RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492996.6

HERC4-211, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC4, Length 3,385 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC4-211ENST00000492996 STAT5AP42229 794 aa6.44□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 MGAT2Q10469 447 aa6.44□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 EFR3AQ14156 821 aa6.44□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 IL11RAQ14626 422 aa6.44□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 MINDY4Q4G0A6 757 aa6.44□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 EIPR1Q53HC9 387 aa6.44□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 THSD4Q6ZMP0 1018 aa6.44□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 RNF44Q7L0R7 432 aa6.44□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 DEFB124Q8NES8 71 aa6.44□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 NLGN4YQ8NFZ3 816 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 TMEM239Q8WW34 195 aa6.44□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 FYTTD1Q96QD9 318 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 HCAR1Q9BXC0 346 aa6.44□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 TEX12Q9BXU0 123 aa6.44□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 TTTY10Q9BZA0 68 aa6.44□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 RNF32Q9H0A6 362 aa6.44□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 RANGRFQ9HD47 186 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 NDUFB11Q9NX14 153 aa6.44□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 CDH10Q9Y6N8 788 aa6.44□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 UNC119BA6NIH7 251 aa6.43□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 LEUTXA8MZ59 168 aa6.43□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 D6RAR5 112 aa6.43□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 ZNF670-ZNF695F2Z2N8 137 aa6.43□□□□□ -1.38
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HERC4-211ENST00000492996 MRPL3P09001 348 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 BMP7P18075 431 aa6.43□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 EMDP50402 254 aa6.43□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 RORCP51449 518 aa6.43□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 GFERP55789 205 aa6.43□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 PLAURQ03405 335 aa6.43□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 RAB40BQ12829 278 aa6.43□□□□□ -1.38
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HERC4-211ENST00000492996 BTBD16Q32M84 506 aa6.43□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 Q5BKY6 102 aa6.43□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 C19orf47Q8N9M1 422 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 GATSQ8NAP1 163 aa6.43□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 POGLUT1Q8NBL1 392 aa6.43□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 MMABQ96EY8 250 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 TGM7Q96PF1 710 aa6.43□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 DCLRE1CQ96SD1 692 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 SLC38A3Q99624 504 aa6.43□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 SLC30A2Q9BRI3 323 aa6.43□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 TRAF4Q9BUZ4 470 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 IFT27Q9BW83 186 aa6.43□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 NXF2Q9GZY0 626 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 SEMA6CQ9H3T2 930 aa6.43□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 DUSP22Q9NRW4 184 aa6.43□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 POMT2Q9UKY4 750 aa6.43□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 HSPB11Q9Y547 144 aa6.43□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 MPDZO75970 2070 aa6.43□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 HYKKA2RU49 373 aa6.43□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 LRRN3E7EW58 273 aa6.43□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 DVL2O14641 736 aa6.43□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 PTTG1O95997 202 aa6.43□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 SLC1A3P43003 542 aa6.43□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 HTR3AP46098 478 aa6.43□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 DHPSP49366 369 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
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HERC4-211ENST00000492996 ZNF45Q02386 682 aa6.43□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 KHDRBS1Q07666 443 aaKnown RBP eCLIP6.43□□□□□ -1.38
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HERC4-211ENST00000492996 DEFB133Q30KQ1 61 aa6.43□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 C14orf28Q4W4Y0 310 aa6.43□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 YIF1BQ5BJH7 314 aa6.43□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 C3orf38Q5JPI3 329 aa6.43□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 AADACL4Q5VUY2 407 aa6.43□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 NKAIN2Q5VXU1 208 aa6.43□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 CXXC5Q7LFL8 322 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 RAB43Q86YS6 212 aa6.43□□□□□ -1.38
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HERC4-211ENST00000492996 ZNF843Q8N446 348 aa6.43□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 ARL14Q8N4G2 192 aa6.43□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 OR52L1Q8NGH7 329 aa6.43□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 ADAMTS17Q8TE56 1095 aa6.43□□□□□ -1.38
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HERC4-211ENST00000492996 SLC41A2Q96JW4 573 aa6.43□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 IP6K3Q96PC2 410 aa6.43□□□□□ -1.38
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HERC4-211ENST00000492996 TAAR9Q96RI9 348 aa6.43□□□□□ -1.38
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HERC4-211ENST00000492996 FBXL4Q9UKA2 621 aa6.43□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 SPATA2Q9UM82 520 aa6.43□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 LHX6Q9UPM6 363 aa6.43□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 C2orf92A0A1B0GVN3 265 aa6.43□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 CIB4A0PJX0 185 aa6.43□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 KDM4EB2RXH2 506 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 GMFGO60234 142 aa6.43□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 BRINP1O60477 761 aa6.43□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 ZNF780AO75290 641 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 IGKV1D-16P01601 117 aa6.43□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 FCER2P06734 321 aa6.43□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 CLUP10909 449 aa6.43□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 PAICSP22234 425 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 NOS3P29474 1203 aa6.43□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 FABP5Q01469 135 aa6.43□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 PRKCDQ05655 676 aa6.43□□□□□ -1.38
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