RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442481.5

PRAME-210, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 3

Gene PRAME, Length 581 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-210ENST00000442481 ELK4P28324 431 aa10.36□□□□□ -0.75
PRAME-210ENST00000442481 SHC1P29353 583 aa10.36□□□□□ -0.75
PRAME-210ENST00000442481 SLC7A1P30825 629 aa10.36□□□□□ -0.75
PRAME-210ENST00000442481 GSK3BP49841 420 aa10.36□□□□□ -0.75
PRAME-210ENST00000442481 MVDP53602 400 aa10.36□□□□□ -0.75
PRAME-210ENST00000442481 LIPEQ05469 1076 aa10.36□□□□□ -0.75
PRAME-210ENST00000442481 CEACAM7Q14002 265 aa10.36□□□□□ -0.75
PRAME-210ENST00000442481 P2RY6Q15077 328 aa10.36□□□□□ -0.75
PRAME-210ENST00000442481 RGNQ15493 299 aa10.36□□□□□ -0.75
PRAME-210ENST00000442481 CYP51A1Q16850 503 aa10.36□□□□□ -0.75
PRAME-210ENST00000442481 TMEM176BQ3YBM2 270 aaPredicted RBP10.36□□□□□ -0.75
PRAME-210ENST00000442481 LIN52Q52LA3 116 aa10.36□□□□□ -0.75
PRAME-210ENST00000442481 GCNT6Q5T4J0 391 aa10.36□□□□□ -0.75
PRAME-210ENST00000442481 C22orf34Q6ZV56 151 aa10.36□□□□□ -0.75
PRAME-210ENST00000442481 VRK2Q86Y07 508 aa10.36□□□□□ -0.75
PRAME-210ENST00000442481 C10orf111Q8N326 155 aa10.36□□□□□ -0.75
PRAME-210ENST00000442481 FAM156AQ8NDB6 213 aa10.36□□□□□ -0.75
PRAME-210ENST00000442481 MAPK1IP1LQ8NDC0 245 aa10.36□□□□□ -0.75
PRAME-210ENST00000442481 OR52P1PQ8NH57 321 aa10.36□□□□□ -0.75
PRAME-210ENST00000442481 OR10A6Q8NH74 314 aa10.36□□□□□ -0.75
PRAME-210ENST00000442481 SLC38A5Q8WUX1 472 aa10.36□□□□□ -0.75
PRAME-210ENST00000442481 TMEM234Q8WY98 164 aa10.36□□□□□ -0.75
PRAME-210ENST00000442481 ROBO4Q8WZ75 1007 aa10.36□□□□□ -0.75
PRAME-210ENST00000442481 CNOT9Q92600 299 aaKnown RBP10.36□□□□□ -0.75
PRAME-210ENST00000442481 UTP4Q969X6 686 aaKnown RBP10.36□□□□□ -0.75
PRAME-210ENST00000442481 CCDC124Q96CT7 223 aaKnown RBP10.36□□□□□ -0.75
PRAME-210ENST00000442481 DNAJA3Q96EY1 480 aa10.36□□□□□ -0.75
PRAME-210ENST00000442481 MRGPRX4Q96LA9 322 aa10.36□□□□□ -0.75
PRAME-210ENST00000442481 ADAD1Q96M93 576 aaKnown RBP10.36□□□□□ -0.75
PRAME-210ENST00000442481 GRIP2Q9C0E4 1043 aa10.36□□□□□ -0.75
PRAME-210ENST00000442481 MTHFD2LQ9H903 347 aaPredicted RBP10.36□□□□□ -0.75
PRAME-210ENST00000442481 GP6Q9HCN6 339 aa10.36□□□□□ -0.75
PRAME-210ENST00000442481 THUMPD1Q9NXG2 353 aaKnown RBP10.36□□□□□ -0.75
PRAME-210ENST00000442481 CLEC4AQ9UMR7 237 aa10.36□□□□□ -0.75
PRAME-210ENST00000442481 USP22Q9UPT9 525 aa10.36□□□□□ -0.75
PRAME-210ENST00000442481 CORO2BQ9UQ03 480 aa10.36□□□□□ -0.75
PRAME-210ENST00000442481 A0A0J9YW62 118 aa10.35□□□□□ -0.75
PRAME-210ENST00000442481 A0A1W2PNR3 127 aa10.35□□□□□ -0.75
PRAME-210ENST00000442481 PRORSD1PA6NEY8 169 aa10.35□□□□□ -0.75
PRAME-210ENST00000442481 AGAP5A6NIR3 686 aa10.35□□□□□ -0.75
PRAME-210ENST00000442481 FAM220BPB1ANY3 271 aa10.35□□□□□ -0.75
PRAME-210ENST00000442481 AP3D1O14617 1153 aa10.35□□□□□ -0.75
PRAME-210ENST00000442481 ADAMDEC1O15204 470 aa10.35□□□□□ -0.75
PRAME-210ENST00000442481 PHF1O43189 567 aaPredicted RBP10.35□□□□□ -0.75
PRAME-210ENST00000442481 GUSBP08236 651 aa10.35□□□□□ -0.75
PRAME-210ENST00000442481 DANCRP0C864 163 aa10.35□□□□□ -0.75
PRAME-210ENST00000442481 TFPIP10646 304 aa10.35□□□□□ -0.75
PRAME-210ENST00000442481 UQCRBP14927 111 aa10.35□□□□□ -0.75
PRAME-210ENST00000442481 GPX2P18283 190 aa10.35□□□□□ -0.75
PRAME-210ENST00000442481 PSMA4P25789 261 aaKnown RBP10.35□□□□□ -0.75
PRAME-210ENST00000442481 AGTR1P30556 359 aa10.35□□□□□ -0.75
PRAME-210ENST00000442481 MSX2P35548 267 aaPredicted RBP10.35□□□□□ -0.75
PRAME-210ENST00000442481 MAGEA8P43361 318 aa10.35□□□□□ -0.75
PRAME-210ENST00000442481 SLC6A8P48029 635 aa10.35□□□□□ -0.75
PRAME-210ENST00000442481 IDH2P48735 452 aaKnown RBP10.35□□□□□ -0.75
PRAME-210ENST00000442481 CARD18P57730 90 aa10.35□□□□□ -0.75
PRAME-210ENST00000442481 SESN3P58005 492 aa10.35□□□□□ -0.75
PRAME-210ENST00000442481 FADDQ13158 208 aa10.35□□□□□ -0.75
PRAME-210ENST00000442481 SELENBP1Q13228 472 aa10.35□□□□□ -0.75
PRAME-210ENST00000442481 CTU2Q2VPK5 515 aaKnown RBP10.35□□□□□ -0.75
PRAME-210ENST00000442481 ZNF672Q499Z4 452 aaPredicted RBP10.35□□□□□ -0.75
PRAME-210ENST00000442481 NCMAPQ5T1S8 102 aa10.35□□□□□ -0.75
PRAME-210ENST00000442481 MRPL2Q5T653 305 aaKnown RBP10.35□□□□□ -0.75
PRAME-210ENST00000442481 ALKBH2Q6NS38 261 aa10.35□□□□□ -0.75
PRAME-210ENST00000442481 C3orf33Q6P1S2 294 aa10.35□□□□□ -0.75
PRAME-210ENST00000442481 ZNF836Q6ZNA1 936 aa10.35□□□□□ -0.75
PRAME-210ENST00000442481 NFKBIDQ8NI38 313 aa10.35□□□□□ -0.75
PRAME-210ENST00000442481 OIT3Q8WWZ8 545 aa10.35□□□□□ -0.75
PRAME-210ENST00000442481 ST8SIA1Q92185 356 aa10.35□□□□□ -0.75
PRAME-210ENST00000442481 OSTF1Q92882 214 aa10.35□□□□□ -0.75
PRAME-210ENST00000442481 KISS1RQ969F8 398 aaPredicted RBP10.35□□□□□ -0.75
PRAME-210ENST00000442481 CPNE4Q96A23 557 aaPredicted RBP10.35□□□□□ -0.75
PRAME-210ENST00000442481 S100PBPQ96BU1 408 aa10.35□□□□□ -0.75
PRAME-210ENST00000442481 ZNF524Q96C55 264 aa10.35□□□□□ -0.75
PRAME-210ENST00000442481 RADILQ96JH8 1075 aa10.35□□□□□ -0.75
PRAME-210ENST00000442481 KCTD14Q9BQ13 255 aaPredicted RBP10.35□□□□□ -0.75
PRAME-210ENST00000442481 POTEKPQ9BYX7 375 aa10.35□□□□□ -0.75
PRAME-210ENST00000442481 MMADHCQ9H3L0 296 aaPredicted RBP10.35□□□□□ -0.75
PRAME-210ENST00000442481 KAT8Q9H7Z6 458 aaKnown RBP10.35□□□□□ -0.75
PRAME-210ENST00000442481 SERINC1Q9NRX5 453 aa10.35□□□□□ -0.75
PRAME-210ENST00000442481 RLIMQ9NVW2 624 aa10.35□□□□□ -0.75
PRAME-210ENST00000442481 TMEM160Q9NX00 188 aa10.35□□□□□ -0.75
PRAME-210ENST00000442481 ZNF443Q9Y2A4 671 aaPredicted RBP10.35□□□□□ -0.75
PRAME-210ENST00000442481 AP3M1Q9Y2T2 418 aa10.35□□□□□ -0.75
PRAME-210ENST00000442481 HAX1O00165 279 aa10.34□□□□□ -0.75
PRAME-210ENST00000442481 DNAJA2O60884 412 aa10.34□□□□□ -0.75
PRAME-210ENST00000442481 CIB2O75838 187 aa10.34□□□□□ -0.75
PRAME-210ENST00000442481 SOD3P08294 240 aa10.34□□□□□ -0.75
PRAME-210ENST00000442481 TFPTP0C1Z6 253 aa10.34□□□□□ -0.75
PRAME-210ENST00000442481 GKN3PP0CG01 181 aa10.34□□□□□ -0.75
PRAME-210ENST00000442481 ADH6P28332 368 aa10.34□□□□□ -0.75
PRAME-210ENST00000442481 AQP1P29972 269 aa10.34□□□□□ -0.75
PRAME-210ENST00000442481 THBS2P35442 1172 aa10.34□□□□□ -0.75
PRAME-210ENST00000442481 ACVR1BP36896 505 aa10.34□□□□□ -0.75
PRAME-210ENST00000442481 LARS2Q15031 903 aaKnown RBP10.34□□□□□ -0.75
PRAME-210ENST00000442481 MAPK11Q15759 364 aa10.34□□□□□ -0.75
PRAME-210ENST00000442481 AGAP6Q5VW22 663 aa10.34□□□□□ -0.75
PRAME-210ENST00000442481 PGM2L1Q6PCE3 622 aa10.34□□□□□ -0.75
PRAME-210ENST00000442481 CLEC2AQ6UVW9 174 aa10.34□□□□□ -0.75
PRAME-210ENST00000442481 SERPINA11Q86U17 422 aa10.34□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26 ms