RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000453553.1

USP25-206, Transcript of ubiquitin specific peptidase 25, humanhuman

TSL 3

Gene USP25, Length 611 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP25-206ENST00000453553 CCT8L1PA6NM43 557 aa3.55□□□□□ -1.84
USP25-206ENST00000453553 EFCAB7A8K855 629 aa3.55□□□□□ -1.84
USP25-206ENST00000453553 IDSB3KWA1 339 aa3.55□□□□□ -1.84
USP25-206ENST00000453553 E7ESA3 106 aa3.55□□□□□ -1.84
USP25-206ENST00000453553 TEX46H3BTG2 121 aa3.55□□□□□ -1.84
USP25-206ENST00000453553 SULT2B1O00204 365 aa3.55□□□□□ -1.84
USP25-206ENST00000453553 HSD17B6O14756 317 aa3.55□□□□□ -1.84
USP25-206ENST00000453553 PSTPIP1O43586 416 aa3.55□□□□□ -1.84
USP25-206ENST00000453553 ZNF253O75346 499 aa3.55□□□□□ -1.84
USP25-206ENST00000453553 GPX5O75715 221 aa3.55□□□□□ -1.84
USP25-206ENST00000453553 OR2J3O76001 311 aa3.55□□□□□ -1.84
USP25-206ENST00000453553 NOL4O94818 638 aa3.55□□□□□ -1.84
USP25-206ENST00000453553 LYPD3O95274 346 aa3.55□□□□□ -1.84
USP25-206ENST00000453553 SLC2A10O95528 541 aa3.55□□□□□ -1.84
USP25-206ENST00000453553 OXSR1O95747 527 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
USP25-206ENST00000453553 H2AFZP0C0S5 128 aa3.55□□□□□ -1.84
USP25-206ENST00000453553 CT62P0C5K7 136 aa3.55□□□□□ -1.84
USP25-206ENST00000453553 OTX1P32242 354 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
USP25-206ENST00000453553 EPHX2P34913 555 aa3.55□□□□□ -1.84
USP25-206ENST00000453553 ATP5C1P36542 298 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
USP25-206ENST00000453553 OPRD1P41143 372 aa3.55□□□□□ -1.84
USP25-206ENST00000453553 CDKN1BP46527 198 aa3.55□□□□□ -1.84
USP25-206ENST00000453553 SLC11A1P49279 550 aa3.55□□□□□ -1.84
USP25-206ENST00000453553 RAB9AP51151 201 aa3.55□□□□□ -1.84
USP25-206ENST00000453553 HMGCS2P54868 508 aa3.55□□□□□ -1.84
USP25-206ENST00000453553 CLDN8P56748 225 aa3.55□□□□□ -1.84
USP25-206ENST00000453553 CARD18P57730 90 aa3.55□□□□□ -1.84
USP25-206ENST00000453553 ERVPABLB-1P60509 514 aa3.55□□□□□ -1.84
USP25-206ENST00000453553 LTB4RQ15722 352 aa3.55□□□□□ -1.84
USP25-206ENST00000453553 ZNF77Q15935 545 aa3.55□□□□□ -1.84
USP25-206ENST00000453553 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
USP25-206ENST00000453553 Q1RN00 199 aa3.55□□□□□ -1.84
USP25-206ENST00000453553 GLYR1Q49A26 553 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
USP25-206ENST00000453553 HIKESHIQ53FT3 197 aa3.55□□□□□ -1.84
USP25-206ENST00000453553 CARD16Q5EG05 197 aa3.55□□□□□ -1.84
USP25-206ENST00000453553 AGBL2Q5U5Z8 902 aa3.55□□□□□ -1.84
USP25-206ENST00000453553 CCDC137Q6PK04 289 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
USP25-206ENST00000453553 BAIAP2L2Q6UXY1 529 aa3.55□□□□□ -1.84
USP25-206ENST00000453553 LRRC74BQ6ZQY2 392 aa3.55□□□□□ -1.84
USP25-206ENST00000453553 NIPA1Q7RTP0 329 aa3.55□□□□□ -1.84
USP25-206ENST00000453553 OR7G2Q8NG99 324 aa3.55□□□□□ -1.84
USP25-206ENST00000453553 ZPLD1Q8TCW7 415 aa3.55□□□□□ -1.84
USP25-206ENST00000453553 TCTEX1D2Q8WW35 142 aa3.55□□□□□ -1.84
USP25-206ENST00000453553 HTR3CQ8WXA8 447 aa3.55□□□□□ -1.84
USP25-206ENST00000453553 NRGNQ92686 78 aa3.55□□□□□ -1.84
USP25-206ENST00000453553 PPP1R16AQ96I34 528 aa3.55□□□□□ -1.84
USP25-206ENST00000453553 MCHR1Q99705 422 aa3.55□□□□□ -1.84
USP25-206ENST00000453553 DNTTIP1Q9H147 329 aa3.55□□□□□ -1.84
USP25-206ENST00000453553 REEP4Q9H6H4 257 aa3.55□□□□□ -1.84
USP25-206ENST00000453553 MRPL22Q9NWU5 206 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
USP25-206ENST00000453553 IMPAD1Q9NX62 359 aa3.55□□□□□ -1.84
USP25-206ENST00000453553 B3GNT2Q9NY97 397 aa3.55□□□□□ -1.84
USP25-206ENST00000453553 TBC1D24Q9ULP9 559 aa3.55□□□□□ -1.84
USP25-206ENST00000453553 TMCO1Q9UM00 188 aa3.55□□□□□ -1.84
USP25-206ENST00000453553 ADAMTS9Q9P2N4 1935 aa3.54□□□□□ -1.84
USP25-206ENST00000453553 MROH5Q6ZUA9 1318 aa3.54□□□□□ -1.84
USP25-206ENST00000453553 CCDC182A6NF36 153 aa3.54□□□□□ -1.84
USP25-206ENST00000453553 B4DXG7 233 aa3.54□□□□□ -1.84
USP25-206ENST00000453553 SLC17A2O00624 439 aa3.54□□□□□ -1.84
USP25-206ENST00000453553 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP3.54□□□□□ -1.84
USP25-206ENST00000453553 CLOCKO15516 846 aa3.54□□□□□ -1.84
USP25-206ENST00000453553 HCN1O60741 890 aa3.54□□□□□ -1.84
USP25-206ENST00000453553 TOM1O60784 492 aa3.54□□□□□ -1.84
USP25-206ENST00000453553 OR2F2O95006 317 aa3.54□□□□□ -1.84
USP25-206ENST00000453553 HTR1FP30939 366 aa3.54□□□□□ -1.84
USP25-206ENST00000453553 NAMPTP43490 491 aa3.54□□□□□ -1.84
USP25-206ENST00000453553 EFNA3P52797 238 aa3.54□□□□□ -1.84
USP25-206ENST00000453553 MRPS11P82912 194 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
USP25-206ENST00000453553 SCRN3Q0VDG4 424 aa3.54□□□□□ -1.84
USP25-206ENST00000453553 IFT88Q13099 833 aa3.54□□□□□ -1.84
USP25-206ENST00000453553 DNAJC3Q13217 504 aa3.54□□□□□ -1.84
USP25-206ENST00000453553 ILKQ13418 452 aa3.54□□□□□ -1.84
USP25-206ENST00000453553 VPS26BQ4G0F5 336 aa3.54□□□□□ -1.84
USP25-206ENST00000453553 ATAD3CQ5T2N8 411 aa3.54□□□□□ -1.84
USP25-206ENST00000453553 OR52E8Q6IFG1 317 aa3.54□□□□□ -1.84
USP25-206ENST00000453553 UFSP1Q6NVU6 142 aa3.54□□□□□ -1.84
USP25-206ENST00000453553 NUDCD3Q8IVD9 361 aa3.54□□□□□ -1.84
USP25-206ENST00000453553 GPD1LQ8N335 351 aa3.54□□□□□ -1.84
USP25-206ENST00000453553 ACMSDQ8TDX5 336 aa3.54□□□□□ -1.84
USP25-206ENST00000453553 PAQR8Q8TEZ7 354 aa3.54□□□□□ -1.84
USP25-206ENST00000453553 GIMAP1Q8WWP7 306 aa3.54□□□□□ -1.84
USP25-206ENST00000453553 KIFAP3Q92845 792 aa3.54□□□□□ -1.84
USP25-206ENST00000453553 UFD1Q92890 307 aa3.54□□□□□ -1.84
USP25-206ENST00000453553 ZBED6CLQ96FA7 236 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
USP25-206ENST00000453553 ZNF578Q96N58 590 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
USP25-206ENST00000453553 MCCC1Q96RQ3 725 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
USP25-206ENST00000453553 TEKT3Q9BXF9 490 aa3.54□□□□□ -1.84
USP25-206ENST00000453553 CHIAQ9BZP6 476 aa3.54□□□□□ -1.84
USP25-206ENST00000453553 NIPAL2Q9H841 368 aa3.54□□□□□ -1.84
USP25-206ENST00000453553 CYP3A43Q9HB55 503 aa3.54□□□□□ -1.84
USP25-206ENST00000453553 HOXC10Q9NYD6 342 aa3.54□□□□□ -1.84
USP25-206ENST00000453553 AHSPQ9NZD4 102 aa3.54□□□□□ -1.84
USP25-206ENST00000453553 KCNIP3Q9Y2W7 256 aa3.54□□□□□ -1.84
USP25-206ENST00000453553 INSRP06213 1382 aa3.53□□□□□ -1.84
USP25-206ENST00000453553 CLSPNQ9HAW4 1339 aa3.53□□□□□ -1.84
USP25-206ENST00000453553 IGLV3-10A0A075B6K4 115 aa3.53□□□□□ -1.84
USP25-206ENST00000453553 TRAV25A0A0B4J276 109 aa3.53□□□□□ -1.84
USP25-206ENST00000453553 TRBV11-1A0A0K0K1C0 115 aa3.53□□□□□ -1.84
USP25-206ENST00000453553 ZNF705EA8MWA4 302 aaPredicted RBP3.53□□□□□ -1.84
USP25-206ENST00000453553 GFYI3L273 518 aa3.53□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.8 ms