RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475558.5

SHQ1-207, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

TSL 5

Gene SHQ1, Length 666 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1-207ENST00000475558 SNRPGP62308 76 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
SHQ1-207ENST00000475558 ZNF117Q03924 483 aa6.36□□□□□ -1.39
SHQ1-207ENST00000475558 PTGES3Q15185 160 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
SHQ1-207ENST00000475558 QPRTQ15274 297 aa6.36□□□□□ -1.39
SHQ1-207ENST00000475558 CD226Q15762 336 aa6.36□□□□□ -1.39
SHQ1-207ENST00000475558 PLEKHN1Q494U1 663 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
SHQ1-207ENST00000475558 ZBED5Q49AG3 693 aa6.36□□□□□ -1.39
SHQ1-207ENST00000475558 PDSS1Q5T2R2 415 aa6.36□□□□□ -1.39
SHQ1-207ENST00000475558 C6orf52Q5T4I8 152 aa6.36□□□□□ -1.39
SHQ1-207ENST00000475558 ZNF691Q5VV52 312 aa6.36□□□□□ -1.39
SHQ1-207ENST00000475558 CBLN3Q6UW01 205 aa6.36□□□□□ -1.39
SHQ1-207ENST00000475558 IGFL2Q6UWQ7 119 aa6.36□□□□□ -1.39
SHQ1-207ENST00000475558 OLIG3Q7RTU3 272 aa6.36□□□□□ -1.39
SHQ1-207ENST00000475558 ATG4DQ86TL0 474 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
SHQ1-207ENST00000475558 OAFQ86UD1 273 aa6.36□□□□□ -1.39
SHQ1-207ENST00000475558 EGFL6Q8IUX8 553 aa6.36□□□□□ -1.39
SHQ1-207ENST00000475558 P3H2Q8IVL5 708 aa6.36□□□□□ -1.39
SHQ1-207ENST00000475558 NKAIN4Q8IVV8 208 aa6.36□□□□□ -1.39
SHQ1-207ENST00000475558 CISD2Q8N5K1 135 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
SHQ1-207ENST00000475558 FADS6Q8N9I5 356 aa6.36□□□□□ -1.39
SHQ1-207ENST00000475558 SCAIQ8N9R8 606 aa6.36□□□□□ -1.39
SHQ1-207ENST00000475558 OR2T33Q8NG76 320 aa6.36□□□□□ -1.39
SHQ1-207ENST00000475558 OR10G3Q8NGC4 313 aa6.36□□□□□ -1.39
SHQ1-207ENST00000475558 OR5M3Q8NGP4 307 aa6.36□□□□□ -1.39
SHQ1-207ENST00000475558 MFSD8Q8NHS3 518 aa6.36□□□□□ -1.39
SHQ1-207ENST00000475558 RHOXF1Q8NHV9 184 aa6.36□□□□□ -1.39
SHQ1-207ENST00000475558 IPCEF1Q8WWN9 437 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
SHQ1-207ENST00000475558 HDAC2Q92769 488 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
SHQ1-207ENST00000475558 RFKQ969G6 155 aa6.36□□□□□ -1.39
SHQ1-207ENST00000475558 C3orf49Q96BT1 292 aa6.36□□□□□ -1.39
SHQ1-207ENST00000475558 PITX2Q99697 317 aa6.36□□□□□ -1.39
SHQ1-207ENST00000475558 TAPBPLQ9BX59 468 aa6.36□□□□□ -1.39
SHQ1-207ENST00000475558 RSPO3Q9BXY4 272 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
SHQ1-207ENST00000475558 RIBC2Q9H4K1 309 aa6.36□□□□□ -1.39
SHQ1-207ENST00000475558 FKRPQ9H9S5 495 aa6.36□□□□□ -1.39
SHQ1-207ENST00000475558 LIN28AQ9H9Z2 209 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
SHQ1-207ENST00000475558 ZFP64Q9NPA5 681 aa6.36□□□□□ -1.39
SHQ1-207ENST00000475558 CCNB1IP1Q9NPC3 277 aa6.36□□□□□ -1.39
SHQ1-207ENST00000475558 TIGARQ9NQ88 270 aa6.36□□□□□ -1.39
SHQ1-207ENST00000475558 NANSQ9NR45 359 aa6.36□□□□□ -1.39
SHQ1-207ENST00000475558 MAN2C1Q9NTJ4 1040 aa6.36□□□□□ -1.39
SHQ1-207ENST00000475558 CLN6Q9NWW5 311 aa6.36□□□□□ -1.39
SHQ1-207ENST00000475558 IMPAD1Q9NX62 359 aa6.36□□□□□ -1.39
SHQ1-207ENST00000475558 SCOCQ9UIL1 159 aa6.36□□□□□ -1.39
SHQ1-207ENST00000475558 ZNF229Q9UJW7 825 aa6.36□□□□□ -1.39
SHQ1-207ENST00000475558 OSGIN1Q9UJX0 560 aa6.36□□□□□ -1.39
SHQ1-207ENST00000475558 B3GNT3Q9Y2A9 372 aa6.36□□□□□ -1.39
SHQ1-207ENST00000475558 MYRFQ9Y2G1 1151 aa6.36□□□□□ -1.39
SHQ1-207ENST00000475558 SLC6A5Q9Y345 797 aa6.36□□□□□ -1.39
SHQ1-207ENST00000475558 HDGFL3Q9Y3E1 203 aa6.36□□□□□ -1.39
SHQ1-207ENST00000475558 SCN3AQ9NY46 2000 aa6.36□□□□□ -1.39
SHQ1-207ENST00000475558 F8P00451 2351 aa6.36□□□□□ -1.39
SHQ1-207ENST00000475558 CNTRLQ7Z7A1 2325 aa6.36□□□□□ -1.39
SHQ1-207ENST00000475558 FBN2P35556 2912 aa6.36□□□□□ -1.39
SHQ1-207ENST00000475558 ZGRF1Q86YA3 2104 aa6.35□□□□□ -1.39
SHQ1-207ENST00000475558 TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 188 aa6.35□□□□□ -1.39
SHQ1-207ENST00000475558 TRAV17A0A0B4J275 112 aa6.35□□□□□ -1.39
SHQ1-207ENST00000475558 CENPVL1A0A0U1RR11 272 aa6.35□□□□□ -1.39
SHQ1-207ENST00000475558 SLC35F4A4IF30 521 aa6.35□□□□□ -1.39
SHQ1-207ENST00000475558 OR5H15A6NDH6 313 aa6.35□□□□□ -1.39
SHQ1-207ENST00000475558 ZAR1LA6NP61 321 aa6.35□□□□□ -1.39
SHQ1-207ENST00000475558 E9PQ18 207 aa6.35□□□□□ -1.39
SHQ1-207ENST00000475558 DLGAP1O14490 977 aa6.35□□□□□ -1.39
SHQ1-207ENST00000475558 KLF4O43474 513 aa6.35□□□□□ -1.39
SHQ1-207ENST00000475558 FRS3O43559 492 aa6.35□□□□□ -1.39
SHQ1-207ENST00000475558 DNPH1O43598 174 aa6.35□□□□□ -1.39
SHQ1-207ENST00000475558 SCO2O43819 266 aa6.35□□□□□ -1.39
SHQ1-207ENST00000475558 EIF1BO60739 113 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
SHQ1-207ENST00000475558 TRIM3O75382 744 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
SHQ1-207ENST00000475558 NDUFB2O95178 105 aa6.35□□□□□ -1.39
SHQ1-207ENST00000475558 VAMP5O95183 116 aa6.35□□□□□ -1.39
SHQ1-207ENST00000475558 LYPD3O95274 346 aa6.35□□□□□ -1.39
SHQ1-207ENST00000475558 AHSA1O95433 338 aa6.35□□□□□ -1.39
SHQ1-207ENST00000475558 SAGP10523 405 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
SHQ1-207ENST00000475558 PEPDP12955 493 aa6.35□□□□□ -1.39
SHQ1-207ENST00000475558 PRKCAP17252 672 aa6.35□□□□□ -1.39
SHQ1-207ENST00000475558 CHMP24386 653 aa6.35□□□□□ -1.39
SHQ1-207ENST00000475558 DPP4P27487 766 aa6.35□□□□□ -1.39
SHQ1-207ENST00000475558 SLC6A6P31641 620 aa6.35□□□□□ -1.39
SHQ1-207ENST00000475558 CD96P40200 585 aa6.35□□□□□ -1.39
SHQ1-207ENST00000475558 TUBA4AP68366 448 aa6.35□□□□□ -1.39
SHQ1-207ENST00000475558 ARG2P78540 354 aa6.35□□□□□ -1.39
SHQ1-207ENST00000475558 HOXC5Q00444 222 aa6.35□□□□□ -1.39
SHQ1-207ENST00000475558 CDK5Q00535 292 aa6.35□□□□□ -1.39
SHQ1-207ENST00000475558 CRYZQ08257 329 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
SHQ1-207ENST00000475558 Q0VFX4 171 aa6.35□□□□□ -1.39
SHQ1-207ENST00000475558 PPP1R8Q12972 351 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
SHQ1-207ENST00000475558 TUBA3CQ13748 450 aa6.35□□□□□ -1.39
SHQ1-207ENST00000475558 GINS1Q14691 196 aa6.35□□□□□ -1.39
SHQ1-207ENST00000475558 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP6.35□□□□□ -1.39
SHQ1-207ENST00000475558 SEC23BQ15437 767 aa6.35□□□□□ -1.39
SHQ1-207ENST00000475558 OCLNQ16625 522 aa6.35□□□□□ -1.39
SHQ1-207ENST00000475558 HYAL4Q2M3T9 481 aa6.35□□□□□ -1.39
SHQ1-207ENST00000475558 ZIK1Q3SY52 487 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
SHQ1-207ENST00000475558 KLHL22Q53GT1 634 aa6.35□□□□□ -1.39
SHQ1-207ENST00000475558 EMC4Q5J8M3 183 aa6.35□□□□□ -1.39
SHQ1-207ENST00000475558 C6orf141Q5SZD1 244 aa6.35□□□□□ -1.39
SHQ1-207ENST00000475558 FAM69AQ5T7M9 428 aa6.35□□□□□ -1.39
SHQ1-207ENST00000475558 SLX4IPQ5VYV7 408 aa6.35□□□□□ -1.39
SHQ1-207ENST00000475558 SP5Q6BEB4 398 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
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