RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000382723.4

MSX1-201, Transcript of msh homeobox 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene MSX1, Length 1,939 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSX1-201ENST00000382723 KCNMB2Q9Y691 235 aa24.22■■□□□ 1.47
MSX1-201ENST00000382723 CPAMD8Q8IZJ3 1885 aa24.21■■□□□ 1.47
MSX1-201ENST00000382723 ENTPD6O75354 484 aa24.21■■□□□ 1.47
MSX1-201ENST00000382723 ADH6P28332 368 aa24.21■■□□□ 1.47
MSX1-201ENST00000382723 CXCR4P61073 352 aa24.21■■□□□ 1.47
MSX1-201ENST00000382723 C3orf33Q6P1S2 294 aa24.21■■□□□ 1.47
MSX1-201ENST00000382723 MAMDC2Q7Z304 686 aaPredicted RBP24.21■■□□□ 1.47
MSX1-201ENST00000382723 GTPBP8Q8N3Z3 284 aaPredicted RBP24.21■■□□□ 1.47
MSX1-201ENST00000382723 LNX2Q8N448 690 aa24.21■■□□□ 1.47
MSX1-201ENST00000382723 SNIP1Q8TAD8 396 aaKnown RBP24.21■■□□□ 1.47
MSX1-201ENST00000382723 ZFP64Q9NPA5 681 aa24.21■■□□□ 1.47
MSX1-201ENST00000382723 SCN3BQ9NY72 215 aa24.21■■□□□ 1.47
MSX1-201ENST00000382723 BOKQ9UMX3 212 aaPredicted RBP24.21■■□□□ 1.47
MSX1-201ENST00000382723 HMGN1P05114 100 aa24.2■■□□□ 1.46
MSX1-201ENST00000382723 PRPS1P60891 318 aa24.2■■□□□ 1.46
MSX1-201ENST00000382723 EFNB1P98172 346 aa24.2■■□□□ 1.46
MSX1-201ENST00000382723 PIGFQ07326 219 aa24.2■■□□□ 1.46
MSX1-201ENST00000382723 ZNF800Q2TB10 664 aaPredicted RBP eCLIP24.2■■□□□ 1.46
MSX1-201ENST00000382723 SYT14P1Q58G82 188 aa24.2■■□□□ 1.46
MSX1-201ENST00000382723 MDS2Q8NDY4 140 aa24.2■■□□□ 1.46
MSX1-201ENST00000382723 TMEM163Q8TC26 289 aa24.2■■□□□ 1.46
MSX1-201ENST00000382723 MRPS26Q9BYN8 205 aaKnown RBP24.2■■□□□ 1.46
MSX1-201ENST00000382723 PAK1IP1Q9NWT1 392 aaPredicted RBP24.2■■□□□ 1.46
MSX1-201ENST00000382723 HIF3AQ9Y2N7 669 aa24.2■■□□□ 1.46
MSX1-201ENST00000382723 TRIM64A6NGJ6 449 aa24.2■■□□□ 1.46
MSX1-201ENST00000382723 MT-ATP6P00846 226 aa24.2■■□□□ 1.46
MSX1-201ENST00000382723 SP1P08047 785 aa24.2■■□□□ 1.46
MSX1-201ENST00000382723 GRK5P34947 590 aa24.2■■□□□ 1.46
MSX1-201ENST00000382723 RFC3P40938 356 aa24.2■■□□□ 1.46
MSX1-201ENST00000382723 FOXK2Q01167 660 aa24.2■■□□□ 1.46
MSX1-201ENST00000382723 FOXO1Q12778 655 aa24.2■■□□□ 1.46
MSX1-201ENST00000382723 ZNF540Q8NDQ6 660 aa24.2■■□□□ 1.46
MSX1-201ENST00000382723 LRR1Q96L50 414 aa24.2■■□□□ 1.46
MSX1-201ENST00000382723 ERMAPQ96PL5 475 aaPredicted RBP24.2■■□□□ 1.46
MSX1-201ENST00000382723 TPRKBQ9Y3C4 175 aa24.2■■□□□ 1.46
MSX1-201ENST00000382723 SPIN1Q9Y657 262 aaPredicted RBP24.2■■□□□ 1.46
MSX1-201ENST00000382723 OR2T1O43869 369 aa24.19■■□□□ 1.46
MSX1-201ENST00000382723 NOS3P29474 1203 aa24.19■■□□□ 1.46
MSX1-201ENST00000382723 GRPRP30550 384 aa24.19■■□□□ 1.46
MSX1-201ENST00000382723 SRD5A2P31213 254 aa24.19■■□□□ 1.46
MSX1-201ENST00000382723 MAP2K6P52564 334 aa24.19■■□□□ 1.46
MSX1-201ENST00000382723 APOFQ13790 326 aa24.19■■□□□ 1.46
MSX1-201ENST00000382723 SLC25A25Q6KCM7 469 aa24.19■■□□□ 1.46
MSX1-201ENST00000382723 YRDCQ86U90 279 aaKnown RBP24.19■■□□□ 1.46
MSX1-201ENST00000382723 HAS2Q92819 552 aa24.19■■□□□ 1.46
MSX1-201ENST00000382723 ADAM18Q9Y3Q7 739 aa24.19■■□□□ 1.46
MSX1-201ENST00000382723 TRAPPC6AO75865 159 aa24.18■■□□□ 1.46
MSX1-201ENST00000382723 CLPTM1O96005 669 aa24.18■■□□□ 1.46
MSX1-201ENST00000382723 GDF1P27539 372 aa24.18■■□□□ 1.46
MSX1-201ENST00000382723 SFTPDP35247 375 aa24.18■■□□□ 1.46
MSX1-201ENST00000382723 TEKQ02763 1124 aa24.18■■□□□ 1.46
MSX1-201ENST00000382723 RPL18Q07020 188 aaKnown RBP24.18■■□□□ 1.46
MSX1-201ENST00000382723 SELENBP1Q13228 472 aa24.18■■□□□ 1.46
MSX1-201ENST00000382723 OR7A5Q15622 319 aa24.18■■□□□ 1.46
MSX1-201ENST00000382723 ALG10Q5BKT4 473 aa24.18■■□□□ 1.46
MSX1-201ENST00000382723 GALNTL5Q7Z4T8 443 aa24.18■■□□□ 1.46
MSX1-201ENST00000382723 SLC43A2Q8N370 569 aa24.18■■□□□ 1.46
MSX1-201ENST00000382723 FAM26EQ8N5C1 309 aa24.18■■□□□ 1.46
MSX1-201ENST00000382723 OR14L1PQ8NHC6 308 aa24.18■■□□□ 1.46
MSX1-201ENST00000382723 C5orf34Q96MH7 638 aa24.18■■□□□ 1.46
MSX1-201ENST00000382723 Q96MT0 163 aa24.18■■□□□ 1.46
MSX1-201ENST00000382723 RNF32Q9H0A6 362 aa24.18■■□□□ 1.46
MSX1-201ENST00000382723 IER3IP1Q9Y5U9 82 aa24.18■■□□□ 1.46
MSX1-201ENST00000382723 A0A087WXM4 84 aa24.18■■□□□ 1.46
MSX1-201ENST00000382723 OR2M5A3KFT3 312 aa24.18■■□□□ 1.46
MSX1-201ENST00000382723 F13BP05160 661 aa24.18■■□□□ 1.46
MSX1-201ENST00000382723 CD46P15529 392 aa24.18■■□□□ 1.46
MSX1-201ENST00000382723 UQCRC1P31930 480 aa24.18■■□□□ 1.46
MSX1-201ENST00000382723 IDUAP35475 653 aa24.18■■□□□ 1.46
MSX1-201ENST00000382723 C19orf57Q0VDD7 668 aa24.18■■□□□ 1.46
MSX1-201ENST00000382723 DPY19L2P2Q6ZN68 376 aa24.18■■□□□ 1.46
MSX1-201ENST00000382723 OTULINQ96BN8 352 aa24.18■■□□□ 1.46
MSX1-201ENST00000382723 BAIAP2Q9UQB8 552 aa24.18■■□□□ 1.46
MSX1-201ENST00000382723 FTCDNL1E5RQL4 147 aa24.17■■□□□ 1.46
MSX1-201ENST00000382723 CDK2AP1O14519 115 aa24.17■■□□□ 1.46
MSX1-201ENST00000382723 NME2P1O60361 137 aa24.17■■□□□ 1.46
MSX1-201ENST00000382723 IMPDH2P12268 514 aa24.17■■□□□ 1.46
MSX1-201ENST00000382723 NME2P22392 152 aa24.17■■□□□ 1.46
MSX1-201ENST00000382723 SHC1P29353 583 aa24.17■■□□□ 1.46
MSX1-201ENST00000382723 GABARAPL2P60520 117 aa24.17■■□□□ 1.46
MSX1-201ENST00000382723 ERVK-25P63136 954 aa24.17■■□□□ 1.46
MSX1-201ENST00000382723 CSNK2BP67870 215 aa24.17■■□□□ 1.46
MSX1-201ENST00000382723 MYBPHQ13203 477 aa24.17■■□□□ 1.46
MSX1-201ENST00000382723 TMEM44Q2T9K0 475 aa24.17■■□□□ 1.46
MSX1-201ENST00000382723 AHSA2Q719I0 299 aa24.17■■□□□ 1.46
MSX1-201ENST00000382723 OR5J2Q8NH18 312 aa24.17■■□□□ 1.46
MSX1-201ENST00000382723 OR5B2Q96R09 309 aa24.17■■□□□ 1.46
MSX1-201ENST00000382723 KATNB1Q9BVA0 655 aa24.17■■□□□ 1.46
MSX1-201ENST00000382723 ASPNQ9BXN1 380 aa24.17■■□□□ 1.46
MSX1-201ENST00000382723 POTEKPQ9BYX7 375 aa24.17■■□□□ 1.46
MSX1-201ENST00000382723 KLF13Q9Y2Y9 288 aaPredicted RBP24.17■■□□□ 1.46
MSX1-201ENST00000382723 SH3D21A4FU49 640 aa24.16■■□□□ 1.46
MSX1-201ENST00000382723 M0R082 166 aa24.16■■□□□ 1.46
MSX1-201ENST00000382723 PMS2P3Q13401 168 aa24.16■■□□□ 1.46
MSX1-201ENST00000382723 OCLNQ16625 522 aa24.16■■□□□ 1.46
MSX1-201ENST00000382723 TMEM176BQ3YBM2 270 aaPredicted RBP24.16■■□□□ 1.46
MSX1-201ENST00000382723 GLYR1Q49A26 553 aaPredicted RBP24.16■■□□□ 1.46
MSX1-201ENST00000382723 TMEM201Q5SNT2 666 aa24.16■■□□□ 1.46
MSX1-201ENST00000382723 CCDC81Q6ZN84 652 aa24.16■■□□□ 1.46
MSX1-201ENST00000382723 FAM83FQ8NEG4 500 aaPredicted RBP24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.3 ms