RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368147.8

SPTA1-201, Transcript of spectrin alpha, erythrocytic 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SPTA1, Length 7,999 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Dendrite .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTA1-201ENST00000368147 SMCHD1A6NHR9 2005 aa6.6□□□□□ -1.35
SPTA1-201ENST00000368147 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa6.6□□□□□ -1.35
SPTA1-201ENST00000368147 M0R2Z0 102 aa6.6□□□□□ -1.35
SPTA1-201ENST00000368147 PABPC4LP0CB38 370 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
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SPTA1-201ENST00000368147 XKRY2A2RUG3 117 aa6.6□□□□□ -1.35
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SPTA1-201ENST00000368147 TMEM139Q8IV31 216 aa6.6□□□□□ -1.35
SPTA1-201ENST00000368147 IQCKQ8N0W5 287 aa6.6□□□□□ -1.35
SPTA1-201ENST00000368147 ACOT4Q8N9L9 421 aa6.6□□□□□ -1.35
SPTA1-201ENST00000368147 PPP1R35Q8TAP8 253 aa6.6□□□□□ -1.35
SPTA1-201ENST00000368147 LIPHQ8WWY8 451 aa6.6□□□□□ -1.35
SPTA1-201ENST00000368147 PHF7Q9BWX1 381 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
SPTA1-201ENST00000368147 LANCL2Q9NS86 450 aa6.6□□□□□ -1.35
SPTA1-201ENST00000368147 TXNL4BQ9NX01 149 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
SPTA1-201ENST00000368147 LIPCP11150 499 aa6.59□□□□□ -1.35
SPTA1-201ENST00000368147 RPA2P15927 270 aa6.59□□□□□ -1.35
SPTA1-201ENST00000368147 BCL6P41182 706 aa6.59□□□□□ -1.35
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