RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426333.6

EFTUD2-202, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene EFTUD2, Length 4,548 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-202ENST00000426333 GALR3O60755 368 aaPredicted RBP10.25□□□□□ -0.77
EFTUD2-202ENST00000426333 SERPINA2P20848 420 aa10.25□□□□□ -0.77
EFTUD2-202ENST00000426333 GABRA5P31644 462 aa10.25□□□□□ -0.77
EFTUD2-202ENST00000426333 P2RY2P41231 377 aa10.25□□□□□ -0.77
EFTUD2-202ENST00000426333 ACSM1Q08AH1 577 aa10.25□□□□□ -0.77
EFTUD2-202ENST00000426333 OPCMLQ14982 345 aa10.25□□□□□ -0.77
EFTUD2-202ENST00000426333 OR1Q1Q15612 314 aa10.25□□□□□ -0.77
EFTUD2-202ENST00000426333 ZNF852Q6ZMS4 543 aa10.25□□□□□ -0.77
EFTUD2-202ENST00000426333 VRK2Q86Y07 508 aa10.25□□□□□ -0.77
EFTUD2-202ENST00000426333 KDM8Q8N371 416 aa10.25□□□□□ -0.77
EFTUD2-202ENST00000426333 OR6T1Q8NGN1 323 aa10.25□□□□□ -0.77
EFTUD2-202ENST00000426333 MSI2Q96DH6 328 aaKnown RBP10.25□□□□□ -0.77
EFTUD2-202ENST00000426333 OCSTAMPQ9BR26 566 aa10.25□□□□□ -0.77
EFTUD2-202ENST00000426333 PDLIM7Q9NR12 457 aa10.25□□□□□ -0.77
EFTUD2-202ENST00000426333 FAM212BQ9NTI7 297 aaPredicted RBP10.25□□□□□ -0.77
EFTUD2-202ENST00000426333 FAM186AA6NE01 2351 aa10.25□□□□□ -0.77
EFTUD2-202ENST00000426333 SPAG17Q6Q759 2223 aa10.25□□□□□ -0.77
EFTUD2-202ENST00000426333 ACOD1A6NK06 481 aa10.25□□□□□ -0.77
EFTUD2-202ENST00000426333 TAS2R46P59540 309 aa10.25□□□□□ -0.77
EFTUD2-202ENST00000426333 TMEM201Q5SNT2 666 aa10.25□□□□□ -0.77
EFTUD2-202ENST00000426333 FBXW12Q6X9E4 464 aa10.25□□□□□ -0.77
EFTUD2-202ENST00000426333 DPPA4Q7L190 304 aa10.25□□□□□ -0.77
EFTUD2-202ENST00000426333 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP10.25□□□□□ -0.77
EFTUD2-202ENST00000426333 RDH10Q8IZV5 341 aa10.25□□□□□ -0.77
EFTUD2-202ENST00000426333 DAZAP1Q96EP5 407 aaKnown RBP10.25□□□□□ -0.77
EFTUD2-202ENST00000426333 SORCS2Q96PQ0 1159 aa10.25□□□□□ -0.77
EFTUD2-202ENST00000426333 PSD2Q9BQI7 771 aa10.25□□□□□ -0.77
EFTUD2-202ENST00000426333 LRRC37A2A6NM11 1700 aa10.25□□□□□ -0.77
EFTUD2-202ENST00000426333 PIP5K1CO60331 668 aa10.25□□□□□ -0.77
EFTUD2-202ENST00000426333 IGHG1P01857 330 aa10.25□□□□□ -0.77
EFTUD2-202ENST00000426333 TACR1P25103 407 aa10.25□□□□□ -0.77
EFTUD2-202ENST00000426333 AOAHP28039 575 aa10.25□□□□□ -0.77
EFTUD2-202ENST00000426333 UBE2KP61086 200 aa10.25□□□□□ -0.77
EFTUD2-202ENST00000426333 CHRNEQ04844 493 aa10.25□□□□□ -0.77
EFTUD2-202ENST00000426333 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP10.25□□□□□ -0.77
EFTUD2-202ENST00000426333 OR52W1Q6IF63 320 aa10.25□□□□□ -0.77
EFTUD2-202ENST00000426333 LANCL3Q6ZV70 420 aa10.25□□□□□ -0.77
EFTUD2-202ENST00000426333 CMIPQ8IY22 773 aa10.25□□□□□ -0.77
EFTUD2-202ENST00000426333 MIB2Q96AX9 1013 aa10.25□□□□□ -0.77
EFTUD2-202ENST00000426333 LIN7BQ9HAP6 207 aa10.25□□□□□ -0.77
EFTUD2-202ENST00000426333 ZNF286AQ9HBT8 521 aa10.25□□□□□ -0.77
EFTUD2-202ENST00000426333 C2orf72A6NCS6 295 aa10.24□□□□□ -0.77
EFTUD2-202ENST00000426333 METTL15A6NJ78 407 aa10.24□□□□□ -0.77
EFTUD2-202ENST00000426333 DRGXA6NNA5 263 aa10.24□□□□□ -0.77
EFTUD2-202ENST00000426333 CBX7O95931 251 aa10.24□□□□□ -0.77
EFTUD2-202ENST00000426333 SNRPBP14678 240 aaKnown RBP10.24□□□□□ -0.77
EFTUD2-202ENST00000426333 IDUAP35475 653 aa10.24□□□□□ -0.77
EFTUD2-202ENST00000426333 GDNFP39905 211 aa10.24□□□□□ -0.77
EFTUD2-202ENST00000426333 SLC1A3P43003 542 aa10.24□□□□□ -0.77
EFTUD2-202ENST00000426333 BDH1Q02338 343 aa10.24□□□□□ -0.77
EFTUD2-202ENST00000426333 VASNQ6EMK4 673 aa10.24□□□□□ -0.77
EFTUD2-202ENST00000426333 SBSNQ6UWP8 590 aa10.24□□□□□ -0.77
EFTUD2-202ENST00000426333 IDO2Q6ZQW0 420 aa10.24□□□□□ -0.77
EFTUD2-202ENST00000426333 ARRDC2Q8TBH0 407 aa10.24□□□□□ -0.77
EFTUD2-202ENST00000426333 MUL1Q969V5 352 aa10.24□□□□□ -0.77
EFTUD2-202ENST00000426333 TMEM106AQ96A25 262 aa10.24□□□□□ -0.77
EFTUD2-202ENST00000426333 HHIPL1Q96JK4 782 aa10.24□□□□□ -0.77
EFTUD2-202ENST00000426333 SNX18Q96RF0 628 aa10.24□□□□□ -0.77
EFTUD2-202ENST00000426333 CPPED1Q9BRF8 314 aaPredicted RBP10.24□□□□□ -0.77
EFTUD2-202ENST00000426333 ENKD1Q9H0I2 346 aa10.24□□□□□ -0.77
EFTUD2-202ENST00000426333 C1GALT1Q9NS00 363 aa10.24□□□□□ -0.77
EFTUD2-202ENST00000426333 CREBZFQ9NS37 354 aa10.24□□□□□ -0.77
EFTUD2-202ENST00000426333 MED17Q9NVC6 651 aa10.24□□□□□ -0.77
EFTUD2-202ENST00000426333 PUS1Q9Y606 427 aaKnown RBP eCLIP10.24□□□□□ -0.77
EFTUD2-202ENST00000426333 SLC9B1P1A6NJY1 282 aa10.24□□□□□ -0.77
EFTUD2-202ENST00000426333 PRAMEF26H0Y7S4 382 aa10.24□□□□□ -0.77
EFTUD2-202ENST00000426333 LPLP06858 475 aa10.24□□□□□ -0.77
EFTUD2-202ENST00000426333 CPMP14384 443 aa10.24□□□□□ -0.77
EFTUD2-202ENST00000426333 PPP3CBP16298 524 aa10.24□□□□□ -0.77
EFTUD2-202ENST00000426333 IL32P24001 234 aa10.24□□□□□ -0.77
EFTUD2-202ENST00000426333 APEX1P27695 318 aaKnown RBP10.24□□□□□ -0.77
EFTUD2-202ENST00000426333 SNCAP37840 140 aa10.24□□□□□ -0.77
EFTUD2-202ENST00000426333 CASP3P42574 277 aa10.24□□□□□ -0.77
EFTUD2-202ENST00000426333 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP10.24□□□□□ -0.772e-6■■■■□ 26.7
EFTUD2-202ENST00000426333 STK11Q15831 433 aa10.24□□□□□ -0.77
EFTUD2-202ENST00000426333 PLK5Q496M5 336 aa10.24□□□□□ -0.77
EFTUD2-202ENST00000426333 HENMT1Q5T8I9 393 aaKnown RBP10.24□□□□□ -0.77
EFTUD2-202ENST00000426333 HBMQ6B0K9 141 aa10.24□□□□□ -0.77
EFTUD2-202ENST00000426333 KCNIP4Q6PIL6 250 aa10.24□□□□□ -0.77
EFTUD2-202ENST00000426333 Q6ZSR6 202 aa10.24□□□□□ -0.77
EFTUD2-202ENST00000426333 CLDN22Q8N7P3 220 aa10.24□□□□□ -0.77
EFTUD2-202ENST00000426333 OR13C9Q8NGT0 318 aa10.24□□□□□ -0.77
EFTUD2-202ENST00000426333 PSMF1Q92530 271 aa10.24□□□□□ -0.77
EFTUD2-202ENST00000426333 MYADMQ96S97 322 aa10.24□□□□□ -0.77
EFTUD2-202ENST00000426333 IL23AQ9NPF7 189 aa10.24□□□□□ -0.77
EFTUD2-202ENST00000426333 HIDE1A8MVS5 230 aa10.24□□□□□ -0.77
EFTUD2-202ENST00000426333 TRAPPC2LH3BP13 241 aa10.24□□□□□ -0.77
EFTUD2-202ENST00000426333 FOXE1O00358 373 aaPredicted RBP10.24□□□□□ -0.77
EFTUD2-202ENST00000426333 PRICKLE3O43900 615 aaPredicted RBP10.24□□□□□ -0.77
EFTUD2-202ENST00000426333 SCAF4O95104 1147 aaKnown RBP10.24□□□□□ -0.77
EFTUD2-202ENST00000426333 F13BP05160 661 aa10.24□□□□□ -0.77
EFTUD2-202ENST00000426333 F2RL1P55085 397 aa10.24□□□□□ -0.77
EFTUD2-202ENST00000426333 GPLD1P80108 840 aa10.24□□□□□ -0.77
EFTUD2-202ENST00000426333 TNK1Q13470 666 aa10.24□□□□□ -0.77
EFTUD2-202ENST00000426333 SHISA6Q6ZSJ9 500 aa10.24□□□□□ -0.77
EFTUD2-202ENST00000426333 TECPR1Q7Z6L1 1165 aa10.24□□□□□ -0.77
EFTUD2-202ENST00000426333 RNF113BQ8IZP6 322 aaKnown RBP10.24□□□□□ -0.77
EFTUD2-202ENST00000426333 MMP21Q8N119 569 aa10.24□□□□□ -0.77
EFTUD2-202ENST00000426333 TMEM130Q8N3G9 435 aa10.24□□□□□ -0.77
EFTUD2-202ENST00000426333 OR5L1Q8NGL2 311 aa10.24□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 6.5 ms