RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436404.6

CNGA3-205, Transcript of cyclic nucleotide gated channel alpha 3, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CNGA3, Length 2,504 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3-205ENST00000436404 LRRN1Q6UXK5 716 aa15.51■□□□□ 0.07
CNGA3-205ENST00000436404 PXKQ7Z7A4 578 aa15.51■□□□□ 0.07
CNGA3-205ENST00000436404 C1orf210Q8IVY1 113 aa15.51■□□□□ 0.07
CNGA3-205ENST00000436404 TMEFF1Q8IYR6 380 aa15.51■□□□□ 0.07
CNGA3-205ENST00000436404 ACBD7Q8N6N7 88 aa15.51■□□□□ 0.07
CNGA3-205ENST00000436404 RELL2Q8NC24 303 aaPredicted RBP15.51■□□□□ 0.07
CNGA3-205ENST00000436404 NANPQ8TBE9 248 aa15.51■□□□□ 0.07
CNGA3-205ENST00000436404 NARS2Q96I59 477 aaKnown RBP15.51■□□□□ 0.07
CNGA3-205ENST00000436404 TIMM29Q9BSF4 260 aa15.51■□□□□ 0.07
CNGA3-205ENST00000436404 TEX12Q9BXU0 123 aa15.51■□□□□ 0.07
CNGA3-205ENST00000436404 DPEP2Q9H4A9 486 aa15.51■□□□□ 0.07
CNGA3-205ENST00000436404 H2AFY2Q9P0M6 372 aaPredicted RBP15.51■□□□□ 0.07
CNGA3-205ENST00000436404 A0A1W2PR77 199 aa15.5■□□□□ 0.07
CNGA3-205ENST00000436404 TNFRSF10CO14798 259 aa15.5■□□□□ 0.07
CNGA3-205ENST00000436404 SERPINA3P01011 423 aa15.5■□□□□ 0.07
CNGA3-205ENST00000436404 DLX5P56178 289 aa15.5■□□□□ 0.07
CNGA3-205ENST00000436404 TSPAN31Q12999 210 aa15.5■□□□□ 0.07
CNGA3-205ENST00000436404 TMEM88Q6PEY1 159 aa15.5■□□□□ 0.07
CNGA3-205ENST00000436404 COMTD1Q86VU5 262 aa15.5■□□□□ 0.07
CNGA3-205ENST00000436404 WDR5BQ86VZ2 330 aa15.5■□□□□ 0.07
CNGA3-205ENST00000436404 SIRT6Q8N6T7 355 aa15.5■□□□□ 0.07
CNGA3-205ENST00000436404 BBS1Q8NFJ9 593 aa15.5■□□□□ 0.07
CNGA3-205ENST00000436404 OR6S1Q8NH40 331 aa15.5■□□□□ 0.07
CNGA3-205ENST00000436404 OR51I1Q9H343 314 aa15.5■□□□□ 0.07
CNGA3-205ENST00000436404 MED17Q9NVC6 651 aa15.5■□□□□ 0.07
CNGA3-205ENST00000436404 TTC28Q96AY4 2481 aa15.5■□□□□ 0.07
CNGA3-205ENST00000436404 A0A0G2JPF8 293 aa15.5■□□□□ 0.07
CNGA3-205ENST00000436404 HNRNPCL3B7ZW38 293 aa15.5■□□□□ 0.07
CNGA3-205ENST00000436404 PLPP2O43688 288 aa15.5■□□□□ 0.07
CNGA3-205ENST00000436404 EIF3GO75821 320 aaKnown RBP eCLIP15.5■□□□□ 0.07
CNGA3-205ENST00000436404 KLHL18O94889 574 aa15.5■□□□□ 0.07
CNGA3-205ENST00000436404 THEGLP0DJG4 465 aa15.5■□□□□ 0.07
CNGA3-205ENST00000436404 HNRNPCL4P0DMR1 293 aa15.5■□□□□ 0.07
CNGA3-205ENST00000436404 TYRP1P17643 537 aa15.5■□□□□ 0.07
CNGA3-205ENST00000436404 IFNGR2P38484 337 aa15.5■□□□□ 0.07
CNGA3-205ENST00000436404 GMFBP60983 142 aa15.5■□□□□ 0.07
CNGA3-205ENST00000436404 MAPK14Q16539 360 aa15.5■□□□□ 0.07
CNGA3-205ENST00000436404 CCSMST1Q4G0I0 132 aa15.5■□□□□ 0.07
CNGA3-205ENST00000436404 AGTRAPQ6RW13 159 aa15.5■□□□□ 0.07
CNGA3-205ENST00000436404 PRRC1Q96M27 445 aa15.5■□□□□ 0.07
CNGA3-205ENST00000436404 UTP23Q9BRU9 249 aaKnown RBP15.5■□□□□ 0.07
CNGA3-205ENST00000436404 ALG8Q9BVK2 526 aa15.5■□□□□ 0.07
CNGA3-205ENST00000436404 ZDHHC5Q9C0B5 715 aa15.5■□□□□ 0.07
CNGA3-205ENST00000436404 DUSP15Q9H1R2 295 aaPredicted RBP15.5■□□□□ 0.07
CNGA3-205ENST00000436404 BARX1Q9HBU1 254 aaPredicted RBP15.5■□□□□ 0.07
CNGA3-205ENST00000436404 GSN-AS1Q9NRJ2 163 aa15.5■□□□□ 0.07
CNGA3-205ENST00000436404 KLF15Q9UIH9 416 aa15.5■□□□□ 0.07
CNGA3-205ENST00000436404 KCNK6Q9Y257 313 aa15.5■□□□□ 0.07
CNGA3-205ENST00000436404 A0A087WUU8 490 aa15.49■□□□□ 0.07
CNGA3-205ENST00000436404 SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 76 aa15.49■□□□□ 0.07
CNGA3-205ENST00000436404 DISC1C4P0D8 188 aa15.49■□□□□ 0.07
CNGA3-205ENST00000436404 LAMTOR5O43504 91 aa15.49■□□□□ 0.07
CNGA3-205ENST00000436404 SGCEO43556 437 aa15.49■□□□□ 0.07
CNGA3-205ENST00000436404 ATF1P18846 271 aa15.49■□□□□ 0.07
CNGA3-205ENST00000436404 ANXA7P20073 488 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
CNGA3-205ENST00000436404 MPGP29372 298 aa15.49■□□□□ 0.07
CNGA3-205ENST00000436404 STAT5AP42229 794 aa15.49■□□□□ 0.07
CNGA3-205ENST00000436404 SRSF5Q13243 272 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
CNGA3-205ENST00000436404 FZD2Q14332 565 aa15.49■□□□□ 0.07
CNGA3-205ENST00000436404 APOOLQ6UXV4 268 aa15.49■□□□□ 0.07
CNGA3-205ENST00000436404 TMPRSS9Q7Z410 1059 aa15.49■□□□□ 0.07
CNGA3-205ENST00000436404 TEX19Q8NA77 164 aa15.49■□□□□ 0.07
CNGA3-205ENST00000436404 OR51G2Q8NGK0 314 aa15.49■□□□□ 0.07
CNGA3-205ENST00000436404 GLYATL2Q8WU03 294 aa15.49■□□□□ 0.07
CNGA3-205ENST00000436404 OR2M4Q96R27 311 aa15.49■□□□□ 0.07
CNGA3-205ENST00000436404 TSNAXQ99598 290 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
CNGA3-205ENST00000436404 TIMP4Q99727 224 aa15.49■□□□□ 0.07
CNGA3-205ENST00000436404 RASL12Q9NYN1 266 aa15.49■□□□□ 0.07
CNGA3-205ENST00000436404 TAAR2Q9P1P5 351 aa15.49■□□□□ 0.07
CNGA3-205ENST00000436404 A0A0B4J203 849 aa15.49■□□□□ 0.07
CNGA3-205ENST00000436404 SAP18O00422 153 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
CNGA3-205ENST00000436404 HMGN4O00479 90 aa15.49■□□□□ 0.07
CNGA3-205ENST00000436404 ACAA1P09110 424 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
CNGA3-205ENST00000436404 TBXA2RP21731 343 aa15.49■□□□□ 0.07
CNGA3-205ENST00000436404 MECP2P51608 486 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
CNGA3-205ENST00000436404 KRT33BQ14525 404 aa15.49■□□□□ 0.07
CNGA3-205ENST00000436404 PRAMEF13Q5VWM6 474 aa15.49■□□□□ 0.07
CNGA3-205ENST00000436404 LDLRAD3Q86YD5 345 aa15.49■□□□□ 0.07
CNGA3-205ENST00000436404 IZUMO1Q8IYV9 350 aa15.49■□□□□ 0.07
CNGA3-205ENST00000436404 SVBPQ8N300 66 aa15.49■□□□□ 0.07
CNGA3-205ENST00000436404 OR4Q3Q8NH05 313 aa15.49■□□□□ 0.07
CNGA3-205ENST00000436404 CCL4L1Q8NHW4 92 aa15.49■□□□□ 0.07
CNGA3-205ENST00000436404 PDCD10Q9BUL8 212 aa15.49■□□□□ 0.07
CNGA3-205ENST00000436404 MIEF1Q9NQG6 463 aa15.49■□□□□ 0.07
CNGA3-205ENST00000436404 KMT2EQ8IZD2 1858 aa15.48■□□□□ 0.07
CNGA3-205ENST00000436404 STX11O75558 287 aa15.48■□□□□ 0.07
CNGA3-205ENST00000436404 PNLIPRP1P54315 467 aa15.48■□□□□ 0.07
CNGA3-205ENST00000436404 ZNF613Q6PF04 617 aa15.48■□□□□ 0.07
CNGA3-205ENST00000436404 LINGO2Q7L985 606 aa15.48■□□□□ 0.07
CNGA3-205ENST00000436404 PUSL1Q8N0Z8 303 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
CNGA3-205ENST00000436404 DTWD2Q8NBA8 298 aa15.48■□□□□ 0.07
CNGA3-205ENST00000436404 DMBX1Q8NFW5 382 aa15.48■□□□□ 0.07
CNGA3-205ENST00000436404 OR6T1Q8NGN1 323 aa15.48■□□□□ 0.07
CNGA3-205ENST00000436404 DNASE2BQ8WZ79 361 aa15.48■□□□□ 0.07
CNGA3-205ENST00000436404 OSTF1Q92882 214 aa15.48■□□□□ 0.07
CNGA3-205ENST00000436404 ZNF251Q9BRH9 671 aa15.48■□□□□ 0.07
CNGA3-205ENST00000436404 TCEAL2Q9H3H9 227 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
CNGA3-205ENST00000436404 TDRD6O60522 2096 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
CNGA3-205ENST00000436404 FOXE1O00358 373 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
CNGA3-205ENST00000436404 SOCS6O14544 535 aa15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.7 ms