RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000380828.6

RABGEF1-202, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

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Gene RABGEF1, Length 3,864 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-202ENST00000380828 GOT1P17174 413 aa6.28□□□□□ -1.4
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RABGEF1-202ENST00000380828 MTNR1AP48039 350 aa6.28□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 TRAF3Q13114 568 aa6.28□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 BATFQ16520 125 aa6.28□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 SYTL3Q4VX76 610 aa6.28□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 MESTQ5EB52 335 aa6.28□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 TFDP3Q5H9I0 405 aa6.28□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 LRRTM1Q86UE6 522 aa6.28□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 MFSD9Q8NBP5 474 aa6.28□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 TTC16Q8NEE8 873 aa6.28□□□□□ -1.4
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RABGEF1-202ENST00000380828 RORBQ92753 470 aa6.28□□□□□ -1.4
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RABGEF1-202ENST00000380828 GREM2Q9H772 168 aa6.28□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 ACTR8Q9H981 624 aa6.28□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 SLC2A9Q9NRM0 540 aa6.28□□□□□ -1.4
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RABGEF1-202ENST00000380828 MSH4O15457 936 aa6.28□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 ATP6AP2O75787 350 aa6.28□□□□□ -1.4
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RABGEF1-202ENST00000380828 UBE2KP61086 200 aa6.28□□□□□ -1.4
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RABGEF1-202ENST00000380828 SLC17A1Q14916 467 aa6.28□□□□□ -1.4
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RABGEF1-202ENST00000380828 MED10Q9BTT4 135 aa6.28□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 MEGF9Q9H1U4 602 aa6.28□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 PORCNQ9H237 461 aa6.28□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 TMPRSS4Q9NRS4 437 aa6.28□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 PNPOQ9NVS9 261 aa6.28□□□□□ -1.4
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RABGEF1-202ENST00000380828 LINC00471Q8N535 108 aa6.27□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 ZNF655Q8N720 491 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 HPSE2Q8WWQ2 592 aa6.27□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 PNMA5Q96PV4 448 aa6.27□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 TM6SF2Q9BZW4 377 aa6.27□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 RASL12Q9NYN1 266 aa6.27□□□□□ -1.4
RABGEF1-202ENST00000380828 RAB22AQ9UL26 194 aa6.27□□□□□ -1.4
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RABGEF1-202ENST00000380828 ZNF195O14628 629 aa6.27□□□□□ -1.41
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RABGEF1-202ENST00000380828 G6PC2Q9NQR9 355 aa6.27□□□□□ -1.41
RABGEF1-202ENST00000380828 ERRFI1Q9UJM3 462 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
RABGEF1-202ENST00000380828 ADAM29Q9UKF5 820 aa6.27□□□□□ -1.41
RABGEF1-202ENST00000380828 FBXW2Q9UKT8 454 aa6.27□□□□□ -1.41
RABGEF1-202ENST00000380828 PRPF19Q9UMS4 504 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
RABGEF1-202ENST00000380828 EXOSC1Q9Y3B2 195 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
RABGEF1-202ENST00000380828 HS3ST3A1Q9Y663 406 aa6.27□□□□□ -1.41
RABGEF1-202ENST00000380828 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa6.27□□□□□ -1.41
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