RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000377962.7

CNMD-201, Transcript of chondromodulin, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CNMD, Length 1,410 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNMD-201ENST00000377962 CHP2O43745 196 aa11.22□□□□□ -0.61
CNMD-201ENST00000377962 TIPRLO75663 272 aa11.22□□□□□ -0.61
CNMD-201ENST00000377962 RCBTB2O95199 551 aa11.22□□□□□ -0.61
CNMD-201ENST00000377962 CST1P01037 141 aa11.22□□□□□ -0.61
CNMD-201ENST00000377962 H1F0P07305 194 aaKnown RBP11.22□□□□□ -0.61
CNMD-201ENST00000377962 TMIGD3P0DMS9 266 aaPredicted RBP11.22□□□□□ -0.61
CNMD-201ENST00000377962 THRBP10828 461 aa11.22□□□□□ -0.61
CNMD-201ENST00000377962 CARD18P57730 90 aa11.22□□□□□ -0.61
CNMD-201ENST00000377962 RPS3AP61247 264 aaKnown RBP11.22□□□□□ -0.61
CNMD-201ENST00000377962 SELENBP1Q13228 472 aa11.22□□□□□ -0.61
CNMD-201ENST00000377962 SNTB1Q13884 538 aaKnown RBP11.22□□□□□ -0.61
CNMD-201ENST00000377962 HSPB2Q16082 182 aa11.22□□□□□ -0.61
CNMD-201ENST00000377962 SWT1Q5T5J6 900 aaKnown RBP11.22□□□□□ -0.61
CNMD-201ENST00000377962 SP5Q6BEB4 398 aaPredicted RBP11.22□□□□□ -0.61
CNMD-201ENST00000377962 ZNF787Q6DD87 383 aa11.22□□□□□ -0.61
CNMD-201ENST00000377962 LINC00114Q6XXX2 140 aa11.22□□□□□ -0.61
CNMD-201ENST00000377962 WDR88Q6ZMY6 472 aa11.22□□□□□ -0.61
CNMD-201ENST00000377962 ESPNLQ6ZVH7 1005 aa11.22□□□□□ -0.61
CNMD-201ENST00000377962 NKAIN4Q8IVV8 208 aa11.22□□□□□ -0.61
CNMD-201ENST00000377962 OFCC1Q8IZS5 231 aa11.22□□□□□ -0.61
CNMD-201ENST00000377962 PIK3C3Q8NEB9 887 aa11.22□□□□□ -0.61
CNMD-201ENST00000377962 OR52J3Q8NH60 311 aa11.22□□□□□ -0.61
CNMD-201ENST00000377962 MPP4Q96JB8 637 aa11.22□□□□□ -0.61
CNMD-201ENST00000377962 ARL5BQ96KC2 179 aa11.22□□□□□ -0.61
CNMD-201ENST00000377962 TM9SF2Q99805 663 aa11.22□□□□□ -0.61
CNMD-201ENST00000377962 PRSS27Q9BQR3 290 aa11.22□□□□□ -0.61
CNMD-201ENST00000377962 YY1AP1Q9H869 796 aa11.22□□□□□ -0.61
CNMD-201ENST00000377962 ARMC1Q9NVT9 282 aa11.22□□□□□ -0.61
CNMD-201ENST00000377962 STOML1Q9UBI4 398 aa11.22□□□□□ -0.61
CNMD-201ENST00000377962 CLEC4AQ9UMR7 237 aa11.22□□□□□ -0.61
CNMD-201ENST00000377962 ZC3H12DA2A288 527 aaKnown RBP11.21□□□□□ -0.61
CNMD-201ENST00000377962 ZNF208O43345 1280 aa11.21□□□□□ -0.61
CNMD-201ENST00000377962 HNRNPRO43390 633 aaKnown RBP11.21□□□□□ -0.61
CNMD-201ENST00000377962 TFPIP10646 304 aa11.21□□□□□ -0.61
CNMD-201ENST00000377962 PTNP21246 168 aa11.21□□□□□ -0.61
CNMD-201ENST00000377962 ENPP1P22413 925 aa11.21□□□□□ -0.61
CNMD-201ENST00000377962 CTSSP25774 331 aa11.21□□□□□ -0.61
CNMD-201ENST00000377962 RRM2P31350 389 aa11.21□□□□□ -0.61
CNMD-201ENST00000377962 SMIM11AP58511 58 aa11.21□□□□□ -0.61
CNMD-201ENST00000377962 SIRPAP78324 504 aa11.21□□□□□ -0.61
CNMD-201ENST00000377962 SPIBQ01892 262 aa11.21□□□□□ -0.61
CNMD-201ENST00000377962 TFF3Q07654 80 aa11.21□□□□□ -0.61
CNMD-201ENST00000377962 TRAM2Q15035 370 aa11.21□□□□□ -0.61
CNMD-201ENST00000377962 OR2T5Q6IEZ7 315 aa11.21□□□□□ -0.61
CNMD-201ENST00000377962 C3orf33Q6P1S2 294 aa11.21□□□□□ -0.61
CNMD-201ENST00000377962 ZFP1Q6P2D0 407 aa11.21□□□□□ -0.61
CNMD-201ENST00000377962 P3H2Q8IVL5 708 aa11.21□□□□□ -0.61
CNMD-201ENST00000377962 OR2T29Q8NH02 315 aa11.21□□□□□ -0.61
CNMD-201ENST00000377962 S100A14Q9HCY8 104 aa11.21□□□□□ -0.61
CNMD-201ENST00000377962 NPDC1Q9NQX5 325 aaPredicted RBP11.21□□□□□ -0.61
CNMD-201ENST00000377962 MAN2C1Q9NTJ4 1040 aa11.21□□□□□ -0.61
CNMD-201ENST00000377962 SPIN1Q9Y657 262 aaPredicted RBP11.21□□□□□ -0.61
CNMD-201ENST00000377962 INTS1Q8N201 2190 aaKnown RBP11.21□□□□□ -0.62
CNMD-201ENST00000377962 DOPEY1Q5JWR5 2465 aa11.21□□□□□ -0.62
CNMD-201ENST00000377962 LRRK2Q5S007 2527 aa11.2□□□□□ -0.62
CNMD-201ENST00000377962 A0A1W2PRQ8 180 aa11.2□□□□□ -0.62
CNMD-201ENST00000377962 CYSRT1A8MQ03 144 aa11.2□□□□□ -0.62
CNMD-201ENST00000377962 A8MVM7 634 aa11.2□□□□□ -0.62
CNMD-201ENST00000377962 H3BNX3 289 aa11.2□□□□□ -0.62
CNMD-201ENST00000377962 GNGT2O14610 69 aa11.2□□□□□ -0.62
CNMD-201ENST00000377962 TNFSF13O75888 250 aa11.2□□□□□ -0.62
CNMD-201ENST00000377962 KRT36O76013 467 aa11.2□□□□□ -0.62
CNMD-201ENST00000377962 GADD45GO95257 159 aa11.2□□□□□ -0.62
CNMD-201ENST00000377962 FKBP2P26885 142 aaKnown RBP11.2□□□□□ -0.62
CNMD-201ENST00000377962 MAP2K6P52564 334 aa11.2□□□□□ -0.62
CNMD-201ENST00000377962 ELF3P78545 371 aaPredicted RBP11.2□□□□□ -0.62
CNMD-201ENST00000377962 EGR4Q05215 589 aa11.2□□□□□ -0.62
CNMD-201ENST00000377962 PPP1R8Q12972 351 aaKnown RBP11.2□□□□□ -0.62
CNMD-201ENST00000377962 DGCR6Q14129 220 aa11.2□□□□□ -0.62
CNMD-201ENST00000377962 SYT14P1Q58G82 188 aa11.2□□□□□ -0.62
CNMD-201ENST00000377962 VWA1Q6PCB0 445 aa11.2□□□□□ -0.62
CNMD-201ENST00000377962 TTC33Q6PID6 262 aaPredicted RBP11.2□□□□□ -0.62
CNMD-201ENST00000377962 TMEM255BQ8WV15 326 aa11.2□□□□□ -0.62
CNMD-201ENST00000377962 DHRS1Q96LJ7 313 aa11.2□□□□□ -0.62
CNMD-201ENST00000377962 PRRG4Q9BZD6 226 aa11.2□□□□□ -0.62
CNMD-201ENST00000377962 RNF122Q9H9V4 155 aa11.2□□□□□ -0.62
CNMD-201ENST00000377962 KCNJ16Q9NPI9 418 aa11.2□□□□□ -0.62
CNMD-201ENST00000377962 ZNF175Q9Y473 711 aa11.2□□□□□ -0.62
CNMD-201ENST00000377962 MPDZO75970 2070 aa11.2□□□□□ -0.62
CNMD-201ENST00000377962 USP9YO00507 2555 aaPredicted RBP11.2□□□□□ -0.62
CNMD-201ENST00000377962 IGKV1D-42A0A075B6H8 117 aa11.19□□□□□ -0.62
CNMD-201ENST00000377962 TRBV4-1A0A0J9YWV2 114 aa11.19□□□□□ -0.62
CNMD-201ENST00000377962 A0A1W2PNV4 684 aa11.19□□□□□ -0.62
CNMD-201ENST00000377962 GJE1A6NN92 205 aa11.19□□□□□ -0.62
CNMD-201ENST00000377962 EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 151 aa11.19□□□□□ -0.62
CNMD-201ENST00000377962 TNFRSF11BO00300 401 aa11.19□□□□□ -0.62
CNMD-201ENST00000377962 CLOCKO15516 846 aa11.19□□□□□ -0.62
CNMD-201ENST00000377962 EEF1E1O43324 174 aaKnown RBP11.19□□□□□ -0.62
CNMD-201ENST00000377962 SYNGR4O95473 234 aa11.19□□□□□ -0.62
CNMD-201ENST00000377962 FASP25445 335 aa11.19□□□□□ -0.62
CNMD-201ENST00000377962 KIR2DL2P43627 348 aaPredicted RBP11.19□□□□□ -0.62
CNMD-201ENST00000377962 CLK1P49759 484 aaKnown RBP11.19□□□□□ -0.62
CNMD-201ENST00000377962 DIO1P49895 249 aa11.19□□□□□ -0.62
CNMD-201ENST00000377962 HMGA2P52926 109 aa11.19□□□□□ -0.62
CNMD-201ENST00000377962 MYBPHQ13203 477 aa11.19□□□□□ -0.62
CNMD-201ENST00000377962 ZNF239Q16600 458 aaKnown RBP11.19□□□□□ -0.62
CNMD-201ENST00000377962 FGD3Q5JSP0 725 aa11.19□□□□□ -0.62
CNMD-201ENST00000377962 PDSS1Q5T2R2 415 aa11.19□□□□□ -0.62
CNMD-201ENST00000377962 PODNL1Q6PEZ8 512 aa11.19□□□□□ -0.62
CNMD-201ENST00000377962 TBPL2Q6SJ96 375 aa11.19□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.4 ms