
TSPAN7-208ENST00000494037 USB1Q9BQ65 265 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
TSPAN7-208ENST00000494037 PRR14Q9BWN1 585 aa7.29□□□□□ -1.24
TSPAN7-208ENST00000494037 TAPBPLQ9BX59 468 aa7.29□□□□□ -1.24
TSPAN7-208ENST00000494037 GSX2Q9BZM3 304 aa7.29□□□□□ -1.24
TSPAN7-208ENST00000494037 TMEM38AQ9H6F2 299 aa7.29□□□□□ -1.24
TSPAN7-208ENST00000494037 ARMC7Q9H6L4 198 aa7.29□□□□□ -1.24
TSPAN7-208ENST00000494037 ESRP2Q9H6T0 727 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
TSPAN7-208ENST00000494037 SLC7A10Q9NS82 523 aa7.29□□□□□ -1.24
TSPAN7-208ENST00000494037 ZNF446Q9NWS9 450 aa7.29□□□□□ -1.24
TSPAN7-208ENST00000494037 ASB6Q9NWX5 421 aa7.29□□□□□ -1.24
TSPAN7-208ENST00000494037 TAS2R16Q9NYV7 291 aa7.29□□□□□ -1.24
TSPAN7-208ENST00000494037 SEC14L4Q9UDX3 406 aa7.29□□□□□ -1.24
TSPAN7-208ENST00000494037 LEF1Q9UJU2 399 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
TSPAN7-208ENST00000494037 ZNF232Q9UNY5 417 aa7.29□□□□□ -1.24
TSPAN7-208ENST00000494037 LAMP3Q9UQV4 416 aa7.29□□□□□ -1.24
TSPAN7-208ENST00000494037 MAGED1Q9Y5V3 778 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
TSPAN7-208ENST00000494037 SLC25A15Q9Y619 301 aa7.29□□□□□ -1.24
TSPAN7-208ENST00000494037 SVEP1Q4LDE5 3571 aa7.28□□□□□ -1.24
TSPAN7-208ENST00000494037 IGKV1D-42A0A075B6H8 117 aa7.28□□□□□ -1.24
TSPAN7-208ENST00000494037 CIB4A0PJX0 185 aa7.28□□□□□ -1.24
TSPAN7-208ENST00000494037 TRIM64A6NGJ6 449 aa7.28□□□□□ -1.24
TSPAN7-208ENST00000494037 TRIM64BA6NI03 449 aa7.28□□□□□ -1.24
TSPAN7-208ENST00000494037 CCT8L1PA6NM43 557 aa7.28□□□□□ -1.24
TSPAN7-208ENST00000494037 EVPLLA8MZ36 301 aa7.28□□□□□ -1.24
TSPAN7-208ENST00000494037 SHISA9B4DS77 424 aa7.28□□□□□ -1.24
TSPAN7-208ENST00000494037 ABCD4O14678 606 aa7.28□□□□□ -1.24
TSPAN7-208ENST00000494037 FZD7O75084 574 aa7.28□□□□□ -1.24
TSPAN7-208ENST00000494037 AHSA1O95433 338 aa7.28□□□□□ -1.24
TSPAN7-208ENST00000494037 OPN1SWP03999 348 aa7.28□□□□□ -1.24
TSPAN7-208ENST00000494037 SOD3P08294 240 aa7.28□□□□□ -1.24
TSPAN7-208ENST00000494037 DANCRP0C864 163 aa7.28□□□□□ -1.24
TSPAN7-208ENST00000494037 PNMTP11086 282 aa7.28□□□□□ -1.24
TSPAN7-208ENST00000494037 FOSL1P15407 271 aa7.28□□□□□ -1.24
TSPAN7-208ENST00000494037 PAX1P15863 534 aa7.28□□□□□ -1.24
TSPAN7-208ENST00000494037 PTNP21246 168 aa7.28□□□□□ -1.24
TSPAN7-208ENST00000494037 RPS5P46782 204 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
TSPAN7-208ENST00000494037 SELENOPP49908 381 aa7.28□□□□□ -1.24
TSPAN7-208ENST00000494037 CDH11P55287 796 aa7.28□□□□□ -1.24
TSPAN7-208ENST00000494037 PCBP3P57721 371 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
TSPAN7-208ENST00000494037 LGALS3BPQ08380 585 aa7.28□□□□□ -1.24
TSPAN7-208ENST00000494037 DMTNQ08495 405 aa7.28□□□□□ -1.24
TSPAN7-208ENST00000494037 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP7.28□□□□□ -1.24
TSPAN7-208ENST00000494037 GABRA6Q16445 453 aa7.28□□□□□ -1.24
TSPAN7-208ENST00000494037 CGB2Q6NT52 195 aa7.28□□□□□ -1.24
TSPAN7-208ENST00000494037 CIARTQ8N365 385 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
TSPAN7-208ENST00000494037 DPP10Q8N608 796 aa7.28□□□□□ -1.24
TSPAN7-208ENST00000494037 HIPK4Q8NE63 616 aa7.28□□□□□ -1.24
TSPAN7-208ENST00000494037 STK35Q8TDR2 534 aa7.28□□□□□ -1.24
TSPAN7-208ENST00000494037 FBXW5Q969U6 566 aa7.28□□□□□ -1.24
TSPAN7-208ENST00000494037 MUCL1Q96DR8 90 aa7.28□□□□□ -1.24
TSPAN7-208ENST00000494037 C18orf12Q96KH6 178 aa7.28□□□□□ -1.24
TSPAN7-208ENST00000494037 COX4I2Q96KJ9 171 aa7.28□□□□□ -1.24
TSPAN7-208ENST00000494037 ANKRD27Q96NW4 1050 aa7.28□□□□□ -1.24
TSPAN7-208ENST00000494037 ALKBH3Q96Q83 286 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
TSPAN7-208ENST00000494037 CGREF1Q99674 301 aa7.28□□□□□ -1.24
TSPAN7-208ENST00000494037 SIKE1Q9BRV8 207 aa7.28□□□□□ -1.24
TSPAN7-208ENST00000494037 SF3B5Q9BWJ5 86 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
TSPAN7-208ENST00000494037 TMEM120AQ9BXJ8 343 aa7.28□□□□□ -1.24
TSPAN7-208ENST00000494037 TRIM2Q9C040 744 aa7.28□□□□□ -1.24
TSPAN7-208ENST00000494037 AMBRA1Q9C0C7 1298 aa7.28□□□□□ -1.24
TSPAN7-208ENST00000494037 RABEP2Q9H5N1 569 aa7.28□□□□□ -1.24
TSPAN7-208ENST00000494037 NGBQ9NPG2 151 aa7.28□□□□□ -1.24
TSPAN7-208ENST00000494037 ZNF701Q9NV72 531 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
TSPAN7-208ENST00000494037 TESQ9UGI8 421 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
TSPAN7-208ENST00000494037 PRDM4Q9UKN5 801 aa7.28□□□□□ -1.24
TSPAN7-208ENST00000494037 TRIM33Q9UPN9 1127 aa7.28□□□□□ -1.24
TSPAN7-208ENST00000494037 CORO2BQ9UQ03 480 aa7.28□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 63.7 ms