RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000437111.1

SHQ1P1-201, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene SHQ1P1, Length 1,544 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1P1-201ENST00000437111 TMCC2O75069 709 aa5.78□□□□□ -1.48
SHQ1P1-201ENST00000437111 NDUFB2O95178 105 aa5.78□□□□□ -1.48
SHQ1P1-201ENST00000437111 CBX7O95931 251 aa5.78□□□□□ -1.48
SHQ1P1-201ENST00000437111 CH25HO95992 272 aa5.78□□□□□ -1.48
SHQ1P1-201ENST00000437111 LIMS3P0CW19 117 aa5.78□□□□□ -1.48
SHQ1P1-201ENST00000437111 LIMS4P0CW20 117 aa5.78□□□□□ -1.48
SHQ1P1-201ENST00000437111 PNMTP11086 282 aa5.78□□□□□ -1.48
SHQ1P1-201ENST00000437111 PRG2P13727 222 aa5.78□□□□□ -1.48
SHQ1P1-201ENST00000437111 GNLYP22749 145 aa5.78□□□□□ -1.48
SHQ1P1-201ENST00000437111 HTR2AP28223 471 aa5.78□□□□□ -1.48
SHQ1P1-201ENST00000437111 CCKBRP32239 447 aa5.78□□□□□ -1.48
SHQ1P1-201ENST00000437111 MAP3K8P41279 467 aa5.78□□□□□ -1.48
SHQ1P1-201ENST00000437111 SLC6A8P48029 635 aa5.78□□□□□ -1.48
SHQ1P1-201ENST00000437111 EIF2B2P49770 351 aaKnown RBP5.78□□□□□ -1.48
SHQ1P1-201ENST00000437111 SEPHS1P49903 392 aa5.78□□□□□ -1.48
SHQ1P1-201ENST00000437111 SLC16A1P53985 500 aa5.78□□□□□ -1.48
SHQ1P1-201ENST00000437111 DCAF7P61962 342 aa5.78□□□□□ -1.48
SHQ1P1-201ENST00000437111 CCL7P80098 99 aa5.78□□□□□ -1.48
SHQ1P1-201ENST00000437111 PSG6Q00889 435 aa5.78□□□□□ -1.48
SHQ1P1-201ENST00000437111 HSF2Q03933 536 aa5.78□□□□□ -1.48
SHQ1P1-201ENST00000437111 MRPL28Q13084 256 aaKnown RBP5.78□□□□□ -1.48
SHQ1P1-201ENST00000437111 C1orf61Q13536 156 aa5.78□□□□□ -1.48
SHQ1P1-201ENST00000437111 DNASE1L3Q13609 305 aa5.78□□□□□ -1.48
SHQ1P1-201ENST00000437111 KRTAP21-3Q3LHN1 58 aa5.78□□□□□ -1.48
SHQ1P1-201ENST00000437111 C14orf28Q4W4Y0 310 aa5.78□□□□□ -1.48
SHQ1P1-201ENST00000437111 KLHL12Q53G59 568 aa5.78□□□□□ -1.48
SHQ1P1-201ENST00000437111 C22orf42Q6IC83 251 aa5.78□□□□□ -1.48
SHQ1P1-201ENST00000437111 ZNF544Q6NX49 715 aa5.78□□□□□ -1.48
SHQ1P1-201ENST00000437111 PLBD1Q6P4A8 553 aa5.78□□□□□ -1.48
SHQ1P1-201ENST00000437111 CD200R1LQ6Q8B3 271 aa5.78□□□□□ -1.48
SHQ1P1-201ENST00000437111 ZNF322Q6U7Q0 402 aaPredicted RBP5.78□□□□□ -1.48
SHQ1P1-201ENST00000437111 PRSS41Q7RTY9 318 aa5.78□□□□□ -1.48
SHQ1P1-201ENST00000437111 KMT5CQ86Y97 462 aa5.78□□□□□ -1.48
SHQ1P1-201ENST00000437111 PLXDC1Q8IUK5 500 aa5.78□□□□□ -1.48
SHQ1P1-201ENST00000437111 GPR135Q8IZ08 494 aa5.78□□□□□ -1.48
SHQ1P1-201ENST00000437111 PLPP7Q8NBV4 271 aa5.78□□□□□ -1.48
SHQ1P1-201ENST00000437111 OR5T3Q8NGG3 340 aa5.78□□□□□ -1.48
SHQ1P1-201ENST00000437111 OR51G2Q8NGK0 314 aa5.78□□□□□ -1.48
SHQ1P1-201ENST00000437111 GATAD2BQ8WXI9 593 aa5.78□□□□□ -1.48
SHQ1P1-201ENST00000437111 HTRA1Q92743 480 aa5.78□□□□□ -1.48
SHQ1P1-201ENST00000437111 NACC2Q96BF6 587 aa5.78□□□□□ -1.48
SHQ1P1-201ENST00000437111 ANKRD9Q96BM1 317 aaPredicted RBP5.78□□□□□ -1.48
SHQ1P1-201ENST00000437111 SGTBQ96EQ0 304 aa5.78□□□□□ -1.48
SHQ1P1-201ENST00000437111 MMABQ96EY8 250 aaPredicted RBP5.78□□□□□ -1.48
SHQ1P1-201ENST00000437111 PEX11GQ96HA9 241 aa5.78□□□□□ -1.48
SHQ1P1-201ENST00000437111 DIRAS2Q96HU8 199 aa5.78□□□□□ -1.48
SHQ1P1-201ENST00000437111 TXNDC15Q96J42 360 aa5.78□□□□□ -1.48
SHQ1P1-201ENST00000437111 VSTM2LQ96N03 204 aa5.78□□□□□ -1.48
SHQ1P1-201ENST00000437111 FAM210AQ96ND0 272 aa5.78□□□□□ -1.48
SHQ1P1-201ENST00000437111 GFM1Q96RP9 751 aaKnown RBP5.78□□□□□ -1.48
SHQ1P1-201ENST00000437111 CNN2Q99439 309 aaKnown RBP5.78□□□□□ -1.48
SHQ1P1-201ENST00000437111 GPA33Q99795 319 aa5.78□□□□□ -1.48
SHQ1P1-201ENST00000437111 PRSS27Q9BQR3 290 aa5.78□□□□□ -1.48
SHQ1P1-201ENST00000437111 ALOXE3Q9BYJ1 711 aa5.78□□□□□ -1.48
SHQ1P1-201ENST00000437111 STRADBQ9C0K7 418 aa5.78□□□□□ -1.48
SHQ1P1-201ENST00000437111 SLC22A4Q9H015 551 aa5.78□□□□□ -1.48
SHQ1P1-201ENST00000437111 TCEAL2Q9H3H9 227 aaPredicted RBP5.78□□□□□ -1.48
SHQ1P1-201ENST00000437111 HINT3Q9NQE9 182 aaKnown RBP5.78□□□□□ -1.48
SHQ1P1-201ENST00000437111 EXOSC3Q9NQT5 275 aaKnown RBP5.78□□□□□ -1.48
SHQ1P1-201ENST00000437111 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa5.78□□□□□ -1.48
SHQ1P1-201ENST00000437111 DNAJB12Q9NXW2 375 aaKnown RBP5.78□□□□□ -1.48
SHQ1P1-201ENST00000437111 HAO2Q9NYQ3 351 aa5.78□□□□□ -1.48
SHQ1P1-201ENST00000437111 RABL2AQ9UBK7 228 aaPredicted RBP5.78□□□□□ -1.48
SHQ1P1-201ENST00000437111 COPS7AQ9UBW8 275 aa5.78□□□□□ -1.48
SHQ1P1-201ENST00000437111 RABL2BQ9UNT1 228 aa5.78□□□□□ -1.48
SHQ1P1-201ENST00000437111 SIGLEC7Q9Y286 467 aa5.78□□□□□ -1.48
SHQ1P1-201ENST00000437111 SLC6A5Q9Y345 797 aa5.78□□□□□ -1.48
SHQ1P1-201ENST00000437111 CHST2Q9Y4C5 530 aa5.78□□□□□ -1.48
SHQ1P1-201ENST00000437111 NOX1Q9Y5S8 564 aa5.78□□□□□ -1.48
SHQ1P1-201ENST00000437111 OTOGQ6ZRI0 2925 aa5.78□□□□□ -1.48
SHQ1P1-201ENST00000437111 CRYBG3Q68DQ2 2970 aa5.78□□□□□ -1.48
SHQ1P1-201ENST00000437111 ZFHX3Q15911 3703 aa5.77□□□□□ -1.48
SHQ1P1-201ENST00000437111 F8P00451 2351 aa5.77□□□□□ -1.49
SHQ1P1-201ENST00000437111 SETD2Q9BYW2 2564 aaPredicted RBP5.77□□□□□ -1.49
SHQ1P1-201ENST00000437111 EXPH5Q8NEV8 1989 aa5.77□□□□□ -1.49
SHQ1P1-201ENST00000437111 FITM1A5D6W6 292 aa5.77□□□□□ -1.49
SHQ1P1-201ENST00000437111 FABP12A6NFH5 140 aa5.77□□□□□ -1.49
SHQ1P1-201ENST00000437111 SERINC4A6NH21 518 aa5.77□□□□□ -1.49
SHQ1P1-201ENST00000437111 ELOA3DA6NLF2 546 aaPredicted RBP5.77□□□□□ -1.49
SHQ1P1-201ENST00000437111 C12orf71A8MTZ7 269 aa5.77□□□□□ -1.49
SHQ1P1-201ENST00000437111 IQCJ-SCHIP1C9J366 451 aaPredicted RBP5.77□□□□□ -1.49
SHQ1P1-201ENST00000437111 LMO7DNF2Z398 122 aa5.77□□□□□ -1.49
SHQ1P1-201ENST00000437111 GABRPO00591 440 aa5.77□□□□□ -1.49
SHQ1P1-201ENST00000437111 IDH3BO43837 385 aa5.77□□□□□ -1.49
SHQ1P1-201ENST00000437111 TMEM127O75204 238 aa5.77□□□□□ -1.49
SHQ1P1-201ENST00000437111 ARL6IP5O75915 188 aa5.77□□□□□ -1.49
SHQ1P1-201ENST00000437111 CLDN1O95832 211 aa5.77□□□□□ -1.49
SHQ1P1-201ENST00000437111 KRT8P05787 483 aa5.77□□□□□ -1.49
SHQ1P1-201ENST00000437111 CELA2BP08218 269 aaPredicted RBP5.77□□□□□ -1.49
SHQ1P1-201ENST00000437111 CT62P0C5K7 136 aa5.77□□□□□ -1.49
SHQ1P1-201ENST00000437111 GKN3PP0CG01 181 aa5.77□□□□□ -1.49
SHQ1P1-201ENST00000437111 UBL4AP11441 157 aa5.77□□□□□ -1.49
SHQ1P1-201ENST00000437111 IMPDH2P12268 514 aa5.77□□□□□ -1.49
SHQ1P1-201ENST00000437111 PEPDP12955 493 aa5.77□□□□□ -1.49
SHQ1P1-201ENST00000437111 CELP19835 753 aa5.77□□□□□ -1.49
SHQ1P1-201ENST00000437111 FUT4P22083 530 aa5.77□□□□□ -1.49
SHQ1P1-201ENST00000437111 GRNP28799 593 aaKnown RBP5.77□□□□□ -1.49
SHQ1P1-201ENST00000437111 TNFSF8P32971 234 aa5.77□□□□□ -1.49
SHQ1P1-201ENST00000437111 RORAP35398 523 aa5.77□□□□□ -1.49
SHQ1P1-201ENST00000437111 RPS19P39019 145 aaKnown RBP5.77□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 133.3 ms