RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000392415.6

UBE2E3-201, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 E3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 3 BASIC

Gene UBE2E3, Length 1,347 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E3-201ENST00000392415 UBE2J2Q8N2K1 259 aa18.17■□□□□ 0.5
UBE2E3-201ENST00000392415 TMEM45BQ96B21 275 aa18.17■□□□□ 0.5
UBE2E3-201ENST00000392415 TMUB1Q9BVT8 246 aa18.17■□□□□ 0.5
UBE2E3-201ENST00000392415 TRIM2Q9C040 744 aa18.17■□□□□ 0.5
UBE2E3-201ENST00000392415 PIF1Q9H611 641 aa18.17■□□□□ 0.5
UBE2E3-201ENST00000392415 ASB6Q9NWX5 421 aa18.17■□□□□ 0.5
UBE2E3-201ENST00000392415 ADPRHL2Q9NX46 363 aa18.17■□□□□ 0.5
UBE2E3-201ENST00000392415 RPS6KB2Q9UBS0 482 aa18.17■□□□□ 0.5
UBE2E3-201ENST00000392415 A0A1B0GWA3 101 aa18.16■□□□□ 0.5
UBE2E3-201ENST00000392415 FTCDNL1E5RQL4 147 aa18.16■□□□□ 0.5
UBE2E3-201ENST00000392415 VAMP5O95183 116 aa18.16■□□□□ 0.5
UBE2E3-201ENST00000392415 AHSA1O95433 338 aa18.16■□□□□ 0.5
UBE2E3-201ENST00000392415 PLAUP00749 431 aa18.16■□□□□ 0.5
UBE2E3-201ENST00000392415 P2RY4P51582 365 aa18.16■□□□□ 0.5
UBE2E3-201ENST00000392415 ADAM8P78325 824 aa18.16■□□□□ 0.5
UBE2E3-201ENST00000392415 CAPRIN1Q14444 709 aaKnown RBP18.16■□□□□ 0.5
UBE2E3-201ENST00000392415 ZFHX3Q15911 3703 aa18.16■□□□□ 0.5
UBE2E3-201ENST00000392415 TRMT5Q32P41 509 aaKnown RBP18.16■□□□□ 0.5
UBE2E3-201ENST00000392415 NCMAPQ5T1S8 102 aa18.16■□□□□ 0.5
UBE2E3-201ENST00000392415 ZIC4Q8N9L1 334 aa18.16■□□□□ 0.5
UBE2E3-201ENST00000392415 OR9K2Q8NGE7 335 aa18.16■□□□□ 0.5
UBE2E3-201ENST00000392415 OR52E4Q8NGH9 312 aa18.16■□□□□ 0.5
UBE2E3-201ENST00000392415 MFSD8Q8NHS3 518 aa18.16■□□□□ 0.5
UBE2E3-201ENST00000392415 DNAJA4Q8WW22 397 aaPredicted RBP18.16■□□□□ 0.5
UBE2E3-201ENST00000392415 ESRP2Q9H6T0 727 aaKnown RBP18.16■□□□□ 0.5
UBE2E3-201ENST00000392415 EVA1AQ9H8M9 152 aa18.16■□□□□ 0.5
UBE2E3-201ENST00000392415 SAR1AQ9NR31 198 aa18.16■□□□□ 0.5
UBE2E3-201ENST00000392415 TESQ9UGI8 421 aaKnown RBP18.16■□□□□ 0.5
UBE2E3-201ENST00000392415 OR5H1A6NKK0 313 aa18.15■□□□□ 0.5
UBE2E3-201ENST00000392415 ELOA3DA6NLF2 546 aaPredicted RBP18.15■□□□□ 0.5
UBE2E3-201ENST00000392415 FZD7O75084 574 aa18.15■□□□□ 0.5
UBE2E3-201ENST00000392415 HOXC12P31275 282 aa18.15■□□□□ 0.5
UBE2E3-201ENST00000392415 RGS8P57771 180 aaPredicted RBP18.15■□□□□ 0.5
UBE2E3-201ENST00000392415 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP18.15■□□□□ 0.5
UBE2E3-201ENST00000392415 FAPQ12884 760 aa18.15■□□□□ 0.5
UBE2E3-201ENST00000392415 KLF10Q13118 480 aa18.15■□□□□ 0.5
UBE2E3-201ENST00000392415 CYLC2Q14093 348 aaPredicted RBP18.15■□□□□ 0.5
UBE2E3-201ENST00000392415 PPA1Q15181 289 aa18.15■□□□□ 0.5
UBE2E3-201ENST00000392415 STK11Q15831 433 aa18.15■□□□□ 0.5
UBE2E3-201ENST00000392415 ELOA3BQ3SY89 546 aa18.15■□□□□ 0.5
UBE2E3-201ENST00000392415 COQ5Q5HYK3 327 aa18.15■□□□□ 0.5
UBE2E3-201ENST00000392415 FAM91A1Q658Y4 838 aa18.15■□□□□ 0.5
UBE2E3-201ENST00000392415 TMEM225Q6GV28 225 aa18.15■□□□□ 0.5
UBE2E3-201ENST00000392415 NANOGP8Q6NSW7 305 aa18.15■□□□□ 0.5
UBE2E3-201ENST00000392415 ULK3Q6PHR2 472 aa18.15■□□□□ 0.5
UBE2E3-201ENST00000392415 CASP12Q6UXS9 341 aa18.15■□□□□ 0.5
UBE2E3-201ENST00000392415 ELOA3Q8NG57 546 aa18.15■□□□□ 0.5
UBE2E3-201ENST00000392415 WFDC6Q9BQY6 131 aa18.15■□□□□ 0.5
UBE2E3-201ENST00000392415 PTDSS2Q9BVG9 487 aa18.15■□□□□ 0.5
UBE2E3-201ENST00000392415 PRR14Q9BWN1 585 aa18.15■□□□□ 0.5
UBE2E3-201ENST00000392415 NANOGQ9H9S0 305 aa18.15■□□□□ 0.5
UBE2E3-201ENST00000392415 TAS2R16Q9NYV7 291 aa18.15■□□□□ 0.5
UBE2E3-201ENST00000392415 SLC13A4Q9UKG4 626 aa18.15■□□□□ 0.5
UBE2E3-201ENST00000392415 M0QX08 132 aa18.14■□□□□ 0.49
UBE2E3-201ENST00000392415 PDLIM1O00151 329 aa18.14■□□□□ 0.49
UBE2E3-201ENST00000392415 TPST2O60704 377 aa18.14■□□□□ 0.49
UBE2E3-201ENST00000392415 PNMTP11086 282 aa18.14■□□□□ 0.49
UBE2E3-201ENST00000392415 CD99P14209 185 aa18.14■□□□□ 0.49
UBE2E3-201ENST00000392415 GZMMP51124 257 aa18.14■□□□□ 0.49
UBE2E3-201ENST00000392415 NCALDP61601 193 aa18.14■□□□□ 0.49
UBE2E3-201ENST00000392415 DUSP7Q16829 419 aa18.14■□□□□ 0.49
UBE2E3-201ENST00000392415 ALG10BQ5I7T1 473 aa18.14■□□□□ 0.49
UBE2E3-201ENST00000392415 C5orf46Q6UWT4 87 aa18.14■□□□□ 0.49
UBE2E3-201ENST00000392415 GPAT4Q86UL3 456 aa18.14■□□□□ 0.49
UBE2E3-201ENST00000392415 SLC30A8Q8IWU4 369 aa18.14■□□□□ 0.49
UBE2E3-201ENST00000392415 LRRC75A-AS1Q8N1F1 130 aa18.14■□□□□ 0.49
UBE2E3-201ENST00000392415 SMYD1Q8NB12 490 aa18.14■□□□□ 0.49
UBE2E3-201ENST00000392415 OR10A6Q8NH74 314 aa18.14■□□□□ 0.49
UBE2E3-201ENST00000392415 IGFBPL1Q8WX77 278 aa18.14■□□□□ 0.49
UBE2E3-201ENST00000392415 SLC38A4Q969I6 547 aa18.14■□□□□ 0.49
UBE2E3-201ENST00000392415 MUCL1Q96DR8 90 aa18.14■□□□□ 0.49
UBE2E3-201ENST00000392415 KTI12Q96EK9 354 aaPredicted RBP18.14■□□□□ 0.49
UBE2E3-201ENST00000392415 ZNF385AQ96PM9 386 aaKnown RBP18.14■□□□□ 0.49
UBE2E3-201ENST00000392415 CCL19Q99731 98 aa18.14■□□□□ 0.49
UBE2E3-201ENST00000392415 SLC7A10Q9NS82 523 aa18.14■□□□□ 0.49
UBE2E3-201ENST00000392415 SETD2Q9BYW2 2564 aaPredicted RBP18.13■□□□□ 0.49
UBE2E3-201ENST00000392415 CIB4A0PJX0 185 aa18.13■□□□□ 0.49
UBE2E3-201ENST00000392415 HS3ST1O14792 307 aa18.13■□□□□ 0.49
UBE2E3-201ENST00000392415 RAD51DO75771 328 aa18.13■□□□□ 0.49
UBE2E3-201ENST00000392415 LGI1O95970 557 aa18.13■□□□□ 0.49
UBE2E3-201ENST00000392415 NPPAP01160 153 aa18.13■□□□□ 0.49
UBE2E3-201ENST00000392415 C8BP07358 591 aa18.13■□□□□ 0.49
UBE2E3-201ENST00000392415 ITGA5P08648 1049 aa18.13■□□□□ 0.49
UBE2E3-201ENST00000392415 PCGF2P35227 344 aa18.13■□□□□ 0.49
UBE2E3-201ENST00000392415 MDH1P40925 334 aaKnown RBP18.13■□□□□ 0.49
UBE2E3-201ENST00000392415 RPS5P46782 204 aaKnown RBP18.13■□□□□ 0.49
UBE2E3-201ENST00000392415 FOXG1P55316 489 aaPredicted RBP18.13■□□□□ 0.49
UBE2E3-201ENST00000392415 OR1Q1Q15612 314 aa18.13■□□□□ 0.49
UBE2E3-201ENST00000392415 TSPO2Q5TGU0 170 aa18.13■□□□□ 0.49
UBE2E3-201ENST00000392415 ADAM5Q6NVV9 412 aa18.13■□□□□ 0.49
UBE2E3-201ENST00000392415 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa18.13■□□□□ 0.49
UBE2E3-201ENST00000392415 ZNF611Q8N823 705 aa18.13■□□□□ 0.49
UBE2E3-201ENST00000392415 LRRC58Q96CX6 371 aa18.13■□□□□ 0.49
UBE2E3-201ENST00000392415 SLC47A1Q96FL8 570 aa18.13■□□□□ 0.49
UBE2E3-201ENST00000392415 MUS81Q96NY9 551 aa18.13■□□□□ 0.49
UBE2E3-201ENST00000392415 SH3GL1Q99961 368 aa18.13■□□□□ 0.49
UBE2E3-201ENST00000392415 TMEM27Q9HBJ8 222 aa18.13■□□□□ 0.49
UBE2E3-201ENST00000392415 KLHL14Q9P2G3 628 aa18.13■□□□□ 0.49
UBE2E3-201ENST00000392415 UPB1Q9UBR1 384 aa18.13■□□□□ 0.49
UBE2E3-201ENST00000392415 RASD1Q9Y272 281 aa18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 66.9 ms