RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491302.1

PTPRC-212, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRC, Length 648 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-212ENST00000491302 MCF2P10911 925 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRC-212ENST00000491302 ETS2P15036 469 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRC-212ENST00000491302 SHMT2P34897 504 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRC-212ENST00000491302 MRPL28Q13084 256 aaKnown RBP5.59□□□□□ -1.51
PTPRC-212ENST00000491302 GPRC6AQ5T6X5 926 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRC-212ENST00000491302 LCE1FQ5T754 118 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRC-212ENST00000491302 FAM228AQ86W67 206 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRC-212ENST00000491302 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP5.59□□□□□ -1.51
PTPRC-212ENST00000491302 ECHDC2Q86YB7 292 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRC-212ENST00000491302 TREM2Q9NZC2 230 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRC-212ENST00000491302 UGT2A1Q9Y4X1 527 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRC-212ENST00000491302 PEX16Q9Y5Y5 336 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRC-212ENST00000491302 IGLV3-10A0A075B6K4 115 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRC-212ENST00000491302 IGHV1OR21-1A0A087WYE8 117 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRC-212ENST00000491302 A0A0G2JRQ6 117 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRC-212ENST00000491302 CTAGE15A4D2H0 777 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRC-212ENST00000491302 ZFP92A6NM28 416 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRC-212ENST00000491302 KLK3P07288 261 aaPredicted RBP5.58□□□□□ -1.52
PTPRC-212ENST00000491302 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRC-212ENST00000491302 ATP1B2P14415 290 aaPredicted RBP5.58□□□□□ -1.52
PTPRC-212ENST00000491302 CRYBB2P43320 205 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRC-212ENST00000491302 KIR2DS4P43632 304 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRC-212ENST00000491302 RGRP47804 291 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRC-212ENST00000491302 GPM6AP51674 278 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRC-212ENST00000491302 TLE4Q04727 773 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRC-212ENST00000491302 PLD1Q13393 1074 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRC-212ENST00000491302 OR5I1Q13606 314 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRC-212ENST00000491302 GNMTQ14749 295 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRC-212ENST00000491302 C1orf146Q5VVC0 180 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRC-212ENST00000491302 CTAGE6Q86UF2 777 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRC-212ENST00000491302 PAQR7Q86WK9 346 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRC-212ENST00000491302 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP5.58□□□□□ -1.52
PTPRC-212ENST00000491302 CNN2Q99439 309 aaKnown RBP5.58□□□□□ -1.52
PTPRC-212ENST00000491302 PPA2Q9H2U2 334 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRC-212ENST00000491302 SH2D2AQ9NP31 389 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRC-212ENST00000491302 NT5MQ9NPB1 228 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRC-212ENST00000491302 SMAD5-AS1Q9Y6J3 95 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRC-212ENST00000491302 AGRNO00468 2067 aa5.57□□□□□ -1.52
PTPRC-212ENST00000491302 IGHV3OR16-13A0A075B7E8 117 aa5.57□□□□□ -1.52
PTPRC-212ENST00000491302 GOLGA8OA6NCC3 632 aa5.57□□□□□ -1.52
PTPRC-212ENST00000491302 OR5B21A6NL26 309 aa5.57□□□□□ -1.52
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF716A6NP11 495 aa5.57□□□□□ -1.52
PTPRC-212ENST00000491302 E7ENQ6 273 aa5.57□□□□□ -1.52
PTPRC-212ENST00000491302 GOLGA8NF8WBI6 632 aa5.57□□□□□ -1.52
PTPRC-212ENST00000491302 HSD17B6O14756 317 aa5.57□□□□□ -1.52
PTPRC-212ENST00000491302 BBOX1O75936 387 aa5.57□□□□□ -1.52
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF735P0CB33 412 aa5.57□□□□□ -1.52
PTPRC-212ENST00000491302 NPR2P20594 1047 aa5.57□□□□□ -1.52
PTPRC-212ENST00000491302 TPMTP51580 245 aa5.57□□□□□ -1.52
PTPRC-212ENST00000491302 CSNK1G2P78368 415 aa5.57□□□□□ -1.52
PTPRC-212ENST00000491302 BST2Q10589 180 aaKnown RBP5.57□□□□□ -1.52
PTPRC-212ENST00000491302 IDI1Q13907 227 aa5.57□□□□□ -1.52
PTPRC-212ENST00000491302 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP5.57□□□□□ -1.52
PTPRC-212ENST00000491302 UQCC3Q6UW78 93 aa5.57□□□□□ -1.52
PTPRC-212ENST00000491302 BRSK1Q8TDC3 778 aa5.57□□□□□ -1.52
PTPRC-212ENST00000491302 FGF11Q92914 225 aa5.57□□□□□ -1.52
PTPRC-212ENST00000491302 MRPL45Q9BRJ2 306 aaKnown RBP5.57□□□□□ -1.52
PTPRC-212ENST00000491302 ABCG2Q9UNQ0 655 aa5.57□□□□□ -1.52
PTPRC-212ENST00000491302 A0A1W2PPE3 182 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRC-212ENST00000491302 ATP6V1B2P21281 511 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRC-212ENST00000491302 GABRR1P24046 479 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRC-212ENST00000491302 CASP14P31944 242 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRC-212ENST00000491302 SELENOTP62341 195 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRC-212ENST00000491302 SCRN3Q0VDG4 424 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRC-212ENST00000491302 PPP1R7Q15435 360 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRC-212ENST00000491302 MARCH8Q5T0T0 291 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRC-212ENST00000491302 OR2G6Q5TZ20 316 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRC-212ENST00000491302 TIGD3Q6B0B8 471 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRC-212ENST00000491302 LRRC31Q6UY01 552 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRC-212ENST00000491302 LRRC74BQ6ZQY2 392 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRC-212ENST00000491302 FAM220AQ7Z4H9 259 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRC-212ENST00000491302 CEP112Q8N8E3 955 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRC-212ENST00000491302 OR52I1Q8NGK6 324 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRC-212ENST00000491302 TBRG4Q969Z0 631 aaKnown RBP eCLIP5.56□□□□□ -1.52
PTPRC-212ENST00000491302 MARC2Q969Z3 335 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRC-212ENST00000491302 OXGR1Q96P68 337 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRC-212ENST00000491302 FMO2Q99518 471 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRC-212ENST00000491302 ARHGDIGQ99819 225 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRC-212ENST00000491302 POLR2J2Q9GZM3 115 aaKnown RBP5.56□□□□□ -1.52
PTPRC-212ENST00000491302 POLR2J3Q9H1A7 115 aaKnown RBP5.56□□□□□ -1.52
PTPRC-212ENST00000491302 KIF25Q9UIL4 384 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRC-212ENST00000491302 KCNIP3Q9Y2W7 256 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRC-212ENST00000491302 MMP24Q9Y5R2 645 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRC-212ENST00000491302 GFYI3L273 518 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRC-212ENST00000491302 ABCD4O14678 606 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRC-212ENST00000491302 MBTPS2O43462 519 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRC-212ENST00000491302 TOM1O60784 492 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRC-212ENST00000491302 IGKV3-15P01624 115 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF853P0CG23 659 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRC-212ENST00000491302 KLK2P20151 261 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRC-212ENST00000491302 HSD17B2P37059 387 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRC-212ENST00000491302 KPNA2P52292 529 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
PTPRC-212ENST00000491302 GK3PQ14409 553 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF77Q15935 545 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF571Q7Z3V5 609 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
PTPRC-212ENST00000491302 RDH10Q8IZV5 341 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRC-212ENST00000491302 FNDC5Q8NAU1 212 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRC-212ENST00000491302 OR51S1Q8NGJ8 323 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRC-212ENST00000491302 STMN2Q93045 179 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRC-212ENST00000491302 TM4SF19Q96DZ7 209 aa5.55□□□□□ -1.52
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